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1 : golsen 1.5 # This is a legacy file and will be deleted soon. Nothing
2 :     # should refer to it. The current module name is RNA_reps_SSU_rRNA.pm
3 :     #
4 :     # SSU_rRNA_reps
5 :     #
6 : golsen 1.4 package RNA_reps;
7 : overbeek 1.1 use strict;
8 :     use gjoseqlib;
9 :    
10 : golsen 1.4 our @RNA_reps = read_fasta( \*DATA );
11 :     our $assignment = 'SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA';
12 :     our $tag = 'SSU_rRNA';
13 :     our $max_expect = 1e-20;
14 : golsen 1.5 our $max_exptrapolate = 15;
15 : golsen 1.4 our $min_coverage = 0.20;
16 : overbeek 1.1
17 :     __DATA__
18 :     >E.coli Escherichia coli K12 [gi|49175990 223771-225312]
19 :     AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA
20 :     GTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAA
21 :     TGTCTGGGAAACTGCCTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCAT
22 :     AACGTCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCGGATGTGCCCAGATG
23 :     GGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGA
24 :     GGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGG
25 :     GGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCT
26 :     TCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATT
27 :     GACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAG
28 :     GGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCA
29 :     GATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCTGATACTGGCAAGCTTGAGTCTC
30 :     GTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGGAGGAATACC
31 :     GGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCA
32 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCC
33 :     CTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCA
34 :     AGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAAT
35 :     TCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGA
36 :     TTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGA
37 :     AATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGC
38 :     CGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC
39 :     ATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAAGCG
40 :     ACCTCGCGAGAGCAAGCGGACCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAAC
41 :     TCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGT
42 :     TCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGT
43 :     AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAA
44 :     CAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTA
45 :     >Pseu.aerug Pseudomonas aeruginosa PAO1 [gi|15595198 722096-723631]
46 :     GAACTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA
47 :     GTCGAGCGGATGAAGGGAGCTTGCTCCTGGATTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTA
48 :     GGAATCTGCCTGGTAGTGGGGGATAACGTCCGGAAACGGGCGCTAATACCGCATACGTCC
49 :     TGAGGGAGAAAGTGGGGGATCTTCGGACCTCACGCTATCAGATGAGCCTAGGTCGGATTA
50 :     GCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCGTAACTGGTCTGAGAGGATGA
51 :     TCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATA
52 :     TTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGAT
53 :     TGTAAAGCACTTTAAGTTGGGAGGAAGGGCAGTAAGTTAATACCTTGCTGTTTTGACGTT
54 :     ACCAACAGAATAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCA
55 :     AGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGTGGTTCAGCAAGTTGGATGTG
56 :     AAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCCAAAACTACTGAGCTAGAGTACGGTAGAG
57 :     GGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACACCAGTGGC
58 :     GAAGGCGACCACCTGGACTGATACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGG
59 :     ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGAG
60 :     ATCTTAGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTA
61 :     AAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAG
62 :     CAACGCGAAGAACCTTACCTGGCCTTGACATGCTGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTG
63 :     CCTTCGGGAACTCAGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
64 :     GGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTACCAGCACCTCGGGTGGGCA
65 :     CTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATG
66 :     GCCCTTACGGCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAGGGTTGCCAAGCCG
67 :     CGAGGTGGAGCTAATCCCATAAAACCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACT
68 :     GCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGG
69 :     GCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGCTAGTCTA
70 :     ACCGCAAGGGGGACGGTTACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGT
71 :     AGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
72 :     >Xyle.fasti Xylella fastidiosa Dixon [fig|155919.1.rna.046]
73 :     TAAGTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA
74 :     GTCGGACGGCAGCACATTGGTAGTAATACCATGGGTGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGGAA
75 :     TACATCGGAATCTACCTTATCGTGGGGGATAACGTAGGGAAACTTACGCTAATACCGCAT
76 :     ACGACCTACGGGTGAAAGCAGGGGACCTTAGGGCCTTGTGCGATTGGATGAGCCGATGTC
77 :     CGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGA
78 :     GGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGG
79 :     GGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCTATGCCGCGTGGGTGAAGAATGCCT
80 :     TCGGGTTGTAAAGCCCTTTTGTTGGGGAAGAAAAGCAATTGGTTAATACCTAGTTGTTAT
81 :     GACGGTACCCAAAGAATAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAG
82 :     GGTGCAAGCGTTACTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGTGGTTATTTAAGTCT
83 :     GTTGTGAAAGCCCTGGGCTTAACCTGGGAATGGCAGTGGATACTGGATAGCTAGAGTGTG
84 :     GTAGAGGGTAGCGGAATTCCTGGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATCAGGAGGAACATC
85 :     CGTGGCGAAGGCGGCTACCTGGGCCAACACTGACACTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCA
86 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGCGAACTGGATGTTGAGTGC
87 :     AAATTGGCACTCAGTATCGAAGCTAACGCGTTAAGTTCGCCGCCTGGGGAGTACGGTCGC
88 :     AAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAA
89 :     TTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCTGCGGAACTTTCCAGAGATGG
90 :     ATTGGTGCCTTCGGGAGCCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTG
91 :     AGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCCAGCACGTAAT
92 :     GGTGGGAACTTTAAGGAGACTGCCGGTGACAAATCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAG
93 :     TCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTACTACAATGGTAGGGACAGAGGGCTG
94 :     CGATCTCGCGAGGGTGAGCTAATCCCAGAAACCCTATCTCAGTCCGGATTGGAGTCTGCA
95 :     ACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCTGCGGTGAATA
96 :     CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTTGTTGCACCAGAAGCA
97 :     GGTAGCTTAACCGCGAGGAGGGCGCTTGCCACGGTGTGGCCGATGACTGGGGTGAAGTCG
98 :     TAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
99 :     >Nitr.ocean Nitrosococcus oceani ATCC 19707 [fig|323261.3.rna.51]
100 :     AAACTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCAA
101 :     GTCGAACGGCAGCAGCACCTAAGCTTGCTTAGGTGGCTGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGT
102 :     AACGCGTGGGAATCTGGCCTCTAGAGGGGGATAACTCGGGGAAACTCGGGCTAATACCGC
103 :     ATAATCTCTAAGGAGGAAAGCGGGGGACCGAAAGGCCTCGCGCTGGGGGATGAGCCTGCG
104 :     TCCGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAGGGCCTACCAAGGCGATGATCGGTAGCTGGTCTGA
105 :     GAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
106 :     GGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGGGTGAAGAAGGC
107 :     TTTCGGGTTGTAAAGCCCTTTCAGTGGGGAAGAAAAGCGATGTGTGAATAGCACATCGTG
108 :     TTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGG
109 :     AGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTTGGTAAGT
110 :     TGGGTGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAATGGCACTTGATACTGCCTGGCTAGAGTA
111 :     TGGTAGAGGGAGGCGGAATTTCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGAAGGAACA
112 :     CCAGTGGCGAAGGCGGCCTCCTGGACCACTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAG
113 :     CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGAGAACTAGACGTTGGGA
114 :     GGGATAGCCTTTCAGTGTTGCAGCTAACGCGTTAAGTTCTCCGCCTGGGGAGTACGGCCG
115 :     CAAGGTTGAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTA
116 :     ATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGCCTTGACATCCCCGGAACTTTGCTGAGAGG
117 :     CGAAGGTGCCTTCGGGAGCCGGGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGT
118 :     GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTCTAGTTGCCAGCGGTTCG
119 :     GCCGGGCACTCTAGAGGGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAG
120 :     TCATCATGGCCCTTATGGCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGTGG
121 :     CCAAGCAGCGATGCGGAGCTAATCTCAGAAAACCGGTCGTAGTCCGGATTGCAGTCTGCA
122 :     ACTCGACTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCAATGCCGCGGTGAATA
123 :     CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTGCACCAGAAGTG
124 :     GGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTTACTACGGTGTGGTCAATGACTGGGGTGAAGTCG
125 :     TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
126 :     >Fran.talar Francisella tularensis subsp. tularensis Schu 4 [gi|56707187 c1379589-1378063]
127 :     AAACTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGTGGCATGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGT
128 :     AACAGGTCTTAGGATGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGGAATCTGCCCATTTGAGGGGG
129 :     ATACCAGTTGGAAACGACTGTTAATACCGCATAATATCTGTGGATTAAAGGTGGCTTTCGGGCTGTCGCA
130 :     GATGGATGAGCCTGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAGGGCCCACCAAGGCTACGATCCATAGCTG
131 :     ATTTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGG
132 :     AATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCAATGCCATGTGTGTGAAGAAGGCCCTAGGGTTGTAAA
133 :     GCACTTTAGTTGGGGAGGAAAGCCTCAAGGTTAATAGCCTTGGGGAGGACGTTACCCAAAGAATAAGCAC
134 :     CGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAA
135 :     AGGGTCTGTAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCAGGGCTCAACCTTGGAACTGCATTTGATAC
136 :     TGGCAAACTAGAGTACGGTAGAGGAATGGGGAATTTCTGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCAGAAG
137 :     GAACACCAATGGCGAAGGCAACATTCTGGACCGATACTGACACTGAGGGACGAAAGCGTGGGGATCAAAC
138 :     AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGAGTACTAGCTGTTGGAGTCGGTGTAAAGGCTC
139 :     TAGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTACTCCGCCTGGGGACTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAAT
140 :     TGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTC
141 :     TTGACATCCTGCGAACTTTCTAGAGATAGATTGGTGCCTTCGGGAACGCAGTGACAGGTGCTGCACGGCT
142 :     GTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGATAGTTACCA
143 :     TCATTAAGTTGGGTACTCTATTGAGACTGCCGCTGACAAGGCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCA
144 :     TCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGGTATTACAGAGGGCTGCGAAGGTGCGAGC
145 :     TGGAGCGAAACTCAAAAAGGTACTCTTAGTCCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGTCGGAAT
146 :     CGCTAGTAATCGCAGGTCAGAATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACAC
147 :     CATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGATAGCTTAACGAATGGGCGTTTACCACGGAGTGATTCATGACT
148 :     GGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
149 :     >Thsp.cruno Thiomicrospira crunogena XCL-2 [fig|317025.3.rna.52]
150 :     ATTAAACTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG
151 :     CAAGTCGGACGGAAACGACAAGAACAATCACTTCGGTGTGCGTTTTTGGGCGTCGAGTGG
152 :     CGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAATCTACCCTTTAGTTGGGGACAACATATGGAAACGT
153 :     ATGCTAATACCGAATATGCTCTACGGAGTAAAGGTGCCCTCTCCTTGGAAGGTATCGCTA
154 :     AAGGATGAGCCCGCGTTAGATTAGCTAGTTGGTAAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGACGAT
155 :     CTATAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCT
156 :     ACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGAGGGAAACCTTGATGCAGCCATGCCGC
157 :     GTGTGTGAAGAAGGCCCGAGGGTTGTAAAGCACTTTCAATTGTGAGGAAGATTAAGTAGC
158 :     TAATACCTGCTTAGTTTGACGTTAACTTTAGAAGAAGCACCGGCTAACTCTGTGCCAGCA
159 :     GCCGCGGTAATACAGAGGGTGCAAGCGTTATTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTA
160 :     GGCGGACTGTTAAGTCGGTTGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTAGGAACTGCATCCGATAC
161 :     TGGCAATCTAGAGTTTAAGAGAGGGAAGTGGAATTCCAGGTGTAGCAGTGAAATGCGTAG
162 :     ATATCTGGAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGACTTCCTGGCTTAAAACTGACGCTGAGGTG
163 :     CGAAAGCTTGGGTAGCGAACGGGATTAGATACCCCGGTAGTCCAAGCCGTAAACGATGTC
164 :     AACTAGCTGTTGGCCTTATTAAAAAGGTTAGTAGCGTAGCTAACGCGATAAGTTGACCGC
165 :     CTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGG
166 :     TGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCATCCCTTGACATCCTGC
167 :     GAACTTTCTAGAGATAGATTGGTGCCTTCGGGAACGCAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGT
168 :     CGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCATT
169 :     AGTTGCTAACATTCAGTTGAGAACTCTAATGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGC
170 :     GGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGG
171 :     GGGTACAAAGAGCAGCCAACTGGCGACAGTGCGCGAATCTCATAAAACCTCTCGTAGTCC
172 :     GGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
173 :     TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGG
174 :     TTGCAAAAGAAGTGGGTAGTCTAACCTTCGGGAGGGCGCTCACCACTTTGTGATTCATGA
175 :     CTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCCTAGCGGAAGCTGGGGCTGGATCACCTCCTTTA
176 :     >Nies.menin Neisseria meningitidis MC58 [gi|15675948 60971-62514]
177 :     TGAACATAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCA
178 :     AGTCGGACGGCAGCACAGAGAAGCTTGCTTCTCGGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTA
179 :     ACATATCGGAACGTACCGAGTAGTGGGGGATAACTGATCGAAAGATCAGCTAATACCGCA
180 :     TACGTCTTGAGAGAGAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTGCGCTATTCGAGCGGCCGATAT
181 :     CTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCGGGTCTGAG
182 :     AGGATGATCCGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG
183 :     GGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTCTGAAGAAGGCC
184 :     TTCGGGTTGTAAAGGACTTTTGTCAGGGAAGAAAAGGCTGTTGCTAATATCAGCGGCTGA
185 :     TGACGGTACCTGAAGAATAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTA
186 :     GGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGGGCGCAGACGGTTACTTAAGCA
187 :     GGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCCGGGAACTGCGTTCTGAACTGGGTGACTCGAGTGT
188 :     GTCAGAGGGAGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATAC
189 :     CGATGGCGAAGGCAGCCTCCTGGGACAACACTGACGTTCATGCCCGAAAGCGTGGGTAGC
190 :     AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAATTAGCTGTTGGGCA
191 :     ACCTGATTGCTTGGTAGCGTAGCTAACGCGTGAAATTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGC
192 :     AAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAA
193 :     TTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGTACGGAATCCTCCGGAGACGG
194 :     AGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTG
195 :     AGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAGTTGCCATCATTCAGT
196 :     TGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC
197 :     CTCATGGCCCTTATGACCAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGTACAGAGGGTAGCC
198 :     AAGCCGCGAGGCGGAGCCAATCTCACAAAACCGATCGTAGTCCGGATTGCACTCTGCAAC
199 :     TCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGT
200 :     TCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGGGATACCAGAAGTAGGT
201 :     AGGATAACCACAAGGAGTCCGCTTACCACGGTATGCTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAA
202 :     CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
203 :     >Rals.solan Ralstonia solanacearum GMI1000 [gi|17544719 1532698-1534234]
204 :     GAACTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTTACACATGCAAGTCGAACGGC
205 :     AGCGGGGGTAGCTTGCTACCTGCCGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTGCCCTGTAG
206 :     TGGGGGATAACTAGTCGAAAGACTAGCTAATACCGCATACGACCTGAGGGTGAAAGTGGGGGACCGCAAG
207 :     GCCTCATGCTATAGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCCACCAAGGCGACGA
208 :     TCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
209 :     AGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTC
210 :     GGGTTGTAAAGCACTTTTGTCCGGAAAGAAATCGCACTGGTTAATACCTGGTGTGGATGACGGTACCGGA
211 :     AGAATAAGGACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTCCAAGCGTTAATCGGAATT
212 :     ACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTGTGCAAGACCGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAATT
213 :     GCATTGGTGACTGCACGGCTAGAGTGTGTCAGAGGGAGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTA
214 :     GAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAAGGCAGCCTCCTGGGATAACACTGACGCTCATGCACGAAAGCGT
215 :     GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTTGGGGATTC
216 :     ATTTCCTTAGTAACGTAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCA
217 :     AAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTA
218 :     CCTACCCTTGACATGCCACTAACGAAGCAGAGATGCATTAGGTGCTCGAAAGAGAAAGTGGACACAGGTG
219 :     CTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCT
220 :     CTAGTTGCTACGAAAGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCA
221 :     AGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTGCATACAGAGGGTTGCCAAGCCG
222 :     CGAGGTGGAGCTAATCCCAGAAAATGCATCGTAGTCCGGATCGTAGTCTGCAACTCGACTACGTGAAGCT
223 :     GGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGT
224 :     CACACCATGGGAGTGGGCTTTACCAGAAGTAGTTAGCCTAACCGCAAGGAGGGCGATTACCACGGTAGGG
225 :     TTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTA
226 :     >Agro.tumef Agrobacterium tumefaciens str. C58 [fig|176299.3.rna.63]
227 :     TCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCA
228 :     AGTCGAACGCCCCGCAAGGGGAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAATCTACCCAT
229 :     CTCTGCGGAATAGCTCTGGGAAACTGGAATTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGA
230 :     TTTATCGGGGATGGATGAGCCCGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCA
231 :     AGGCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGC
232 :     CCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCA
233 :     GCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCACCGATGAAGATA
234 :     ATGACGGTAGTCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGA
235 :     AGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATATTTAAGT
236 :     CAGGGGTGAAATCCCGCAGCTCAACTGCGGAACTGCCTTTGATACTGGGTATCTTGAGTA
237 :     TGGAAGAGGTAAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACA
238 :     CCAGTGGCGAAGGCGGCTTACTGGTCCATTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAG
239 :     CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGTTAGCCGTCGGGC
240 :     AGTATACTGTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGC
241 :     AAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA
242 :     TTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATTCGGGGTATGGGCATTGGAGAC
243 :     GATGTCCTTCAGTTAGGCTGGCCCCAGAACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGT
244 :     CGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCAGCATT
245 :     TAGTTGGGCACTCTAAGGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTC
246 :     AAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGGTGACAGTGGG
247 :     CAGCGAGACAGCGATGTCGAGCTAATCTCCAAAAGCCATCTCAGTTCGGATTGCACTCTG
248 :     CAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATGCTGCGGTGAAT
249 :     ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAAGG
250 :     TAGTGCGCTAACCGCAAGGAGGCAGCTAACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTC
251 :     GTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
252 :     >Rhod.rubru Rhodospirillum rubrum [fig|1085.1.rna.053]
253 :     GATCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG
254 :     CAAGTCGAACGCATCCTTCGGGATGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTAC
255 :     CTTGGAGTGCGGAATAATCTTTGGAAACGAGGACTAATACCGCATACGCCCTTAGGGGGA
256 :     AAGATTTATCGCTCCAAGATCGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGCGGGGTAATGGCCC
257 :     ACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGGCCAGCCACACTGGGACTGAGACA
258 :     CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGCAACCCTGA
259 :     CGCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCGGGTGTGAA
260 :     GATGATGACGGTAACACCAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
261 :     ACGAAGGGGGCAAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGCGCGTAGGCGGTCTGAT
262 :     TAGTCAGAGGTGAAATCCCAGAGCTCAACTTTGGAACTGCCTTTGATACTGTTAGACTAG
263 :     AATCCGTGAGAGGGTGGTGGAATTCCCAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTGGGAGG
264 :     AACACCAGTGGCGAAGGCGGCCACCTGGCGCGGTATTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGG
265 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGATGTC
266 :     GGGGTACATGTACCTCGGTGTCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGG
267 :     CCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGT
268 :     TTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCCGTGACACTTCCAGAG
269 :     ATGGAAGGTTCCCTTCGGGGACACGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGT
270 :     CGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCATCTTCAGTTGCCAGCAAG
271 :     TAACGTTGGGCACTCTGAAGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGT
272 :     CAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCCTACAATGG
273 :     GCAGCGACCTCGCGAGGGGAAGCTAATCTCCAAAAGGCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCT
274 :     GCAACTCGGGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAA
275 :     TACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCCGAAG
276 :     ACGGTACGCTAACCGCAAGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGT
277 :     CGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCA
278 :     >Sili.pomer Silicibacter pomeroyi DSS-3 [fig|246200.3.rna.62]
279 :     TTAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCA
280 :     AGTCGAGCGCGCCCTTCGGGGTGAGCGGCGGACGGGTTAGTAACGCGTGGGAACGTACCC
281 :     TTTGGTAGGGAATAGCCACTGGAAACGGTGAGTAATACCCTATGAGCCCTTCGGGGGAAA
282 :     GATTTATCGCCAAAGGATCGGCCCGCGTTAGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTAC
283 :     CAAGCCTACGATCTATAGCTGGTTTTAGAGGATGATCAGCAACACTGGGACTGAGACACG
284 :     GCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATC
285 :     CAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTAGGGTCGTAAAGCTCTTTCGCCTGTGAAGA
286 :     TAATGACGGTAGCAGGTAAAGAAACCCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATAC
287 :     GGAGGGGGTTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGACCAGAAA
288 :     GTTGGGGGTGAAATCCCGGGGCTCAACCCCGGAACTGCCTCCAAAACTCCTGGTCTTGAG
289 :     TTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAA
290 :     CACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGTGTGGGG
291 :     AGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACACCGTAAACGATGAATGCCAGTCGTCGG
292 :     GTAGCATGCTGCTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGCC
293 :     GCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTT
294 :     AATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATCCTCGGACCGTCCCAGAGAT
295 :     GGGTCTTTCACTTCGGTGACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCG
296 :     TGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACACCCTTAGTTGCCAGCATTCA
297 :     GTTGGGCACTCTAGGGGAACTGCCCGTGATAAGCGGGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAG
298 :     TCCTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTA
299 :     ATCCCAAAAAACTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAA
300 :     TCGCTAGTAATCGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC
301 :     GCCCGTCACACCATGGGAGTTGGGTCTACCCGAAGACGGTGCGCCAACCTTTCGAGGAGG
302 :     CAGCTGGCCACGGTAGGCTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGA
303 :     ACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
304 :     >Magn.MC-1 Magnetococcus sp. MC-1 [fig|156889.1.rna.046]
305 :     TTTTGTGTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGTTGGTGGCATGCTTAACACATG
306 :     CAAGTCGAACGGTAGCAGGCCCTTCGGGGTGCTGACGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGC
307 :     GTGGATGACCTACCCAGATGTGGGGGACAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGCATAA
308 :     TCCCTAAGGGGGAAAGGCTTAGGCCGCATTTGGAGGGGTCCGCGTTGGATTAGGTAGTTG
309 :     GTGGGGTAAAGGCCTACCAAGCCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
310 :     ACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAA
311 :     TGGGGGAAACCCTGACGCAGCAATGCCACGTGAATGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGT
