[Bio] / FigWebPages / ask_CG38.aln Repository:
ViewVC logotype

View of /FigWebPages/ask_CG38.aln

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log


Revision 1.1 - (download) (annotate)
Thu May 14 14:53:09 2009 UTC (10 years, 5 months ago) by dsouza
Branch: MAIN
CVS Tags: rast_rel_2009_05_18, rast_rel_2014_0912, rast_rel_2010_0928, rast_rel_2009_0925, rast_rel_2010_0827, rast_rel_2014_0729, rast_rel_2009_07_09, myrast_33, rast_rel_2011_0928, rast_rel_2010_0526, rast_rel_2010_1206, rast_rel_2010_0118, rast_rel_2011_0119, HEAD
Supplementary material for Evolutionary Cohesion Group Analysis of Aspartokinase paper with Roy Jensen

>Wend_a_|_CG-38
MDKIIIKKFGGTSLTD---LNRVANLIKNDIEKGCNVIVVVSAVAGFTDQMVFQARQI-S
NLSYRQELSEYDVMLSAGEQISCGLLAITLQSIGVNAKSWLAWQLPIVTDDFYSESKIKT
IKIERVKRSFAEGYTAAIIAGFQGIN-DDRITTFGRGGSDISAVAFAVAFGVRTCEIFTD
IDGIYTADPRIVPKARKLKFISYDEMLEMSSSGAKILHNRSVQLAMKHNIKVQVLSTFKE
VEGTTVLHKRDV------------------------------------------------
LERYLITGITYSTNEALVTFTNLA---NNLRTLRDIAGANVKIDMIHGSS---------F
VISKFDIDLMEKLLNKNEN------YAINDNVAKISIIGIGVMSNTEVMHRTLKVLSEKK
IEILAITTSEIKISIIVQKECAVALVKDLHTEYELDMQH-------
>Amar_Aa_|_CG-38
MGRILVKKFGGTSLKDVECILRVANIVRQSVERGHKLVVVVSAMGRFTDEAVTTAQEV-S
ELASEAQLSEYDVVVSSGEQVSCGLLALALQRIDIKATSIMGWQIPINTTGEHSRARIIE
IKPDRILSLLNEH-DVVIVAGFQGIH-NARITTLGRGGSDISAVAIAAALRLDACYMYTD
VAGVYTANPCLVPSARKLDHVTYNDMVEISASGRAILNVRSVEMAMRCGVRIHVMSSSQE
AKGTLVSFGCER-----------------------------------------------E
MESRIITGIAISKKIASVSLGGVPAVPGIAAALLPIAEGNIDVDMIMQTVDGELRN-ITF
TVQEEDLQKTQDILLQHKHNILYESLAVTDSLAKVSLVGACMISRPGVASRVFSALASGG
IAVLAVSTSEIKITVLMHEQSAAPALSLLHEEFALDR-ESVLCT--
>Ecan_Aa_|_CG-38
MERILVKKFGGTSLQDIKCINKVVEIIKQDINNNYKVVVIVSAMGKFTDNIISQIKQI-S
DVKSPSERSEYDLIISSGEQISCGLLSLALQKVGINAQSWLGWQLPIVTTEDHTKARIID
INVNSLQDSLANN-DVAIVAGFQGMHKNNRVTTLGRGGSDTSAVAIAVALGVDLCYIYTD
VDGIYTADPNLVPKAHKLDYITYDEMIEMSSLGAKVLQVRSVEIAMKYNIKLCILSTFNP
GKGTMLCKKGES-----------------------------------------------H
MESQLITGVTCNNKTASITLKQVKTLSGITTVFNAIAEKNINVDMIIQNMNDNNANDITF
TISEEDLPTTKKFLTEIQSELMYQDLIINSEVAKVSIIGVGMISHSGIAYKMFDTLTSNN
IKILAVTTSEIKISVLIYRKDSQLATVALHSAFELDSTESNLYTIS
>Echa_Aa_|_CG-38
