[Bio] / FigKernelScripts / load_features.pl Repository:
ViewVC logotype

Diff of /FigKernelScripts/load_features.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1.3, Tue Dec 23 19:43:42 2003 UTC revision 1.4, Fri Dec 26 04:25:44 2003 UTC
# Line 43  Line 43 
43                              );                              );
44      }      }
45    
     $dbf->create_index( idx  => "features_org_ix",  
                         tbl  => "features",  
                         type => "btree",  
                         flds => "genome" );  
     $dbf->create_index( idx  => "features_type_ix",  
                         type => "btree",  
                         tbl  => "features",  
                         flds => "type" );  
     $dbf->create_index( idx  => "features_beg_ix",  
                         type => "btree",  
                         tbl  => "features",  
                         flds => "genome,contig,minloc" );  
   
46      @genomes = $fig->genomes;      @genomes = $fig->genomes;
47  }  }
48  else  else
# Line 127  Line 114 
114  $dbf->load_table( tbl => "features",  $dbf->load_table( tbl => "features",
115                    file => "$temp_dir/tmpfeat$$" );                    file => "$temp_dir/tmpfeat$$" );
116    
117  if (@ARGV == 0) {  $dbf->vacuum_it("features") }  if (@ARGV == 0)
118    {
119        $dbf->create_index( idx  => "features_org_ix",
120                            tbl  => "features",
121                            type => "btree",
122                            flds => "genome" );
123        $dbf->create_index( idx  => "features_type_ix",
124                            type => "btree",
125                            tbl  => "features",
126                            flds => "type" );
127        $dbf->create_index( idx  => "features_beg_ix",
128                            type => "btree",
129                            tbl  => "features",
130                            flds => "genome,contig,minloc" );
131    
132        $dbf->vacuum_it("features") }
133    }
134  unlink("$temp_dir/tmpfeat$$");  unlink("$temp_dir/tmpfeat$$");
Legend:
Removed from v.1.3  
changed lines
  Added in v.1.4
MCS Webmaster
 ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3