312 :     TCTTTTAGTAGGGAAGATAGTGACGGTACCTACAGAAAAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCC
313 :     AGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCAAACGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCG
314 :     CGTAGGCGGTTATCTAAGCCAGAAGTGAAATCTCGGGGCTCAACCTCGAAACTGCTTTTG
315 :     GAACTGGAAGACTAGAATCCGGTAGAGGATGGTGGAATTCCCCGTGTAGAGGTGAAATTC
316 :     GTAGATATGGGGAGGAACACCGGAGGCGAAGGCGGCCATCTGGGCCGGTATTGACGCTGA
317 :     GGCGCGAAAGTGTGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACACCGTAAACGA
318 :     TGAGTGCTAGTAGTTGCGGGTATCGACCCCTGCGGCTACGAAGTTAACACGATAAGCACT
319 :     CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAA
320 :     GCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGCTTTTGACATC
321 :     CTTGGAACCTTACGGAGACGTAGGGGTGCTTTTCGGAGAACCAAGTGACAGGTGCTGCAT
322 :     GGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCT
323 :     GCCTTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAGAGGAACTGCCGGTGTTAAGCCGGAG
324 :     GAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGGGCAGGGCTACACACGTGCTAC
325 :     AATGGCGGATACAGAGGGCGGCGAAGCAGTGATGTGGAGCGAATCTCTTAAAGTCCGTCT
326 :     CAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGA
327 :     TCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGG
328 :     AGTTGGTTTTACCCGAAGCCGGTGGCCTAACCTTTCGAGGGGGGAGCTGTCTACGGTAAG
329 :     ATCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCAC
330 :     CTCCTTTCTA
331 :     >Gluc.oxyda Gluconobacter oxydans 621H [fig|290633.1.rna.44]
332 :     TGAACCTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCA
333 :     AGTCGCACGAAGGTTTCGGCCTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGGGATCTATCC
334 :     ACGGGTGGGGGACAACTTCGGGAAACTGGAGCTAATACCGCATGATACCTGAGGGTCAAA
335 :     GGCGCAAGTCGCCTGTGGAGGAACCTGCGTTCGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCT
336 :     ACCAAGGCGATGATCGATAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACA
337 :     CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGA
338 :     TCCAGCAATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGATTGTAAAGCACTTTCGACGGGGAC
339 :     GATGATGACGGTACCCGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
340 :     ACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATGACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTGTTA
341 :     CAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCATTTGATACGTGACGACTAG
342 :     AGTTCGAGAGAGGGTTGTGGAATTCCCAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTGGGAAG
343 :     AACACCGGTGGCGAAGGCGGCAACCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGG
344 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGTGTGCTGGATGTT
345 :     GGGAAACTTAGTTTCTCAGTGTCGAAGCTAACGCGCTAAGCACACCGCCTGGGGAGTACG
346 :     GCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGG
347 :     TTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGGGCTTGCATGGGGAGGACCGGTTCAGA
348 :     GATGGACCTTTCTTCGGACCTCCCGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCG
349 :     TGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTTAGTTGCCAGCACTTT
350 :     CAGGTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCA
351 :     AGTCCTCATGGCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGA
352 :     AGCTACATGGTGACATGGTGCTGATCTCTAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGTACTCTGC
353 :     AACTCGAGTACATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATA
354 :     CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCGACCTTAAGCC
355 :     GGTGAGCGAACCGCAAGGACGCAGCCGACCACGGACGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCG
356 :     TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCA
357 :     >C.Pela.ubi Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 [gi|71082709 511358-512832]
358 :     TAACTTGAGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAA
359 :     GTAGCAATACTTAGTGGCAGACGGGTGAGTAACATGTGGGTATCTACCCTTTGGCCTGGAATAACACGAG
360 :     GAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGTCTTTACGGAGAAAGCTTTATGCACCATTGGATGAGCCCGCACTT
361 :     GATTAGTTTGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGACTATGATCAATAGCTGATTTGAGAGGATGATCAGC
362 :     CACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCACAATGGAGGA
363 :     AACTCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTTGGGTTGTAAAGCTCTTTCGTCGGGGAAGA
364 :     AAATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGACCT
365 :     AGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCTTAAAGAGTTCGTAGGTGGTTGAAAAAGTTGGTGGTGAAATCCCAGA
366 :     GCTTAACTCTGGAACTGCCATCAAAACTTTTCAGCTAGAGTATGATAGAGGAAAGCAGAATTTCTAGTGT
367 :     AGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGAAAGAATACCAATTGCGAAGGCAGCTTTCTGGATCATTACTGACAC
368 :     TGAGGAACGAAAGCATGGGTAGCGAAGAGGATTAGATACCCTCGTAGTCCATGCCGTAAACGATGTGTGT
369 :     TAGACGTTGGAAATTTATTTTCAGTGTCGCAGGGAAACCGATAAACACACCGCCTGGGGAGTACGACCGC
370 :     AAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTAGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGATA
371 :     CGCGCAGAACCTTACCAACACTTGACATGTTCGTCGCGACTCTAAGAGATTAGAGTTTTCGGTTCGGCCG
372 :     GACGAAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGA
373 :     GCGCAACCCTCACTTTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTGAAAGAACTGCCAGTGATAAGCTGGA
374 :     GGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCATC
375 :     TACAACAGGAAGCAAAACGGCAACGTTAAGCAAATCCCGAAAAGATGCCTCAGTTCGGATTGCACTCTGC
376 :     AACTCGAGTGCATGAAGCTGGAATTACTAGTAATCGTGGATCAGCGTGCCACGGTGAATGCGTTCCCGGG
377 :     TCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTTAAGGCAAGGTTTTAAACCCTTGACC
378 :     ACGGTATAGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATTACCT
379 :     CCTTT
380 :     >Rick.prowa Rickettsia prowazekii str. Madrid E [fig|272947.1.rna.25]
381 :     ATCAAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTATCGGTATGCTTAACACATG
382 :     CAAGTCGAACGGATTAACTAGAGCTCGCTTTAGTTAATTAGTGGCAGACGGGTGAGTAAC
383 :     ACGTGGGAATCTACCCATCAGTACGGAATAACTTTTAGAAATAAAAGCTAATACCGTATA
384 :     TTCTCTACGGAGGAAAGATTTATCGCTGATGGATGGGCCCGCGTCAGATTAGGTAGTTGG
385 :     TGAGGTAATGGCTCACCAAGCCGACGATCTGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACA
386 :     CTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAAT
387 :     GGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATACCGAGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCT
388 :     CTTTTAGCAAGGAAGATAATGACGTTACTTGCAGAAAAAGCCCCGGCTAACTCCGTGCCA
389 :     GCAGCCGCGGTAAGACGGAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGTGC
390 :     GTAGGCGGTTTAGTAAGTTGGAAGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCTCGGAATTGCTTTCAA
391 :     AACTACTAATCTAGAGTGTAGTAGGGGATGATGGAATTCCTAGTGTAGAGGTGAAATTCT
392 :     TAGATATTAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGTCATCTGGGCTACAACTGACGCTGAT
393 :     GCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGAT
394 :     GAGTGCTAGATATCGGAGGATTCTCTTTCGGTTTCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGC
395 :     CTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCTCGCACAAGCGG
396 :     TGGAGCATGCGGTTTAATTCGATGTTACGCGAAAAACCTTACCAACCCTTGACATGGTGG
397 :     TTACGGATTGCAGAGATGCTTTCCTTCAGTTCGGCTGGGCCACACACAGGTGTTGCATGG
398 :     CTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTAT
399 :     TCTTATTTGCCAGTGGGTAATGCCGGGAACTATAAGAAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAG
400 :     GAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACGCGTGCTAC
401 :     AATGGTGTTTACAGAGGGAAGCAATACGGTGACGTGGAGCAAATCCCTAAAAGACATCTC
402 :     AGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGAT
403 :     CAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACTGCCCGTCACGCCATGGGA
404 :     GTTGGTTTTACCTGAAGGTGGTGAGCTAACGCAAGAGGCAGCCAACCACGGTAAAATTAG
405 :     CGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACTGCGGCTGGATTACCTCCTT
406 :     A
407 :     >Ehrl.canis Ehrlichia canis str. Jake [fig|269484.4.rna.37]
408 :     GTCAAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAAGCCTAACACATG
409 :     CAAGTCGAACGGACAATTATTTATAGCCTCTGGCTATAGGAAATTGTTAGTGGCAGACGG
410 :     GTGAGTAATGCGTAGGAATCTACCTAGTAGTACGGAATAGCCATTAGAAATGGTGGGTAA
411 :     TACTGTATAATCCCCGAGGGGGAAAGATTTATCGCTATTAGATGAGCCTACGTTAGATTA
412 :     GCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTTACCAAGGCTATGATCTATAGCTGGTCTGAGAGGACGA
413 :     TCAGCCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATA
414 :     TTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCTATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGT
415 :     TGTAAAACTCTTTCAATAGGGAAGATAATGACGGTACCTATAGAAGAAGTCCCGGCAAAC
416 :     TCTGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCAAGCGTTGTTCGGAATTATTGGGCGT
417 :     AAAGGGCACGTAGGTGGACTAGTAAGTTAAAAGTGAAATACCAAAGCTTAACTTTGGAGC
418 :     GGCTTTTAATACTGCTAGACTAGAGGTCGAAAGAGGATAGCGGAATTCCTAGTGTAGAGG
419 :     TGAAATTCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTATCTGGTTCGATACT
420 :     GACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCT
421 :     GTAAACGATGAGTGCTAAATGTGAGGATTTTATCTTTGTATTGTAGCTAACGCGTTAAGC
422 :     ACTCCGCCTGGGGACTACGGTCGCAAGACTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCA
423 :     ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCTACGCGAAAAACCTTACCACTTTTTGA
424 :     CATGAAGGTCGTATCCCTCCTAACAGGGGGAGTCAGTTCGGCTGGACCTTACACAGGTGC
425 :     TGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA
426 :     CCCTCATTCTTAGTTACCAACAGGTAATGCTGGGCACTCTAAGGAAACTGCCAGTGATAA
427 :     ACTGGAGGAAGGTGGGGATGATGTCAAATCAGCACGGCCCTTATAGGGTGGGCTACACAC
428 :     GTGCTACAATGGCAACTACAATAGGTTGCGAGACCGCAAGGTTTAGCTAATCCATAAAAG
429 :     TTGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGAAACTCGAGAGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAAT
430 :     CGTGGATCATCACGCCACGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACTGCCCGTCACGC
431 :     CATGGGAATTGGCTTAACTCGAAGCTGGTGTGCTAACCGCAAGGAAGCAGCCATTTAAGG
432 :     TTGGGTTAGTGACTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCTGTAGGTGAACCTGCGGCTGGA
433 :     TTACCTCCTTTTA
434 :     >Desu.desul Desulfovibrio desulfuricans G20 [fig|207559.3.rna.70]
435 :     TTCTAACTGGAGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG
436 :     CAAGTCGTACGCGAAAGTTCCTTCGGGAATGAGTAAAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCG
437 :     TGGATTATCTACCTGCATCACCGGAATAACGGTTGGAAACGACTGCTAATGCCGGATAGT
438 :     CTTGAAAGGGTAAAGGGGGCCTCTGCTTGCAAGCTTCCGGGTGCTGATGAGTCCGCGTCT
439 :     GATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATCAGTAGCAGGTTTGAGAG
440 :     GATGACCTGCCACACTGGGACTGGAACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGG
441 :     GAATATTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGGAGGATGAAGGCCTT
442 :     CGGGTCGTAAACTCCTGTCAAGAGGGAAGAACCGTATGCGGAATAATACGCCGCATGCCT
443 :     GACGGTACCTCTAGAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAG
444 :     GGTGCAAGCGTTAATCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGCTTGGTAAGTCA
445 :     GGTGTGAAAGCCCCCGGCCCAACCGGGGAATTGCACTTGATACTGCTAGGCTAGAGTTCA
446 :     GGAGAGGGTGGCGGAATTCCAGGTGTAGGAGTGAAATCCGTAGATATCTGGAGGAACACC
447 :     GGTGGCGAAGGCGGCCACCTGGACTGACACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGTAGCA
448 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTCGGGGAC
449 :     TTGATCCTCGGTGCCGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG
450 :     GCTGAAACTCAAAGAAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTC
451 :     GATGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGGCTTGACATCCGGAGAATCCCTCCGAAAAGAGGG
452 :     AGTGCCCTTCGGGGAGCTCCGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGA
453 :     GGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCTTCAGTTGCCATCAGGTGATG
454 :     CTGGGCACTCTGGAGAGACTGCCCCGGTTAACGGGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGT
455 :     CATCATGGCCCTTACGCCTAGGGCTACACACGTACTACAATGGCGCATACAAAGGGTTGC
456 :     GATACCGCGAGGTGGAGCTAATCCCAAAAAGTGCGTCTCAGTCCGGATTGCAGTCTGCAA
457 :     CTCGACTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCCCGTATCATCATGACGGGGTGAATGCG
458 :     TTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGTTGGTTCTGCCCGACGCCGA
459 :     TGAGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGTCGTCTACGGTAGGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCG
460 :     TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTA
461 :     >Desu.psych Desulfotalea psychrophila LSv54 [gi|51243852 806222-807712]
462 :     TCAAACTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
463 :     AAGTCGAACGCGAACGAGTTTTTCGAAACTCTAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGC
464 :     GTAAGTAATCTACCCTGATATCTGGGATAACAATTCGAAAGGATTGCTAATACCGGATAC
465 :     GTTGATTTATCAAGAAAGATGGCCTCTTCATGAAAGCTATTGTATCGGGAGGAGCTTGCG
466 :     TACCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGGCGACGATGGTTAGCGGGTCTGA
467 :     GAGGATGATCCGCCACACTGGAACTGAAACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
468 :     GAGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGGATGATGAAGGC
469 :     CTTCGGGTCGTAAAATCCTGTCAGATGGGAAGAAATGGTAATGAGCTAATACCTCGTTAC
470 :     TTTGACGGTACCATCAAAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACG
471 :     GGGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGCTTTTTAAG
472 :     TCAGATGTGAAAGTCCTCGGCTCAACCGAGGAAGTGCATTTGAAACTGGGGAGCTTGAGT
473 :     ACTGGAGGGGATGGTGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAAT
474 :     ACCGGTGGCGAAGGCGACCATCTGGCCAGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGA
475 :     GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCAACTAGGTGTTGGA
476 :     GTGGTTAATCGCTTCATTGCCGGAGCTAACGCATTAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGT
477 :     CGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTT
478 :     TAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCTCGGAAATCTCTTGGAAA
479 :     CAGGAGAGTGCCTCTTGAGGAATCCGATGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTG
480 :     TCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTCTCTAGTTGCCATCAT
481 :     TAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGTCAAACCGGAGGAAGGTAGGGATGACGTC
482 :     AAGTCCTCATGGCCTTTATGACCAGGGCTACACACGTACTACAATGGCATAGACAAAGGG
483 :     CAGCAACACAGCGATGTGAAGCCAATCCCATAAACTATGTCTCAGTCCGGATTGGAGTCT
484 :     GCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGCATGCTACGGTGAA
485 :     TACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGGTTGTACCAGAAG
486 :     CAGTTGAGCTAACCCTTCGGGGGGGCAGGCTGCCAAGGTATGGCTGGTAACTGGGGTGAA
487 :     GTCGTAACAAGGTAGCCCTAGGGGAACCTGGGGCTGGATCACCTCCTTT
488 :     >Pelo.carbi Pelobacter carbinolicus DSM 2380 [gi|77917618 c2748366-2746944]
489 :     TAACTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAA
490 :     GTCGAACGCGAAAGTTTCCTTCGGGAAGCGAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACACGT
491 :     GGATAATCTGCCCGATGACCTGGGATAACACTTCGAAAGAGGTGCTAATACCGGATAAGC
492 :     CCACAGGCTCTTCGGAGCATGCGGGAAAAGGTGGGGACCTTCGGGCCTACCGTCATCGGA
493 :     TGAGTCCGCGGCCCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATGGGTA
494 :     GCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG
495 :     AGGCAGCAGTGGGGAATTTTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGAG
496 :     TGATGAAGGCTTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTCAGAGGGGAAGAAACTATCGTGGTCGAAT
497 :     AGGCCCCGGTACTGACGGTACCCTCAAAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCG
498 :     CGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGTGTAGGCG
499 :     GTCTGTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCCGGGAAGTGCATTGGATACTGGC
500 :     AGACTTGAGTACGGGAGAGGAAAGTGGAATTCCGAGTGTAGGGGTGAAATCCGTAGATAT
501 :     TCGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGCTTTCTGGACCGATACTGACGCTGAGACGCGAA
502 :     AGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTACT
503 :     AGGTGTCGCGGGTATTGACCCCTGCGGTGCCGAAGCTAACGCATTAAGTACCCCGCCTGG
504 :     GGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA
505 :     GCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCTGGGCTTGACATCCCGATCGT
506 :     ACTTTCTGGAAACAGTTAGGTCAGTACGGCTGGATCGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTC
507 :     GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTA
508 :     GTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGTTAAACCGGAGGAAGGTG
509 :     GGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGTCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCC
510 :     GGTACAAAGGGCAGCGAAACCGCAAGGTTTAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCG
511 :     GATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCAT
512 :     GCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGAT
513 :     TGTACCTGAAATCGGTGGGCTAACCTTCGGGAGGCAGCCGCTTATGGTATGGTCGGTAAC
514 :     TGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT
515 :     >Bact.marin Bacteriovorax marinus SJ [fig|97084.1.rna.14]
516 :     ATTTGCTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGTCGGCATGCCTAACACATG
517 :     CAAGTCGTACGAGAAAGCACCTTCGGGTGTGAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCG
518 :     TAGGTGATCTACCATTTGGCGGGGGATAACCAGGAGAAATTCTGGCTAATACCGCATACG
519 :     TACTGCAATTTTGAAAGTAGCAGTAGAAAGAATGCCTCTCCTTGGAAGCATTTACCAAAT
520 :     GATGAGCCTGCGTAGCATTAGTTTGATGGTGGGGTAATGGCCTACCATGACTACGATGCT
521 :     TAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACG
522 :     GGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAATGCCGAGTG
523 :     AGTGAGGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCAGAAGGGAATAATGGTGTAGGGTCCA
524 :     ATAGGCCTTACATTTGAAGGTACCTTCAAAGGAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGC
525 :     CGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGG
526 :     CGGATTGTTAAGTCAGATGTGAAATCTCGGGGCTCAACCTCGAAACTGCGTCTGAAACTG
527 :     ATAATCTAGAATCTCGGAGGGGGAAGGGGAATTTCGCATGTAGGGGTAAAATCCGTAGAG
528 :     ATGCGAAGGAACACCAGAGGCGAAGGCGCCTTCCTGGACGAGTATTGACGCTGAGGCGCG
529 :     AAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTGCA
530 :     CTAGATATTGGAGGTTTGACCCCTTCAGTGTCGTAGCTAACGCATTAAGTGCACCGCCTG
531 :     GGGAGTACGGTCGCAAGACTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGG
532 :     ATTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCTAGGCTTGAAATCCTGAGAA
533 :     TCTAATGGAAACATTGGAGTGCTCTTCGGAGAATTCAGTGACAGGCGCTGCATGGCTGTC
534 :     GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCTCGCAACGAGCGCAACCCCTATCCTTA
535 :     GTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAGGGAGACTGCCCGGGCTAACCGGGAGGAAGGTG
536 :     GGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGTCTAGGGCTACACACGTAATACAATGGTA
537 :     CATACAAAGGGAAGCGACCTGGCAACAGTGAGCAAATCTCAAAAAGTGTATCTCAGTCCG
538 :     GATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGGAGATCAGCAC
539 :     GCTCCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGGT
540 :     CTTACCTGAAGTCGTGGCCCTAACTGCTTGCAGAGGGGAGCGCCTACGGTCGGACCGATG
541 :     ACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
542 :     TAA
543 :     >Anae.dehal Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C [gi|86156430 1361311-1362870]
544 :     TAATTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGAG
545 :     AAAGCCCGCAAGGGTGAGTAAAGCGGCGCACGGGTGCGTAACACGTGGGTAATCTGCCCTAGAGTCCGGA
546 :     ATAACTCGCCGAAAGGCGTGCTAATGCCGGATGAGACCACGGGAGCTTCGGCTCCTGCGGGAAAAGGTGG
547 :     CCTCTGTACACAAGCTATCGCTCTAGGATGAGCCCGCGGCCCATCAGCTCGTTGGCGGGGTAATGGCCCA
548 :     CCAAGGCAACGACGGGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACT
549 :     CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGTGTG
550 :     ATGAAGGTCTTCGGATCGTAAAGCACTGTCGCGAGGGACGAATAAGGGACGGGCGAACAGTCCGTCACGA
551 :     TGACGGTACCTCGAGAGGAAGCACCGGCTAACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACAGAGGGTGCGAGC
552 :     GTTGTTCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGTGTAGGCGGCCTAGCAAGTCGGATGTGAAAGCCCTCGGCT
553 :     TAACCGAGGAAGTGCGTTCGAAACTACTGGGCTTGAGTACCGGAGAGGGTGGCGGAATTCCCGGTGTAGA
554 :     GGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCCACCTGGACGGATACTGACGCTGA
555 :     GACGCGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGAGCGCTAG
556 :     GTGTTGCGGGTGTTGACCCCTGCAGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCGCTCCGCCTGGGAAGTACGGCCG
557 :     CAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCA
558 :     ACGCGCAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCTCGGAATCCCTCAGAGATGAGGGGGTGCCCGCAAGGGAA
559 :     CCGAGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG
560 :     CGCAACCCCTGCCGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAACGGGACTGCCGGCGTCAAGCCGGAG
561 :     GAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCTTTATGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCGGT
562 :     ACAGAGGGTCGCCAAGTCGCGAGACGGAGCTAATCCCAGAAAACCGGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGC
563 :     AACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGG
564 :     CCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGTTGCTCCAGAAGTGGCCGCGCCAACCCGCAAGGG
565 :     AGGCAGGTCCCTAAGGAGTGGCTGGTAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCG
566 :     GCTGGATCACCTCCTTTCTA
567 :     >Woli.succi Wolinella succinogenes DSM 1740 [gi|34556458 136184-137682]
568 :     ATTATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGGT
569 :     AACAGGGTGTAGCTTGCTATACTGCTGACGAGTGGCGCACGGGTGAGTAATGCATAGGTTATGTGCCCCA
570 :     TAGTCTGGAATAGCCACTGGAAACGGTGATTAATACCGGATATTCCCGAGAGGGGAAAGTTTTTCGCTAT
571 :     GGGATCAGCCTATGTCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCTATGACGGGTATCCGGC
572 :     CTGAGAGGGTGATCGGACACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAA
573 :     TATTGCTCAATGGGCGAAAGCCTGAAGCAGCAACGCCGCGTGGAGGATGAAGGTCTTCGGATTGTAAACT
574 :     CCTTTTCTAAGAGAAGATTATGACGGTATCTTAGGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCG
575 :     GTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTACTCGGAATCACTGGGCGTAAAGAGCACGTAGGCGGCCTTGCAAGTC
576 :     AGATGTGAAATCCAACGGCTTAACCGTTGAACTGCATTTGAAACTGCAAGGCTAGAGTATGGGAGAGGTA
577 :     GGTGGAATTCTCGGTGTAGGGGTAAAATCCGTAGAGATCGAGAGGAATACTCATTGCGAAGGCGACCTGC
578 :     TGGAACATTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACG
579 :     CCCTAAACGATGAATGCTAGTTGTTGCCCTGCTTGTCAGGGCAGTAATGCAGTTAACACATTAAGCATTC
580 :     CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATAGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCA
581 :     TGTGGTTTAATTCGAAGATACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATTGATAGAATCCTATAGAGATAT
582 :     GGGAGTGCCAGTTTACTGGAGCTTGAAAACAGGTGCTGCACGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGT
583 :     TGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTCACTAGTTGCTAACGGTTCGGCCGAGCACTCTAGTGA
584 :     GACTGCCTTCGCAAGGAGGAGGAAGGTGAGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGCCCAGGGCTAC
585 :     ACACGTGCTACAATGGTGTGTACAAAGAGAAGCAATACCGCGAGGTGGAGCAAATCTTTAAAACACATCT
586 :     CAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGCAATGC
587 :     TACGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACTCACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGTATTCGCCTTAAGC
588 :     CGGGACGCTAAACTGGCTACCGTCCACGGCGGATGCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGT
589 :     AGGTGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTT
590 :     >Prop.acnes Propionibacterium acnes [fig|267747.1.rna.10 NC_006085_606156_607682]
591 :     TCATTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAA
592 :     GTCGAACGGAAAGGCCCTGCTTTTGTGGGGTGCTCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACG
593 :     TGAGTAACCTGCCCTTGACTTTGGGATAACTTCAGGAAACTGGGGCTAATACCGGATAGG
594 :     AGCTCCTGCTGCATGGTGGGGGTTGGAAAGTTTCGGCGGTTGGGGATGGACTCGCGGCTT
595 :     ATCAGCTTGTTGGTGGGGTAGTGGCTTACCAAGGCTTTGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGG
596 :     GTGACCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGG
597 :     AATATTGCACAATGGGCGGAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGCGGGATGACGGCCTTC
598 :     GGGTTGTAAACCGCTTTCGCCTGTGACGAAGCGTGAGTGACGGTAATGGGTAAAGAAGCA
599 :     CCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTGATACGTAGGGTGCGAGCGTTGTCCGGATTT
600 :     ATTGGGCGTAAAGGGCTCGTAGGTGGTTGATCGCGTCGGAAGTGTAATCTTGGGGCTTAA
601 :     CCCTGAGCGTGCTTTCGATACGGGTTGACTTGAGGAAGGTAGGGGAGAATGGAATTCCTG
602 :     GTGGAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGTTCTCTGG
603 :     GCCTTTCCTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGCTTAGATACCCTGGTA
604 :     GTCCACGCTGTAAACGGTGGGTACTAGGTGTGGGGTCCATTCCACGGGTTCCGTGCCGTA
605 :     GCTAACGCTTTAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAAT
606 :     TGACGGGGCCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGTAGAACC
607 :     TTACCTGGGTTTGACATGGATCGGGAGTGCTCAGAGATGGGTGTGCCTCTTTTGGGGTCG
608 :     GTTCACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
609 :     CAACGAGCGCAACCCTTGTTCACTGTTGCCAGCACGTTATGGTGGGGACTCAGTGGAGAC
610 :     CGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCC
611 :     AGGGCTTCACGCATGCTACAATGGCTGGTACAGAGAGTGGCGAGCCTGTGAGGGTGAGCG
612 :     AATCTCGGAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCTCATGAAGTCGG
613 :     AGTCGCTAGTAATCGCAGATCAGCAACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGGCTTGTACAC
614 :     ACCGCCCGTCAAGTCATGAAAGTTGGTAACACCCGAAGCCGGTGGCCTAACCGTTGTGGG
615 :     GGAGCCGTCGAAGGTGGGACTGGTGATTAGGACTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGG
616 :     AAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
617 :     >Mycb.tuber Mycobacterium tuberculosis CDC1551 [gi|50953765 1471388-1472923]
618 :     TTTGTTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
619 :     AAGTCGAACGGAAAGGTCTCTTCGGAGATACTCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTG
620 :     GGTGATCTGCCCTGCACTTCGGGATAAGCCTGGGAAACTGGGTCTAATACCGGATAGGAC
621 :     CACGGGATGCATGTCTTGTGGTGGAAAGCGCTTTAGCGGTGTGGGATGAGCCCGCGGCCT
622 :     ATCAGCTTGTTGGTGGGGTGACGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGG
623 :     GTGTCCGGCCACACTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGG
624 :     AATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGGGGGATGACGGCCTTC
625 :     GGGTTGTAAACCTCTTTCACCATCGACGAAGGTCCGGGTTCTCTCGGATTGACGGTAGGT
626 :     GGAGAAGAAGCACCGGCCAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCG
627 :     TTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGTGGTTTGTCGCGTTGTTCGTGAAAT
628 :     CTCACGGCTTAACTGTGAGCGTGCGGGCGATACGGGCAGACTAGAGTACTGCAGGGGAGA
629 :     CTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAG
630 :     GCGGGTCTCTGGGCAGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTA
631 :     GATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGGTGGGTACTAGGTGTGGGTTTCCTTCCTTGGG
632 :     ATCCGTGCCGTAGCTAACGCATTAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAA
633 :     ACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCA
634 :     ACGCGAAGAACCTTACCTGGGTTTGACATGCACAGGACGCGTCTAGAGATAGGCGTTCCC
635 :     TTGTGGCCTGTGTGCAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGT
636 :     TAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTCATGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGGACTC
637 :     GTGAGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCC
638 :     CTTATGTCCAGGGCTTCACACATGCTACAATGGCCGGTACAAAGGGCTGCGATGCCGCGA
639 :     GGTTAAGCGAATCCTTAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATCGGGGTCTGCAACTCGACCCCG
640 :     TGAAGTCGGAGTCGCTAGTAATCGCAGATCAGCAACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGC
641 :     CTTGTACACACCGCCCGTCACGTCATGAAAGTCGGTAACACCCGAAGCCAGTGGCCTAAC
642 :     CCTCGGGAGGGAGCTGTCGAAGGTGGGATCGGCGATTGGGACGAAGTCGTAACAAGGTAG
643 :     CCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
644 :     >Stre.coeli Streptomyces coelicolor A3(2) [fig|100226.1.rna.3]
645 :     CATTCACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
646 :     AAGTCGAACGATGAACCACTTCGGTGGGGATTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGG
647 :     CAATCTGCCCTTCACTCTGGGACAAGCCCTGGAAACGGGGTCTAATACCGGATACTGACC
648 :     CTCGCAGGCATCTGCGAGGGTCGAAAGCTCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATC
649 :     AGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGCG
650 :     ACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAAT
651 :     ATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATGACGGCCTTCGGG
652 :     TTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAGAAGCGCCG
653 :     GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATT
654 :     GGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGCTTGTCACGTCGGTTGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCC
655 :     CGGGTCTGCAGTCGATACGGGCAGGCTAGAGTTCGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGGTG
656 :     TAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGATCTCTGGGCC
657 :     GATACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC
658 :     CACGCCGTAAACGGTGGGCACTAGGTGTGGGCAACATTCCACGTTGTCCGTGCCGCAGCT
659 :     AACGCATTAAGTGCCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGA
660 :     CGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTA
661 :     CCAAGGCTTGACATACACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGCCCCCCTTGTGGTCGGTGTAC
662 :     AGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGA
663 :     GCGCAACCCTTGTCCCGTGTTGCCAGCAAGCCCTTCGGGGTGTTGGGGACTCACGGGAGA
664 :     CCGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTC
665 :     TTGGGCTGCACACGTGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGATACCGCAAGGTGGAGC
666 :     GAATCTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCG
667 :     GAGTCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACA
668 :     CACCGCCCGTCACGTCACGAAAGTCGGTAACACCCGAAGCCGGTGGCCCAACCCCTTGTG
669 :     GGAGGGAGCTGTCGAAGGTGGGACTGGCGATTGGGACGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA
670 :     CCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
671 :     >Bifi.longu Bifidobacterium longum NCC2705 [fig|206672.1.rna.53]
672 :     TTTTTGTGGAGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
673 :     AAGTCGAACGGGATCCATCAGGCTTTGCTTGGTGGTGAGAGTGGCGAACGGGTGAGTAAT
674 :     GCGTGACCGACCTGCCCCATACACCGGAATAGCTCCTGGAAACGGGTGGTAATGCCGGAT
675 :     GCTCCAGTTGATCGCATGGTCTTCTGGGAAAGCTTTCGCGGTATGGGATGGGGTCGCGTC
676 :     CTATCAGCTTGACGGCGGGGTAACGGCCCACCGTGGCTTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGA
677 :     GGGCGACCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGG
678 :     GGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATGGAGGCCT
679 :     TCGGGTTGTAAACCTCTTTTATCGGGGAGCAAGCGAGAGTGAGTTTACCCGTTGAATAAG
680 :     CACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGAA
681 :     TTATTGGGCGTAAAGGGCTCGTAGGCGGTTCGTCGCGTCCGGTGTGAAAGTCCATCGCTT
682 :     AACGGTGGATCCGCGCCGGGTACGGGCGGGCTTGAGTGCGGTAGGGGAGACTGGAATTCC
683 :     CGGTGTAACGGTGGAATGTGTAGATATCGGGAAGAACACCAATGGCGAAGGCAGGTCTCT
684 :     GGGCCGTTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGG
685 :     TAGTCCACGCCGTAAACGGTGGATGCTGGATGTGGGGCCCGTTCCACGGGTTCCGTGTCG
686 :     GAGCTAACGCGTTAAGCATCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGAA
687 :     ATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAA
688 :     CCTTACCTGGGCTTGACATGTTCCCGACGGTCGTAGAGATACGGCTTCCCTTCGGGGCGG
689 :     GTTCACAGGTGGTGCATGGTCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
690 :     CAACGAGCGCAACCCTCGCCCCGTGTTGCCAGCGGATTATGCCGGGAACTCACGGGGGAC
691 :     CGCCGGGGTTAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAGATCATCATGCCCCTTACGTCC
692 :     AGGGCTTCACGCATGCTACAATGGCCGGTACAACGGGATGCGACGCGGCGACGCGGAGCG
693 :     GATCCCTGAAAACCGGTCTCAGTTCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGGCGG
694 :     AGTCGCTAGTAATCGCGAATCAGCAACGTCGCGGTGAATGCGTTCCCGGGCCTTGTACAC
695 :     ACCGCCCGTCAAGTCATGAAAGTGGGCAGCACCCGAAGCCGGTGGCCTAACCCCTTGTGG
696 :     GATGGAGCCGTCTAAGGTGAGGCTCGTGATTGGGACTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAC
697 :     CGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
698 :     >Rubr.xylan Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 [fig|266117.1.rna.047]
699 :     TTTAGTTCGGAGAGTTTGATCTTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTTAGGCATG
700 :     CAAGTCGAACGCGAAAGCCCCTTCGGGGGTGAGTAGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACG
701 :     TGGGTAACCTGCCCCTCGCAGGGGGATAACCGGGGGAAACCCCGGCTAATACCCCGTACG
702 :     CTTGCCGGGGCGCATGCTCCGGCAAGGAAAGGTAGCTTCGGCCATCCGGCGAGGGAGGGG
703 :     CCCGCGGCCCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATGGGTAGCTG
704 :     GCCTGAGAGGGTGGTCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
705 :     AGCAGCCAGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGGCGAT
706 :     GAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCCCTGTTGTCGGGGACGAAGGGCGAAGGGTTAATAGCCC
707 :     CTAGCCTGACGGTACCCGACGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA
708 :     TACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATCATTGGGCGTAAAGAGCGTGTAGGCGGCCCGG
709 :     TAAGTCTGCTGTGAAAACCCGGGGCTCAACCCCGGGCGTGCAGTGGAAACTGCCGGGCTA
710 :     GAGGGCGGCAGAGGCGAGTGGAATTCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCGGGAG
711 :     GAACACCAGTAGCGAAGGCGGCTCGCTGGGCCGTTCCTGACGCTGAGACGCGAAAGCTAG
712 :     GGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGGCACTAGGTGT
713 :     GGGGGGAGTCGAATCCCTCCGTGCCGCAGCCAACGCGTTAAGTGCCCCGCCTGGGGAGTA
714 :     CGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAAGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGT
715 :     TCTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATGCTGGTGGTAGGCGC
716 :     CGGAAACGGTGGCCGACCCTTCGGGGAGCCAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCT
717 :     CGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCCTGTGTTGCCA
718 :     GCATTGAGTTGGGGACTCACAGGGGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA
719 :     CGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGCCCAGGGCTAGAAACGTGCTACAATGGCCGGTACAA
720 :     TGGGCTGCGATGCCGCGAGGCGGAGCGAATCCCATCAAAGCCGGTCTAAGTTCGGATTGG
721 :     AGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGGCGGAGTTGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCG
722 :     GTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTCGGCAATACC
723 :     CGAAGCAGGCGCAGCTAACCCCTCTTCGGAGGGGAGGCGGCTTGCGAAGGTAGGGCCGGC
724 :     GACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCTGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
725 :     TCTA
726 :     >Chla.trach Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX [gi|15604717 854124-855677]
727 :     TTTTCTGAGAATTTGATCTTGGTTCAGATTGAACGCTGGCGGCGTGGATGAGGCATGCAAGTCGAACGGA
728 :     GCAATTGTTTCGACGATTGTTTAGTGGCGGAAGGGTTAGTAATGCATAGATAATTTGTCCTTAACTTGGG
729 :     AATAACGGTTGGAAACGGCCGCTAATACCGAATGTGGCGATATTTGGGCATCCGAGTAACGTTAAAGAAG
730 :     GGGATCTTAGGACCTTTCGGTTAAGGGAGAGTCTATGTGATATCAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTAC
731 :     CAAGGCTATGACGTCTAGGCGGATTGAGAGATTGGCCGCCAACACTGGGACTGAGACACTGCCCAGACTC
732 :     CTACGGGAGGCTGCAGTCGAGAATCTTTCGCAATGGACGGAAGTCTGACGAAGCGACGCCGCGTGTGTGA
733 :     TGAAGGCTCTAGGGTTGTAAAGCACTTTCGCTTGGGAATAAGAGAAGACGGTTAATACCCGCTGGATTTG
734 :     AGCGTACCAGGTAAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCTGCGGTAATACGGAGGGTGCTAGCGT
735 :     TAATCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGCGTGTAGGCGGAAAGGTAAGTTAGTTGTCAAAGATCGGGGCTCA
736 :     ACCCCGAGTCGGCATCTAATACTATTTTTCTAGAGGATAGATGGAGAAAAGGGAATTTCACGTGTAGCGG
737 :     TGAAATGCGTAGATATGTGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGCTTTTCTAATTTATACCTGACGCTAAGG
738 :     CGCGAAAGCAAGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCTTGCCGTAAACGATGCATACTTGAT
739 :     GTGGATGGTCTCAACCCCATCCGTGTCGGAGCTAACGCGTTAAGTATGCCGCCTGAGGAGTACACTCGCA
740 :     AGGGTGAAACTCAAAAGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAAC
741 :     GCGAAGGACCTTACCTGGGTTTGACATGTATATGACCGCGGCAGAAATGTCGTTTTCCGCAAGGACATAT
742 :     ACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA
743 :     CCCTTATCGTTAGTTGCCAGCACTTAGGGTGGGAACTCTAACGAGACTGCCTGGGTTAACCAGGAGGAAG
744 :     GCGAGGATGACGTCAAGTCAGCATGGCCCTTATGCCCAGGGCGACACACGTGCTACAATGGCCAGTACAG
745 :     AAGGTGGCAAGATCGCGAGATGGAGCAAATCCTCAAAGCTGGCCCCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTC
746 :     GACTACATGAAGTCGGAATTGCTAGTAATGGCGTGTCAGCCATAACGCCGTGAATACGTTCCCGGGCCTT
747 :     GTACACACCGCCCGTCACATCATGGGAGTTGGTTTTACCTTAAGTCGTTGACTCAACCCGCAAGGGAGAG
748 :     AGGCGCCCAAGGTGAGGCTGATGACTAGGATGAAGTCGTAACAAGGTAGCCCTACCGGAAGGTGGGGCTG
749 :     GATCACCTCCTTT
750 :     >Para.UWE25 Parachlamydia sp. UWE25 [fig|264201.1.rna.39]
751 :     TTTTTCTGTGAGAATTTGATCTTGGTTCAGATTGAATGCTGACAGCGTGGATGAGGCATG
752 :     CAAGTCGAACGAAACCTTCGGGTTTAGTGGCGGAAGGGTTAGTAAGACATGGATAACTTG
753 :     CCTTTAACTCTGGGATAACGGTTGGAAACGACCGCTAATACCGGATAGGGTGAAAAGAAG
754 :     ACATCTTTTTTTTATTAAAGTGGGGGATCGCAAGACCTCGCGGTTAAAGAGAGGTCCATG
755 :     GGATATCAGCTAGTTGGTGTGGTAAAGGCGCACCAAGGCTAAGACGTCTAGGCGGATTGA
756 :     GAGATTGACCGCCAACACTGGGACTGAGAACTGCCCAGACTCCTACGGGAGGCTGCAGTC
757 :     GAGAATCATTCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGATGCGACGCTGTGTGAGTGAAGAAGGCC
758 :     TTAGGGTCGTAAAGCTCTTTCGCCTGGGAACAAGATGAGCTGGCTAACATCCAGTGATTT
759 :     TGAGCGTACCAGGTAAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCTGCGGTAATACGGA
760 :     GGGTGCAAGCATTAATCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGGGGTGTCAGTC
761 :     AGATGTGAAATCCCGAGGCTCAACCTCGGAACAGCATTTGAAACTACATCTCTAGAGGGT
762 :     AGGCGGAGAAAACGGAATTCCACAAGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATGTGGAAGAACAC
763 :     CGGTGGCGAAGGCGGTTTTCTAGCTTATACCTGACGCTAAAGCGCGAAAGCAAGGGGATC
764 :     AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCTTGCCGTAAACTATGTATACTTGGTGTAACTGG
765 :     ACTCAACCCTAGTTGTGCCGTAGCTAACGCGTTAAGTATACCGCCTGGGGAGTACAGTCG
766 :     CAAGGCTGAAACTCAAAAGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCAGTGGAGCATGTGGTTTA
767 :     ATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCCAGACTTGACATGTAGTAGACCGGTCTAGAAAT
768 :     AGGCCTTTCCTTCGGGACTGCTACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTG
769 :     AGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCATTAGTTGCCAACATTTAAG
770 :     GTGGGAACTCTAATGAGACTGCCTGGGTTAACCAGGAGGAAGGTGAGGATGACGTCAAGT
771 :     CCGCATGGCCCTTATGTCTGGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAAGGCAGC
772 :     GAAGCCGCGAGGTGAAGCAAATCCCGAAAGCCGGCCCCAGTTCAGATTGTAGTCTGCAAC
773 :     TCGACTACATGAAGACGGAATTGCTAGTAATGGCGAGTCAGCAACATCGCCGTGAATACG
774 :     TTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACATCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAATCCGC
775 :     TGGCTTAACCGCAAGGGAAGAGGCGTGTAAGGTGAGGCCGATGACTGGGATGAAGTCGTA
776 :     ACAAGGTAGCCCTACCGGAAGGTGGGGCTGGATCACCTCCTTTA
777 :     >Ther.marit Thermotoga maritima MSB8 [fig|243274.1.rna.2]
778 :     TATATGGAGGGTTTGATCCTGGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAA
779 :     GTCGAGCGGGGGAAACTCCCTTCGGGGAGGAGTACCCAGCGGCGGACGGGTGAGTAACAC
780 :     GTGGGTAACCTGCCCTCCGGAGGGGGATAACCAGGGGAAACCCTGGTTAATACCCCATAC
781 :     GCTCCATCAACGCAAGTTGGTGGAGGAAAGGGGCGTTTGCCCCGCCGGAGGAGGGGCCCG
782 :     CGGCCCATCAGGTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGACGACGGGTAGCCGGCCT
783 :     GAGAGGGTGGTCGGCCACAGGGGCACTGAGACACGGGCCCCACTCTACGGGAGGCAGCAG
784 :     TGGGGAATCTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCGACGCCGCGTGCGGGACGAAGC
785 :     CTTCGGGGTGTAAACCGCTGTGGCGGGGGAAGAATAAGGTAGGGAGGAAATGCCCTACCG
786 :     ATGACGGTACCCCGCTAGAAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGT
787 :     AGGGGGCAAGCGTTACCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGGGGCGTAGGCGGCCTGGTGTGT
788 :     CGGATGTGAAATCCCACGGCTCAACCGTGGGGCTGCATCCGAAACTACCAGGCTTGGGGG
789 :     CGGTAGAGGGAGACGGAACTGCCGGTGTAGGGGTGAAATCCGTAGATATCGGCAGGAACG
790 :     CCGGTGGGGAAGCCGGTCTCCTGGGCCGACCCCGACGCTGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAG
791 :     CAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACGATGCCCACTAGGTGTGGGGG
792 :     GGTAATCCCTCCGTGCTGAAGCTAACGCGTTAAGTGGGCCGCCTGGGGAGTACGCCCGCA
793 :     AGGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCGTGTGGTTTAAT
794 :     TGGATGCTAAGCCAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATGCCGGTGGTACCTCCCCGAAAGG
795 :     GGTAGGGACCCAGTCCTTCGGGACTGGGAGCCGGCACAGGTGGTGCACGGCCGTCGTCAG
796 :     CTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGCCCCTAGTTGC
797 :     CAGCGGTTCGGCCGGGCACTCTAGGGGGACTGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGA
798 :     TGACGTCAGGTACTCGTGCCCCTTATGCCCTGGGCGACACACGCGCTACAATGGGCGGTA
799 :     CAATGGGTTGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAATCCCCAAAGCCGCCCTCAGTTCGGATCG
800 :     CAGGCTGCAACCCGCCTGCGTGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCCATGCCG
801 :     CGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACGCCACCCGAGTCGGGGGCT
802 :     CCCGAAGACACCTACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGTGTCGAGGGAGAACCTGGCGAG
803 :     GGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCT
804 :     >Fuso.nucle Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 [fig|190304.1]
805 :     GATTGAACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG
806 :     CAAGTCTACTTGAATTTGGGTTTTTTAACTTCGATTTGGGTGGCGGACGGGTGAGTAACG
807 :     CGTAAAGAATTTGCCTCACAGCTAGGGACAACATTTGGAAACGAATGCTAATACCTGATA
808 :     TTATGATTATAGGGCATCCTAGAATTATGAAAGCTATATGCGCTGTGAGAGAGCTTTGCG
809 :     TCCCATTAGCTAGTTGGAGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGATGATGGGTAGCCGGCCTGA
810 :     GAGGGTGAACGGCCACAAGGGGACTGAGACACGGCCCTTACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
811 :     GGGGAATATTGGACAATGGACCGAGAGTCTGATCCAGCAATTCTGTGTGCACGATGACGT
812 :     TTTTCGGAATGTAAAGTGCTTTCAGTTGGGAAGAAAAAAATGACGGTACCAACAGAAGAA
813 :     GTGACGGCTAAATACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGTCACGAGCGTTATCCGGA
814 :     TTTATTGGGCGTAAAGCGCGTCTAGGTGGTTATGTAAGTCTGATGTGAAAATGCAGGGCT
815 :     CAACTCTGTATTGCGTTGGAAACTGTGTAACTAGAGTACTGGAGAGGTAAGCGGAACTAC
816 :     AAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTTGTAGGAATGCCGATGGGGAAGCCAGCTTACT
817 :     GGACAGATACTGACGCTGAAGCGCGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGG
818 :     TAGTCCACGCCGTAAACGATGATTACTAGGTGTTGGGGGTCGAACCTCAGCGCCCAAGCA
819 :     AACGCGATAAGTAATCCGCCTGGGGAGTACGTACGCAAGTATGAAACTCAAAGGAATTGA
820 :     CGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAGGAACCTTA
821 :     CCAGCGTTTGACATCTTAGGAATGAGACAGAGATGTTTCAGTGTCCCTTCGGGGAAACCT
822 :     AAAGACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
823 :     CAACGAGCGCAACCCCTTTCGTATGTTACCATCATTAAGTTGGGGACTCATGCGATACTG
824 :     CCTACGATGAGTAGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATACGCTG
825 :     GGCTACACACGTGCTACAATGGGTAGAACAGAGAGTTGCAAAGCCGTGAGGTGGAGCTAA
826 :     TCTCAGAAAACTATTCTTAGTTCGGATTGTACTCTGCAACTCGAGTACATGAAGTTGGAA
827 :     TCGCTAGTAATCGCGAATCAGCAATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACAC
828 :     CGCCCGTCACACCACGAGAGTTGGTTGCACCTGAAGTAGCAGGCCTAACCGTAAGGAGGG
829 :     ATGTTCCGAGGGTGTGATTAGCGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTATCCGTACGGGAA
830 :     CGTGCGGATGGATCACCTCCTTTCTA
831 :     >Aqui.aeoli Aquifex aeolicus VF5 [gi|15282445 c572785-571199]
832 :     TTTCCCTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGCGCGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGC
833 :     AAGTCGTGCGCAGGGTCGGCCCCTTTTGGGGCCGGCCGCTGAGCGGCAAACGGGTGAGTA
834 :     ACACGTGGGTAACCTACCCCCAGGAGGGGGATAACCCCGGGAAACCGGGGCTAATACCCC
835 :     ATAATGCCACCCGCCACTAAGGCGCGGTGGCCAAAGGGGGCCTCTGGCCTTCGGCCACGC
836 :     TCCCGCCTGGGGATGGGCCCGCGGCCCATCAGGTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAG
837 :     CCTATGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGCCGGCCACAGCGGGACTGAGACACGGCCC
838 :     GCACCCCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATCGTGGGCAATGGGCGAAAGCCTGACCCCGC
839 :     GACGCCGCGTGGGGGATGAAGCCCTGCGGGGTGTAAACCCCTGTCGGGGGGGACGATGCG
840 :     GACACGGGTTAATAGCCCGTGTCCGTGACGGTACCCCCAGAGGAAGGGACGGCTAACTAC
841 :     GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTCCCAAGCGTTGCGCGAAGTCACTGGGCGTAAA
842 :     GCGTCCGCAGCCGGTCGGGTAAGCGGGATGTCAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGACCGGC
843 :     ATCCCGAACTGCCCGACTTGAGGCACGCCCGGGCAGGCGGAATTCCCGGGGTAGCGGTGA
844 :     AATGCGTAGATCTCGGGAGGAACACCGAAGGGGAAGCCAGCCTGCTGGGGCTGTCCTGAC
845 :     GGTCAGGGACGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCCGGCCGTA
846 :     AACCATGGGCGCTAGGGCTTGTCCCTCTGGGGCAGGCTCGCAGCTAACGCGTTAAGCGCC
847 :     CCGCCTGGGGAGTACGGGCGCAAGCCTGAAACTCAAAGGAATTGGCGGGGGCCCGCACAA
848 :     CCGGTGGAGCGTCTGGTTCAATTCGATGCTAACCGAAGAACCTTACCCGGGCTTGACATG
849 :     CCGGGGAGACTCCGCGAAAGCGGAGTTGTGGAAGTCCCTAGGACTTTCCCCCGGCACAGG
850 :     TGGTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCG
851 :     CAACCCCTGCCCCCAGTTGCTACCCCGTTTGGGGAGCACTCTGGGGGGACCGCCGGCGAT
852 :     AAGCCGGAGGAAGGGGGGGATGACGTCAGGTCAGTATGCCCTTTATGCCCGGGGCCACAC
853 :     AGGCGCTACAGTGGCCGGGACAATGGGATGCGACCCCGTAAGGGGGAGCTAATCCCTAAA
854 :     CCCGGTCATGGTGCGGATTGGGGGCTGAAACTCGCCCCCATGAAGCCGGAATCGGTAGTA
855 :     ACGGGGTATCAGCGATGTCCCCGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGCACACACCGCCCGTCA
856 :     CGCCACGGAAGTCGGTCCGGCCGGAAGTCCCCGAGCTAACCGGCTCCTTCGGGAGCCGGA
857 :     GGCAGGGGCCGATGGCCGGGCCGGCGACTGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGG
858 :     GAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTA
859 :     >Porp.gingi Porphyromonas gingivalis W83 [gi|34539880 119556-121030]
860 :     ACAGTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATGCAA
861 :     GTCGAGGGGCAGCATGATCTTAGCTTGCTAAGGTTGATGGCGACCGGCGCACGGGTGCGT
862 :     AACGCGTATGCAACTTGCCTTACAGAGGGGGATAACCCGTTGAAAGACGGACTAAAACCG
863 :     CATACACTTGTATTATTGCATGATATTACAAGGAAATATTTATAGCTGTAAGATAGGCAT
864 :     GCGTCCCATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGGGTAGGGGAAC
865 :     TGAGAGGTTTATCCCCCACACTGGTACTGAGACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGC
866 :     AGTGAGGAATATTGGTCAATGGGCGAGAGCCTGAACCAGCCAAGTCGCGTGAAGGAAGAC
867 :     AGTCCTAAGGATTGTAAACTTCTTTTATACGGGAATAACGGGCGATACGAGTATTGCATT
868 :     GAATGTACCGTAAGAATAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAG
869 :     GATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGTTGTTCGGTAAGTCA
870 :     GCGGTGAAACCTGAGCGCTCAACGTTCAGCCTGCCGTTGAAACTGCCGGGCTTGAGTTCA
871 :     GTGGCGGCAGGCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACGAGGAACTCC
872 :     GATTGCGAAGGCAGCTTGCCATACTGCGACTGACACTGAAGCACGAAGGCGTGGGTATCA
873 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCAGTAAACGATGATTACTAGGAGTTTGCGAT
874 :     ATACCGTCAAGCTTCCACAGCGAAAGCGTTAAGTAATCCACCTGGGGAGTACGCCGGCAA
875 :     CGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGAGGAACATGTGGTTTAATT
876 :     CGATGATACGCGAGGAACCTTACCCGGGATTGAAATGTAGATGACGGATGGTGAAAACCG
877 :     TCTTCCCTTCGGGGCTTCTATGTAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGG
878 :     TGTCGGCTTAAGTGCCATAACGAGCGCAACCCACATCGGTAGTTACTAACAGTTTTCGCT
879 :     GAGGACTCTACCGAGACTGCCGTCGTAAGGCGTGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAATCA
880 :     GCACGGCCCTTACATCCGGGGCGACACACGTGTTACAATGGGAGGGACAAAGGGCAGCTA
881 :     CCGGGCGACCGGATGCGAATCTCTAAACCCTTCCCCAGTTCGGATCGGAGTCTGCAACTC
882 :     GACTCCGTGAAGCTGGATTCGCTAGTAATCGCGCATCAGCCATGGCGCGGTGAATACGTT
883 :     CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGGAGTCGGGGGTACCTGAAGGGCGTA
884 :     ACCGCAAGGGGCGCACTAGGGTAATACCGGTGACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCC
885 :     GTACCGGAAGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTT
886 :     >Bact.frag Bacteroides fragilis YCH46 [gi|53711291 c3145859-3144323]
887 :     TTTACAATGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG
888 :     CAAGTCGAGGGGCATCAGGAAGAAAGCTTGCTTTCTTTGCTGGCGACCGGCGCACGGGTG
889 :     AGTAACACGTATCCAACCTGCCCTTTACTCGGGGATAGCCTTTCGAAAGAAAGATTAATA
890 :     CCCGATGGCATAATGATTCCGCATGGTTTCATTATTAAAGGATTCCGGTAAAGGATGGGG
891 :     ATGCGTTCCATTAGGTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGCCTTCGATGGATAGGGGT
892 :     TCTGAGAGGAAGGTCCCCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAAACTCCTACGGGAGGCA
893 :     GCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGGCGCTAGCCTGAACCAGCCAAGTAGCGTGAAGGATG
894 :     AAGGCTCTATGGGTCGTAAACTTCTTTTATATAAGAATAAAGTGCAGTATGTATACTGTT
895 :     TTGTATGTATTATATGAATAAGGATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGG
896 :     AGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTAGGTGGACTGGTAAGT
897 :     CAGTTGTGAAAGTTTGCGGCTCAACCGTAAAATTGCAGTTGATACTGTCAGTCTTGAGTA
898 :     CAGTAGAGGTGGGCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCTTAGATATCACGAAGAACT
899 :     CCGATTGCGAAGGCAGCTCACTGGACTGCAACTGACACTGATGCTCGAAAGTGTGGGTAT
900 :     CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACACAGTAAACGATGAATACTCGCTGTTTGCG
901 :     ATATACAGTAAGCGGCCAAGCGAAAGCATTAAGTATTCCACCTGGGGAGTACGCCGGCAA
902 :     CGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGAGGAACATGTGGTTTAATT
903 :     CGATGATACGCGAGGAACCTTACCCGGGCTTAAATTGCAGTGGAATGATGTGGAAACATG
904 :     TCAGTGAGCAATCACCGCTGTGAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGG
905 :     TGTCGGCTTAAGTGCCATAACGAGCGCAACCCTTATCTTCAGTTACTAACAGGTTATGCT
906 :     GAGGACTCTGGAGAGACTGCCGTCGTAAGATGTGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCA
907 :     GCACGGCCCTTACGTCCGGGGCTACACACGTGTTACAATGGGGGGTACAGAAGGCAGCTA
