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revision 1.20, Fri Dec 19 15:46:52 2003 UTC revision 1.31, Wed Jul 7 16:24:48 2004 UTC
# Line 1  Line 1 
1  from wxPython.wx import *  from wxPython.wx import *
2  from FaST.BssFactory import BssFactory  from FaST.BssFactory import BssFactory
3    from FaST.BssFactoryProxy    import BssFactoryProxy
4  from FaST.WitFactory import WitFactory  from FaST.WitFactory import WitFactory
5  from FaST.SeedDataFactory import SeedDataFactory  from FaST.SeedDataFactory import SeedDataFactory
6  from FaST.SeedDataFactory import SeedOrganism  from FaST.SeedDataFactory import SeedOrganism
7  from FaST.RecoElem import RecoElem  from KahOM.RecoElem           import RecoElem
8  from RecoElempanel import RecoElemWindow  from PyGUI.RecoElempanel           import RecoElempanel
9    from CatalogServices.Catalog import Catalog
10    
11    
12    class Catalogpanel:
 class CatalogWindow:  
 #    def __init__(self, parent):  
 #    def initCatEvents(self ):  
 #    def initCatData( self ):  
 #    def loadBssCatalog(self, bssItemId):  
 #    def loadWitCatalog(self, witItemId):  
 #    def loadSeedCatalog(self, witItemId):  
 #    def onLeftClick(self,treeEvent):  
 #    def onLoadBtnPress(self, event):  
 #    def bssLoader( self, bssCatEntry ):  
 #    def witOrgLoader(self,  orgName ):  
 #    def witPwyLoader(self,  pwyName ):  
   
13      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
14      def __init__(self, parent):      def __init__(self, parent):
15      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
# Line 40  Line 29 
29          self.initCatData()          self.initCatData()
30    
31    
32          self.seedServerMenu = wxMenu()          # setup catalog editing menu (right click)
33          self.seedServerAddId = wxNewId()  
34          self.setupSeedServerMenu()          self.catEditMenu         = wxMenu()
35            self.catEditMkItemId     = wxNewId()
36            self.catEditMkDirId      = wxNewId()
37            self.setupCatEditMenu()
38    
39          return          return
40    
# Line 50  Line 42 
42      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
43      def initCatEvents(self ):      def initCatEvents(self ):
44      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
45          button1= self.parent.OK_button  
         EVT_BUTTON(self.parent, self.parent.loadbtn.GetId(),  
                    self.onLoadBtnPress)  
46          EVT_TREE_SEL_CHANGED(self.parent.catalog_tree,          EVT_TREE_SEL_CHANGED(self.parent.catalog_tree,
47                               self.parent.catalog_treeId,                               self.parent.catalog_treeId,
48                               self.onLeftClick)                               self.onLeftClick)
# Line 63  Line 53 
53          EVT_RIGHT_DOWN(self.parent.catalog_tree, self.onRightClickCatalogTree)          EVT_RIGHT_DOWN(self.parent.catalog_tree, self.onRightClickCatalogTree)
54    
55    
56          EVT_LEFT_DCLICK (self.parent.catalog_tree, self.onLoadBtnPress)          EVT_LEFT_DCLICK (self.parent.catalog_tree, self.onLeftDClick)
57    
58            EVT_COMBOBOX(self.parent.catVersionValueComboBox,
59                         self.parent.catVersionValueComboBox.GetId(),
60                         self.onCatVersionValueComboBox)
61    
62          return          return
63    
64      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
65      def initCatData( self ):      def initCatData( self ):
66      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
         self.parent.catalogRootId = self.parent.catalog_tree.AddRoot("Data Sources")  
67    
68          bssItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(self.parent.catalogRootId,          self.parent.catalogRootId = self.parent.catalog_tree.AddRoot("/")
69                                                     "BioSimScratch" )          self.loadCatalog()
         witItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(self.parent.catalogRootId,  
                                                    "WIT3" )  
         self.seedItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(self.parent.catalogRootId,  
                                                    "Seed" )  
   
         self.loadBssCatalog( bssItemId )  
         self.loadWitCatalog( witItemId )  
   
