[Bio] / Sprout / SproutLoad.pm Repository:
ViewVC logotype

Diff of /Sprout/SproutLoad.pm

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1.40, Thu Jun 8 15:37:32 2006 UTC revision 1.41, Thu Jun 8 19:43:34 2006 UTC
# Line 785  Line 785 
785                          if ($pegCount > 0) {                          if ($pegCount > 0) {
786                              Trace("$pegCount PEGs in $cellCount cells for $genomeID.") if T(3);                              Trace("$pegCount PEGs in $cellCount cells for $genomeID.") if T(3);
787                              $loadParticipatesIn->Put($genomeID, $subsysID, $variantCode);                              $loadParticipatesIn->Put($genomeID, $subsysID, $variantCode);
                             # Partition the PEGs found into clusters.  
                             my @clusters = $fig->compute_clusters(\@pegsFound, $sub);  
788                              # Create a hash mapping PEG IDs to cluster numbers.                              # Create a hash mapping PEG IDs to cluster numbers.
789                              # We default to -1 for all of them.                              # We default to -1 for all of them.
790                              my %clusterOf = map { $_ => -1 } @pegsFound;                              my %clusterOf = map { $_ => -1 } @pegsFound;
791                                # Partition the PEGs found into clusters.
792                                my @clusters = $fig->compute_clusters([keys %clusterOf], $sub);
793                              for (my $i = 0; $i <= $#clusters; $i++) {                              for (my $i = 0; $i <= $#clusters; $i++) {
794                                  my $subList = $clusters[$i];                                  my $subList = $clusters[$i];
795                                  for my $peg (@{$subList}) {                                  for my $peg (@{$subList}) {

Legend:
Removed from v.1.40  
changed lines
  Added in v.1.41

MCS Webmaster
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3