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revision 1.21, Thu Feb 5 07:24:09 2009 UTC revision 1.22, Mon Mar 16 00:24:23 2009 UTC
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116                                                   -checked => $statistical,                                                   -checked => $statistical,
117                                                   -value => 1,                                                   -value => 1,
118                                                   -label => 'Use Statistical Algorithm') .                                                   -label => 'Use Statistical Algorithm') .
119                                    SearchHelper::Hint("SigGenes",                                    SearchHelper::Hint("SigGenes", 24),
                                                      "When two sets of genomes are specified, check this " .  
                                                      "box to use a statistical algorithm designed " .  
                                                      "specifically to choose differentiating genes. " .  
                                                      "This box has no effect when looking for genes " .  
                                                      "in common."),  
120                                    CGI::checkbox(-name => 'useSims',                                    CGI::checkbox(-name => 'useSims',
121                                                   -checked => $useSims,                                                   -checked => $useSims,
122                                                   -value => 1,                                                   -value => 1,
123                                                   -label => 'Use Similarities') .                                                   -label => 'Use Similarities') .
124                                    SearchHelper::Hint("SigGenes",                                    SearchHelper::Hint("SigGenes", 25)))),
                                                      "Normally, Bidirectional Best Hits are used to " .  
                                                      "find matching genes. Check this box to use " .  
                                                      "similarities instead.")))),  
125                  CGI::Tr(CGI::td(), CGI::td(join(" ",                  CGI::Tr(CGI::td(), CGI::td(join(" ",
126                                    CGI::checkbox(-name => 'showMatch',                                    CGI::checkbox(-name => 'showMatch',
127                                                   -checked => $showMatch,                                                   -checked => $showMatch,
128                                                   -value => 1,                                                   -value => 1,
129                                                   -label => 'Show Matching Genes') .                                                   -label => 'Show Matching Genes') .
130                                    SearchHelper::Hint("SigGenes",                                    SearchHelper::Hint("SigGenes", 26)))),
                                                      "Check this button to display the genes matching " .  
                                                      "each gene displayed in the results.")))),  
131                  CGI::Tr(CGI::td("Cutoff"),                  CGI::Tr(CGI::td("Cutoff"),
132                           CGI::td(CGI::textfield(-name => 'cutoff',                           CGI::td(CGI::textfield(-name => 'cutoff',
133                                                    -value => $cutoff,                                                    -value => $cutoff,

Legend:
Removed from v.1.21  
changed lines
  Added in v.1.22

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