         localSeedServer        = "http://localhost/FIG/"  
 #        localSeedServer        = "http://float179.mcs.anl-external.org/FIG/"  
         self.loadSeedCatalog( localSeedServer)  
70    
71          self.parent.catalog_tree.Expand( self.parent.catalogRootId)          self.parent.catalog_tree.Expand( self.parent.catalogRootId)
72          return          return
73    
74      #------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------
75      def setupSeedServerMenu(self):      def setupCatEditMenu(self):
76      #------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------
         self.seedServerAddId = wxNewId()  
77    
78          self.seedServerMenu.Append( self.seedServerAddId,          self.catEditMenu.Append( self.catEditMkDirId,
79                                        "Add Seed Server", "New seed server arg3" )                                   "New Directory", "NewDirectory" )
80          EVT_MENU(self.parent, self.seedServerAddId, self.doSeedServerAdd)          EVT_MENU(self.parent, self.catEditMkDirId, self.doCatEditMkDir)
81    
82            self.catEditMenu.Append( self.catEditMkItemId,
83                                     "New Item", "NewDirectory" )
84            EVT_MENU(self.parent, self.catEditMkItemId, self.doCatEditMkItem)
85    
86            return
87    
88      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
89      def loadBssCatalog(self, bssItemId):      def loadCatalog(self):
90      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
91            wxBeginBusyCursor()
92    
93            localSeedServer        = "http://localhost/FIG"
94            seedFactory   = SeedDataFactory( localSeedServer )
95          b=BssFactory()          b=BssFactory()
96          for catEntryTuple in b.getLsCat():  
97              id=self.parent.catalog_tree.AppendItem(bssItemId, catEntryTuple[0])          #theConnectionInfo = ["terra.mcs.anl.gov", 3000]
98              self.parent.catalog_tree.SetPyData(id, (self.bssLoader, catEntryTuple) )          #b             = BssFactoryProxy(theConnectionInfo)
99    
100            try:
101                Catalog.instance().addDataFactory( seedFactory )
102                Catalog.instance().addDataFactory( b )
103            except:
104                self.parent.error("loadCatalog: error" )
105                wxEndBusyCursor()
106                return
107    
108            ##
109            # Handle top/root of catalog/tree specially to avoid "two root"
110            # on display problem
111            ##
112    
113            top = Catalog.instance().getCatalogTop()
114            parentTree = self.parent.catalog_tree
115            parentTree.SetPyData( self.parent.catalogRootId,
116                                  (self.recoElemLoader, top, self.parent.catalogRootId) )
117    
118            for e in top.entries():
119                self.recurseCatalog( e, parentTree, self.parent.catalogRootId)
120    
121            parentTree.SortChildren( self.parent.catalogRootId)
122    
123            wxEndBusyCursor()
124    
125          return          return
126    
127      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
128      def loadWitCatalog(self, witItemId):      def recurseCatalog( self, catEntry, parentTree, parentItemId):
129      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
130          w=WitFactory()          """
131            Create a new item under parentItemId in wxTree, parentTree.  Associate
132            catEntry with it.  If catEntry has entries, recurse on them.
133            """
134    
135            if ( catEntry.isTerminal() ):
136                displayedName = catEntry.name()
137            else:
138                displayedName = catEntry.name() + "/"
139    
140          pwyItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(witItemId, "Pathways" )          newItemId=parentTree.AppendItem(parentItemId, displayedName )
141    
142          pwyList = w.listPathways( )          # associate data needed to manipulate the catEntry
143          for pwy in pwyList:  
144              id=self.parent.catalog_tree.AppendItem(pwyItemId, pwy)          parentTree.SetPyData( newItemId,
145              self.parent.catalog_tree.SetPyData(id, (self.witPwyLoader,pwy) )                                (self.recoElemLoader, catEntry, newItemId ) )
146    
147          orgItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(witItemId, "Organisms" )          if ( not catEntry.isTerminal() ):
148                for e in catEntry.entries():
149          orgList = w.listOrganisms( )                  self.recurseCatalog( e, parentTree, newItemId)
150          for org in orgList:  
151              id=self.parent.catalog_tree.AppendItem(orgItemId, org)          parentTree.SortChildren( newItemId )
             self.parent.catalog_tree.SetPyData(id, (self.witOrgLoader, org ))  
152    
153          return          return
154    
155      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
156      def loadSeedCatalog(self, seedServer ):      def loadSeedCatalog(self, seedServer ):
157      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
158            """
159            This adds a Seed instance to the catalog.  It is called from the
160            MainMenuBar when Data->Add Seed Instance is called, for example.
161            """
162    
163          wxBeginBusyCursor()          wxBeginBusyCursor()
164    
165          # The SeedDataFactory ctor is slow and actually reads a bunch of          # The SeedDataFactory ctor is slow and actually reads a bunch of
# Line 141  Line 169 
169    
170          # add it to the list in the catalog          # add it to the list in the catalog
171          try:          try:
172              self.parent.factoryMgr.addFactory( seedServer, seedFactory )              Catalog.instance().addDataFactory( seedFactory )
173          except:          except:
174              self.parent.error("loadSeedCatalog: %s already in foundry list." % seedServer)              self.parent.error("loadSeedCatalog: %s already in foundry list." % seedServer)
175              wxEndBusyCursor()              wxEndBusyCursor()
176              return              return
177    
178          # make an entry in the tree for it          top = seedFactory.getCatalogTop()
179          #          self.recurseCatalog( top, self.parent.catalog_tree, self.parent.catalogRootId)
         newSeedItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(self.seedItemId, seedServer )  
180    
         # jam in the data  
         #  
         orgList = seedFactory.listOrganisms( )  
         if ( orgList== None ):  
             orgItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(newSeedItemId,  
                          "Could not get Org list from "+ seedServer )  
181              wxEndBusyCursor()              wxEndBusyCursor()
             return  
   