MKRILVKKFGGTSLQDIECINRVAEIIKQDVNNNYKVVVVVSAMGKFTDNIISQIKQI-S
DVKSQSERSEYDLIISSGEQISCGLLSLALQKIGINAQSWLGWQLPIVTTEDHTKARIID
INTCSLQDSLANN-DVAIVAGFQGMHKNNRVTTLGRGGSDTSAVAIAAALKVDLCYIYTD
VDGIYTADPNVVPKARKLDYITYDEMIEMSSLGAKVLQVRSVEIAMKYNIKLCILSTFNP
GKGTILRKKGES-----------------------------------------------D
MESQLITGVTCNNKTASITLKEVKAISGVTTVFNAIAEKNINVDMIIQSVNDNNANDITF
TISEEDLPTTTKFLTEIQTELMYQDLIINSEVAKVSIIGVGMISHSGVAYKMFDTLTSNN
IKILAVTTSEIKISVLISRKDSQLATIALHSTFGLDNTESDLHIIS
>Erum_Aa_|_CG-38
MTKILVKKFGGTSLQNIKCINQVTEIIKQDVCSNHKVVVIVSAMGKFTDNIISQIKKI-S
DVKSYNELSEYDLIISSGEQISCGMLSLALQKLGIKAQSWLGWQLPIVTTDDHTKARIME
INTSALQDFLANN-DVAIIAGFQGMHKENRVTTLGRGGSDTSAVAIAAALGIDLCYIYTD
VDGIYTSDPNIVPKARKLDYIAYDEMIEMASLGAKVLQVRSVELAMKYNIKLHVLSTFNS
IKGTILCKKGEI-----------------------------------------------K
MESQLITGITYNSNTASITLKKVRALFGITTLFSIIADNGINVDMIIQNMDNNAND-ITF
TIPEEDLSITETLLIKTKDKLMYEELIINPDVAKVSVIGVGMISHPGIAYKMFDTLTSNN
ITILAVTTSEIKISVLVLRKDGQLATQYLHSSFKLDS-QSNLHTTS
>Otsu_Aa_|_CG-38
MN-IIVQKFGGACVSDTAKIANLVTKVQREIDASNKVIVVVSAMAGITKKLISFCYNLNS
ELYTPETLAEYDSALSSGEIMTASLFALALQQKSIKSRSLHSWQIPIKTNNYHSKAIIID
INTNLIHDMLLQG-IVPVISGFQGITNHNRITTLGRGGSDITAVAIAAALQAKRCDIYTT
VDGVFSADPELIPQACKHDKITYTEMLELASLGSRVVHYRAVQMGMRYNVPIKVIHAFGK
GQGTIIQEIT-------------------------------------------------T
MEQPQITGITYNKDIILVTI-CINDNKQFFLVINHMLKYSVSIEQITNYQLNKVS----I
IIPLSDLTASKKAFDELQNQCIINSYQIN-NVASVSVVGYAIKYNPSIFQQITMVLSKFE
VQILGILALEARISIILNKIDVEPIVAELHHHLISTASSAI-----
>Rbel_Aa_|_CG-38
MA-LIIQKFGGTSVTTIDRIKKIIPIIKAEIAKNNQVIIVVSAMAGVTNQLVTLCNEV-S
SLNKSSQLAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEENINARSFLAWQLPILTDDNHSKALVES
VDTNLLNECLQQN-IIPIIAGFQGINKHNRLATLGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTD
VEGVFAADPRIIPKAKKIDEIDFSEMLELALSGAKVLHSRAAEIVMRYQIDMRILSTFAP
EAGCTLITSKDK-----------------------------------------------I
MEKRIISGITSNKNLLYITIESSS--LNFIQVASIIAQNNNHIEVMQEIEPNKRYS---F
ITNLTDKNSLHILLTNLKNNNQISNFTFDTEIATVSIIGHGIKNDLKLLEVILSKLAKDN
INVQMVQISEIKIILLINDKQVEKTVLDLYDLLKISETGHC-----
>Rcon_Aa_|_CG-38
MA-LIIQKFGGTSVANIDRIKKIVPIIKTEIAKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCNEL-S
SLNNISQFAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEEDIKARSFLAWQLPMLTDNNHSKALVES