908 :     GCGGGTGACCGTATGCTAATCCCAAAAGCCTCTCTCAGTTCGGATCGAAGTCTGCAACCC
909 :     GACTTCGTGAAGCTGGATTCGCTAGTAATCGCGCATCAGCCACGGCGCGGTGAATACGTT
910 :     CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGGAGCCGGGGGTACCTGAAGTACGTA
911 :     ACCGCAAGGATCGTCCTAGGGTAAAACTGGTGACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCC
912 :     GTACCGGAAGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTTCT
913 :     >Cyto.hutch Cytophaga hutchinsonii [fig|985.1]
914 :     TTTACAATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAATACATG
915 :     CAAGTCGAGGGGCAGCGGGGTAGCAATACTGCCGGCGACCGGCGCACGGGTGCGTAACAC
916 :     GTATGCAACCTACCTTAAACTGGGAGATAGCCCGGGGAAACTCGGATTAATACCCCATAA
917 :     CACATTTGTGTCTCATGACATGATTGTTAAAGATTTATCGGTTTAAGATGGGCATGCGTT
918 :     CGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCTACGATCGATAGGGGGTCTGAGA
919 :     GGATGATCCCCCACACTGGTACTGAGATACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAG
920 :     GGAATATTGGTCAATGGAGGCAACTCTGAACCAGCCATGCCGCGTGTAGGAAGAAGGCGT
921 :     TCTGCGTTGTAAACTACTTTTGATTGGGAACAAATGACTCTTGCGAGAGTAGCTGAGTGT
922 :     ACCAATAGAATAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCA
923 :     AGCGTTGTCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCTTAATAAGTCAGTGGTG
924 :     AAAGCCGATCGCTTAACGATCGAACTGCCATTGATACTGCTAGGCTTGAGTATAGATGAG
925 :     GTAGGCGGAATTGACAGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATTGTCAAGAACACCAATTGC
926 :     GAAGGCAGCTTACTAAGTTATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGTGCGGGGATCAAACAGG
927 :     ATTAGATACCCTGGTAGTCCGCACCGTAAACGATGATCACTCGCTGTGTGCGATAAACAG
928 :     TACGCGGCCAAGCGAAAGCGATAAGTGATCCACCTGGGGAGTACGCCCGCAAGGGTGAAA
929 :     CTCAAAGGAATTGACGGGGGTCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATA
930 :     CGCGAGGAACCTTACCTAGGCTAGAATGTGAAGGAATGTATCAGAAATGGTGCAGTCAGC
931 :     AATGACCTGAAACAAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTT
932 :     AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCTTTAGTTGCCAGCGAGTTATGTCGGGGACTCT
933 :     AGAGAGACTGCCTGTGTAAACAGAGAGGAAGGAGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCC
934 :     TTACGCCTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGTGTTGCAAGCTAGTGAT
935 :     AGCAAGCCAATCACAAAAAGTGCGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCAT
936 :     GAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGTATCAGCAATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGACC
937 :     TTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGAAAGTCTGGTGGACCTGAAGGCCGTAACCGCAAG
938 :     GAGCGGCTCAGGGTAAAACAGGTAATTAGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGA
939 :     AGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTTC
940 :     >Croc.atlan Croceibacter atlanticus HTCC2559 [fig|216432.3.rna.32]
941 :     ACTACGATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG
942 :     CAAGTCGAACGGCAGCGGGAAGGAGCTTGCTCCTTTGCCGGCGAGTGGCGCACGGGTGCG
943 :     TAACGCGTATACAACCTACCTTATACAGGGGTATAGCCCAGGGAAACTTGGATTAACACC
944 :     CCATAGTAATATGTTTTGGCATCATTACATATTTAAAACTACGGTGGTATAAGATGGGTA
945 :     TGCGTCCCATTAGCTTGTTGGTGTGGTAACGGCACACCAAGGCAACGATGGGTAGGGGCC
946 :     CTGAGAGGGGGATCCCCCACACTGGTACTGAGACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAG
947 :     CAGTGAGGAATATTGGACAATGGGCGGGAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGCAGGAAGA
948 :     CTGCCCTATGGGTTGTAAACTGCTTTTATACGGGAAGAAACCCACCTACGTGTAGGTGGC
949 :     TGACGGTACCGTAAGAATAAGGACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGA
950 :     GGGTCCGAGCGTTATCCGGAATCATTGGGTTTAAAGGGTCCGCAGGCGGCCAGATAAGTC
951 :     AGTGGTGAAATTCCGTGGCTCAACCACGGAACTGCCATTGATACTGTTTGGCTTGAATCA
952 :     GTTCGAGGATGCCGGAATGTGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACACAGAACAC
953 :     CAATTGCGAAGGCAGGTGTCCAGAACTGTATTGACGCTGATGGACGAAAGCGTGGGTAGC
954 :     GAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGTCACTAGCTGTCCGGAC
955 :     TTAGGTCTGGGTGGCCAAGCGAAAGTGATAAGTGACCCACCTGGGGAGTACGTTCGCAAG
956 :     AATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC
957 :     GATGATACGCGAGGAACCTTACCAGGGCTTAAATGCATTATGACAGGGGTGGAGACACCC
958 :     TTTTCTTCGGACATTTTGCAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGT
959 :     CAGGTTAAGTCCTATAACGAGCGCAACCCCTGTTGTTAGTTGCCAGCGAGTAATGTCGGG
960 :     AACTCTAGCAAGACTGCCGGTGCAAACCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCA
961 :     CGGCCCTTACGCCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCAGGTACAGCAAGCAGCCACTG
962 :     GGCGACCAGGAGCGAATCTGTAAAGCCTGTCACAGTTCGGATCGGAGTCTGCAACTCGAC
963 :     TCCGTGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCATATCAGCCATGATGCGGTGAATACGTTCCC
964 :     GGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGCTGGGAGTGCCTGAAGTCCGTCGCC
965 :     GTAAGGAGCGGCCTAGGGTAAGACCGGTAACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA
966 :     CCGGAAGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTTCTG
967 :     >Chlo.tepid Chlorobium tepidum TLS [fig|194439.1.rna.54]
968 :     CTTACAACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
969 :     CAAGTCAAAGTTTGAGTAACTTCGGTTACAAAGACTTGGCGCAAGGGTGAGTAAGGCATA
970 :     GGTAATCTGCCTTTTGGTCTGGGATAACCCCGAGAAATCGGGAACAATACCAGATGATGC
971 :     AGCGGAATCGCATGGTTATGTTGTTAAAGATTTATCGCCAAAAGATGAGCCTATGTTCCA
972 :     TCAGGTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGCCTACGACGGATAGCTGGTCTGAGAGGA
973 :     TGATCAGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGA
974 :     ATATTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGATGATGAAGTTCTTCG
975 :     GAATGTAAAATCCTTTTGCAGGAGACGAAGAGGTCGGCTTGCCGGCTGTGACGGTACCCT
976 :     GCGAATAAGCCACGGCTAACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGTGATACAGGGGTGGCAAGCGT
977 :     TGTCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGTGCGCAGGCGGATCGATAAGTCGGGGGTTAAATC
978 :     CATGTGCTTAACACATGCACGGCTTCCGATACTGTTGATCTAGAGTCTCGAAGAGGAAGG
979 :     TGGAATTTCCGGTGTAACGGTGGAATGTGTAGATATCGGAAAGAACACCAGTGGCGAAGG
980 :     CAGCCTTCTGGTCGAGTACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAG
981 :     ATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGATGTTGGTCATAGTGATCAGTG
982 :     TCGCAGCTAACGCGTTAAGTATTCCACCTGGGAAGTACGCCCGCAAGGGTGAAACTCAAA
983 :     GGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGATCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAA
984 :     GAACCTTACCTAGGCTTGATATTACAGCTAAACCTCCTGAAAGGGAGGGTCCTTCGGGGA
985 :     GCTGTAACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC
986 :     CGCAACGAGCGCAACCCCTACAATTAGTTACCATCAGGTTAAGCTGGGGACTCTAATTGA
987 :     ACTGCCTACGCAAGTAGAGAGGAGGGAGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGC
988 :     CTAGGGCCACACACGTGATACAATGGCGACTACAGAGGGCAAAGCCGCAAGGCAGAGGGA
989 :     ATCCCAAAAAAGTCGTCTCAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTTGGA
990 :     ATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATGTGTTCCCGGGCCTTGTACACAC
991 :     CGCCCGTCAAGTCATGGAAGTCAGGAGTACCCAAAGACGCTCGCGCGTTTAAGGTAAGAC
992 :     TGGTAACTGGGACTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCT
993 :     CCTTT
994 :     >Sali.ruber Salinibacter ruber DSM 13855 [gi|83814055 c3330049-3328508]
995 :     TACTACGGAGAGTTTGATCCTAGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCA
996 :     AGTCGCACGAGAACGTTCTGGCTTTGCCAGGACAAGTACAGTGGCGGACGGGTGCGTATC
997 :     GCGTAGATAACCTGCCCTCAGGCGCGGGACAATCACGGGAAACCGTGGCTAATACCGCAC
998 :     GTCGTCTGGATCCCGCATGGGGACCAGATGAAAGCCTTCGGGCGCCTTTGGATGGGTCTG
999 :     CGTTGGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATCCATAGCTGGTCT
1000 :     GAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCA
1001 :     GTGGGGAATCTTGCACAATGGGGTCACCCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGGAGGAAGACA
1002 :     CCCCTATGGGGCGTAAACTCCTTTTCTGAATGAAGAAACCCCTGTAGCTTCAGGGCGCGA
1003 :     CGGTAGTTCAGGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGG
1004 :     TGCAAGCGTTGTCCGGAATCACTGGGTGTAAAGGGTGTGCAGGCGGGGCAGCAAGTCGGA
1005 :     TGTGAAACCCCATGGCTTAACCATGGAGGTGCATTCGAAACTGTTGCTCTTGAGTCCCGG
1006 :     AGAGGCTGTCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCACGAGGAACACCAG
1007 :     AGGCGAAAGCGGACAGCTGGACGGGTACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA
1008 :     CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCTCGCCGTTGCCTCGTT
1009 :     AGGGGGCAGTGGCTAAGCTAACGCGTTAAGCATTCCACCTGGGGAGTACGATCGCAAGGT
1010 :     TGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGCTCAATTCGA
1011 :     TGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGGCTCGAACGCTAAAGGACCGCTCCTGAAAGGGAGCT
1012 :     TCCCCTTTGGGGCCTTTAGCGAGGTACTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
1013 :     TTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGTAACCCCTGTTGCTAGTTACCAGCGGATAATGCCGG
1014 :     GGACTCTAGCGAAACTGCCTGCGCAAGCAGTGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATC
1015 :     ATGGTCCTTACGCCTAGGGCTGCACACGTGCTACAATGGCCGGTACAACGAGCAGCCACC
1016 :     TCGCGAGAGGGAGCGAATCTCTGAAAACCGGTCCCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCG
1017 :     ACTCCATGAAGCAGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCAATGCCGCGGTGAATCCGTTC
1018 :     CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGCTGAGAGCACCCGAAGTCCGTGA
1019 :     CCCAACCTTTTGGGAGGGAGCGGCCGAAGGTGAGCTCAGTGACTGGGGCTAAGTCGTAAC
1020 :     AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTAAA
1021 :     >Dein.radio Deinococcus radiodurans R1 [gi|15805042 84836-86337]
1022 :     TTTATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGCGTGCTTAAGACATGCAA
1023 :     GTCGAACGCGGTCTTCGGACCGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACACGTAACTGACCTACCC
1024 :     AGAAGTCACGAATAACTGGCCGAAAGGTCCGCTAATACGTGATGTGGTGATGCACCGTGG
1025 :     TGCATCACTAAAGATTTATCGCTTCTGGATGGGGTTGCGTTCCATCAGCTGGTTGGTGGG
1026 :     GTAAAGGCCTACCAAGGCGACGACGGATAGCCGGCCTGAGAGGGTGGCCGGCCACAGGGG
1027 :     CACTGAGACACGGGTCCCACTCCTACGGGAGGCAGCAGTTAGGAATCTTCCACAATGGGC
1028 :     GCAAGCCTGATGGAGCGACGCCGCGTGAGGGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAACCTCTGA
1029 :     ATCTGGGACGAAAGAGCCTTAGGGCAGATGACGGTACCAGAGTAATAGCACCGGCTAACT
1030 :     CCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTACCCGGAATCACTGGGCGTA
1031 :     AAGGGCGTGTAGGCGGAAATTTAAGTCTGGTTTTAAAGACCGGGGCTCAACCTCGGGGAT
1032 :     GGACTGGATACTGGATTTCTTGACCTCTGGAGAGGTAACTGGAATTCCTGGTGTAGCGGT
1033 :     GGAATGCGTAGATACCAGGAGGAACACCAATGGCGAAGGCAAGTTACTGGACAGAAGGTG
1034 :     ACGCTGAGGCGCGAAAGTGTGGGGAGCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCACACCC
1035 :     TAAACGATGTACGTTGGCTAAGCGCAGGATGCTGTGCTTGGCGAAGCTAACGCGATAAAC
1036 :     GTACCGCCTGGGAAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA
1037 :     CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGAC
1038 :     ATGCTAGGAACTTTGCAGAGATGCAGAGGTGCCCTTCGGGGAACCTAGACACAGGTGCTG
1039 :     CATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
1040 :     CTTGCCTTTAGTTGTCAGCATTCAGTTGGACACTCTAGAGGGACTGCCTATGAAAGTAGG
1041 :     AGGAAGGCGGGGATGACGTCTAGTCAGCATGGTCCTTACGTCCTGGGCGACACACGTGCT
1042 :     ACAATGGGTAGGACAACGCGCAGCAAACCCGCGAGGGTAAGCGAATCGCTAAAACCTATC
1043 :     CCCAGTTCAGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCG
1044 :     GGTCAGCATACCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATG
1045 :     GGAGTAGATTGCAGTTGAAACCGCCGGGAGCTTAACGGCAGGCGTCTAGACTGTGGTTTA
1046 :     TGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACTGTACCGGAAGGTGCGGTTGGATCACCTCCT
1047 :     TT
1048 :     >Ther.ther Thermus thermophilus HB8 [gi|55771382 131300-132821]
1049 :     TTTGTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAAGACATGCA
1050 :     AGTCGTGCGGGCCGCGGGGTTTTACTCCGTGGTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTG
1051 :     GGTGACCTACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACTCGGGCTAATCCCCCATGTGGA
1052 :     CCCGCCCCTTGGGGTGTGTCCAAAGGGCTTTGCCCGCTTCCGGATGGGCCCGCGTCCCAT
1053 :     CAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCCACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGTCTGAGAGGAT
1054 :     GGCCGGCCACAGGGGCACTGAGACACGGGCCCCACTCCTACGGGAGGCAGCAGTTAGGAA
1055 :     TCTTCCGCAATGGGCGCAAGCCTGACGGAGCGACGCCGCTTGGAGGAAGAAGCCCTTCGG
1056 :     GGTGTAAACTCCTGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACTGACGGTACCGGGGTA
1057 :     ATAGCGCCGGCCAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGCGCGAGCGTTACCC
1058 :     GGATTCACTGGGCGTAAAGGGCGTGTAGGCGGCCTGGGGCGTCCCATGTGAAAGACCACG
1059 :     GCTCAACCGTGGGGGAGCGTGGGATACGCTCAGGCTAGACGGTGGGAGAGGGTGGTGGAA
1060 :     TTCCCGGAGTAGCGGTGAAATGCGCAGATACCGGGAGGAACGCCGATGGCGAAGGCAGCC
1061 :     ACCTGGTCCACCCGTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACCGGATTAGATACC
1062 :     CGGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGCGCGCTAGGTCTCTGGGTCTCCTGGGGGCCGAAGC
1063 :     TAACGCGTTAAGCGCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTG
1064 :     ACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTT
1065 :     ACCAGGCCTTGACATGCTAGGGAACCCGGGTGAAAGCCTGGGGTGCCCCGCGAGGGGAGC
1066 :     CCTAGCACAGGTGCTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCC
1067 :     CGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGTTAGTTGCCAGCGGTTCGGCCGGGCACTCTAACGGGA
1068 :     CTGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGTCTGGTCAGCATGGCCCTTACGGCC
1069 :     TGGGCGACACACGTGCTACAATGCCCACTACAAAGCGATGCCACCCGGCAACGGGGAGCT
1070 :     AATCGCAAAAAGGTGGGCCCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACCCGACCCCATGAAGCCGG
1071 :     AATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAC
1072 :     ACCGCCCGTCACGCCATGGGAGCGGGCTCTACCCGAAGTCGCCGGGAGCCTACGGGCAGG
1073 :     CGCCGAGGGTAGGGCCCGTGACTGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCTGTACCGGAAGGT
1074 :     GCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1075 :     >Synec.6803 Synechocystis sp. PCC 6803 [fig|1148.1]
1076 :     ACAATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCCTAACACATGCAA
1077 :     GTCGAACGGAGTTCTTCGGAACTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGAGAACCTACC
1078 :     TTCAGAATGGGGACAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCCAATGTGCCGAAAGGTGAAA
1079 :     GATTTATCGTCTGAAGATGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGATGGTGGGGTAAGAGCCTAC
1080 :     CATGGCAACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGAGCAGCCACACTGGGACTGAGACACG
1081 :     GCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACG
1082 :     GAGCAATACCGCGTGAGGGAGGAAGGTCCTTGGATTGTAAACCTCTTTTATCAGGGAAGA
1083 :     AGTTCTGACGGTACCTGATGAATAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
1084 :     ACGGAGGATGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGTCCGTAGGTGGTTATGC
1085 :     AAGTCTGCCGTTAAAGAATGGAGCTTAACTCCATAGGAGCGGTGGAAACTGCAAGACTAG
1086 :     AGTACAGTAGGGGTAGCAGGAATTCCCAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTGGGAAG
1087 :     AACATCGGTGGCGAAAGCGTGCTACTGGGCTGAAACTGACACTGAGGGACGAAAGCTAGG
1088 :     GTAGCGAAAGGGATTAGATACCCCTGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTG
1089 :     GCTTGTATCGACCCGAGCCGTGCCGAAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTAC
1090 :     GCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTG
1091 :     GTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATCCCTGGAATCCTGCGG
1092 :     AAACGTGGGAGTGCCTTAGGGAGCCAGGAGACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGT
1093 :     GTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTTTTTAGTTGCCATCA
1094 :     TTAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGT
1095 :     CAAGTCATCATGCCCCTTACGCCTTGGGCTACACACGTACTACAATGGTCGGGACAACGG
1096 :     GCAGCGAGCTCGCGAGAGTAAGCGAATCCCATCAAACCCGGCCTCAGTTCAGATTGCAGG
1097 :     CTGCAACTCGCCTGCATGAAGGAGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGAATACTGCGGTG
1098 :     AATTCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGCTGGTCACGCCCGA
1099 :     AGTCGTTACTCTAACCTTAGGGAGGAGGGCGCCGAAGGCAGGGCTAGTGACTGGGGTGAA
1100 :     GTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGTGGCTGGATCACCTCCTTTA
1101 :     >Marc.polym_c Marchantia polymorpha chloroplast [fig|3197.1.rna.44]
1102 :     TCTCATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCA
1103 :     AGTCGTACGGGAAGGATCCTAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAG
1104 :     AACCTGCCCTTGGGAGGGGGACAACAGCTGGAAACGGTTGCTAATACCCCATAGGCTGAG
1105 :     GAGCAAAAGGAGGAATCCGCCTAAGGAGGGGCTTGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGT
1106 :     AATAGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGA
1107 :     CTGAGACACGGCCCAGACTCTTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGA
1108 :     AACGTGACGGAGCAATGCCGCGTGGAGGTAGAAGGCTCACGGGTCGTAAACTCCTTTTCT
1109 :     CAGAGAAGATGCAATGACGGTATCTGAGGAATAAGCATCGGCTAACTCTGTGCCAGCAGC
1110 :     CGCGGTAAGACAGAGGATGCAAGCGTTATCCGGAATGATTGGGCGTAAAGCGTCTGTAGG
1111 :     TGGCTTTTTAAGTCCGCCGTCAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGACAGGCGGTGGAAACTA
1112 :     CCAAGCTGGAGTACGGTAGGGGCAGAGGGAATTTCCGGTGGAGCGGTGAAATGCGTAGAG
1113 :     ATCGGAAAGAACACCAATGGCGAAAGCACTCTTCTGGGCCGACACTGACACTGAGAGACG
1114 :     AAAGCTAGGGGAGCAAATGGGATTAGATACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATA
1115 :     CTAAGCGCTGTGCTATCGACCCGTGCAGTGCTGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTG
1116 :     GGGAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGG
1117 :     AGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATGCCGTGAA
1118 :     TCTTTTTGAAAGAAAAGAGTGCCTTCGGGAACGCGGACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGT
1119 :     CAGCTCGTGCCGTAAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCTTGTTTAGT
1120 :     TGCCATCATTAAGTTTGGAACCCTAAACAGACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGAG
1121 :     GATGACGTCAAGTCAGCATGCCCCTTACGCCCTGGGCGACACACGTGCTACAATGGCCGG
1122 :     GACAAAGGGTCGCGACCTCGCGAGAGAAAGCTAACCTCAAAAACCCGGCCTCAGTTCGGA
1123 :     TTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCCATA
1124 :     CGGCGGTGAATCCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACTATGGGAGCTGGCC
1125 :     ATGCCCGAAGTCGTTACTCTAACCGTAAGGAGGGGGGTGCCGAACAGGGGCTAGTGACTG
1126 :     GAGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACTGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCC
1127 :     >Toxo.gondi_p Toxoplasma gondii plastid [fig|5811.1.rna.36]
1128 :     AAATTATTACGAGTTTGATCCTGGCTCCGGAAGAACGCAAGAGATGTGCTTAACACATGC
1129 :     TAATTGAATGGTATTAATATATCATAGTGTAATAGTGAGTAATGTATGAGAATTTATTTT
1130 :     TAGAATATAATAAAAATTTAATAATTTATAATAAACGCAATAGTGTTTTAAAAGATAATT
1131 :     ATTGTCTAAAAAAAAGCTCATATCTAATTAGCTAGTTGGTGAAGTAATAGTTTTACCAAG
1132 :     GCGAAGATTAGTAGCTGCCTTGAGAGGGGAAACAGCCACATAGAGATTGAAATACAGCTC
1133 :     TAACTCCTAAGGGGGGCAGCAGTGGGGAATTTTCTGCCAATAAGCGCAAGCTTGACAGAG
1134 :     CGTCATCACATGAAGGAGGAAGGCCTATAAAGGTTGTAAACTTCTTTTGCTTAAAAAAAT
1135 :     AATACTGACGTTTAAGTTTAAAAAGTATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTCATA
1136 :     CGGGGGATACAAGCGTTTTCCAAAATTACTGGGCGTAAAGTGTATGTAGGTGGATTGGTA
1137 :     TGTTCTTCCTTAAATACTATTTGATAAATTTAGAAAAAGGAAGAAAACTATTAATCTTGA
1138 :     GTTCGATAAGGGTAAGAGGAATTTTTTGAGGAGTAGTGAAATGCGAAGATACAAAAAAGA
1139 :     AGATCAACAGCGAAAGCATCTTACTGGGTCGATACTGACACTGAGATACGAAAGTTAAGG
1140 :     TAGCAAATGGGATTAGATACCCCAGTAGTCTTAACTGTAAACAATGGATACTCGGTACTG
1141 :     GAGACATTAAATATATAAATTCAGTACCCTAGCTAACGCGTTAAGTATTCCGCCTGAGTA
1142 :     GTACGCTCGCAAGGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCTCGTACAAGCGGTGGAGCA
1143 :     CGTAATTTAATTCGATGTAACGCGATAAACCTTACCAGAACTAGACTAAATTTATTTTAA
1144 :     ATTATTAATATTAATTAATAAAAAATTTACAGGAGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGT
1145 :     CGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCTACGAGCGCTACCCTTATTTAAAGTTTTTTATATC
1146 :     TTTAAAAACAGACTATATAAATTTTTGTACTAAATTAGTAGGAAGGAGAGGAAAACGTCA
1147 :     AGTCTTTATGCCCTTTATGTTCTGGGCTACATACGTGCTACAATAGATGGTACAATAATT
1148 :     TTTAAAAATAAATACAATATCAATTTATTTTTAATTTATTTGTGAAAATAAATGTAATAA
1149 :     TTGAAAACCATTTTTAGTTCGGAACATAAACTGCAATTTGTTTATGTAAAGTTGGAATCG
1150 :     CTAGTAATCGCCGGTCAGCATTACGGCGGTGAATAAGTCTTCGAGCCTTGTACACACCGC
1151 :     CCGTCACGCCACGGAAATTGATTATTTTTTAAAACTTTTGATAAAAGGATAAATAATAAT
1152 :     AAATAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCTGTACTGGAAGGTGCTGCTGGATAA
1153 :     >Cyan.calda_c Cyanidium caldarium cyanelle [fig|2771.1.rna.10]
1154 :     ATATTATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC
1155 :     AAGTCGTACGAAAACTTTAATGTTTTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGAATTTG
1156 :     CCCTTAGGAAGAGAATAACGATTGGAAACGATCGCTAATACTCTATATCTCTAAGTTTTA
1157 :     ATTTAGATGAAAAAGATTAGATTTGTACATTGTGTAGATTTAATCTGCCTAAGGAGAAGC
1158 :     TCGCGGCTGATTAGCTAGTTGGTAAGGTAAATGCTTACCAAGGCTATGATCAGTAGCTGG
1159 :     TCTAAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCA
1160 :     GCAGTGGGGAATTTTCTGCAATGGGCGCAAGCCTGACAGAGCAATACCGCGTGAAGGAAG
1161 :     AAGGCCTTAGGGTTGTAAACTTCTTTTGTTAGGGAAGAAATTTTGACGGTACCTAAAGAA
1162 :     TAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGGGATGCAAGCGTTATCC
1163 :     GGAATTATTGGGCGTAAAGCGTTTGTAGGTGGTTTAGCAAGTCTGTTGTTAAATCTTGAG
1164 :     GCTTAACTTCAAACAAGCAAGAGAAACTGCTAGACTAGAGTGTGGTGGAGGCAGAGGGAA
1165 :     TTTCCAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTGGAAAGAACACCAGAAGCGAAAGCGCTT
1166 :     TGCTATACCAAAACTGACACTGAGAAACGAAAGCTAGGGGAGCAAATGGGATTAGATACC
1167 :     CCAGTAGTCCTAGCTGTAAACTATGGATACTAGATGTTGCGTAAAAGATTATGCAGTGTC
1168 :     ATAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGAAGTACGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGG
1169 :     AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGA
1170 :     ACCTTACCAAAGCTTGACATGTTGCGAATTTCTTTAATCAAGAAAGTACCTTTTGGAACG
1171 :     CAAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCC
1172 :     GCAACGAGCGCAACCCTTGTTTTTAGTTGCCACCATTAAGTTGGGAACTTTAAAAAGACT
1173 :     GCCAGTGACAAGCTGGAGGAAGGTGAGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGCTTT
1174 :     GGGCTACACACGTGCTACAATGACTAAGACAACGAGTCGCAAAGTTGTGAAACCTAGCTA
1175 :     ATCTCTTAAACTTAGTCTCAGTTCAGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGACGGA
1176 :     ATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCCACACGGCGGTGAATTTGTTCCCGGGCCTTGTACACA
1177 :     CCGCCCGTCACACCATGGAAGCTGATTGTGCCCGAAGTCGTTTTTTCTCCATAACAATGG
1178 :     TAGTAAGCGCCTAAGGCAAAATTAGTGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACT
1179 :     GGAAGGTGCGGCTGGATTACCTCC
1180 :     >Cyan.merol_c Cyanidioschyzon merolae chloroplast [fig|45157.1.rna.34]
1181 :     CAAAAGAAGCGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC
1182 :     AAGTCGAACGCGCGTAAGTGGCGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGAATCTGCCCCT
1183 :     AGGAGTTGGATAAGGCTTGGAAACGAGCGCTAAACCAACATATAAGGAAAGGAGAGATCG
1184 :     CCTAGGGAAGAGCTCGCGGCTGATTAGCTAGTTGGTAGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGAT
1185 :     GATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT
1186 :     CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCTGCAATGGGCGAAAGCCTGACAGAGCAATAC
1187 :     CGCGTGAGGGATGAAGGCCTTAGGGTTGTCAACCTCTTTTGATGGGGAAGAATAGATGAC
1188 :     GGTACCCATAGAAAAAGCATCGGCAAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGGGGGAT
1189 :     GCAAGCGTTATCCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGTCTGTAGGTGGTGATGCAAGTCACTG
1190 :     GTGCAAAACTCTGGCTCAACCGGAGGAAAGCCAGTGAAACTGCATGACTAGAGTGTGGGA
1191 :     GAGGTAGAAGGAATTCCCTGAGTAGCGGTGAAATGCGTAGATACAGGGAAGAACACCGGA
1192 :     GGCGAAAGCGTTCTACTGGAACACAACTGACACTGAGAGACGAAAGCTAGGGGAGCGAAT
1193 :     GGGATTAGATACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGACGTTGGCCTAAGC
1194 :     CAGTGTCGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGAAGTACGCTCGCAAGAGTGAAAC
1195 :     TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAAC
1196 :     GCGAAGAACCTTACCAGTACTTGACATGTGGTGAAGTGACCTTAATGGGTCACAAGGACG
1197 :     GCAACGTCCACACCAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
1198 :     GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTTAGTTAAAGTATCTAGAGAGACTGC
1199 :     CGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGAGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTACTGG
1200 :     GCGACACACGTGCTACAATGGCGCAGACAAACAGTGAATCTGAGAAACTGCGCCCAAGTT
1201 :     CAGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGC
1202 :     CATACGGCGGTGAATCCGTACCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGCT
1203 :     GGCCATGCCCGAAGTGATGTTACCATCCCCACGGCAGGGCTAGTGACTGGGGTGAAGTCG
1204 :     TAACAAGGTAGCCGTACTGGAAGGTGCGGCTGGATTACCTCC
1205 :     >Eugl.graci_c Euglena gracilis chloroplast [fig|3039.1.rna.49]
1206 :     TGGAAATGACGAGTTTGATCCTTGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC
1207 :     AAGTTGAACGAAATTACTAGCAATAGTAATTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAATATGTAAG
1208 :     AATCTGCGCTTGGGTGAGGAATAACAGATGGAAACGTTTGCTAATGCCTCATAATTTACT
1209 :     AGATCTATGTGAGTAGCTAGTTAAAGAGAATTTCGCCTAGGCATGAGCTTGCATCTGATT
1210 :     AGCTTGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGATTTGAGAGGATG
1211 :     ATCAGCCACACTGGGATTGAGAACGGAACAGACTTTTACGGAAGGCAGCAGTGAGGAATT
1212 :     TTCCGCAATGGGCGCAAGCCTGACGGAGCAATACCGCGTGAAGGAAGAAGGCCTTTGGGT
1213 :     TGTAAACTTCTTTTCTCAAAGAAGAAGAAATGACGGTATTTGAGGAATAAGCATCGGCTA
1214 :     ATTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGAGATGCGAGCGTTATCCGGAATTATTGGGC
1215 :     GTAAAGAGTTTGTAGGCGGTCAAGTGTGTTTAATGTTAAAAGTCAAAGCTTAACTTTGGA
1216 :     AGGGCATTAAAAACTGCTAGACTTGAGTATGGTAGGGGTGAAGGGAATTTCCAGTGTAGC
1217 :     GGTGAAATGCGTAGAGATTGGAAAGAACACCAATGGCGAAGGCACTTTTCTAGGCCAATA
1218 :     CTGACGCTGAGAAACGAAAGCTGAGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCTTGG
1219 :     CCGTAAACTATGGATACTAAGTGGTGCTGAAAGTGCACTGCTGTAGTTAACACGTTAAGT
1220 :     ATCCCGCCTGGGGAGTACGCTTGCACAAGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA
1221 :     CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACACGAAGAACCTTACCAGGATTTGAC
1222 :     AGGATCTAGGAGGAAGTTTGAAAGAACGCAGTACCTTCGGGTATCTAGACACAGGTGGTG
1223 :     CATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACCCTTTTTTTT
1224 :     AATTAACGCTTGTCATTTAGAAATACTGCTGGTTATTACCAGAGGAAGGTGAGGACGACG
1225 :     TCAAGTCATCATGCCCCTTATATCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTAAGACAATA
1226 :     AGTTGCAATTTTGTGAAAATGAGCTAATCTTAAAACTTAGCCTAAGTTCGGATTGTAGGC
1227 :     TGAAACTCGCCTACATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCTATACGGCGGTG
1228 :     AATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGAAGTTGGCTGTGCCCGA
1229 :     AGTTATTATCTTGCCTGAAAAGAGGGAAATACCTAAGGCCTGGCTGGTGACTGGGGTGAA
1230 :     GTCGTAACAAGGTAGCCGTACTGGAAGGTGTGGCTGGAACAATT
1231 :     >Borr.burg Borrelia burgdorferi B31 [gi|15594346 c446118-444581]
1232 :     AAATAACGAAGAGTTTGATCCTGGCTTAGAACTAACGCTGGCAGTGCGTCTTAAGCATGC
1233 :     AAGTCAAACGGGATGTAGCAATACATTCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGATGAT
1234 :     CTACCTATGAGATGGGGATAACTATTAGAAATAGTAGCTAATACCGAATAAGGTCAGTTA
1235 :     ATTTGTTAATTGATGAAAGGAAGCCTTTAAAGCTTCGCTTGTAGATGAGTCTGCGTCTTA
1236 :     TTAGCTAGTTGGTAGGGTAAATGCCTACCAAGGCAATGATAAGTAACCGGCCTGAGAGGG
1237 :     TGAACGGTCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGCTAAGA
1238 :     ATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCGACACTGCGTGAATGAAGAAGGTCGAAA
1239 :     GATTGTAAAATTCTTTTATAAATGAGGAATAAGCTTTGTAGGAAATGACAAAGTGATGAC
1240 :     GTTAATTTATGAATAAGCCCCGGCTAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAAGGG
1241 :     GCGAGCGTTGTTCGGGATTATTGGGCGTAAAGGGTGAGTAGGCGGATATATAAGTCTATG
1242 :     CATAAAATACCACAGCTCAACTGTGGACCTATGTTGGAAACTATATGTCTAGAGTCTGAT
1243 :     AGAGGAAGTTAGAATTTCTGGTGTAAGGGTGGAATCTGTTGATATCAGAAAGAATACCGG
1244 :     AGGCGAAGGCGAACTTCTGGGTCAAGACTGACGCTGAGTCACGAAAGCGTAGGGAGCAAA
1245 :     CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCTACGCTGTAAACGATGCACACTTGGTGTTAACTAAAA
1246 :     GTTAGTACCGAAGCTAACGTGTTAAGTGTGCCGCCTGGGGAGTATGCTCGCAAGAGTGAA
1247 :     ACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGAT
1248 :     ACGCGAGGAACCTTACCAGGGCTTGACATATATAGGATATAGTTAGAGATAATTATTCCC
1249 :     CGTTTGGGGTCTATATACAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCTGTGAGGTGTTG
1250 :     GGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTATCTGTTACCAGCATGTAATGGTGGGGA
1251 :     CTCAGATAAGACTGCCGGTGATAAGTCGGAGGAAGGTGAGGATGACGTCAAATCATCATG
1252 :     GCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCTGTACAAAGCGAAGCGAAACAG
1253 :     TGATGTGAAGCAAAACGCATAAAGCAGGTCTCAGTCCGGATTGAAGTCTGAAACTCGACT
1254 :     TCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTATATCAGAATGATACGGTGAATACGTTCTCGG
1255 :     GCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACCCGAGTTGAGGATACCCGAAGCTATTATTCTA
1256 :     ACCCGTAAGGGAGGAAGGTATTTAAGGTATGTTTAGTGAGGGGGGTGAAGTCGTAACAAG
1257 :     GTAGCCGTACTGGAAAGTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
1258 :     >Trep.dent Treponema denticola ATCC 35405 [gi|42516522 610184-611729]
1259 :     ATGATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGCGTCTTAAGCATGCAAGTCGAACGGT
1260 :     AAGGGAGAGCTTGCTCTCCCCTAGAGTGGCGGACTGGTGAGTAACGCGTGGGTGACCTGCCCTGAAGATG
1261 :     GGGATAGCTAGTAGAAATATTAGATAATACCGAATGTGCTCATTTACATAAAGGTAAATGAGGAAAGGAG
1262 :     CTACGGCTCCGCTTCAGGATGGGCCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCCCACCAAGGCAA
1263 :     CGATGGGTATCCGGCCTGAGAGGGTGAACGGACACATTGGGACTGAGATACGGCCCAAACTCCTACGGGA
1264 :     GGCAGCAGCTAAGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCGACGCCGTGTGAATGAAGAAGGCC
1265 :     GAAAGGTTGTAAAATTCTTTTGCAGATGAAGAATAAGAAGAAGAGGGAATGCTTCTTTGATGACGGTAGT
1266 :     CATGCGAATAAGCCCCGGCTAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAACACGTAAGGGGCGAGCGTTGTTCGG
1267 :     AATTATTGGGCGTAAAGGGTATGTAGGCGGTTAGGTAAGCCTGGTGTGAAATCTACGAGCTCAACTCGTA
1268 :     AACTGCATTGGGTACTGCTTGACTTGAATCACGGAGGGGAAACCGGAATTCCAAGTGTAGGGGTGGAATC
1269 :     TGTAGATATTTGGAAGAACACCGGTGGCGAAGGCGGGTTTCTGGCCGATGATTGACGCTGATATACGAAG
1270 :     GTGCGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCGCACAGTAAACGATGTACACTAGGTGTCGGGG
1271 :     CAAGAGCTTCGGTGCCGACGCAAACGCATTAAGTGTACCGCCTGGGAAGTATGCCCGCAAGGGTGAAACT
1272 :     CAAAGGAATTGACGGGGGCCCACACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAGAAACCT
1273 :     TACCTGGGTTTGACATCAAGAGCAATGACATAGAGATATGGCAGCGTAGCAATACGGCTCTTGACAGGTG
1274 :     CTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTACTG
1275 :     CCAGTTACTAACAGGTAAAGCTGAGGACTCTGGCGGAACTGCCGATGACAAATCGGAGGAAGGTGGGGAT
1276 :     GACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGCTACAAATCGAAGC
1277 :     GACACCGCGAGGTCAAGCAAAACGCAAAAAAGCAATCGTAGTCCGGATTGAAGTCTGAAACTCGACTTCA
1278 :     TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCACATCAGCACGGTGCGGTGAATACGTTCCTGGGCCTTGTACACAC
1279 :     CGCCCGTCACACCATCCGAGTCGAGGGTACCCGAAGTCGCTAGTCTAACCCGTAAGGGAGGACGGTGCCG
1280 :     AAGGTACGTTTGGTAAGGAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCT
1281 :     CCTTTC
1282 :     >Lept.inter Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 [fig|267671.1.rna.20]
1283 :     AACACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACTAACGCTGGCGGCGCGTCTTAAACATGCAA
1284 :     GTCAAGCGGAGTAGCAATACTCAGCGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGGTAATCTTCCT
1285 :     CTGAGTCTGGGATAACTTTCCGAAAGGGAAGCTAATACTGGATGGTCCCGAGAGATCATA
1286 :     AGATTTTTCGGGTAAAGATTTATTGCTCGGAGATGAGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGG
1287 :     TGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGTTCGGCCACA
1288 :     ATGGAACTGAGACACGGTCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTTAAGAATCTTGCTCAAT
1289 :     GGGGGGAACCCTGAAGCAGCGACGCCGCGTGAACGATGAAGGTCTTCGGATTGTAAAGTT
1290 :     CAGTAAGCAGGGAAAAATAAGCAGCAATGTGATGATGGTACCTGCCTAAAGCACCGGCTA
1291 :     ACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATCATTGGGC
1292 :     GTAAAGGGTGCGTAGGCGGACATGTAAGTCAGGTGTGAAAACTGCGGGCTCAACTCGCAG
1293 :     CCTGCACTTGAAACTATGTGTCTGGAGTTTGGGAGAGGCAAGTGGAATTCCAGGTGTAGC
1294 :     GGTGAAATGCGTAGATATCTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTGCTGGCCTAAAA
1295 :     CTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGTAGTGAACGGGATTAGATACCCCGGTAATCCACG
1296 :     CCCTAAACGTTGTCTACCAGTTGTTGGGGGTTTTAACCCTCAGTAACGAACCTAACGGAT
1297 :     TAAGTAGACCGCCTGGGGACTATGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGT
1298 :     CCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAAAAACCTCACCTAGGC
1299 :     TTGACATGGAGTGGAATCATGTAGAGATACATGAGCCTTCGGGCCGCTTCACAGGTGCTG
1300 :     CATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
1301 :     CTCACCTTATGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCGTAAGGAACTGCCGGTGACAAACCG
1302 :     GAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCCTCATGGCCTTTATGTCTAGGGCAACACACGTGC
1303 :     TACAATGGCCGGTACAAAGGGTAGCCAACTCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAAAAATCCGG
1304 :     TCCCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGC
1305 :     GGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGACCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAC
1306 :     CTGAGTGGGGAGCACCCGAAGTGGTCTTTGCCAACCGCAAGGAAGCAGACTACTAAGGTG
1307 :     AAACTCGTGAAGGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATC
1308 :     ACCTCCTTT
1309 :     >Amin.colom Aminobacterium colombiense [TTCGGCTTAGA,gi|4079807]
1310 :     TTCGGCTTAGA
1311 :     GTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCTTGTTTAACACATGCAAGTTGTACGGG
1312 :     ACGGATATTGAAGCGACTTTTCGGAGTGGTGGATATATTTGTTTAGTAGCGGACGGGTGA
1313 :     GTAATGCATGAGAACCTGCCCTTCAGAGGGGGACAACAGTTGGAAACGGTTGCTAATACC
1314 :     CCATATGCCGAGAGGTGAAAGGAGCGATCCGCTGAAGGAGTGGCTCATGTCCTATCAGCT
1315 :     AGTTGGTGAGGTAAGTGCTCACCAAGGCGATGACGGGTACCCGGCCTGAAAGGGCGACCG
1316 :     GCCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTG
1317 :     GGCAATGGGCGGAACCTGACCCACCGACGCCGCGTGAGGGAAGAAGGCCTTTGGNTCGTA
1318 :     AACCTCTGTTGTATGGGAAGAAGGAAGTGACGGTACCATACGAGGAAGTCCCGGCTAACT
1319 :     ACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGACGAGCGTTGTCCGGAATTATCGGGCGTA
1320 :     AAGGGCGCGCAGGCGGATATTTAAGTCAGCTGTTAAAGTCATGGGCTCAACTCATGGATG
1321 :     CGGTTGAAACTGGGTATTTAGAGTGCTGGAGAGGTAGGCGGAATTCCCGGTGTAGCGGTG
1322 :     AAATGCGTAGATATCGGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTACTGGCCAGCAACTGA
1323 :     CGCTGAGGCGCGAAAGCCAGGGGAGCGAACGGGATTAGATACCCCGGTAGTCCTGGCCGT
1324 :     AAACGATGAATGCTAGGTGTGGGTGTCGAGAGGCATCCGTGCCGGAGTTAACGCGATAAG
1325 :     CATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGC
1326 :     ACAAGCGGTGGAGCACGTGGTTTAATTCGATGCAAACCGAAGAACCTTACCTAGGTTTGA
1327 :     CATGTACGTGGTACGGATCTGAAAGGAGAAGGACCTAGCCTTCGGGCAAGGAGCGTACAC
1328 :     AGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGA
1329 :     GCGCAACCCCTGCATCCAGTTACCATCGAGTGAAGTCGGGGACTCTGGATGGACTGCCAA
1330 :     CGACAAGCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGCCTAGGGCG
1331 :     ACACACGTGCTACAATGGCCGATACAGCGGGAAGCTAGCCTGCGAAGGTATGTGGATCCC
1332 :     ACAAAGTCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGTGTGCAACTCGACTGCATGAAGGAGGAATCGC
1333 :     TAGTAATCGCGGATCAGCCAAGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCC
1334 :     CGTACACCACCCGAGTTGGGTGCACCCGAAGCCGGAGGCTTAACCTTTCGAGGAAGGATC
1335 :     CGTCTAAGGTGTGTCTGGTGAGGGGGGTGAANTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGT
1336 :     GCGGCTGGATCACCTCCNT
1337 :     >Anae.mobil Anaerobaculum mobile [gi|14494874, trimmed]
1338 :     TTCGGCTTAGAGTTGGATCCTGGCTCAGGACG
1339 :     AACGCTGGCGGCGCGCTTAACACATGCAAGTCGTGCGGTGTCGAAGGCAAGTCTTACGACAAGCCTTCGA
1340 :     CACAGCGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGTAGCTGTCCTAAGGAGGGGGATAACGCCTGGAAACGGGT
1341 :     GCTAATACCCCATATGCCTCGCAAGAGGTGAAAGTGTACTTGTTACAGCCTTAGGGTGTGCTCGCGGCCT
1342 :     ATCAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCTAAGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGTACGGCC
1343 :     ACACTGGAATTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGGGCAATGGGCGAA
1344 :     AGCCTGACCCAGCGACGCCGCGTTGGGGATGAAGCCCTTCGGGGCGTAAACCCATGTTGTAGGGGACGAA
1345 :     GAAAGTGACGGTACCCTACGAGAAAGCCCTGGCCAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAAACGTAGGGGG
1346 :     CGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCACGCAGGCGGTACGCCAAGTCGGGGGTGTAAAGTTA
1347 :     CGGCTCAACCGTGACCTTGCAATCGATACTGGCGTACTGGAGTGCGGGAGAGGGAAGTGGAATTCCCGGT
1348 :     GTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACGCCAGTGGCGAAGGCGGCTTCCTGGCCCGCGACTGAC
1349 :     GCTCATGTGCGAAAGCCAGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCCGTAAACGATGGGT
1350 :     GCTAGGTGTAGGCGCGTCAAGCGTCTGTGCCGCAGTTAACGCGATAAGCACCTCGCCTGGGGAGTACGGT
1351 :     CGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCACGTGGTTTAATTCGATG
1352 :     CAAACCGAAGAACCTTACCTGGGTTTGACATGCAGGTGGTACGAGCCTGAAAGGGCGAGGACCGCATCTT
1353 :     CGGATGCGGAGCCTGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC
1354 :     CGCAACGAGCGCAACCCCTGCGCCTAGTTGCCATCAGTTAGGCTGGGCACTCTAGGCGGACTGCCGGCGA
1355 :     CAAGTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCTTTAAGCCCAGGGCGACACACGTGCTAC
1356 :     AATGGCCAGCACAGAGGGCTGCAAGTCCGCGAGGACAAGCGAATCCCTTAAAGCTGGTCTCAGTTCGGAT
1357 :     TGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCCATACGGCGGTGAAT
1358 :     ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACCCGAGTTGGGTGCTCCCGAAGCCGCCGGCCCA
1359 :     ACCCCGTAAGGGGAGGGAGGCGTCGAAGGAGTGTCTGATAAGGGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGT
1360 :     ACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
1361 :     >Ther.tengc Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 [fig|273068.3]
1362 :     GATTAGCTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
1363 :     CAAGTCGAGCGGGCCTGTCAAGGCGTTATGTTTTGGCAGGTTAAGCGGCGGACGGGTGAG
1364 :     TAACGCGTGAGCAACCTACCCTTGAGACAGGGATAACCCTGGGAAACCGGGGCTAATACC
1365 :     TGATATACTCTATTAGGGCATCCTGATGGAGGAAAGGGCGGGAAGCCGCTCAAGGATGGG
1366 :     CTCGCGTCCCATCAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCTACGACGGGTAGCCG
1367 :     GCCTGAGAGGGTGGTCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
1368 :     AGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCGACGCCGCGTGAGCGAA
1369 :     GAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCGATAGTGTGGGAAGAAGGGATGACGGTACCACACGA
1370 :     AAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCG
1371 :     GAGTTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTTAGCAAGTCAGGTGTAAAAGGCCACGG
1372 :     CTCAACCGTGGATATGCATCTGAAACTGCTGAGCTAGAGGGCAGGAGAGGGGAGTGGAAT
1373 :     TCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAATACCAGTGGCGAAGGCGACTC
1374 :     CCTGGACTGGCCCTGACGCTGAGGCGCGAGAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCC
1375 :     TGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGGGTGCTAGGTGTGGGGAGCGGAAGCTTTCCGTGCCG
1376 :     TAGGAAACCCAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGA
1377 :     ATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAA
1378 :     CCTTACCAGGGCTTGACATGCAGGTAGTAGCGAGCCGAAAGGTGAGCGACCCTTTCTTAT
1379 :     GGGAGGGAGCCTGCACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGG
1380 :     TTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGCCTCTAGTTGCCATCGGGTAAAGCCGGGCACT
1381 :     CTAGAGGGACTGCCGTCGACAAGACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCC
1382 :     CTATATGCCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGAAGCGAAGGAGCG
1383 :     ATCCGGAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGC
1384 :     ATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATGCGTTCCCGGGC
1385 :     CTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTCTGCAACACCCGAAGCCGGTGGCCCAAC
1386 :     CCGAAGAGGGAGGGAGCCGTCGAAGGTGGGGCAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGG
1387 :     TAGCCGTACGGGAACGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
1388 :     >Ther.xylan Thermoanaerobacterium xylanolyticum [ATRAACATGAGA,gi|349572]
1389 :     ATRAACATGAGA
1390 :     GTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGAT
1391 :     CCGGCACTCAACTAAGCGCTTACAGNTTTNTNAGACAGCNAAGAGAGNAGTAAGCAGTTT
1392 :     NNAGAGAGAAATAAGAGTAAACGCGGAGTTGAGTGCCGGATAGCGGCGGACGGGTGAGTA
1393 :     ACGCGTGGACAATCTACCCTGTAGACTGGGATAACACCCCGAAAGGGGTGCTAATACCGG
1394 :     ATAATGTCAAGTAATGGCATCATTGCTTGAAGAAAGGAGAAATCCGCTATAGGATGAGTC
1395 :     CGCGTCCCATTAGCTAGTTGGCGGGGTAAAAGCCCACCAAGGCGACGATGGGTAGCCGGC
1396 :     CTGAGAGGGTGATCGNCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
1397 :     CAGTGGGGAATATTGTTCAATGGGGGAAACCCTGACACAGCGACNCCGCGTGAGCGAAGA
1398 :     AGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCAATAGTATGGGAAGATAATGACGGTACCATACGAAAGC
1399 :     CCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAAT
1400 :     TACTGGGCGTAAAGAGCACGTAGGCGGCTATAAAAGTCAGATGTGAAAAACCTGGGCTCA
1401 :     ACCGAGGGTATGCATCTGAAACTAAATAGCTTGAGTCAAGGAGAGGAGAGCGGAATTCCT
1402 :     GGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCAGGAAGAATACCAGTGGCGAAAGCGGCTCTCTG
1403 :     GACTTGAACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGT
1404 :     AGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTGGGTTAGTATAATCCGTGCCGGAGTTAA
1405 :     CGCAATAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACG
1406 :     GGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACC
1407 :     AGGGCTTGACATCCACAGAATCCGGTAGAAATACCGGAGTGCCTCGAAAGAGGAGCTGTG
1408 :     AGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCA
1409 :     ACGAGCGCAACCCCTGTTGGTAGTTACCAGCGTAAAGGCGGGGACTCTACCGAGACTGCC
1410 :     GTGGATAACACGGAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTTTATGCCCTGGG
1411 :     CTACACACGTGCTACAATGGCCTGAACAGAGGGCAGCGAAGGAGCGATCCGGAGCGAATC
1412 :     CCAGAAAACAGGTCCCAGTTCAGATTGCAGGCTGCAACCCGCCTGCATGAAGACGGAGTT
1413 :     GCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGC
1414 :     CCGTCACACCACGAGAGTTTACAACACCCGAAGTCAGTGACCTAACCGCAAGGAAGGAGC
1415 :     TGCCGAAGGTGGGGTAAATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCCCATCGGAAGGT
1416 :     GCGGCTGGATCACCTCCTTTC
1417 :     >Deha.ethen Dehalococcoides ethenogenes 195 [gi|57233530 c929873-928439]
1418 :     TTGAGCTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCGTGCCTTATGCATG
1419 :     CAAGTCGAACGGTCTTAAGCAATTAAGATAGTGGCAAACGGGTGAGTAACGCGTAAGTAA
1420 :     CCTACCTCTAAGTGGGGGATAGCTTCGGGAAACTGAAGGTAATACCGCATGTGATGGGCT
1421 :     GACATAAGTCGGTTCATTAAAGCCGCAAGGTGCTTGGTGAGGGGCTTGCGTCCGATTAGC
1422 :     TAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGGCTTCGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATC
1423 :     AGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGCAAGGAATCTT
1424 :     GGGCAATGGGCGAAAGCCTGACCCAGCAACGCCGCGTGAGGGATGAAGGCTTTCGGGTTG
1425 :     TAAACCTCTTTTCACAGGGAAGAATAATGACGGTACCTGTGGAATAAGCTTCGGCTAACT
1426 :     ACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGAAGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTA
1427 :     AAGTGAGCGTAGGTGGTCTTTCAAGTTGGATGTGAAATTTCCCGGCTTAACCGGGACGTG
1428 :     TCATTCAATACTGTTGGACTAGAGTACAGCAGGAGAAAACGGAATTCCCGGTGTAGTGGT
1429 :     AAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGAGGCGAAGGCGGTTTTCTAGGTTGTCACTG
1430 :     ACACTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGAATTAGATACTCTGGTAGTCCACGCCT
1431 :     TAAACTATGGACACTAGGTATAGGGAGTATCGACCCTCTCTGTGCCGAAGCTAACGCTTT
1432 :     AAGTGTCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCC
1433 :     CGCACAAGCAGCGGAGCGTGTGGTTTAATTCGATGCTACACGAAGAACCTTACCAAGATT
1434 :     TGACATGCATGAAGTAGTGAACCGAAAGGGAAACGACCTGTTAAGTCAGGAGTTTGCACA
1435 :     GGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTTGGTTAAGTCCTGCAACGAG
1436 :     CGCAACCCTTGTTGCTAGTTAAATTTTCTAGCGAGACTGCCCCGCGAAACGGGGAGGAAG
1437 :     GTGGGGATGACGTCAAGTCAGCATGGCCTTTATATCTTGGGCTACACACACGCTACAATG
1438 :     GACAGAACAATAGGTTGCAACAGTGTGAACTGGAGCTAATCCCCAAAGCTGTCCTCAGTT
1439 :     CGGATTGCAGGCTGAAACCCGCCTGCATGAAGTTGGAGTTGCTAGTAACCGCATATCAGC
1440 :     AAGGTGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACGTCATGAAAGCCG
1441 :     GTAACACTTGAAGTCGATGTGCCAACCGCAAGGAGGCAGTCGCCGAGGGTGGGACTGGTA
1442 :     ATTGGGACGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGCGGAAGCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
1443 :     >Baci.subti Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 [fig|224308.1]
1444 :     TTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCA
1445 :     AGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACAC
1446 :     GTGGGTAACCTGCCTGTAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGG
1447 :     TTGTTTGAACCGCATGGTTCAAACATAAAAGGTGGCTTCGGCTACCACTTACAGATGGAC
1448 :     CCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGA
1449 :     CCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCA
1450 :     GCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATG
1451 :     AAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTACCGTTCGAATAGGGC
1452 :     GGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTA
1453 :     ATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTTC
1454 :     TTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACT
1455 :     TGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGA
1456 :     GGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGT
1457 :     GGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTG
1458 :     TTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGT
1459 :     ACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATG
1460 :     TGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCCT
1461 :     AGAGATAGGACGTCCCCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTC
1462 :     GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAG
1463 :     CATTCAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGAC
1464 :     GTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGACAGAACAAA
1465 :     GGGCAGCGAAACCGCGAGGTTAAGCCAATCCCACAAATCTGTTCTCAGTTCGGATCGCAG
1466 :     TCTGCAACTCGACTGCGTGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGT
1467 :     GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCG
1468 :     AAGTCGGTGAGGTAACCTTTTAGGAGCCAGCCGCCGAAGGTGGGACAGATGATTGGGGTG
1469 :     AAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1470 :     >Mycp.hyopn Mycoplasma hyopneumoniae 7448 [fig|262722.3.rna.33]
1471 :     GCAATCATGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATAAACGCTAGCTGTGTGCTTAATACATGC
1472 :     ATGTTGAACGGAATATTTTAGTTCGCTAAAATATTTAGTAGCAAATGGGTGAGTAACACG
1473 :     TACCTAACCTACCTTTTGGACTGGGATAACCATTGGAAACAGTGGCTAATACCGGATATG
1474 :     ATAAAAATTTGCATGAATTTTTATTCAAAGGAGCCTTCAAGCTTCACCAAGAAATGGGGG
1475 :     TGCGCAACATTAGTTAGTTGGTAGGGTAAAAGCCTACCAAGACGATGATGTTTAGCGGGG
1476 :     CCAAGAGGTTGTACCGCCACACTGGGATTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
1477 :     CAGTAAGGAATATTCCACAATAAGCGAAAGCTTGATGGAGCGACACAGCGTGCAGGATGA
1478 :     AGTCTTTCGGGATGTAAACTGCTGTTGTAAGGGAAGAAAAAACTAGATAGGAAATGCTCT
1479 :     AGTCTTGACGGTACCTTATTAGAAAGCGACGGCAAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
1480 :     ACATAGGTCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGTCCGTAGGTTTTTTGTT
1481 :     AAGTTTAAAGTTAAATGCTAAAGCTCAACTTTAGTCCGCTTTAGATACTGGCAAAATAGA
1482 :     ATTATGAAGAGGTTAGCGGAATTCCTAGTGGAGTGGTGGAATACGTAGATATTAGGAAGA
1483 :     ACACCAATAGGCGAAGGCAGCTAACTGGTCATATATTGACACTAAGGGACGAAAGCGTGG
1484 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATCATTAGTTGGT
1485 :     GGCAAAAGTCACTAACACAGCTAACGCGTTAAATGATCCGCCTGAGTAGTATGCTCGCAA
1486 :     GAGTGAAACTTAAAGGAATTGACGGGAACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATT
1487 :     TGATGTTACGCGTAGAACCTTACCCACTCTTGACATTCTCGCAAAACTATAGAGATATAG
1488 :     CCGAGGCTAACGAGATCACAGATGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
1489 :     AGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCTTTTCTTTAGTTGCTAACATTTAGTTGAGAAC
1490 :     CCTAAAGATACTGCCGGCGCAAGCCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCC
1491 :     TCTTACGAGTGGGGCAACACACGTGCTACAATGGCTACTACAAAGAGCAGCAAAACAGTG
1492 :     ATGTCAAGCTAATCTCAAAAAAGTAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTC
1493 :     ATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCTATACTGCGGTGAATACGTTCTCGGG
1494 :     TTTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTAATGCCCAAAGTCGGTGAGTTAA
1495 :     CTTCGGAGACCATTGCCTAAGGCAGGACCGATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTATC
1496 :     CCTACGAGAACGTGGGGATGGAACACCTCCTTTCT
1497 :     >Myco.capr Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 [gi|83319253 464430-465954]
1498 :     TAAAATGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATAAACGCTGGCGGCATGCCTAATACATGCAAGTCGAACGGG
1499 :     GGTGCTTGCACCTCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTATCTAACCTACCTTATAGCGGGGGATAACTT
1500 :     TTGGAAACGAAAGATAATACCGCATGTAGATCTTATTATCGCATGAGAAAAGATCAAAAGAACCGTTTGG
1501 :     TTCACTATGAGATGGGGATGCGGCGTATTAGCTAGTAGGTGAGATAATAGCCCACCTAGGCGATGATACG
1502 :     TAGCCGAACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCA
1503 :     GTAGGGAATTTTTCACAATGGACGAAAGTCTGATGAAGCAATGCCGCGTGAGTGATGACGGCCTTCGGGT
1504 :     TGTAAAGCTCTGTTGTAAGGGAAGAAAAAATAGAGTAGGAAATGACTTTATCTTGACAGTACCTTACCAG
1505 :     AAAGCCACGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTG
1506 :     GGCGTATAGGGTGCGTAGGCGGTTTTGCAAGTTTGAGGTTAAAGTCCGGAGCTCAACTCCGGTTCGCCTT
1507 :     GAAGACTGTTTTACTAGAATGCAAGAGAGGTAAGCGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATAT
1508 :     ATGGAAGAACACCTGTGGCGAAAGCGGCTTACTGGCTTGTTATTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGA
1509 :     GCAAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTACTAAGTGTTGGGGTAACTCAGC
1510 :     GCTGCAGCTAACGCATTAAGTACTCCGCCTGAGTAGTATGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGGAATTGAC
1511 :     GGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACACGAAGAACCTTACCAGGGCTTGA
1512 :     CATCCAGTGCAAAGCTATAGAGATATAGTAGAGGTTAACATTGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAG
1513 :     TTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAACGCAACCCTTGTCGTTAGTTACTAACATTAAG
1514 :     TTGAGAACTCTAACGAGACTGCTAGTGTAAGCTAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCC
1515 :     TTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCTGGTACAAAGAGTTGCAATCCTGTGAAGGGGAGCTAA
1516 :     TCTCAAAAAACCAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAAGCCGGAATCACTAGTAA
1517 :     TCGCGAATCAGCTATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAG
1518 :     TTGGTAATACCAGAAGTAGGTAGCTTAACCATTTGGAGAGCGCTTCCCAAGGTAGGACTAGCGATTGGGG
1519 :     TGAAGTCGTAACAAGGTATCCGTACGGGAACGTGCGGATGGATCACCTCCTTTCT
1520 :     >Myco.pneum Mycoplasma pneumoniae M129 [gi|13507739 118312-119824]
1521 :     ATTTTTCTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTGGCGGCATGCCTAATACATGC
1522 :     AAGTCGATCGAAAGTAGTAATACTTTAGAGGCGAACGGGTGAGTAACACGTATCCAATCT
1523 :     ACCTTATAATGGGGGATAACTAGTTGAAAGACTAGCTAATACCGCATAAGAACTTTGGTT
1524 :     CGCATGAATCAAAGTTGAAAGGACCTGCAAGGGTTCGTTATTTGATGAGGGTGCGCCATA
1525 :     TCAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCAATGACGTGTAGCTATGCTGAGAAGT
1526 :     AGAATAGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGA
1527 :     ATTTTTCACAATGAGCGAAAGCTTGATGGAGCAATGCCGCGTGAACGATGAAGGTCTTTA
1528 :     AGATTGTAAAGTTCTTTTATTTGGGAAGAATGACTTTAGCAGGTAATGGCTAGAGTTTGA
1529 :     CTGTACCATTTTGAATAAGTGACGACTAACTATGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACATAGG
1530 :     TCGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCAAGCGCAGGCGGATTGAAAAGTCTG
1531 :     GTGTTAAAGGCAGCTGCTTAACAGTTGTATGCATTGGAAACTATTAATCTAGAGTGTGGT
1532 :     AGGGAGTTTTGGAATTTCATGTGGAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGAAGGAACACCAG
1533 :     TGGCGAAGGCGAAAACTTAGGCCATTACTGACGCTTAGGCTTGAAAGTGTGGGGAGCAAA
1534 :     TAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACACCGTAAACGATAGATACTAGCTGTCGGGGCGAT
1535 :     CCCCTCGGTAGTGAAGTTAACACATTAAGTATCTCGCCTGGGTAGTACATTCGCAAGAAT
1536 :     GAAACTCAAACGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTTGCTTAATTCGA
1537 :     CGGTACACGAAAAACCTTACCTAGACTTGACATCCTTGGCAAAGTTATGGAAACATAATG
1538 :     GAGGTTAACCGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG
1539 :     GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCGTTAGTTACATTGTCTAGCGAGACTGCTA
1540 :     ATGCAAATTGGAGGAAGGAAGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTAGGGCT
1541 :     GCAAACGTGCTACAATGGCCAATACAAACAGTCGCCAGCTTGTAAAAGTGAGCAAATCTG
1542 :     TAAAGTTGGTCTCAGTTCGGATTGAGGGCTGCAATTCGTCCTCATGAAGTCGGAATCACT
1543 :     AGTAATCGCGAATCAGCTATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCC
1544 :     GTCAAACTATGAAAGCTGGTAATATTTAAAAACGTGTTGCTAACCATTAGGAAGCGCATG
1545 :     TCAAGGATAGCACCGGTGATTGGAGTTAAGTCGTAACAAGGTACCCCTACGAGAACGTGG
1546 :     GGGTGGATCACCTCCTTT
1547 :     >Mycp.penet Mycoplasma penetrans HF-2 [fig|272633.1.rna.32]
1548 :     GTCAATTTTAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTAGCGGGATGCCTAATACATG
1549 :     CAAGTCGGACGAAGCACTTGTGCTTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTATCTAACATA
1550 :     CCTTTTAGTGGGGGATAACTGGTTGAAAAACTAGCTAATACCGCATAGGACATTACTATC
1551 :     GCATGAGAAAATGTTTAAAGTTGCGTTTGCAACGCTTTAAGATTGAGGTGTGGCATATCA
1552 :     GATAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGTCTATGACGTGTAGCTGTGCTGAGAGGCAAA
1553 :     ACAGCCACAATGGAACTGAGACACGGTCCATACTTCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATT
1554 :     TTTCACAATGGGCGCAAGCCTGATGGAGCAATCCCGCGTGAACGACGAAGGTTTTTTAAA
1555 :     TTGTAAAGTTCTTTTATTGGGGACGAATTGTAAGAAGAGGAAATGCTTTTTATTTGACTG
1556 :     TACCCTTTGAATAAGTATCGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGATGC
1557 :     AAGCGTTATCCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGATTTACAAGTCTGGTGT
1558 :     TAAATATAGCTGCCCAACAGTTATATGCATTGGAAACTGTAAGTCTAGAGTGCAGTAGAG
1559 :     AGTTTTGGAACTCCATGTGGAGCGGTGGAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGAGGC
1560 :     GAAGGCGAAAACTTAGGCTGTTACTGACGCTTAGGCTCGAAAGTGTGGGGAGCAAATAGG
1561 :     ATTAGATACCCTAGTAGTCCACACCGTAAACGATGGTAATTAAATCTTGGTACGGGATGT
1562 :     ATCAGGATTGCAGTTAACACATTAAATTACCCGCCTGGGTAGTACATTCGCAAGAATGAA
1563 :     ACTCAAACGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTTGCTTAATTCGACGA
1564 :     TACACGTAAAACCTTACCTGGGTTTGACATCCTCTGCAAAGCTATAGAGATATAGTGGAG
1565 :     GTTAACAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTT
1566 :     AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCGTTAGTTACTTCATCTAGCGAGACTGCCAGCG
1567 :     TAAGCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTTTATATCCAGGGCCGCA
1568 :     AACGTGCTACAATGGTCGGTACAAACTGTTGCCAATCAGCAATGAGGAGCTAATCAGAGA
1569 :     AAGCCGATCTCAGTTCGGATCGAGGGCTGCAATTCGTCCTCGTGAAGTTGGAATCACTAG
1570 :     TAATCGCAAATCAGCCATGTTGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCCGT
1571 :     CAAACTATGAGAGCTGGTAATACCTAAAACCGTTAAGCTAACCTCGTGAGGCTTGCGTCT
1572 :     AGGGTAGGACTGGTAATTGGAGTTAAGTCGTAACAAGGTACCCCTACGGGAATGTGGGGG
1573 :     TGGATCACCTCCTTTCTA
1574 :     >Urea.parvu Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970 [fig|273119.1.rna.8]
1575 :     TCAATTTTAAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTGGCGGCATGCCTAATACATG
1576 :     CAAATCGAACGAAGCCTTTTAGGCTTAGTGGTGAACGGGTGAGTAACACGTATCCAATCT
1577 :     ACCCTTAAGTTGGGGATAACTAGTCGAAAGATTAGCTAATACCGAATAATAACATCAATA
1578 :     TCGCATGAGAAGATGTAGAAAGTCGCTCTTTGTGGCGACGCTTTTGGATGAGGGTGCGAC
1579 :     GTATCAGATAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGTCAATGACGCGTAGCTGTACTGAGA
1580 :     GGTAGAACAGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAG
1581 :     GGAATTTTTCACAATGGGCGCAAGCCTTATGAAGCAATGCCGCGTGAACGATGAAGGTCT
1582 :     TATAGATTGTAAAGTTCTTTTATATGGGAAGAAACGCTAAGATAGGAAATGATTTTAGTT
1583 :     TGACTGTACCATTTGAATAAGTATCGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATA
1584 :     GGATGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGCGTAAAACGAGCGCAGGCGGGTTTGTAAGTT
1585 :     TGGTATTAAATCTAGATGCTTAACGTCTAGCTGTATCAAAAACTGTAAACCTAGAGTGTA
1586 :     GTAGGGAGTTGGGGAACTCCATGTGGAGCGGTAAAATGCGTAGATATATGGAAGAACACC
1587 :     GGTGGCGAAGGCGCCAACTTGGACTATCACTGACGCTTAGGCTCGAAAGTGTGGGGAGCA
1588 :     AATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACACCGTAAACGATCATCATTAAATGTCGGCCCG
1589 :     AATGGGTCGGTGTTGTAGCTAACGCATTAAATGATGTGCCTGGGTAGTACATTCGCAAGA
1590 :     ATGAAACTCAAACGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTTGCTTAATTT
1591 :     GACAATACACGTAGAACCTTACCTAGGTTTGACATCTATTGCGATGCTATAGAAATATAG
1592 :     TTGAGGTTAACAATATGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
1593 :     GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTTTCGTTAGTTACTTTTCTAGCGATACTGCT
1594 :     ACCGCAAGGTAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATATCTAGGGC
1595 :     TGCAAACGTGCTACAATGGCTAATACAAACTGCTGCAAAATCGTAAGATGAAGCGAAACA
1596 :     GAAAAAGTTAGTCTCAGTTCGGATAGAGGGCTGCAATTCGTCCTCTTGAAGTTGGAATCA
1597 :     CTAGTAATCGCGAATCAGACATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGC
1598 :     CCGTCAAACTATGGGAGCTGGTAATATCTAAAACCGCAAAGCTAACCTTTTGGAGGCATG
1599 :     CGTCTAGGGTAGGATCGGTGACTGGAGTTAAGTCGTAACAAGGTATCCCTACGAGAACGT
1600 :     GGGGATGGATCACCTCCTTT
1601 :     >Onio.yello Onion yellows phytoplasma OY-M [fig|262768.1.rna.9]
1602 :     CATACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAA
1603 :     GTCGAACGGAAGTTTAAGCAATTAAACTTTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTAAGCA
1604 :     ATCTGCCCCTAAGACGAGGATAACAGTTGGAAACGACTGCTAAGACTGGATAGGAGACAA
1605 :     GAGGGCATCTTCTTGTTTTTAAAAGACCTAGCAATAGGTATGCTTAGGGAGGAGCTTGCG
1606 :     TCACATTAGTTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGACTATGATGTGTAGCCGGGCTGA
1607 :     GAGGTTGAACGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
1608 :     AGGGAATTTTCGGCAATGGAGGAAACTCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAACGATGAAGTA
1609 :     TTTCGGTACGTAAAGTTCTTTTATTAGGGAAGAATAAATGATGGAAAAATCATTCTGACG
1610 :     GTACCTAATGAATAAGCCCCGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGGGG
1611 :     CAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGTTAAATAAGTTTATGG
1612 :     TCTAAGTGCAATGCTCAACATTGTGATGCTATAAAAACTGTTTAGCTAGAGTAAGATAGA
1613 :     GGCAAGTGGAATTCCATGTGTAGTGGTAAAATGCGTAAATATATGGAGGAACACCAGTAG
1614 :     CGAAGGCGGCTTGCTGGGTCTTTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAG
1615 :     GATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTACTAAACGTTGGGTAAAACCA
1616 :     GTGTTGAAGTTAACACATTAAGTACTCCGCCTGAGTAGTACGTACGCAAGTATGAAACTT
1617 :     AAAGGAATTGACGGGACTCCGCACAAGCGGTGGATCATGTTGTTTAATTCGAAGGTACCC
1618 :     GAAAAACCTCACCAGGTCTTGACATGCTTCTGCAAAGCTGTAGAAACACAGTGGAGGTTA
1619 :     TCAGTTGCACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGT
1620 :     CCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTGTTAGTTACCAGCACGTAATGGTGGGGACTTTAGCA
1621 :     AGACTGCCAGTGATAAATTGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCCTTAT
1622 :     GACCTGGGCTACAAACGTGATACAATGGCTGTTACAAAGGGTAGCTGAAGCGCAAGTTTT
1623 :     TGGCGAATCTCAAAAAAACAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAA
1624 :     GTTGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGGTTTGT
1625 :     ACACACCGCCCGTCAAACCACGAAAGTTGGTAATACCCAAAGCCGGTGGCCTAACTTCGC
1626 :     AAGAAGAGGGAACCGTCTAAGGTAGGGTCGATGATTGGGGTTAAGTCGTAACAAGGTATC
1627 :     CCTACCGGAAGGTGGGGATGGATCACCTCCTT
1628 :     >Clos.perfi Clostridium perfringens str. 13 [fig|195102.1.rna.107]
1629 :     TTTTAAATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG
1630 :     CAAGTCGAGCGATGAAGTTTCCTTCGGGAAACGGATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACAC
1631 :     GTGGGTAACCTGCCTCATAGAGTGGAATAGCCTTCCGAAAGGAAGATTAATACCGCATAA
1632 :     CGTTGAAAGATGGCATCATCATTCAACCAAAGGAGCAATCCGCTATGAGATGGACCCGCG
1633 :     GCGCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGA
1634 :     GAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
1635 :     GGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGT
1636 :     TTTCGGATCGTAAAGCTCTGTCTTTGGGGAAGATAATGACGGTACCCAAGGAGGAAGCCA
1637 :     CGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTTATCCGGATTTA
1638 :     CTGGGCGTAAAGGGAGCGTAGGCGGATGATTAAGTGGGATGTGAAATACCCGGGCTCAAC
1639 :     TTGGGTGCTGCATTCCAAACTGGTTATCTAGAGTGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCCTAG
1640 :     TGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGA
1641 :     CTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAG
1642 :     TCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTGGGGGTTTCAACACCTCCGTGCCGCCGCTA
1643 :     ACGCATTAAGTATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGAC
1644 :     GGGGACCCGCACAAGTAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTAC
1645 :     CTACACTTGACATCCCTTGCATTACTCTTAATCGAGGAAATCCCTTCGGGGACAAGGTGA
1646 :     CAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACG
1647 :     AGCGCAACCCTTGTCGTTAGTTACTACCATTAAGTTGAGGACTCTAGCGAGACTGCCTGG
1648 :     GTTAACCAGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTGTAGGGCTA
1649 :     CACACGTGCTACAATGGCTGGTACAGAGAGATGCAATACCGCGAGGTGGAGCCAAACTTA
1650 :     AAAACCAGTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGCTGGAGTTACTA
1651 :     GTAATCGCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGT
1652 :     CACACCATGAGAGTTGGCAATACCCGAAGTCCGTGAGCTAACCGCAAGGAGGCAGCGGCC
1653 :     GAAGGTAGGGTCAGCGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGG
1654 :     CTGGATCACCTCCTTTCTA
1655 :     >Clos.diffi Clostridium difficile 630 [fig|1496.1.rna.81]
1656 :     CTTTTATTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
1657 :     CAAGTTGAGCGATTTACTTCGGTAAAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACC
1658 :     TACCCTGTACACACGGATAACATACCGAAAGGTATGCTAATACGGGATAATATATTTGAG
1659 :     AGGCATCTCTTGAATATCAAAGGTGAGCCAGTACAGGATGGACCCGCGTCTGATTAGCTA
1660 :     GTTGGTAAGGTAATGGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGG
1661 :     CCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGC
1662 :     ACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTCGTA
1663 :     AAACTCTGTCCTCAAGGAAGATAATGACGGTACTTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAACTACG
1664 :     TGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCTAGCGTTATCCGGATTTACTGGGCGTAAAG
1665 :     GGTGCGTAGGCGGTCTTTCAAGTCAGGAGTGAAAGGCTACGGCTCAACCGTAGTAAGCTC
1666 :     TTGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAA
1667 :     TGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTTGCGAAGGCGGCTCTCTGGACTGTAACTGACGC
1668 :     TGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAA
1669 :     CGATGAGTACTAGGTGTCGGGGGTTACCCCCTTCGGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTAC
1670 :     TCCGCCTGGGAAGTACGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACA
1671 :     AGTAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAAGCTTGACAT
1672 :     CCCAATGACATCTCCTTAATCGGAGAGTTCCCTTCGGGGACATTGGTGACAGGTGGTGCA
1673 :     TGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT
1674 :     TGTCTTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCAGGGATAACCTGGA
1675 :     GGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGCTTAGGGCTACACACGTGCTA
1676 :     CAATGGGTAGTACAGAGGGTTGCCAAGCCGTAAGGTGGAGCTAATCCCTTAAAGCTACTC
1677 :     TCAGTTCGGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGCTGGAGTTACTAGTAATCGCAG
1678 :     ATCAGAATGCTGCGGTGAATGCGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGG
1679 :     GAGTTGGAGACGCCCGAAGCCGATTATCTAACCTTTTGGAAGAAGTCGTCGAAGGTGGAA
1680 :     TCAATAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACC
1681 :     TCCTTTCTA
1682 :     >Clos.papyr Clostridium papyrosolvens [TTWTTGAGAG,gi|431242]
1683 :     TTWTTGAGAG
1684 :     TTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGNCGAGCGGAGTAGAGTGTNA
1685 :     GCTTTCTTGTGAGTAACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGCAACCTGCCTGTTACAGGGGGAT
1686 :     AACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGCATAACACNNCGAGAAAGCAGTTTTCTTGTTGTCAAAGGAGCA
1687 :     ATCCGGTAANAGATGGGCCCGCGTCCAATTAGCTAGTTGGTGATGTAACGGACCACCAAGGCGACGATTG
1688 :     GTAGCCGAACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGC
1689 :     AGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAAGGATGAAGGTTTTCGGA
1690 :     TTGTAAACTTCTTTAGTCAGGGACGAATAAATGACGGTACCTGAAGAATAAGCCACGGCTAACTACGTGC
1691 :     CAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTAGGCGG
1692 :     GAATGTAAGTCAGATGTGAAATCCCAGAGCTTAACTCTGGAGCTGCATCTGAAACTATGTTTCTTGAGTG
1693 :     CCGGAGAGGAAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGA
1694 :     AGGCGGCTTTCTGGACGGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCT
1695 :     GGTAGTCCACGCTGTAAACGATGGATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGGAGTTAACA
1696 :     CAATAAGTATCCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACA
1697 :     AGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATAATAGTGAAT
1698 :     ACGGTAGAGATATCGTAGTCCTTCGGGACACTATTACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGT
1699 :     GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTTGCTAGTTGATAACATTAAGATGATCACTC
1700 :     TAGCGAGACTGCCGGTGATAAATCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTGAAATCATCATGCCCCTTATGTCTT
1701 :     GGGCTACACACGTACTACAATGGCTATAACAGAGGGAAGCTAAGCTGCAAAGTGGAGCAAATCCCCAAAA
1702 :     ATAGTCCCAGTTCAGATTGTGGGCTGCAACCCGCCCACATGAAGTCGGAATTGCTAGTAATGGCAGGTCA
1703 :     GCATACTGCCGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTCTGCAACACC
1704 :     CGAAGTCGATAGTCTAACCGCAAGGAGGACGTCGCCGAAGGTGGGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCGTAA
1705 :     CAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1706 :     >Clos.therm Clostridium thermocellum ATCC 27405 [fig|203119.1.rna.057]
1707 :     CTTTTTTTAGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
1708 :     CAAGTCGAGCGGGGATATACGGAAGGTTTACCGGAAGTATATCCTAGCGGCGGACGGGTG
1709 :     AGTAACGCGTGGGTAACCTACCTCATACAGGGGGATAACACAGGGAAACCTGTGCTAATA
1710 :     CCGCATAACATAACGGGGCGGCATCGTCCTGTTATCAAAGGAGAAATCCGGTATGAGATG
1711 :     GGCCCGCGTCCGATTAGCTGGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGC
1712 :     CGAACTGAGAGGTTGGTCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAG
1713 :     GCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGAAGG
1714 :     AAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAACTTCTTTGATTGGGGACGAAGGAAGTGACGGTACCCAA
1715 :     AGAACAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTT
1716 :     GTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGCGCGTAGGCGGGGATGCAAGTCAGATGTGAAATTC
1717 :     CGGGGCTTAACCCCGGCGCTGCATCTGAAACTGTATCTCTTGAGTGCTGGAGAGGAAAGC
1718 :     GGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGC
1719 :     GGCTTTCTGGACAGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGA
1720 :     TACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTC
1721 :     TGTGCCGGAGTTAACACAATAAGTATCCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACT
1722 :     CAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACG
1723 :     CGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCCTCTGACAGCTCTAGAGATAGGGCTTCCCTTC
1724 :     GGGGCAGAGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTT
1725 :     AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCGTTAGTTGCCAGCACGTTAAGGTGGGCACTCT
1726 :     AGCGAGACTGCCGGCGACAAGTCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCC
1727 :     TTATGTCCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCTGCTACAAAGGGAAGCGATACCGCGAG
1728 :     GTGGAGCAAATCCCCAAAAGCAGTCCCAGTTCGGATTGCAGGCTGAAACTCGCCTGCATG
1729 :     AAGTCGGAATTGCTAGTAATGGCAGGTCAGCATACTGCCGTGAATACGTTCCCGGGCCTT
1730 :     GTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTCTGCAACACCCGAAGTCAGTAGTCTAACCGT
1731 :     AAGGAGGGCGCTGCCGAAGGTGGGGCAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCG
1732 :     TATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
1733 :     >Clos.cellu Clostridium cellulolyticum [TTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGG,gi|431235]
1734 :     TTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCGAGTCGAGCGGAGTT
1735 :     ACCTTTAGCNCTGAGTATTCTTGGANATGATGCTGNCCCGACAGCGTCATCCNNNAACAA
1736 :     CCTTAATGAAATATTTAGTTGGAGTTTTGCATCACGCGTTTTATCAAAGTGTCAACACAT
1737 :     AATAGTAGAAGAGAATGTTCAGTGCTGAAGGTAACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGC
1738 :     GTGGGCAACCTGCCTGTTACAGGGGGATAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGCATAA
1739 :     CACAACGAAGAAGCATTTCNTTGTTGTCAAAGGAGCAATCCGGTGACAGATGGGCCCGCG
1740 :     TCCAATTAGCTAGTTGGTGATGTAACGGATCACCAAGGCGACGATTGGTAGCCGAACTGA
1741 :     GAGGTTGATCGGCCACATTGGGNCTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
1742 :     GGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAAGGATGAAGGT
1743 :     TTTCGGATTGTAAACTTCTTTAGTCAGGGACGAAGAAAATGACGGTACCTGAAGAATAAG
1744 :     CCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAA
1745 :     TTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTAGGCGGGAATGTAAGTCAGATGTGAAATCCCAGGGCTT
1746 :     AACCCTGGAGCTGCATCTGAAACTATGTTTCTTGAGTGCCGGAGAGGAAAGCGGAATTCC
1747 :     TAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTTCT
1748 :     GGACGGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGG
1749 :     TAGTCCACGCTGTAAACGATGGATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGG
1750 :     AGTTAACACAATAAGTATCCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAA
1751 :     TTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAAC
1752 :     CTTACCAAGGCTTGACATATAGCGGAATNCGGCAGAGATGTCGTAGTCCTTCGGGACTGC
1753 :     TATACACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCC
1754 :     GCAACGAGCGCAACCCCTGTTGCTAGTTGATAACATTAAGATGATCACTCTAGCGAGACT
1755 :     GCCGGTGACAAATCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTT
1756 :     GGGCTACACACGTACTACAATGGCTATAACAGAGGGAAGCTAAGCTGCAAAGTGGAGCAA
1757 :     ATCCCCAAAAATAGTCCCAGTTCAGATGGTGGGCTGCAACCCGCCCACATGAAGTCGGAA
1758 :     TTGCTAGTAATGGTAGGTCAGTATACTGTCGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC
1759 :     GCCCGTCACACCATGAGAGTCTGCAACACCCGAAGTCGATAGTCTAACCGCAAGGAGGAC
1760 :     GTCGCCGAAGGTGGGGCCGATGATTGGTGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAG
1761 :     GTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
1762 :     >Clos.polys Clostridium polysaccharolyticum [TTTTTGAGAG,gi|431244]
1763 :     TTTTTGAGAG
1764 :     TTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGANCGAAG
1765 :     CACCTGGATGGATTCCTTCGGGAGGAAGTTCTTGTGACTGAGTGGCGGACGGGTGAGTAA
1766 :     CGCGTGGGCAACCTGCCTCATACAGGGGGATAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCGCA
1767 :     TAACCCGATAGGGCCGCATGGCCCGGTCGGAAAAGAATTATCGGTATGAGATGGACCCGC
1768 :     GTCTGATTAGCTAGTTGGAGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGGCTTG
1769 :     AGAGATTGACCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAG
1770 :     TGGGGAATATTACACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGTGAAGAAGT
1771 :     ATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGNACCTGAATAAGAAGCC
1772 :     CCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGTGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTT
1773 :     ACTGGGTGTAAAGGGAGCGCAGGTGGCGTGGCAAGTCAGAAGTGAAAGCCCGGGGCTCAA
1774 :     CCCCGGGACTGCTTTTGAAACTGTCATGCTGGAGTGCAGGAGAGGCAGGCGGAATTCCTA
1775 :     GTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCCTGCTGG
1776 :     ACTGTAACTGACACTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTA
1777 :     GTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTCGGGGCCCACAGGGCTTCGGTGCCGCAGC
1778 :     TAACGCAGTAAGTATTCCACCTGGGGAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTG
1779 :     ACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTT
1780 :     ACCAAGCCTTGACATCCCAATGACCGTCCGGCAATGCGGACTTTCCTTCGGGACATTGGA
1781 :     GACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAA
1782 :     CGAGCGCAACCCCTATCTTCAGTAGCCAGCGGATNNGCCGGGCACTCTGGAGAGACTGCC
1783 :     AGGGACAACCTGGAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGNCTTGGG
1784 :     CTACACACGTGCTACAATGGCAGCTACAAAGTGAAGCTACCCCGTGAGGGCGAGCAAATC
1785 :     ACAAAAAGGCTGTCCCAGTTCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGCTGGAATC
1786 :     GCTAGTAATCGCAAATCAGAATGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGC
1787 :     CCGTCACACCATGGGAGTCGGAAATGCCCGAAGTCAGTGCACCCACCCGAAAGGAGGGAG
1788 :     CTGCCGAAGGTGGAGCCGGTAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGG
1789 :     TGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1790 :     >Lact.acido Lactobacillus acidophilus NCFM [fig|272621.3.rna.74]
1791 :     AAAAACGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAA
1792 :     GTCGAGCGAGCTGAACCAACAGATTCACTTCGGTGATGACGTTGGGAACGCGAGCGGCGG
1793 :     ATGGGTGAGTAACACGTGGGGAACCTGCCCCATAGTCTGGGATACCACTTGGAAACAGGT
1794 :     GCTAATACCGGATAAGAAAGCAGATCGCATGATCAGCTTATAAAAGGCGGCGTAAGCTGT
1795 :     CGCTATGGGATGGCCCCGCGGTGCATTAGCTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGGCA
1796 :     ATGATGCATAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAA
1797 :     CTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAAC
1798 :     GCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTGGTGAAGAAGGATAG
1799 :     AGGTAGTAACTGGCCTTTATTTGACGGTAATCAACCAGAAAGTCACGGCTAACTACGTGC
1800 :     CAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGA
1801 :     GCGCAGGCGGAAGAATAAGTCTGATGTGAAAGCCCTCGGCTTAACCGAGGAACTGCATCG
1802 :     GAAACTGTTTTTCTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGGAATG
1803 :     CGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGTCTGCAACTGACGCTG
1804 :     AGGCTCGAAAGCATGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACG
1805 :     ATGAGTGCTAAGTGTTGGGAGGTTTCCGCCTCTCAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCAC
1806 :     TCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACA
1807 :     AGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACAT
1808 :     CTAGTGCAATCCGTAGAGATACGGAGTTCCCTTCGGGGACACTAAGACAGGTGGTGCATG
1809 :     GCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTG
1810 :     TCATTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGG
1811 :     AAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACA
1812 :     ATGGACAGTACAACGAGGAGCAAGCCTGCGAAGGCAAGCGAATCTCTTAAAGCTGTTCTC