         itemName="Spontaneous Reactions"  
         spontaneousRxItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(newSeedItemId, itemName)  
         self.parent.catalog_tree.SetPyData(spontaneousRxItemId,  
                                            (self.seedRecoElemLoader,  
                                            (seedFactory.getRecoElemSpontaneousRx, None) ))  
   
182    
         orgItemId=self.parent.catalog_tree.AppendItem(newSeedItemId, "Organisms" )  
         for org in orgList:  
             id=self.parent.catalog_tree.AppendItem(orgItemId, org.figOrgName )  
             self.parent.catalog_tree.SetPyData(id, (self.seedRecoElemLoader,  
                                                    (seedFactory.getRecoElemByOrg, org) ))  
   
   
         wxEndBusyCursor()  
183          return          return
184    
185      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
# Line 186  Line 191 
191          if (catEntryTuple == None ):          if (catEntryTuple == None ):
192              return              return
193          self.selected = catEntryTuple          self.selected = catEntryTuple
194            catEntry   = catEntryTuple[1]
195    
196            ##
197            # update the history information display
198            ##
199    
200            theBox = self.parent.catVersionValueComboBox
201            theBox.Clear()
202    
203            if ( not catEntry.isTerminal() ):
204    
205                self.parent.catPathValue.SetValue( catEntry.path() + "/" )
206                self.parent.catVersionValueComboBox.SetLabel( "")
207                self.parent.catHistoryDateValue.SetLabel( "" )
208                self.parent.catHistoryUserValue.SetLabel( "" )
209                self.parent.catHistoryCreatedFromValue.SetLabel( "")
210                theBox.SetValue( "" )
211            else:
212                versions   = catEntry.versions()
213                if ( [] == versions ):
214                    self.parent.catPathValue.SetLabel( catEntry.path()+";[None]" )
215                    theBox.SetValue( "None" )
216                else:
217                    maxVersion = max( versions )
218                    for v in versions:
219                        theBox.Append( "%s" % (v ) )
220                        theBox.SetValue( "%s" % (maxVersion) )
221                    self.parent.catPathValue.SetLabel(catEntry.path()+";[%s]" % (maxVersion))
222                #
223                self.parent.catHistoryDateValue.SetLabel( "no date info yet" )
224                self.parent.catHistoryUserValue.SetLabel( "no user info yet" )
225                self.parent.catHistoryCreatedFromValue.SetLabel( "no history info yet" )
226    
227          return          return
228    
229    
230      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
231      def onRightClickCatalogTree(self, event):      def onCatVersionValueComboBox(self, event):
232      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
233            """
234            Handles activity in combo box where user sets Verion to use
235            """
236    
237          goober = event.GetEventObject()          # get the value selected in the combo box.
238          goober.PopupMenu(self.seedServerMenu, event.GetPosition())          choice = event.GetString()
239            self.parent.catVersionValueComboBox.SetValue( "%s" % (choice) )
240    
241            # the operation is interpreted relative to the currently selected
242            # catalogEntry.  find what that is.
243    
244            catEntry   = self.selected[1]
245    
246            # update stuff
247            #version = self.parent.catVersionValueComboBox.GetValue()
248            self.parent.catPathValue.SetLabel( catEntry.path()+";[%s]" % (choice) )
249    
250          return          return
251    
252    
253      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
254      def doSeedServerAdd(self, event):      def onRightClickCatalogTree(self, event):
255      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
256          prompt = "Name of Seed server"          """ Fires off the pop-up menu to handle right click events. """
257    
