[Bio] / SeedViewer / seedviewer.cgi Repository:
ViewVC logotype

Diff of /SeedViewer/seedviewer.cgi

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1.31, Thu Jul 9 10:03:34 2009 UTC revision 1.32, Wed Aug 26 20:33:50 2009 UTC
# Line 2  Line 2 
2  use warnings;  use warnings;
3  no warnings 'once';  no warnings 'once';
4    
5    my $have_fcgi;
6    eval {
7        require CGI::Fast;
8        $have_fcgi = 1;
9    };
10    
11    use IO::Handle;
12    #open(TICKLOG, ">/dev/pts/9") or open(TICKLOG, ">&STDERR");
13    #TICKLOG->autoflush(1);
14    
15    use Time::HiRes 'gettimeofday';
16    my $start = gettimeofday;
17    my $time_last;
18    sub tick {
19        my($w) = @_;
20        my $now = gettimeofday;
21        my $t = $now - $start;
22        my $tms = int(($now - $time_last) * 1000);
23        $time_last = $now;
24        my ($package, $filename, $line) = caller;
25        if (1)
26        {
27            $filename =~ s,.*/common/lib,/lib,;
28            $filename =~ s,.*/CGI,/CGI,;
29            $filename =~ s/WebApplication/WA/;
30            $filename =~ s/WebComponent/WC/;
31        }
32    
33        printf TICKLOG "$$ %-40s %5d %8d %.3f\n", $filename, $line, $tms, $t;
34        TICKLOG->flush();
35    }
36    
37    
38  use DBMaster;  use DBMaster;
39  use WebApplication;  use WebApplication;
40  use WebMenu;  use WebMenu;
# Line 11  Line 44 
44  use FIG_Config;  use FIG_Config;
45  use WebConfig;  use WebConfig;
46    
47    #
48    # If no CGI vars, assume we are invoked as a fastcgi service.
49    #
50    my $n_requests = 0;
51    if ($have_fcgi && $ENV{REQUEST_METHOD} eq '')
52    {
53        #
54        # Precompile modules. Find where we found one, and use that path
55        # to walk for the rest.
56        #
57    
58        my $mod_path = $INC{"WebComponent/Ajax.pm"};
59        if ($mod_path && $mod_path =~ s,WebApplication/WebComponent/Ajax\.pm$,,)
60        {
61            local $SIG{__WARN__} = sub {};
62            for my $what (qw(SeedViewer RAST WebApplication))
63            {
64                for my $which (qw(WebPage WebComponent DataHandler))
65                {
66                    opendir(D, "$mod_path/$what/$which") or next;
67                    my @x = grep { /^[^.]/ } readdir(D);
68                    for my $mod (@x)
69                    {
70                        $mod =~ s/\.pm$//;
71                        my $fullmod = join("::", $what, $which, $mod);
72                        eval " require $fullmod; ";
73                    }
74                    closedir(D);
75                }
76            }
77        }
78        my $max_requests = 100;
79        while ((my $cgi = new CGI::Fast()) &&
80               ($max_requests == 0 || $n_requests++ < $max_requests))
81        {
82  eval {  eval {
83      &main;              &main($cgi);
84  };  };
   
85  if ($@)  if ($@)
86  {  {
87                if ($@ =~ /^cgi_exit/)
88                {
89                    # this is ok.
90                }
91                elsif (ref($@) ne 'ARRAY')
92                {
93                    warn "code died, cgi=$cgi returning error\n";
94                    print $cgi->header(-status => '500 error in body of cgi processing');
95                    print $@;
96                }
97            }
98        endloop:
99        }
100    }
101    else
102    {
103        my $cgi = new CGI();
104        eval { &main($cgi); };
105    
106        if ($@ && $@ !~ /^cgi_exit/)
107        {
108      my $error = $@;      my $error = $@;
109      Warn("Script error: $error") if T(SeedViewer => 0);      Warn("Script error: $error") if T(SeedViewer => 0);
110    
# Line 29  Line 117 
117      print CGI::end_html();      print CGI::end_html();
118    
119  }  }
120    }
121    
122  sub main {  sub main {
123        my($cgi) = @_;
     # initialize cgi  
     my $cgi = new CGI();  
     # Initialize tracing.  
124      ETracing($cgi);      ETracing($cgi);
125      if (FIGRules::nmpdr_mode($cgi)) {      if (FIGRules::nmpdr_mode($cgi)) {
126          Trace("NMPDR mode selected.") if T(3);          Trace("NMPDR mode selected.") if T(3);
# Line 47  Line 133 
133          print CGI::redirect(-uri => "$FIG_Config::cgi_url/wiki/rest.cgi/NmpdrPlugin/SeedViewer$parms",          print CGI::redirect(-uri => "$FIG_Config::cgi_url/wiki/rest.cgi/NmpdrPlugin/SeedViewer$parms",
134                              -status => 301);                              -status => 301);
135      } else {      } else {
136    
137          # initialize layout          # initialize layout
138          # Use the template file for the current mode-- NMPDR or SEED          # Use the template file for the current mode-- NMPDR or SEED
139          my $templateFile = TMPL_PATH . "/SeedViewer.tmpl";          my $templateFile = TMPL_PATH . "/SeedViewer.tmpl";
# Line 94  Line 181 
181                                              menu     => $menu,                                              menu     => $menu,
182                                              layout   => $layout,                                              layout   => $layout,
183                                              default  => 'Home',                                              default  => 'Home',
184                                                cgi => $cgi,
185                                            } );                                            } );
186    
187          my $prefix = "Seed Viewer - ";          my $prefix = "Seed Viewer - ";

Legend:
Removed from v.1.31  
changed lines
  Added in v.1.32

MCS Webmaster
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3