1813 :     AGTTCGGACTGCAGTCTGCAACTCGACTGCACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGAT
1814 :     CAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGA
1815 :     GTCTGCAATGCCCAAAGCCGGTGGCCTAACCTTCGGGAAGGAGCCGTCTAAGGCAGGGCA
1816 :     GATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTC
1817 :     CTTTCTA
1818 :     >Lact.seqri Lactobacillus saerimneri [CCGAATTCGTCGACAACAGAGT,gi|3599569]
1819 :     CCGAATTCGTCGACAACAGAGT
1820 :     TTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCG
1821 :     CATCGGCCCAACTGATTGAAGATGCTTGCATCCGATTGACGATGGTTTACCGATGAGCGG
1822 :     CGGACGGGTGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACA
1823 :     GATGCTAATACCGCATAGGTCATTTGACCGCATGGTCAAATGATTAAAGATGGCTCTGCT
1824 :     ATCACTTCTGGATGGACCTGCGGCGTATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGG
1825 :     CGATGATACGTAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCA
1826 :     GACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGCAAGTCTGATGGAGCA
1827 :     ACGCCGCGTGAGCGAAGAAGGTCTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGAGAAGAACACG
1828 :     GGTGAGAGTAACTGTTCACCTGTTGACGGTATCTAACCAGCAAGTCACGGCTAACTACGT
1829 :     GCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGG
1830 :     GAACGCAGGCGGTTCTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCTTCGGCTTAACCGAAGATGTGCAT
1831 :     TGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAA
1832 :     TGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGGCTCTCTGGTCTGTAACTGACGC
1833 :     TGAGGTTCGAAAGCGTGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA
1834 :     CGATGAATGCTAGGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCCGCAGCTAACGCACTAAGC
1835 :     ATTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA
1836 :     CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCTACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGAC
1837 :     ATCTTTTGACCACCTAAGAGATTAGGTTTTCCCTTCGGGGACAAAATGACAGGTGGTGCA
1838 :     TGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT
1839 :     TGTTGTCAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTGGCGAGACTGCCGGTGACAAACCGGA
1840 :     GGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTA
1841 :     CAATGGGCAGTACAACGAGTCGCGAAACCGCGAGGTTTAGCAAATCTCTTAAAGCTGCTC
1842 :     TCAGTTCGGACTGTAGGCTGCAACTCGCCTRCACGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGA
1843 :     ATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGA
1844 :     GAGTTTGTAACACCCAAAGCCGGTGGGGTAACCTTTTGGAGCCAGCCGTCTAAGGTGGGA
1845 :     CAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACC
1846 :     TCCTTTCT
1847 :     >Oeno.oeni Oenococcus oeni PSU-1 [fig|203123.1.rna.043]
1848 :     TTTTAAATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGTGGCGTGCCTAATACATG
1849 :     CAAGTCGTACGCTAGCCGCTGAATTGATCCTTCGGGTGAAGTGAGGCAATGACTAGAGTG
1850 :     GCGAACTGGTGAGTAACACGTAAGAAACCTGCCCTTTAGTGGGGGATAACATTTGGAAAC
1851 :     AGATGCTAATACCGCGTAACAACAAATCACACATGTGATCTGTTTGAAAGGTCCTTTTGG
1852 :     ATCGCTAGAGGATGGTCTTGCGGCGTATTAGCTTGTTGGTAGGGTAGAAGCCTACCAAGG
1853 :     CAATGATGCGTAGCCGAGTTGAGAGACTGGCCGGCCACATTGGGACTGAGACACTGCCCA
1854 :     AACTCCTACGGGAGGCTGCAGTAGGGAATTTTCCGCAATGCACGAAAGTGTGACGGAGCG
1855 :     ACGCCGCGTGTGTGATGAAGGCTTTCGGGTCGTAAAGCACTGTTGTAAGGGAAGAATAAC
1856 :     TGAATTCAGAGAAAGTTTTCAGCTTGACGGTACCTTACCAGAAAGGGATGGCTAAATACG
1857 :     TGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGTCCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAG
1858 :     CGAGCGCAGACGGTTTATTAAGTCTGATGTGAAATCCCGAGGCCCAACCTCGGAACTGCA
1859 :     TTGGAAACTGATTTACTTGAGTGCGATAGAGGCAAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAA
1860 :     ATGCGTAGATATGTGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGGCTTGCTAGATCGTAACTGACG
1861 :     TTGAGGCTCGAAAGTATGGGTAGCAAACGGGATTAGATACCCCGGTAGTCCATACCGTAA
1862 :     ACGATGGGTGCTAGTTGTTAAGAGGTTTCCGCCTCCTAGTGACGTAGCAAACGCATTAAG
1863 :     CACCCCGCCTGAGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTTAAAGGAATTGACGGGGACCCGC
1864 :     ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGATACGCGAAAAACCTTACCAGGTCTTGA
1865 :     CATACCAATGATCGCTTTTGTAATGAAAGCTTTTCTTCGGAACATTGGATACAGGTGGTG
1866 :     CATGGTCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
1867 :     CTTGTTATTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGATAAACCG
1868 :     GAGGAAGGTGGGGACGACGTCAGATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCAACACACGTGC
1869 :     TACAATGGGAAGTACAACGAGTCGCAAACCGGCGACGGTAAGCTAATCTCTTAAAACTTC
1870 :     TCTCAGTTCGGACTGGAGTCTGCAACTCGACTCCACGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGC
1871 :     GAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCAAATCAT
1872 :     GGGAGTCGGAAGTACCCAAAGTCGCTTGGCTAACTTTTAGAGGCCGGTGCCTAAGGTAAA
1873 :     ATCGATGACTGGGATTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCAC
1874 :     CTCCTTTCTA
1875 :     >Stre.py.MG Streptococcus pyogenes MGAS5005 [fig|293653.3.rna.85]
1876 :     ATTAAAGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAA
1877 :     GTAGAACGCTGAGAACTGGTGCTTGCACCGGTTCAAGGAGTTGCGAACGGGTGAGTAACG
1878 :     CGTAGGTAACCTACCTCATAGCGGGGGATAACTATTGGAAACGATAGCTAATACCGCATA
1879 :     AGAGAGACTAACGCATGTTAGTAATTTAAAAGGGGCAATTGCTCCACTATGAGATGGACC
1880 :     TGCGTTGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATACATAGCCGAC
1881 :     CTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
1882 :     CAGTAGGGAATCTTCGGCAATGGGGGCAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGA
1883 :     AGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGAGAAGAATGATGGTGGGAGTGGAAAATCC
1884 :     ACCAAGTGACGGTAACTAACCAGAAAGGGACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA
1885 :     TACGTAGGTCCCGAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGTTTTT
1886 :     TAAGTCTGAAGTTAAAGGCATTGGCTCAACCAATGTACGCTTTGGAAACTGGAGAACTTG
1887 :     AGTGCAGAAGGGGAGAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAGG
1888 :     AACACCGGTGGCGAAAGCGGCTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGG
1889 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTT
1890 :     AGGCCCTTTCCGGGGCTTAGTGCCGGAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTAC
1891 :     GACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG
1892 :     GTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCGATGCCCGCTCTA
1893 :     GAGATAGAGTTTTACTTCGGTACATCGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGT
1894 :     GTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCA
1895 :     TTAAGTTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGT
1896 :     CAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAACGA
1897 :     GTCGCAAGCCGGTGACGGCAAGCTAATCTCTTAAAGCCAATCTCAGTTCGGATTGTAGGC
1898 :     TGCAACTCGCCTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCACGCCGCGGTGA
1899 :     ATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAA
1900 :     GTCGGTGAGGTAACCTATTAGGAGCCAGCCGCCTAAGGTGGGATAGATGATTGGGGTGAA
1901 :     GTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTC
1902 : golsen 1.3 >Desu.7475 Desulfotomaculum thermobenzoicum DSM 7475 [AGTGATTAGAG gi|2578020]
1903 :     AGTGATTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATTGAGAGGTGAG
1904 : overbeek 1.1 AGGTGAGAGGTTAGAAGTGAGATTAAGAAGGCTTTGGCAAAGCCAAAGCCAACAATAGATCTCACATCTT
1905 :     GCTTCTCACATCTCACCTCTCAATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACCTGCCCATTAGACC
1906 :     GGGATAACGCCGGGAAACTGGTGCTAATACCGGATACGCTCCACTGGCCGCATGGTCGGGGGAGGAAAGG
1907 :     GGAAACCCGCTAATGGATGGGTCCGCGTCCCATTAGCTAGATGGTGGGGTAACGGCCCACCATGGCGACG
1908 :     ATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGA
1909 :     CGGAGCGACGCCGCGTGAGCGAAGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTTGTTGGGGACGAAGGAAGTG
1910 :     ACGGTACCCAACGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGTAGGGGGCGAGCGT
1911 :     TGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGCAGGCGGCTCAAGAAGTCAGGGGTGAAATACCGCAGCTCA
1912 :     ACTGCGGGGGTGCCTTTGAAACCATTGGGCTTGANGGCAGGAGAGGGGAGTGGAATTCCCNGTGTAGCGG
1913 :     TGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGNTCTCTGGCCTGGCCCTGACGCTGAGG
1914 :     CGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTGCTAGGT
1915 :     GTTGGGGGATGTAACCCCCTCAGTGCCGTAGCAAACGCAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCA
1916 :     AGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC
1917 :     GCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCCCTGACAGCCTGTGAAAGCGGGTTTTCTATCTTCGGATAGA
1918 :     CAGGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG
1919 :     CGCAACCCCTACGGTTAGTTGCCAGCGGGTCAAGCCGGGCACTCTAACCGAACTGCCGTTGACAAAACGG
1920 :     AGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCG
1921 :     GTACAAAGGGCAGCGAACCCGCGAGGGGGAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCT
1922 :     GCAACTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCG
1923 :     GGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGCCGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCGCAAGG
1924 :     AGGCAGCCGTCGAAGGTGGGGTTGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCG
1925 :     GCTGGATCACCTCCTT
1926 :     >Desu.reduc Desulfotomaculum reducens [gi|134050581:10041-11659]
1927 :     TTTACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGT
1928 :     CTTCGAGGTTCGACATTCGAGGTTCGAATTTTGAGTTCGAGTAAAGCTTAAGGGTCATTTAAAAGACCCC
1929 :     AAAGAAATGCTTGGATCGAATCACGAATTTCGAACGTCGAACTTCGAAGATAGTGGCGAACGGGTGAGTA
1930 :     ACGCGTGGATAACCTGCCTGATAGACCGGGATAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCGGATACGCTTGC
1931 :     GGAGTCGCATGGCTCTGCAAGGAAAGCTATTGTGCTATCAGATGGATCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGT
1932 :     GGTGTAACGGACCACCAAGGCGACGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGCGAACGGCCACACTGGGACTGAG
1933 :     ACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCA
1934 :     ACGCCGCGTGAGGGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTGTTTTCAGGGAAGAACAAATGACGGTACC
1935 :     TGAAGAGTAAGCTCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGAGCGAGCGTTGTCCGGA
1936 :     TTTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGTGGTGCATTAAGTTAGAGGTGAAAGTTCGGGGCTCAACCCCGTG
1937 :     ATTGCCTCTGATACTGGTGGACTTGAGTGCAGGAGAGGGGAGCAGAATTCCCAGTGTAGCGGTGAAATGC
1938 :     GTAGATATTGGGAGGAATACCAGTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGACTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAG
1939 :     CGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTTGCGGG
1940 :     TATCGACCCCTGCAGTGCCGCAGTAAACACAATAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAA
1941 :     ACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAA
1942 :     CCTTACCAGGGCTTGACATCCTACGAAACTCATAGAGATATGAGCCTTATCCTTCGGGATAACGTAGAGA
1943 :     CAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCC
1944 :     CTAACATTAGTTGCCAGCATGTAAAGGTGGGAACTCTAATGTGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGT
1945 :     GGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCCGGTACAGAC
1946 :     GGAAGCGAAGCCGTGAGGTGGAGCAAACCTGAGAAAGCCGGTCCCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCG
1947 :     ACTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGT
1948 :     ACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGTTGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCGCAAGGAGGCAGCC
1949 :     GTCGAAGGTGGGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATC
1950 :     ACCTCCTTT
1951 :     >Hala.chiti Halanaerobacter chitinivorans [CAATCGGAGAGTTTGATCCTGGCCTAGGA,gi|1235890]
1952 :     CAATCGGAGAGTTTGATCCTGGCCTAGGA
1953 :     CGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTTGCGCCAGAAAGCTACCTTCGGGTAGT
1954 :     GAGTAAAGCGGNGAACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAATCTACCTTTAAGTTAAGGATAAC
1955 :     TTCTCGAAAGGAAAGCTAATACTTAATAATAATAAAGATGGCTTTGCTATCGCTTAGAGA
1956 :     TGAGCCCGCGTCCCATTAGCTTGTTGGTAGGGTAAGGGCCTNCCNAAGGCAACAATGGTA
1957 :     GCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGNACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGG
1958 :     AGGCTGCAGTGGGGAATCGGAGCAATGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTCGCAAGCTCTGTC
1959 :     CTTAGGGAAGAACAAACCAGTTGATAATACCAGCTGGGCTTGACGGTACCTTTGGAGGAA
1960 :     GCCTCGGCTAATTACGTGCCAGAAGCCGCGGTAATACGTAAGAGGCTAGCGTTGTCCGGA
1961 :     ATCACTGGGCGTTAAGGGTGCGCAGCGGGTCTAGTAAGTCAAGAGTGAAAATAAGATACC
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1964 :     GGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAA
1965 :     GAACATTACCAGGGTTTGACATCCTATGACCATCTGTGAAAGCAGAGTTTGGCTCTTTGA
1966 :     GTCACATAGTGACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAAGTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA
1967 :     AGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTTCTTAGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGGACTCTA
1968 :     AGAAGACTGCCGCAGAAAAAATGCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCC
1969 :     CTTATACTCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCTAAACAGAGGGAANCAAGACTGCGA
1970 :     ATCCAAGCGAATCTCACAAATTAGATCTCAGTTCGGATTGCAGATTGTAATTCATCTGCA
1971 :     TGAAGCTGGAGTCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATATGTTCTCGGGCC
1972 :     TTGTACACACCGCCCGTCACACCACCCGAGTTGGGGACACCAGAAGTCATTTGCGATAGC
1973 :     AAGTGCCGAAGGTGTGCCTGATAAGGGGAGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAA
1974 :     GGTGCGGCTGGATCACCTCCTTAA
1975 :     >Pelo.therm Pelotomaculum thermopropionicum [gi|146272432:265365-266967]
1976 :     TTGCAGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGT
1977 :     TCGGCACTCAGCCACTAGTGGTCAGTAGTTGCTATGAGTTTTGGCAATAGCTGAGGCAAGGGAGCAGCAA
1978 :     CTGGCCAGTAGGGCTGAGTGCCGGATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACCTGCCTGTCAGA
1979 :     CCGGGATAACACCGGGAAACTGGTGCTAATACCGGATACGTTCACCGGGGCGCATGCTTTGGTGAAGAAA
1980 :     GGGGCAACCCACTGACAGATGGGTCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGCGGTGTAACGGACCACCAAGGCGA
1981 :     CGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGACGGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGA
1982 :     GGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGCGAAGAAGGCC
1983 :     TTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCTTCAGGGACGAAGGAAGTGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAAC
1984 :     TACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAAACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCG
1985 :     TAGGCGGTTCCTTAAGTCAGGGGTGAAAACTGTCGGCTTAACCGGCAGCCTGCCTTTGAAACTGAGGGAC
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1987 :     GTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGCCTGTTTCTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACGGGATTAG
1988 :     ATACCCCGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTGCTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGTA
1989 :     GTTAACACAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGC
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1993 :     AGAGCCGGGCACTCTAAACGAACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCAT
1994 :     GCCCCTTATGTCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGAGGCGAAGCCGTGAGGCGGA
1995 :     GCAAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGAAATTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCT
1996 :     AGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACG
1997 :     AAAGCTGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCGCGAAAGCGGAGGCAGCCGTCGAAGGTGGGGTTGGT
1998 :     GATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1999 :     >Desu.kuznA Desulfotomaculum kuznetsovii (rrnA) [gi|14585793]
2000 :     AGTGATTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCT
2001 :     CTTGGAGGTTGGAGGTTAGAGGTTAGAAGTTGGATTAAGAAGGAATTCGGCGGAGGCGAATTCCAACAAG
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2025 :     >Desu.kuznB Desulfotomaculum kuznetsovii (rrnB) [gi|14585794]
2026 :     AGTGATTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGT
2027 :     CCAGCACTCAACTCGGTGTTTACGTGATGCATAAGAGAAACCCTTTCACCCGGGAGGGAAGAAGGGGGTA
2028 :     GTGCATCAGGTATACAGCGAGTTGAGTGCTGGATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACCTGC
2029 :     CCATTAGACCGGGATAACGCCGGGAAACTGGCGCTAATACCGGATACGCTCCTCTGGTCGCATGACTGGG
2030 :     GGAGGAAAGGGGAAACCCGCTAATGGATGGGTCCGCGTCCCATTAGCTAGATGGTGGGGTAATGGCCTAC
2031 :     CATGGCGACGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTC
2032 :     CTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCGACGCCGCGTGAGCGA
2033 :     GGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTTCTGGGGGAAGAAGAGGGTGACGGTACCCCAGGAGGAAGCCC
2034 :     CGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAA
2035 :     AGGGCGCGTAGGCGGCTCAAGAAGTCAGGGGTGAAATACCGCAGCTCAACTGCGGGGGTGCCTCTGAAAC
2036 :     CATTGGGCTTGAGGGCAGGAGAGGGGAGTGGAATTCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAG
2037 :     GAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGCCTGGCCCTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAAC
2038 :     AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGGGTGCTAGGTGTTGGGGGGATAGGACCCTTCA
2039 :     GTGCCGTAGCAAACGCAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTG
2040 :     ACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTT
2041 :     GACATCCCCTGACGGCCGTGGAAACACGGATTTCACGGGAGTAATCTCGTGACAGGGAGACAGGTGGTGC
2042 :     ATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTACGGTTAG
2043 :     TTGCTAACGGGTAAAGCCGAGCACTCTAGCCGGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACG
2044 :     TCAAATCATCATGCCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAAAGGGCAGCGAAC
2045 :     CCGCGAGGGGGAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAA
2046 :     GTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCC
2047 :     CGTCACACCACGAAAGCCGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCTGTTCGGAAGTCAGAGGTCAGAAG
2048 :     TCAGAAGTTGGATTGGGAAAAGGAGGGCGGGTAAAACCTCCGCACCCTTAGCCTGGATCTGACATCCGAC
2049 :     TTCCGACTTCCGAACGGGGGGCAGCCGTCGAAGGTGGGGTTGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA
2050 :     GCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
2051 :     >Moor.ther Moorella thermoacetica ATCC 39073 [gi|83588874 147988-149555]
2052 :     TTAATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACAAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGT
2053 :     CTTTAATTGGGGAAATCTTCGGATGGAACCGATTAAAGATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTA
2054 :     ATCTACCCTTCAGACTGGGATAACACCGGGAAACTGGTGCTAATACCGGATACGGTCTACGGGAGGCATC
2055 :     TTCTGTAGAAGAAAGGTGGCGCAAGCTACCGCTGAAGGATGAGCCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGTGAG
2056 :     GTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGTCGGCCACACTGGGACTGAGACA
2057 :     CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACG
2058 :     CCGCGTGAGCGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCATCAGGGACGAAGTCTTAAAGGCGAATAG
2059 :     CCTTTAAGGTGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAAACGTAG
2060 :     GGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGTGTAGGCGGCCTGGCAAGTCAGATGTGAAAA
2061 :     ACCCCGGCTTAACCGGGGGCATGCATTTGAAACTGCCGGGCTTGAGGGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCC
2062 :     CGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGCCTGGCCC
2063 :     TGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGAT
2064 :     GGGTACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGCAGTAAACACAATAAGTACCCCGCCTGGGGA
2065 :     GTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA
2066 :     TTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCGGGGTTTGACATCCTGCGAACCTGGTGGAAACACTGGGGTGCCC
2067 :     TTCGGGGAACGCAGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC
2068 :     CGCAACGAGCGCAACCCCTACCTTTAGTTGCCAGCGGGTAAAGCCGGGCACTCTAAAGGGACTGCCGGTG
2069 :     ACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATATCCCGGGCTACACACGTGCTA
2070 :     CAATGGCCTGTACAAAGGGGTGCGAAGGAGCGATCCGGAGCGAATCCCAAAAAGCAGGTCTCAGTTCGGA
2071 :     TTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAAT
2072 :     ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGCTGGCAACACCCGAAGCCGGTGACCTA
2073 :     ACCCGCGAGGGAAGGAGCCGTCTAAGGTGGGGCTGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAT
2074 :     CGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
2075 :     >Desu.hafni Desulfitobacterium hafniense [fig|49338.1.rna.044]
2076 :     AATTTTATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
2077 :     CAAGTCGAACGGAGAGCTCAATAAGCTTGCTTAGAGAGTTCTTAGTGGCGGACGGGTGAG
2078 :     TAACGCGTGGATAACCTACCTAGTAGACCGGGACAACCCTTGGAAACGAGGGCTAATACC
2079 :     GGATAAGCTTAATTAGTGGCATCACTGATTAAGGAAAGATGGCCTCTGAAGATGCTATCG
2080 :     TTAGTAGATGGATCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGAC
2081 :     GATCAGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGAACGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT
2082 :     CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGC
2083 :     CGCGTGTACGACGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTGTCTTCAGGGACGAACGGTAAGT
2084 :     ATGTAAAGAATGTACTTACATGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCC
2085 :     AGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTGTCCGGAATCATTGGGCGTAAAGGGCG
2086 :     CGTAGGCGGATACTTAAGTCTGGTGTGAAAACCTAGGGCTCAACCCTGGGACTGCATCGG
2087 :     AAACTGGGTATCTTGAGGACAGGAGAGGAAAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGC
2088 :     GTAGATATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGACTGTAACTGACGCTGA
2089 :     GGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGA
2090 :     TGAGTGCTAGGTGTAGAGGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGCAGTTAACACACTAAGCACT
2091 :     CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAA
2092 :     GCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATC
2093 :     CATAGAATCCTGTGGAAACATGGGAGTGCCCTTCGGGGAGCTATGAGACAGGTGGTGCAT
2094 :     GGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCT
2095 :     ATGTTTAGTTGCTAACGCGTAATGGTGAGCACTCTAGACAGACTGCCGGTGACAAACCGG
2096 :     AGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTACACACGTGCT
2097 :     ACAATGGCCAGTACAGACGGAAGCGAAGCCGTGAGGTGAAGCCAATCCGAGAAAGCTGGT
2098 :     CTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCA
2099 :     GGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACG
2100 :     AAAGTCTGCAACACCCGAAGCCGGTGAGGTAACCCGAAAGGGAGCTAGCCGTCGAAGGTG
2101 :     GGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATC
2102 :     ACCTCCTTTCTA
2103 :     >Rhod.balti Rhodopirellula baltica SH 1 [gi|32470666 c5078478-5076964]
2104 :     ACAAAATTGAAGGGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGTTGGCGGCATGGATTAGGCATG
2105 :     CAAGTCGCACGAGAAGCTGAGTAGCTTGCTACAAAGCGGACAGTGGCGAAAGGGAGAGTA
2106 :     ACGTGTGGTTACGTGCCCTCGAGACCGGGATAGCGTCGGGAAACTGGCAGTAATACCGGA
2107 :     TAATATCTACGGATCAAATGGTGAGATTCCGCTCGAGGATTGGACCGCATACTATTAGCT
2108 :     TGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCTGCGATGGTTACCGGGTGTGAGAGCATGGCCC
2109 :     GGCTCACTGGGACTGAGACACTGCCCAGACACCTACGGGTGGCTGCAGTCGAGAATCTTC
2110 :     GGCAATGGACGAAAGTCTGACCGAGCGATGCCGCGTGCGGGATGAAGGCCCTCGGGTTGT
2111 :     AAACCGCTGTCAGTTGTTAGGAAATGCATGGTGGTTATCCATCATGTTTGACCGATCTTC
2112 :     AGAGGAAGGACGGGCTAAGTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAACACGTACCGTCCAAACGTT
2113 :     ATTCGGTATCACTGGGCTTAAAGCGTTCGTAGGCGGCCTAGAAGGTGAGATGTGAAAGCC
2114 :     CACGGCTCAACCGTGGAATTGCGTTTCAAACCACTAGGCTTGAGGAAGACAGGGGTGATG
2115 :     GGAACTTATGGTGGAGCGGTGAAATGCGTTGATATCATAGGGAACACCGGTGGCGAAAGC
2116 :     GCATCACTGGGTCTTTTCTGACGCTGAGGAACGAAAGCTAGGGTAGCGAACGGGATTAGA
2117 :     TACCCCGGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGAGCACTAGGCTGAGGGAACTTCCACATTCTC
2118 :     TCGGCCGCAGGGAAACCATTAAGTGCTCCGCCTGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT
2119 :     CAAAGGAATTGACGGGGGCTCACACAAGCGGTGGAGGATGTGGCTTAATTCGAGGCTACG
2120 :     CGAAGAACCTTATCCTAGACTTGACATGCTTGAGAATCCCTATGAAAGTAGAGAGTGCCC
2121 :     TTCGGGGAGCTCTTGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTCG
2122 :     GGTTAAGTCCCTTAACGAGCGAAACCCTTATCTTTAGTTGCCAGCGGGTAATGCCGGGGA
2123 :     CTCTAAAGAGACTGCCGGTGTCAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATG
2124 :     GCCTTTATGTCTAGGGCTGCACACGTCCTACAATGGCACGGACAAACGGACGCAATACCG
2125 :     CGAGGTGGAGCAAATCCTAGAAACCGTGCCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCT
2126 :     GCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGTAGGTCAGCATACTACGGTGAATGTGTTCCTGA
2127 :     GCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCACGAAAGTTGGGAGGGCCCGAAGTCACCAAGCTA
2128 :     ACCCGCAAGGGAGGCAGGTGCCGAAGGTCAGCTCGACAATTGGGACTAAGTCGTAACAAG
2129 :     GTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