258            event.GetEventObject().PopupMenu(self.catEditMenu, event.GetPosition())
259            return
260    
261        #------------------------------------------------------------------------
262        def doCatEditMkDir( self, event ):
263        #------------------------------------------------------------------------
264            if (None == self.selected):
265                self.parent.error( "A selection is required first.")
266                return
267    
268            catEntryTuple = self.selected
269            catEntry      = catEntryTuple[1]
270            treeItemId    = catEntryTuple[2]
271    
272            if (catEntry.isTerminal()):
273                self.parent.error("Directories can not be added to items.")
274                return
275    
276            prompt = "New catalog directory name:"
277          dlg = wxTextEntryDialog(self.parent, message=prompt, style=wxOK)          dlg = wxTextEntryDialog(self.parent, message=prompt, style=wxOK)
278    
279          if ( dlg.ShowModal() == wxID_OK):          if ( dlg.ShowModal() == wxID_OK):
280              serverName = dlg.GetValue()              theName = dlg.GetValue()
281              if ( serverName=="" ): return              if ( theName=="" ): return
282              dlg.Destroy()              dlg.Destroy()
283          else:          else:
284              #didn't get a kid name              #didn't get a kid name
285              dlg.Destroy()              dlg.Destroy()
286              return              return
287    
288          self.loadSeedCatalog( serverName )          try:
289                newCatEntry=catEntry.mkDir( theName )
290                parentTree=self.parent.catalog_tree
291                newItemId=parentTree.AppendItem(treeItemId, newCatEntry.name() )
292                parentTree.SetPyData( newItemId,
293                                      (self.recoElemLoader, newCatEntry, newItemId )  )
294    
295                parentTree.SortChildren( treeItemId )
296            except:
297                self.parent.error( "Operation refused." )
298    
299    
300          return          return
301    
302      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
303      def onLeftDClick(self,treeEvent):      def doCatEditMkItem( self, event ):
304      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
305          self.onLoadBtnPress(treeEvent)          if (None == self.selected):
306                self.parent.error( "A selection is required first.")
307                return
308    
309          pt = treeEvent.GetPosition()          catEntryTuple = self.selected
310          item = self.parent.tree_ctr.HitTest(pt)          catEntry      = catEntryTuple[1]
311          print item          treeItemId    = catEntryTuple[2]
312          catEntryTuple = self.parent.tree_ctr.GetPyData(item)  
313          apply(catEntryTuple[0], catEntryTuple[1])          if (catEntry.isTerminal()):
314                self.parent.error("Items can not be added to items. Add to a directory.")
315          return          return
316    
317          pt = treeEvent.GetPosition()          prompt = "New catalog entry name:"
318            dlg = wxTextEntryDialog(self.parent, message=prompt, style=wxOK)
319    
320            if ( dlg.ShowModal() == wxID_OK):
321                theName = dlg.GetValue()
322                if ( theName=="" ): return
323                dlg.Destroy()
324            else:
325                #didn't get a kid name
326                dlg.Destroy()
327                return
328    
329          item = self.parent.tree_ctr.HitTest(pt)          try:
330                newCatEntry = catEntry.mkItem( theName )
331                parentTree=self.parent.catalog_tree
332                newItemId=parentTree.AppendItem(treeItemId, newCatEntry.name() )
333                parentTree.SetPyData( newItemId,
334                                      (self.recoElemLoader, newCatEntry, newItemId )  )
335    
336          print item              parentTree.SortChildren( treeItemId )
337          catEntryTuple = self.parent.tree_ctr.GetPyData(item)          except:
