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revision 1.7, Thu Jun 16 19:10:04 2005 UTC revision 1.8, Wed Jun 22 21:31:47 2005 UTC
# Line 38  Line 38 
38                                          page or of particular interest to a research group or web site. A single genome can belong to multiple                                          page or of particular interest to a research group or web site. A single genome can belong to multiple
39                                          such groups or none at all.</Notes>                                          such groups or none at all.</Notes>
40                                  </Field>                                  </Field>
41                    <!-- <Field name="complete" type="boolean">
42                        <Notes>This field is TRUE if the genome is believed to be complete, else
43                        FALSE.</Notes>
44                    </Field> -->
45              </Fields>              </Fields>
46              <Indexes>              <Indexes>
47                  <Index>                  <Index>
# Line 123  Line 127 
127                                          <DataGen testCount="3">StringGen('Pgi|99999', 'Puni|XXXXXX', 'PAAAAAA999')</DataGen>                                          <DataGen testCount="3">StringGen('Pgi|99999', 'Puni|XXXXXX', 'PAAAAAA999')</DataGen>
128                                  </Field>                                  </Field>
129                  <Field name="translation" type="text" relation="FeatureTranslation">                  <Field name="translation" type="text" relation="FeatureTranslation">
130                                          <Notes>[i](optional)[/i] A of this feature's residues into character codes, formed by concatenating                      <Notes>[i](optional)[/i] A translation of this feature's residues into character
131                          the pieces of the feature together.</Notes>                      codes, formed by concatenating the pieces of the feature together. For a
132                        protein encoding group, this is the protein characters. For other types
133                        it is the DNA characters.</Notes>
134                                          <DataGen testCount="0"></DataGen>                                          <DataGen testCount="0"></DataGen>
135                                  </Field>                                  </Field>
136                  <Field name="upstream-sequence" type="text" relation="FeatureUpstream">                  <Field name="upstream-sequence" type="text" relation="FeatureUpstream">
# Line 144  Line 150 
150                                          "&amp;Number=" . IntGen(1,99)</DataGen>                                          "&amp;Number=" . IntGen(1,99)</DataGen>
151                                  </Field>                                  </Field>
152              </Fields>              </Fields>
153                <Indexes>
154                    <Index>
155                        <Notes>This index allows the user to find the feature corresponding to
156                        the specified alias name.</Notes>
157                        <IndexFields>
158                            <IndexField name="alias" order="ascending" />
159                        </IndexFields>
160                    </Index>
161                </Indexes>
162          </Entity>          </Entity>
163          <Entity name="Role" keyType="string">          <Entity name="Role" keyType="string">
164              <Notes>A [i]role[/i] describes a biological function that may be fulfilled by a feature.              <Notes>A [i]role[/i] describes a biological function that may be fulfilled by a feature.

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