[Bio] / Sprout / SHOpSearch.pm Repository:
ViewVC logotype

Diff of /Sprout/SHOpSearch.pm

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1.2, Mon Jul 16 20:04:51 2007 UTC revision 1.3, Mon Aug 20 23:25:08 2007 UTC
# Line 89  Line 89 
89                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'nearDistance',                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'nearDistance',
90                                                    -value => $options->{nearDistance},                                                    -value => $options->{nearDistance},
91                                                    -size => 5) .                                                    -size => 5) .
92                                    SearchHelper::Hint("If the distance between two genes " .                                    SearchHelper::Hint("OpSearch",
93                                                         "If the distance between two genes " .
94                                                       "is greater than this number of base " .                                                       "is greater than this number of base " .
95                                                       "pairs, they will be treated as " .                                                       "pairs, they will be treated as " .
96                                                       "belonging to different operons."))),                                                       "belonging to different operons."))),
# Line 97  Line 98 
98                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'upstream',                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'upstream',
99                                                    -value => $options->{upstream},                                                    -value => $options->{upstream},
100                                                    -size => 5) .                                                    -size => 5) .
101                           SearchHelper::Hint("When displaying the upstream DNA, this is " .                           SearchHelper::Hint("OpSearch",
102                                                "When displaying the upstream DNA, this is " .
103                                              "the number of base pairs preceding the gene " .                                              "the number of base pairs preceding the gene " .
104                                              "that will be shown."))),                                              "that will be shown."))),
105                  $cgi->Tr($cgi->td("Instream base pairs to display"),                  $cgi->Tr($cgi->td("Instream base pairs to display"),
106                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'instream',                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'instream',
107                                                    -value => $options->{instream},                                                    -value => $options->{instream},
108                                                    -size => 5) .                                                    -size => 5) .
109                                    SearchHelper::Hint("When displaying the upstream DNA, this is " .                                    SearchHelper::Hint("OpSearch",
110                                                         "When displaying the upstream DNA, this is " .
111                                                       "the number of base pairs from inside the " .                                                       "the number of base pairs from inside the " .
112                                                       "gene that will be shown."))),                                                       "gene that will be shown."))),
113                  $cgi->Tr($cgi->td("Maximum lint size"),                  $cgi->Tr($cgi->td("Maximum lint size"),
114                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'lintSize',                           $cgi->td($cgi->textfield(-name => 'lintSize',
115                                                    -value => $options->{lintSize},                                                    -value => $options->{lintSize},
116                                                    -size => 5) .                                                    -size => 5) .
117                                    SearchHelper::Hint("Genes whose size in base pairs are equal to " .                                    SearchHelper::Hint("OpSearch",
118                                                         "Genes whose size in base pairs are equal to " .
119                                                       "or less than this amount will; be ignored.")));                                                       "or less than this amount will; be ignored.")));
120      # Add the special feature options.      # Add the special feature options.
121      push @rows, RHFeatures::FeatureFilterFormRows($self, 'options');      push @rows, RHFeatures::FeatureFilterFormRows($self, 'options');

Legend:
Removed from v.1.2  
changed lines
  Added in v.1.3

MCS Webmaster
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3