338          #print catEntryTuple, "catEntryTuple"              self.parent.error( "Operation refused." )
         #self.selected = catEntryTuple  
339    
         #catEntryTuple = self.selected  
         #apply(catEntryTuple[0], [catEntryTuple[1]])  
340    
341          return          return
342    
343    
344      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
345      def onLoadBtnPress(self, event):      def onLeftDClick(self, event):
346      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
347            """ Double left-click means, "Load the currently selected item." """
348    
349          if ( self.selected == None ):          if ( self.selected == None ):
350              print "No selection in onLoadBtnPress"              self.parent.error( "You must select a catalog entry before requesting load.")
351              return              return
352    
353            # We store a loader to actually load the selected item.  This dates
354            # back to a time before a single loader could handle all the various
355            # data factory kinds.
356    
357          catEntryTuple = self.selected          catEntryTuple = self.selected
358          apply( catEntryTuple[0], [catEntryTuple[1]] )          apply( catEntryTuple[0], [catEntryTuple[1]] )
359    
360          return          return
361    
362      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
363      def bssLoader( self, bssCatEntry ):      def recoElemLoader(self,  argList ):
364      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
365          wxBeginBusyCursor()          wxBeginBusyCursor()
         b=BssFactory()  
         top= b.getRecoElemById( bssCatEntry[1] )  
         self.to_re.AddRecoElemTree(self.parent.rootId, top)  
         wxEndBusyCursor()  
366    
367          return          (catalogEntry) = argList
368    
369      #------------------------------------------------------------------------          if (catalogEntry.isTerminal() ):
370      def witOrgLoader(self,  orgName ):              ver = self.parent.catVersionValueComboBox.GetValue()
371      #------------------------------------------------------------------------              if ( ver == "None" ):
372          wxBeginBusyCursor()                  top = RecoElem( catalogEntry.name() )
373          w=WitFactory()              else:
374          top= w.getRxnByOrg( orgName )                  top = catalogEntry.read( int( ver ) )
375          self.to_re.AddRecoElemTree(self.parent.rootId, top)  
376                self.to_re.addRecoElemTree(self.parent.rootId, top, catalogEntry)
377            else:
378                # current selection is directory. can't load that!
379          wxEndBusyCursor()          wxEndBusyCursor()
380          return          return
381    
     #------------------------------------------------------------------------  
     def seedRecoElemLoader(self,  argList ):  
     #------------------------------------------------------------------------  
         wxBeginBusyCursor()  
   
         (theSeedFactoryMethod, org) = argList  
         top = apply( theSeedFactoryMethod, [org] )  
         # top=self.__seedDataFactory.getRecoElemByOrg( org )  
         self.to_re.AddRecoElemTree(self.parent.rootId, top)  
382    
383          wxEndBusyCursor()          wxEndBusyCursor()
384          return          return
385    
386      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
387      def witPwyLoader(self,  pwyName ):      def DOOMwitPwyLoader(self,  pwyName ):
388      #------------------------------------------------------------------------      #------------------------------------------------------------------------
389          wxBeginBusyCursor()          wxBeginBusyCursor()
390          w=WitFactory()          w=WitFactory()
391          top= w.getRxnByPwy( pwyName )          top= w.getRxnByPwy( pwyName )
392          self.to_re.AddRecoElemTree(self.parent.rootId, top)          self.to_re.addRecoElemTree(self.parent.rootId, top)
393          wxEndBusyCursor()          wxEndBusyCursor()
394          return          return

Legend:
Removed from v.1.20  
changed lines
  Added in v.1.31

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