ITTDLLEKYLQLN-TIPIIAGFQGINKSNRLTTLGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTD
VEGIFTADPRIIPNAKKIKEIDFLEMLELASSGAQVLHPRAGELVMRYKIDMRVLSTFSP
DTEGTLITSKDK-----------------------------------------------N
MENGIINSITSNKNLLKISVKSMS--LSFLQVANMITQNNNHIEFMQEIKNNEEYS---F
ITNLTDKNNLQALLTNLKDDKQIQYFTFDTEIATISLIGYGIKNDCKLLETILSKLTNDN
INVHMIQLSEVKITLFINDQDTEKTIFNLYNLFKIS----------
>Rfel_Aa_|_CG-38
MA-LIIQKFGGTSVANIDRIKKIAPIIKAEIAKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCNEV-S
SLNNISQFAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEEDIKAQSFLAWQLPILTDNNHSKALVES
ITTDLLEKYLQLN-TVPIIAGFQGTNKSNRLTTLGRGGSDTTAALIAAAMKAKRCDIYTD
VEGIFTADPRIIPNAKKIKEIDFLEMLELASSGAKVLHPRAVELVMRYKIDMRVLSTFSP
NTEGTLITSKDK-----------------------------------------------N
MENGIINSITSNKNLLKISVKSIS--LSFLQVANMITQNNNHIEFMQEIKNNEEYS---F
ITNLTDENNLQALLTNLKNDKQIQDFTFDAEIATISLIGYGIKNDCKVLEMILSKLTKDN
INVNMIQLSEVKITLLINDQDAEKTIFNLYNLFKIS----------
>Rpro_Aa_|_CG-38
MA-LIIQKFGGTSVANVERIKKLVPIIKAEIAKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCNEV-S
SLNKRSQFAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEEEIKAQSLLAWQLPIRTNNNYSKALVEF
ITTDLLEKYLQLK-IIPIIAGFQGINKSNRVTTLGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTD
VDGIFTADPRIIPNAKRIKEIDFLEMLELASSGAKVLHPRAVELVMRYKIDMRVLSTFSP
NTEGTLITSKDTIPLVKSTY--MEESALNTKHSTKIDIPEDASGSTYKLPIELALQNRYN
MENCVVRCITSNKNLLKVSVNSIS--LSFLQVANMITYNNNCIEFMQEIENNIEYN---F
ITNLTDKNNLQTLLTKCKNNKQIQDFTFDTEIATISLIGYGIKNDCKLLTMILSQLTQDN
INVHMMQLSEVKITLLINDKDVEKTIFNLYNLFKIS----------
>Rtyp_Aa_|_CG-38
MA-LIIQKFGGTSVANIERIKKLVPIIKAEITKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCSEV-S
SLNKISQFAEYDVALSSGEIVTAALLALALQEEEIQAQSLLAWQLPILTNNNHSKALVEF
ITTDLLEKCLQLK-IIPIIAGFQGINKSNRITTFGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTD
VDGIFTADPRIIPNAKRIKEIDFLEMLELASSGAKVLHPRAVELVMRYKIDMRVLSTFLP
NTEGTLITSKDTTPLVKSTYMDMEESAKNIKRSTKINIPDDTSGLTYKLPIELALQNRYN
MENCIIRGITSNKNLLKVSVNTIT--LSFLQVANMITYNNNCIEFMQEIKNNIEYN---F
ITNLTDKNNLQTLLTNCKNNKQIQNFTFDTEIATISLIGYGIKNDCKLLEMILSQLTQDN
INVNMMQLSEVKITLLINDKDVEKTISNLYNLFKIS----------

MCS Webmaster
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3