2130 :     >Meth.kandl Methanopyrus kandleri AV19 [fig|190192.1.rna.15]
2131 :     ACTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCACCGCTATCGGGGTCCGACTAAGCCATGCAAGTCG
2132 :     AGGGCCGCCCGGCAATGGGGGCGGCCCGGCGGACGGCTCAGTAACACGTGGGTAACCTAC
2133 :     CCTCGGGACGGGGATAACCCCGGCGAAAGTGGGGCTAATCCCCGATAGGCGGGGCGGCCT
2134 :     GGAACGGTCCTCCGCCGAAAGGGCCCGGGCCCATGCCGCCCGGGTCCGCCCGAGGATGGG
2135 :     CCTGCGGCCGATTAGGTAGTTGGCGGGGTAACGGCCCGCCAAGCCGATAATCGGTACGGG
2136 :     CGGTGAGAGCCGGAGCCCGGAGACGGGGACTGAGACAAGGCCCCGGGCCCTACGGGGCGC
2137 :     AGCAGGCGCGAAACCTCCGCAATGCGGGCAACCGCGACGGGGGGACCCCGAGTGCCGTCG
2138 :     GGGCAAAGCCCCGGCGGCTGTACCGGGGTGTAAAAAGCCCCGGGTAGAAAGCGGCGGGCA
2139 :     AGACCGCTGCCAGCCGCCGCGGTAATAGCGGCGCCGCAAGTGGTGGCCGCTTTTATTGGG
2140 :     CCTAAAGGGGCCGTAGCCGGTCCCGTGGGTCCCCGCCGAAAGCCCGCGGCTTAACCGCGG
2141 :     GAGTCGGCGGGGAAACTGCGGGACTTGGGACCGGGAGAGGCCGGAGGTACCCCCGGGGTA
2142 :     GGGGTGAAATCCTGTCATCCCGGGGGGACCGCCAGTGGCGAAGGCGTCCGGCTGGAACGG
2143 :     GTCCGACGGTGAGGGCCGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCC
2144 :     GGCTGTAAACGATGCGGACTAGGTGTTGGGGCGGCCACGAGCCGCCCCAGTGCCGTAGGG
2145 :     AAGCCGTTAAGTCCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGG
2146 :     CGGGGGAGCACCACAACCGGTGGAGCCTGCGGTTTAATTGGATTCAACGCCGGAAACCTT
2147 :     ACCGGGGGCGACAGCAGGATGAAGGCCAGGTTGACGACCTTGCCGGACGAGCTGAGAGGA
2148 :     GGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCCTGTTAAGTCAGGTAACGAGCGA
2149 :     GACCCCCGCCCGCAGTTGCCAGCGGGCCCCGTAAGGGGCGCCGGGCACTCTGCGGGGATC
2150 :     GCCGCCGTTAAGGCGGATGAAAGTGGGGGCGACGGCAGGTCCGTATGCCCCGAAACCCCC
2151 :     GGGCTACACGCGGGCTACAATGGCGGGGACAATGGGATCCGACCCCGAAAGGGGGAGGAA
2152 :     ATCCCCTAAACCCCGTCGTAGTTCGGATTGCGGGCTGCAACTCGCCCGCATGAAGGTGGA
2153 :     ATCGGTAGTAACCGTGCCTCAGAATGGCACGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACAC
2154 :     CGCCCGTCACGCCACCCGAGCCCCCCGGGGGCAAGCCCCCGGTCCGCAAGGGCTGGGGGC
2155 :     GAGCCCCCGGGGGGTGAGGGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGG
2156 :     CTGGATCACCTCCA
2157 :     >Meth.janna Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 [fig|243232.1.rna.24]
2158 :     ATTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCACTGCTATCGGGGTCCGACTAAGCCATGCGAGTCA
2159 :     AGGGGCTCCCTTCGGGGAGCACCGGCGCACGGCTCAGTAACACGTGGCTAACCTACCCTC
2160 :     GGGTGGGGGATAACCTCGGGAAACTGAGGCTAATCCCCCATAGGGGAGGAGGTCTGGAAT
2161 :     GATCCCTCCCCGAAAGGCGTAAGCCGCCCGAGGATGGGGCTGCGGCGGATTAGGTAGTTG
2162 :     GTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCTACGATCCGTACGGGCCCTGAGAGGGGGAGCCCGGAG
2163 :     ATGGACACTGAGACACGGGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTCCGCAA
2164 :     TGCGCGAAAGCGCGACGGGGGGACCCCGAGTGCCCACGCCCTGCGTGGGCTTTTCCGGAG
2165 :     TGTAAACAGCTCCGGGAATAAGGGCTGGGCAAGTCCGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACC
2166 :     GGCGGCCCAAGTGGTGGCCACTGTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCGGCCCGGTAAG
2167 :     TCTCTGCTTAAATCCTGCGGCTCAACCGCAGGGCTGGCAGAGATACTGCCGGGCTTGGGA
2168 :     CCGGGAGAGGCCGGGGGTACCCCAGGGGTAGCGGTGAAATGCGTTGATCCCTGGGGGACC
2169 :     ACCTGTGGCGAAGGCGCCCGGCTGGAACGGGTCCGACGGTGAGGGACGAAGGCCAGGGGA
2170 :     GCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACTCTGCGGACTAGGTGTCGCG
2171 :     TCGGCTTCGGGCCGACGCGGTGCCGAAGGGAAGCCGTTAAGTCCGCCGCCTGGGGAGTAC
2172 :     GGTCGCAAGACTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACGGGTGGAGCCTGC
2173 :     GGTTTAATTGGATTCAACGCCGGGCATCTTACCAGGGGCGACGGCAGGATGAAGGCCAGG
2174 :     TTGACGACCTTGCCAGACGCGCCGAGAGGTGGTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTACCGTG
2175 :     AGGCGTCCTGTTAAGTCAGGTAACGAGCGAGACCCGTGCCCCATGTTGCTACCTCCTCCT
2176 :     CCGGGAGGAGGGCACTCATGGGGGACCGCCGGCGCTAAGCCGGAGGAAGGTGCGGGCAAC
2177 :     GACAGGTCCGCATGCCCCGAATCCCCTGGGCTACACGCGGGCTACAATGGCCGGGACAAT
2178 :     GGGACGCGACCCCGAAAGGGGGAGCGAATCCCCTAAACCCGGTCGTAGTCCGGATCGAGG
2179 :     GCTGTAACTCGCCCTCGTGAAGCCGGAATCCGTAGTAATCGCGCCTCACCATGGCGCGGT
2180 :     GAATGCGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCACGCCACCCGAGTTGAGCCCAAGTG
2181 :     AGGCCCTGTCCGCAAGGGCAGGGTCGAACTTGGGTTCAGCGAGGGGGGCGAAGTCGTAAC
2182 :     AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTG
2183 :     >Meth.therm Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H [fig|187420.1.rna.37]
2184 :     ATTCCGTTTGATCCTGGCGGAGGCTACTGCTATTGGGGTTCGATTAAGCCATGCAAGTCG
2185 :     AACGAACCTTGTGTTCGTGGCGAACGGCTCAGTAACACGTGGATAACCTGCCCTTGGGAC
2186 :     CGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGATAAACCCGGATAGGTGATGCTGCCTGGAATGGTTC
2187 :     TTCACCGAAACACCTTCGGGTGCCCAAGGATGGGTCTGCGGCCGATTAGGTTGTTGGTAG
2188 :     GGTAACGGCCTACCAAGCCGATCATCGGTACGGGTTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGATGG
2189 :     AACCTGAGACAAGGTTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTCCGCAATGCA
2190 :     CGCAAGTGCGACGGGGGAACCCCAAGTGCCACTCTTAACGGGGTGGCTTTTCAGAAGTGT
2191 :     AAAAAGCTTCTGGAATAAGGGCTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAACACCGGC
2192 :     AGCTCAAGTGGTAGCCGCTTTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCGGTCTGATAAGTCT
2193 :     CTGGTGAAATCCCACAGCTTAACTGTGGGAATTGCTGGAGATACTATCATGACTCGAGGT
2194 :     CGGGAGAGGCTGGAGGTACTCCCAGGGTAGGGGTGAAATCCTGTAATCCTGGGAGGACCA
2195 :     CCTGTGGCGAAGGCGTCCAGCTGGAACGAACCTGACGGTGAGGGACGAAAGCCAGGGGCG
2196 :     CGAACCGGATTAGATACTCGGGTAGTCCTGGCCGTAAACGATGTGGACTTGGTGTTGGGA
2197 :     TGGCTTCGAGCTGCCCCAGTGCCGAAGGGAAGCTGTTAAGTCCACCGCCTGGGAAGTACG
2198 :     GCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCACAACGCGTGGAGCCTGCG
2199 :     GTTTAATTGGATTCAACGCCGGACATCTCACCAGGGGCGACAGCAGTATGATGGCCAGGT
2200 :     TGATGACCTTGCCTGACGAGCTGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTACCGTGA
2201 :     GGCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCACGCCCTTAGTTACCAGCGGAACCCT
2202 :     TATGGGTTGCCGGGCACACTAAGGGGACCGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGAGTGGACG
2203 :     ACGGTAGGTCCGTATGCCCCGAATCCCCTGGGCAACACGCGGGCTACAATGGCCTGGACA
2204 :     ATGGGTTCCGACACCGAAAGGTGGAGGTAATCCCCTAAACCAGGTCGTAGTTCGGATCGA
2205 :     GGGCTGTAACCCGCCCTCGTGAAGCTGGAATGCGTAGTAATCGCGTGTCACTATCGCGCG
2206 :     GTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCACGCCACCCAAAAAGGGCTTGGA
2207 :     TGAGGCCACAACATTCTGTTGTGGTCGAATCTGGGTTCTTTGAGGAGGGCGAAGTCGTAA
2208 :     CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT
2209 :     >Meth.aceti Methanosarcina acetivorans C2A [fig|188937.1.rna.10]
2210 :     ATTCTGGTTGATCCTGCCAGAGGTTACTGCTATCGGTGTTCGCCTAAGCCATGCGAGTCA
2211 :     TATGTTCTTTGTGAACATGGCGTACTGCTCAGTAACACGTGGATAACCTGCCCTTGGGTC
2212 :     CGGCATAACCCCGGGAAACTGGGGATAATACCGGATAACGCACATATGCTGGAATGCTTT
2213 :     CTGCGTAAAACGGATTCGTCTGCCCAAGGATGGGTCTGCGGCCTATCAGGTAGTAGTGGG
2214 :     TGTAACGTACCTACTAGCCGACAACGGGTACGGGTTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGATGG
2215 :     ATTCTGAGACATGAATCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAAACTTTACAATGCG
2216 :     GGAAACCGTGATAAGGGGACACCGAGTGCCAGCATCATATGCTGGCTGTCCGGATGTGTA
2217 :     AAATACATCTGTTAGCAAGGGCCGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAACACCGGC
2218 :     GGCCCGAGTGGTGATCGTGATTATTGGGTCTAAAGGGTCCGTAGCCGGTTTGGTCAGTCC
2219 :     TCCGGGAAATCTGACAGCTCAACTGTTAGGCTTTCGGGGGATACTGCCAGACTTGGAACC
2220 :     GGGAGAGGTAAGAGGTACTACAGGGGTAGGAGTGAAATCTTGTAATCCCTGTGGGACCAC
2221 :     CTGTGGCGAAGGCGTCTTACCAGAACGGGTTCGACGGTGAGGGACGAAAGCTGGGGGCAC
2222 :     GAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCCAGCCGTAAACGATGCTCGCTAGGTGTCAGGCA
2223 :     TGGCGCGACCGTGTCTGGTGCCGCAGGGAAGCCGTGAAGCGAGCCACCTGGGAAGTACGG
2224 :     CCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACAACAACGGGTGGAGCCTGCGG
2225 :     TTTAATTGGACTCAACGCCGGACAACTCACCGGGGACGACAGCAATATGTAGGCCAGGCC
2226 :     GAAGACCTTGCCTGAATCGCTGAGAGGAGGTGCATGGCCGTCGCCAGTTCGTACTGTGAA
2227 :     GCATCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGTGCCCACTGTTACCAGCATGTCCTCC
2228 :     GGGACGATGGGTACTCTGTGGGGACCGCCGGTGTTAAATCGGAGGAAGGTGCGGGCCACG
2229 :     GTAGGTCAGTATGCCCCGAATTTCCCGGGCTACACGCGGGCTACAATGAATGGGACAATG
2230 :     GGTCCCTCCCCTGAAAAGGGCTGGTAATCTCACAAACCCATCCGTAGTTCGGATCGAGGG
2231 :     CTGTAACTCGCCCTCGTGAAGCTGGAATCCGTAGTAATCGCGTTTCAATATAGCGCGGTG
2232 :     AATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAACCACCCGAGTGAGGTATGGGTGA
2233 :     GGGCACGGACTTCGTGCCGTGTTCGAACCTGAATTTTGCAAGGGGGGTTAAGTCGTAACA
2234 :     AGGTAGCCGTAGGGGAATCTGCGGCTGGATCACCTCCTA
2235 :     >Arch.fulgi Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 [fig|224325.1]
2236 :     ATTCTGGTTGATCCTGCCAGAGGCCGCTGCTATCCGGCTGGGACTAAGCCATGCGAGTCA
2237 :     AGGGGCTTGTATCCCTTCGGGGATGCAAGCACCGGCGGACGGCTCAGTAACACGTGGACA
2238 :     ACCTGCCCTCGGGTGGGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCCATAGGGGATGG
2239 :     GTACTGGAATGTCCCATCTCCGAAAGCGCTTAGCGCCCGAGGATGGGTCTGCGGCGGATT
2240 :     AGGTTGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGAAGATCCGTACGGGCCATGAGAGTGGG
2241 :     AGCCCGGAGATGGACCCTGAGACACGGGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAA
2242 :     CCTCCGCAATGCGGGAAACCGCGACGGGGTCAGCCGGAGTGCTCGCGCATCGCGCGGGCT
2243 :     GTCGGGGTGCCTAAAAAGCACCCCACAGCAAGGGCCGGGCAAGGCCGGTGGCAGCCGCCG
2244 :     CGGTAATACCGGCGGCCCGAGTGGCGGCCACTTTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCG
2245 :     GGCTGGTAAGTCCTCCGGGAAATCTGGCGGCTTAACCGTCAGACTGCCGGAGGATACTGC
2246 :     CAGCCTAGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGTATTCCCGGAGTAGGGGTGAAATCCTGTAATC
2247 :     CCGGGAGGACCACCTGTGGCGAAGGCGCCCGGCTGGAACGGGTCCGACGGTGAGGGACGA
2248 :     AGGCCAGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACGATGCGGAC
2249 :     TAGGTGTCACCGAAGCTACGAGCTTCGGTGGTGCCGGAGGGAAGCCGTTAAGTCCGCCGC
2250 :     CTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACGG
2251 :     GTGGAGCCTGCGGTTTAATTGGATTCAACGCCGGGAAGCTTACCGGGGGAGACAGCGGGA
2252 :     TGAAGGTCGGGCTGAAGACCTTACCAGACTAGCTGAGAGGTGGTGCATGGCCGCCGTCAG
2253 :     TTCGTACTGTGAAGCATCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGTTGC
2254 :     CAGCGGTTCCCTTCGGGGAAGCCGGGCACACTGGGGGGACTGCCGGCGCTAAGCCGGAGG
2255 :     AAGGTGCGGGCAACGGCAGGTCCGTATGCCCCGAATCCCCCGGGCTACACGCGGGCTACA
2256 :     ATGGCCGGGACAATGGGTACCGACCCCGAAAGGGGTAGGTAATCCCCTAAACCCGGTCTA
2257 :     ACCTGGGATCGAGGGCTGCAACTCGCCCTCGTGAACCTGGAATCCGTAGTAATCGCGCCT
2258 :     CAAAATGGCGCGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAGCCACCCGA
2259 :     GTGGGCCAGGGGCGAGGGGGTGGCCCTAGGCCACCTTCGAGCCCAGGGTCCGCGAGGGGG
2260 :     GCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAATCTGCGGCTGGATCACCTCCTA
2261 :     >Ther.volca Thermoplasma volcanium GSS1 [fig|273116.1.rna.47]
2262 :     ACTCCGGTCGATCCTGCCGGCGGTCACTGCTATCAGGTTCCGACTAAGCCATGCAAGTCA
2263 :     CGGGGCCGTAAGGCACCGGCGAACAGCTCAGTAACACGTGGATAATTTACCCTCAGGTGG
2264 :     GGTATAACCTCGGGAAACTGAGGCTAATCCCCCATAGTCATTACAAACTGGAACGTTGTA
2265 :     ATGATGAAAGCTCCGGCGCCTGAGGATAAGTCTGCGGCCTATCAGGTAGTAGGTGGTGTA
2266 :     AAGGACCACCTAGCCTAAGACGGGTACGGGCCCTGAAAGGGGGAGCCCGGAGATGGACTC
2267 :     TGAGACAACAGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAAACTGTGCAATGCGCGAA
2268 :     AGCGCGACACGGGGAACCTGAGTGCCTTGACTTTTCGTCAAGGCTTTTCTGATGCCTAAA
2269 :     AAGCATCAGGAATAAGGGCTGGGCAAGACGGGTGCCAGCCGCCGCGGTAACACCCGCAGC
2270 :     TCGAGTGGTGATCACTTTTATTGAGTCTAAAGCGTCCGTAACCGGTCTTATAAATCTTCA
2271 :     GATAAATTCTCCCGCTTAACGGAAGAACTTCTGAAGAGACTGTAAGACTTGGGACCGGGT
2272 :     GAGGTTGAATGTACTTTCAGGGTAGGGGTAAAATCCTGTAATCCTGAAAGGACGACCGGT
2273 :     GGCGAAAGCGTTCAACTAGAACGGATCCGACGGTGAGGGACGAAGGCTAGGGGAGCAAAC
2274 :     CGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTAGCTGTAAACGCTGCCCACTTGGTGTTGCTTCTCCG
2275 :     TTGAGGGGGAGCAGTGCCGTAGCGAAGGTGTTAAGTGGGTCACTTGGGGAGTACGGCCGC
2276 :     AAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCGCAACGGGAGGAGCGTGCGGTTTA
2277 :     ATTGGATTCAACGCCGGAAAACTCACCGGGAGCGACCTTCGGATGAGGGTCAACCTGACG
2278 :     AATTTACCCGATAGAAGGAGAGGTGGTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTACCGTAGGGCGT
2279 :     TCACTTAAGTGTGATAACGAGCAAGACCCCCATCTCTAATTGCTAAGCTTTCTTAGCGGG
2280 :     AAGCTGCACTTTAGAGGGACCGCCAGCGCTAAGCTGGAGGAAGGAGGGGTCGACGGCAGG
2281 :     TCAGTACGCCCCGAATCTCCCGGGCTACACGCGCGCTACAAAGGACGGGACAATGAGTTG
2282 :     CAACCTCGAAAGGGGAAGCTAACCTCGAAACCCGTTCGTAGTCAGGACTGAGGGCTGTAA
2283 :     CTCGCCCTCACGAATGTGGATTCCGTAGTAATCGTAGGTCAACAGCCTACGGTGAATATG
2284 :     CCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAACCATCCGAGCTGGTGTTGGATGAGGGTCT
2285 :     GTCCATTGGATGGATTCGAATCTGATGTCAGTGAGGAGGGTTAAGTCGTAACAAGGTATC
2286 :     CGTAGGGGAACCTGCGGATGGATCACCTCCA
2287 :     >Halo.NRC-1 Halobacterium sp. NRC-1 [fig|64091.1.rna.42]
2288 :     ATTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCATTGCTATCGGAGTCCGATTTAGCCATGCTAGTTG
2289 :     TGCGGGTTTAGACCCGCAGCGGAAAGCTCAGTAACACGTGGCCAAGCTACCCTGTGGACG
2290 :     GGAATACTCTCGGGAAACTGAGGCTAATCCCCGATAACGCTTTGCTCCTGGAAGGGGCAA
2291 :     AGCCGGAAACGCTCCGGCGCCACAGGATGCGGCTGCGGTCGATTAGGTAGACGGTGGGGT
2292 :     AACGGCCCACCGTGCCCATAATCGGTACGGGTTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAAT
2293 :     CTGAGACAAGATTCCGGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTTTACACTGTACGA
2294 :     AAGTGCGATAAGGGGACTCCGAGTGTGAAGGCATAGAGCCTTCACTTTTGTACACCGTAA
2295 :     GGTGGTGCACGAATAAGGACTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAATACCGGCAG
2296 :     TCCGAGTGATGGCCGATCTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCTGGCTGAACAAGTCCGT
2297 :     TGGGAAATCTGTCCGCTTAACGGGCAGGCGTCCAGCGGAAACTGTTCAGCTTGGGACCGG
2298 :     AAGACCTGAGGGGTACGTCTGGGGTAGGAGTGAAATCCTGTAATCCTGGACGGACCGCCG
2299 :     GTGGCGAAAGCGCCTCAGGAGAACGGATCCGACAGTGAGGGACGAAAGCTAGGGTCTCGA
2300 :     ACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTAGCTGTAAACGATGTCCGCTAGGTGTGGCGCAGG
2301 :     CTACGAGCCTGCGCTGTGCCGTAGGGAAGCCGAGAAGCGGACCGCCTGGGAAGTACGTCT
2302 :     GCAAGGATGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACCGGAGGAGCCTGCGGTT
2303 :     TAATTGGACTCAACGCCGGACATCTCACCAGCCCCGACAGTAGTAATGACGGTCAGGTTG
2304 :     ATGACCTTACCCGAGGCTACTGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTACCGTGAG
2305 :     GCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACTCCTAATTGCCAGCAGTACCCTT
2306 :     TGGGTAGCTGGGTACATTAGGTGGACTGCCGCTGCCAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAAC
2307 :     GGTAGGTCAGTATGCCCCGAATGGGCTGGGCAACACGCGGGCTACAATGGTCGAGACAAT
2308 :     GGGAAGCCACTCCGAGAGGAGGCGCTAATCTCCTAAACTCGATCGTAGTTCGGATTGAGG
2309 :     GCTGAAACTCGCCCTCATGAAGCTGGATTCGGTAGTAATCGCGTGTCAGCAGCGCGCGGT
2310 :     GAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAATCACCCGAGTGGGGTTCGGATG
2311 :     AGGCCGGCATGCGCTGGTCAAATCTGGGCTCCGCAAGGGGGATTAAGTCGTAACAAGGTA
2312 :     GCCGTAGGGGAATCTGCGGCTGGATCACCTCCTA
2313 :     >Pyro.horik Pyrococcus horikoshii OT3 [fig|70601.1.rna.4]
2314 :     ATTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCACTGCTATGGGGGTCCGACTAAGCCATGCGAGTCA
2315 :     AGGGGGCGTCCCTTCTGGGACGCCACCGGCGGACGGCTCAGTAACACGTCGGTAACCTAC
2316 :     CCTCGGGAGGGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCCATAGGCCTGGGGTACTG
2317 :     GAAGGTCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGTAAGGCTCCGCCCGAGGATGGGCCGGCGGCCGA
2318 :     TTAGGTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGAAGATCGGTACGGGCCGTGAGAGCG
2319 :     GGAGCCCGGAGATGGACACTGAGACACGGGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGA
2320 :     AACCTCCGCAATGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGTGCCGTGCCTCTGGCACGG
2321 :     CTTTTCCGGAGTGTAAAAAGCTCCGGGAATAAGGGCTGGGCAAGGCCGGTGGCAGCCGCC
2322 :     GCGGTAATACCGGCGGCCCGAGTGGTGGCCACTATTATTGGGCCTAAAGCGGCCGTAGCC
2323 :     GGGCCCGTAAGTCCCTGGCGAAATCCCACGGCTCAACCGTGGGGCTCGCTGGGGATACTG
2324 :     CGGGCCTTGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGTACCCCCGGGGTAGGGGTGAAATCCTATAAT
2325 :     CCCGGGGGGACCGCCAGTGGCGAAGGCGCCCGGCTGGAACGGGTCCGACGGTGAGGGCCG
2326 :     AAGGCCAGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAAGGATGCGGG
2327 :     CTAGGTGTCGGGCGAGCTTCGAGCTCGCCCGGTGCCGTAGGGAAGCCGTTAAGCCCGCCG
2328 :     CCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAAGG
2329 :     GGTGGAGCGTGCGGTTTAATTGGATTCAACGCCGGGAACCTCACCGGGGGCGACGGCAGG
2330 :     ATGAAGGCCAGGCTGAAGGTCTTGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCA
2331 :     GCTCGTACCGTGAGGCGTCCACTTAAGTGTGGTAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGTTG
2332 :     CCAGTCCCTCCCGCTCGGGAGGGAGGCACTCTGGGGGGACTGCCGGCGATAAGCCGGAGG
2333 :     AAGGGGCGGGCGACGGTAGGTCAGTATGCCCCGAAACCCCCGGGCTACACGCGCGCTACA
2334 :     ATGGGCGGGACAATGGGTGCCGACCCCGAAAGGGGGAGGTAATCCCCTAAACCCGCCCTC
2335 :     AGTTCGGATCGCGGGCTGCAACTCGCCCGCGTGAAGCTGGAATCCCTAGTACCCGCGCGT
2336 :     CATCATCGCGCGGCGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCACTCCACCCGA
2337 :     GCGGGGCCTAGGTGAGGCCCGATCTCCTTCGGGAGGTCGGGTCGAGCCTAGGCTCCGTGA
2338 :     GGGGGGAGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTACGGCTCGATCACCTCCTA
2339 :     >Sulf.solfa Sulfolobus solfataricus P2 [fig|273057.1.rna.44]
2340 :     AATCCGGTTGATCCTGCCGGACCCGACCGCTATCGGGGTGGGGCTAAGCCATGGGAGTCG
2341 :     TACGCTCCCGGGCAAGGGAGCGTGGCGGACGGCTGAGTAACACGTGGCTAACCTACCCTG
2342 :     AGGAGGGAGATAACCCCGGGAAACTGGGGATAATCTCCCATAGGCGAGGAGTCCTGGAAC
2343 :     GGTTCCTCGCTGAAAGGCTCATGGGCTATTCCCCGCTCATGAGCGCCTCAGGATGGGGCT
2344 :     GCGGCCCATCAGGTAGTTGGGGGGGTAAGGGCCCCCCAAGCCTATAACGGGTAGGGGCCG
2345 :     TGAGAGCGGGAGCCCCCAGTTGGGCACTGAGACAAGGGCCCAGGCCCTACGGGGCGCACC
2346 :     AGGCGCGAAACGTCCCCAATGCGCGGAAGCGTGAGGGCGCCACCCCGAGTGCTCCCGTAA
2347 :     GGGAGCTTTTCCCCGCTCTACAAAGGCGGGGGAATAAGCGGGGGGCAAGTCTGGTGTCAG
2348 :     CCGCCGCGGTAATACCAGCCCCGCGAGTGGTCGGGACTCTTACTGGGCCTAAAGCGCCCG
2349 :     TAGCCGGCCCGACAAGTCACTCCTTAAAGACCCCGGCTCAACCGGGGGAATGGGGGTGAT
2350 :     ACTGTCGGGCTAGGGGGCGGGAGAGGCCAGCGGTACTCCCGGAGTAGGGGCGAAATCCTC
2351 :     AGATCTCGGGAGGACCACCAGTGGCGAAAGCGGCTGGCTAGAACGCGCCCGACGGTGAGG
2352 :     GGCGAAAGCCGGGGCAGCAAAAGGGATTAGATACCCCTGTAGTCCCGGCTGTAAACAATG
2353 :     CAGGCTAGGTGTCACATGGGCTTAGAGCCCATGTGGTGCCGCAGGGAAGCCGTTAAGCCT
2354 :     GCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCAC
2355 :     AAGGGGTGGAACCTGCGGCTCAATTGGAGTCAACGCCTGGAATCTTACTAGGGGAGACCG
2356 :     CAGGATGACGGCCAGGCTAACGACCTTGCCTGACTCGCGGAGAGGAGGTGCATGGCCGTC
2357 :     GCCAGCTCGTGTTGTGAAATGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCCCACCACTA
2358 :     GTTGGTATCCTGGTCTCCGGGCCGGGACCACACTAGTGGGACTGCCGGCGTAAGCCGGAG
2359 :     GAGGGAGGGGGCCACGGCAGGTCAGCATGCCCCGAAACCCCTGGGCCGCACGCGGGTTAC
2360 :     AATGGCAGGGACAGCGGGATTCCGACCCCGAAAGGGGAAGGTAATCCCTTAAACCCTGCC
2361 :     GCAGTTGGGATCGAGGGCTGAAACTCGCCCTCGTGAACGAGGAATCCCTAGTAACCGCAG
2362 :     ATCAACAATCTGCGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCGCTCCACCC
2363 :     GAGTAGGAGAGGGGTGAGGCCCCTTGCCTTTGGGTGGGGGGTCGAGCTTCTCTCCTGCAA
2364 :     GGGGGGAGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCA
2365 :     >Aero.perni Aeropyrum pernix K1 (intron removed) [fig|272557.1]
2366 :     GTAACTCCGGTTGATCCTGCCGGACCCGACCGCTATCGGGGTAGGGCTAAGCCATGGGAG
2367 :     TCGAACGCCCCGCCGCTGCGGGGCGTGGCGGACGGCTGAGTAACACGTGGCTAACCTACC
2368 :     CTCGGGACGGGGATAACCCCTCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCGATAGGCGGGGGGTGCC
2369 :     TGGAAGGGTCCTCCGCCGAAAGGGGCCGCGGGGGGTTATCGCCCGCGGTCCGCCCGAGGA
2370 :     TGGGGCTGCGGCCCATCACGGTAGTTGGCGGGGTAATGGCCCGCCAAGCCTACGACGGGT
2371 :     AGGGGCCGTGAGAGCGGGAGCCCCCAGATGGGCACTGAGACAAGGGCCCAGGCCCTACGG
2372 :     GGCGCACCAGGCGCGAAAACTCCGCAATGCGGGCAACCGTGACGGGGCTACCCCGAGTGC
2373 :     CCCCCTTGGGGGGGCTTTTCCCCGCTGTAAGTAGGCGGGGGAATAAGCGGGGGGCAAGAC
2374 :     TGGTGTCAGCCGCCGCGGTAATACCAGCCCCGCGAGCGGTCGGGGTGCTTACTGGGCCTA
2375 :     AAGCGCCCGTAGCCGGCTCGACAAGTCCCCGCCTAAAGCCCCGGGCTCAACCCGGGGAGT
2376 :     GGCGGGGATACTGTCGGGCTAGGGGGCGGGAGAGGCCGAGGGTACTCCCGGGGTAGGGGC
2377 :     GAAATCCATTAATCCCGGGAGGACCACCAGTGGCGAAGGCGCTCGGCTGGAACGCGCCCG
2378 :     ACGGTGAGGGGCGAAAGCCGGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCCGGCTG
2379 :     TAAACGATGCGGGCTAGGTGTTGGGCGGGCGTGCGAGCCCGCCCAGTGCCGCAGGGAAGC
2380 :     CGTTAAGCCCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGG
2381 :     GGAGCACCACAAGGGGTGGAGCCTGCGGCTTAATTGGAGTCAACGCCGGGAACCTCCACC
2382 :     GGGGGCGACAGCAGGATGACGGCCAGGCTGAAGGCCTTGCCCGACGCGCTGAGGGGAGAT
2383 :     GCATGGCCGTCGCCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGAC
2384 :     CCCCGCCCCTAGTTGCCATCCCCGGGGCGACCCGGGGGGCACACTAGGGGGACTGCCGCC
2385 :     GCTAAGGCGGAGGAAGGAGGGGGCAACGGCAGGTCAGCATGCCCCTAAACCCCCGGGCTG
2386 :     CACGCGGGCTACAATGGCGGGGACAGCGGGTGCCGACCCCGAAAGGGGGAGGCAATCCCT
2387 :     CAAACCCCGCCTCAGTTGGGATCGAGGGCTGCAACTCGCCCTCGTGAACGTGGAATCCCT
2388 :     AGTAACCGCGCGTCATCATCGCGCGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACTGCCCG
2389 :     TCGCTCCACCCGAGGGGGGAGGGGGTGAGGCCCTCTCCGCCGGGAGGGGGTCGAACCCCC
2390 :     TCCCCCCGAGGGGGGAGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCA
2391 :     CCTCCCG
2392 :     >Pyro.aerop Pyrobaculum aerophilum str. IM2 (intron removed) [fig|178306.1]
2393 :     CCGGTTGATCCTGCCGGACCCGACCGCTATCGGGGTAGGGCTAAGCCATGCGAGTCGCGC
2394 :     GCCCGGGGGCGCCCGGGAGCGGCGCACGGCTCAGTAACACGTGCCTAACCTAACCTCGGG
2395 :     AGGGGGACACCCCCGGGAAACTGGGGTCAATCCCCCATAGGGGAAGGGCGCTGGAAGGCC
2396 :     CCTTCCCCGAAAGGGATGGCGGCCGATCCGCCGCCGTCCGCCCGAGGGTGGGGGCACGGC
2397 :     CCATCAGGTAGTTGGCGGGTTAAAGGCCCGCCAAGCCGAAGACGGGTAGGGGCGGTGAGA
2398 :     GCCGCGAGCCCCGAGATCGGCACTGAGACAAGGGCCGAGGCCCTACGGGGTGCAGCAGGC
2399 :     GCGAATACTCCGGAATGCGGGCAACCGCGACGGGGCTACCCCGAGTGCCGGGCGAAGAGC
2400 :     CCGGCTTTTGCCCGGTCTAAAACGCCGGGCGAATAAGCGGGGGGCAAGTCTGGTGTCAGC
2401 :     CGCCGCGGTAATACCAGCTCCGCGAGTGGTCGGGGTGTTTACTGGGCTTAAAGCGCCCGT
2402 :     AGCCGGCCCGGCAAGTCGCTCCTGAAATCCCCGGGCTCAACCCGGGGGCGGGGGGCGATA
2403 :     CTGCCGGGCTAGGGGGCGGGAGAGGCCGCCGGTACTCCGGGGGTAGGGGCGAAATCCGTT
2404 :     AATCCCCGGAGGACCACCAGTGGCGAAAGCGGGCGGCCAGAACGCGCCCGACGGTGAGGG
2405 :     GCGAAAGCCGGGGGAGCAAAGGGGATTAGATACCCCTGTAGTCCCGGCCGTAAACGATGC
2406 :     GGGCTAGCTGTCGGTCGGGCTTAGGGCCCGGCCGGTGGCGAAGGGAAACCGTTAAGCCCG
2407 :     CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGGGCACCACA
2408 :     AGGGGTGAAGCTTGCGGCTTAATTGGAGTCAACGCCGGAAACCTCACCCGGGGCGACAGC
2409 :     AGGATGAAGGCCAGGCTAACGACCTTGCCGGACGAGCTGAGAGGAGGTGCATGGCCGTCG
2410 :     TCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGAGACCCCCGCCCCTAG
2411 :     TTGCTACCCCGTCCTTCGGGACGGGGGGCACACTAGGGGGACTGCCGGCGTAAGCCGGAG
2412 :     GAAGGAGGGGGCCACGGCAGGTCAGTATGCCCCGAAACCCCGGGGCTGCACGCGAGCTGC
2413 :     AATGGCGGGGACAGCGGGATCCGACCCCGAAAGGGGGAGGCAATCCCGTAAACCCCGCCC
2414 :     CAGTAGGGATCGAGGGTTGCAACTCGCCCTCGTGAACGTGGAATCCCTAGTAACCGCGTG
2415 :     TCACCAACGCGCGGTGAATACGTCCCTGCCCCTTGCACACACCGCCCGTCGCACCACCCG
2416 :     AGGGAGCCCTCTGCGAGGCCCCTCGCCGAAGAGGTGGGGGGACGAGCAGGGGGCTCCCAA
2417 :     GGGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCA
2418 :     >Nano.equit Nanoarchaeum equitans Kin4-M [fig|228908.1]
2419 :     ACTCCCGTTGATCCTGCGGGAGGCCACCGCTATCTCCGTCCGGCTAACCCATGGAAGGCG
2420 :     AGGGTCCCCGGGTAAGGGGGCCCGCCGCACGGCTGAGTAACACGTCGGTAACCTACCCTC
2421 :     GGGACGGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCGATAGGGGATGGGTGCTGGAAG
2422 :     GCCCCATCCCCGAGAGGGGCTAGCGGTACTTCCCCCGCTAGCCCGCCCGAGGATGGGCCG
2423 :     GCGGCCCATCAGGTAGTTGGCGGGGTAATGGCCCGCCAAGCCGAAGACGGGTAGGGGCCG
2424 :     TGAGAGCGGGAGCCCCCAGATCGGCACTGAGACAAGGGCCGAGGCCCTACGGGGCGCACC
2425 :     AGGGGCGAAACCTCCGCAATGCGGGAAACCGTGACGGGGGGACGGAGAGTGCCGGAGGGC
2426 :     GTTATGCTCTCCGGCTTTTGGGGAGTGTAAGTAGCTCCCCGAATAAGCGGTGGGCAAGAG
2427 :     GGGTGGCAGCCGCCGCGGGAACACCCCCACCGCGAGCGGTGGCCGTGATTATTGGGCCTA
2428 :     AAGGGGCCGTAGCCGGGCCGGTGTGGCTCCGGTGAAATCCTCGGGCTCAACCCGAGGGCG
2429 :     CGCCGGAGCTACTACCGGCCTAGGGACCGGGAGGGGCCGACCGTACTCCCGGGGGAGCGG
2430 :     TGAAATGCTGTAATCCCGGGAGGACGACCCGTGGCGAAAGCGGTCGGCCAGAACGGGTCC
2431 :     GACGGTGAGGGCCGAAGGCCGGGGGCTAGAACGGGATTAGAGACCCCGGTATTCCCGGCT
2432 :     GTCAACGCTGCGGGCTACCTGCTGGGCGGGCTACGAGCCCGCCCAGTGGGGTAGGGAAGC
2433 :     CGTTAAGCCCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATAGGCGGG
2434 :     GGAGCACACAAGAGGTGGGGTGCGCGGTTTAATTGGATTCGACGCCGGGAACCTCACCGG
2435 :     GGCTGACAGCACAATGATGGTCGGCCTGAAGGGCCTACCGGAGGCGCTGAGAGGAGGTGC
2436 :     ATGGCCGCCGTCAGCCTGTGCCGTGAGGTGCCCTGTTAAGTCAGGAAACAGGCGAGACCC
2437 :     GCGCCCGCAGTTGCGACGGCCGAAAGGCCGGCACACTGCGGGGACTGCCGGGGAAACCCG
2438 :     GAGGAAGGTGCGGGCGACGGCAGGTATGCATGCCCCGAATGCCCCGGGCTACACGCGCGC
2439 :     ATCAATGGGCGGGACAGGGGGCCGCGACCCCGAAAGGGGGAGCAAATCCCCAAACCCGCT
2440 :     CTCAGTCCAGATCGAGGGCTGCAACTCGCCCTCGTGACGGCGGAATCTCTAGTAGTCGGA
2441 :     CGTCACCAGCGTCCGGCGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACTCACCGCCCGTCAAGCCACC
2442 :     CGAGCTGGGGCCTAGCGAGGCCGTGGGGGGTTCGCCCCCCACGGTCGAGCTAGGCCCCGG
2443 :     CGAGGGGGGCTAAGTCGACACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT
2444 :     A

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