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1 : overbeek 1.1 package SSU_rRNA_reps;
2 :     use strict;
3 :     use gjoseqlib;
4 :    
5 :     our @SSU_rRNA_reps = read_fasta( \*DATA );
6 :    
7 :     __DATA__
8 :     >E.coli Escherichia coli K12 [gi|49175990 223771-225312]
9 :     AAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA
10 :     GTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAA
11 :     TGTCTGGGAAACTGCCTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCAT
12 :     AACGTCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCGGATGTGCCCAGATG
13 :     GGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGA
14 :     GGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGG
15 :     GGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCT
16 :     TCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATT
17 :     GACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAG
18 :     GGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCA
19 :     GATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCTGATACTGGCAAGCTTGAGTCTC
20 :     GTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGGAGGAATACC
21 :     GGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCA
22 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCC
23 :     CTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCA
24 :     AGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAAT
25 :     TCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGA
26 :     TTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGA
27 :     AATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCCGGC
28 :     CGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC
29 :     ATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAAGCG
30 :     ACCTCGCGAGAGCAAGCGGACCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAAC
31 :     TCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGT
32 :     TCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGT
33 :     AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAA
34 :     CAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTA
35 :     >Pseu.aerug Pseudomonas aeruginosa PAO1 [gi|15595198 722096-723631]
36 :     GAACTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA
37 :     GTCGAGCGGATGAAGGGAGCTTGCTCCTGGATTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTA
38 :     GGAATCTGCCTGGTAGTGGGGGATAACGTCCGGAAACGGGCGCTAATACCGCATACGTCC
39 :     TGAGGGAGAAAGTGGGGGATCTTCGGACCTCACGCTATCAGATGAGCCTAGGTCGGATTA
40 :     GCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCCGTAACTGGTCTGAGAGGATGA
41 :     TCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATA
42 :     TTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGAT
43 :     TGTAAAGCACTTTAAGTTGGGAGGAAGGGCAGTAAGTTAATACCTTGCTGTTTTGACGTT
44 :     ACCAACAGAATAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCA
45 :     AGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGTGGTTCAGCAAGTTGGATGTG
46 :     AAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCCAAAACTACTGAGCTAGAGTACGGTAGAG
47 :     GGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAGGAAGGAACACCAGTGGC
48 :     GAAGGCGACCACCTGGACTGATACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGG
49 :     ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGAG
50 :     ATCTTAGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTA
51 :     AAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAG
52 :     CAACGCGAAGAACCTTACCTGGCCTTGACATGCTGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTG
53 :     CCTTCGGGAACTCAGACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
54 :     GGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTACCAGCACCTCGGGTGGGCA
55 :     CTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATG
56 :     GCCCTTACGGCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAGGGTTGCCAAGCCG
57 :     CGAGGTGGAGCTAATCCCATAAAACCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACT
58 :     GCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGG
59 :     GCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGCTAGTCTA
60 :     ACCGCAAGGGGGACGGTTACCACGGAGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGT
61 :     AGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
62 :     >Xyle.fasti Xylella fastidiosa Dixon [fig|155919.1.rna.046]
63 :     TAAGTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAA
64 :     GTCGGACGGCAGCACATTGGTAGTAATACCATGGGTGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGGAA
65 :     TACATCGGAATCTACCTTATCGTGGGGGATAACGTAGGGAAACTTACGCTAATACCGCAT
66 :     ACGACCTACGGGTGAAAGCAGGGGACCTTAGGGCCTTGTGCGATTGGATGAGCCGATGTC
67 :     CGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGA
68 :     GGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGG
69 :     GGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCTATGCCGCGTGGGTGAAGAATGCCT
70 :     TCGGGTTGTAAAGCCCTTTTGTTGGGGAAGAAAAGCAATTGGTTAATACCTAGTTGTTAT
71 :     GACGGTACCCAAAGAATAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAG
72 :     GGTGCAAGCGTTACTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGTGGTTATTTAAGTCT
73 :     GTTGTGAAAGCCCTGGGCTTAACCTGGGAATGGCAGTGGATACTGGATAGCTAGAGTGTG
74 :     GTAGAGGGTAGCGGAATTCCTGGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATCAGGAGGAACATC
75 :     CGTGGCGAAGGCGGCTACCTGGGCCAACACTGACACTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCA
76 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGCGAACTGGATGTTGAGTGC
77 :     AAATTGGCACTCAGTATCGAAGCTAACGCGTTAAGTTCGCCGCCTGGGGAGTACGGTCGC
78 :     AAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAA
79 :     TTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCTGCGGAACTTTCCAGAGATGG
80 :     ATTGGTGCCTTCGGGAGCCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTG
81 :     AGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCCAGCACGTAAT
82 :     GGTGGGAACTTTAAGGAGACTGCCGGTGACAAATCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAG
83 :     TCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTACTACAATGGTAGGGACAGAGGGCTG
84 :     CGATCTCGCGAGGGTGAGCTAATCCCAGAAACCCTATCTCAGTCCGGATTGGAGTCTGCA
85 :     ACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCTGCGGTGAATA
86 :     CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTTGTTGCACCAGAAGCA
87 :     GGTAGCTTAACCGCGAGGAGGGCGCTTGCCACGGTGTGGCCGATGACTGGGGTGAAGTCG
88 :     TAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
89 :     >Nitr.ocean Nitrosococcus oceani ATCC 19707 [fig|323261.3.rna.51]
90 :     AAACTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCAA
91 :     GTCGAACGGCAGCAGCACCTAAGCTTGCTTAGGTGGCTGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGT
92 :     AACGCGTGGGAATCTGGCCTCTAGAGGGGGATAACTCGGGGAAACTCGGGCTAATACCGC
93 :     ATAATCTCTAAGGAGGAAAGCGGGGGACCGAAAGGCCTCGCGCTGGGGGATGAGCCTGCG
94 :     TCCGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAGGGCCTACCAAGGCGATGATCGGTAGCTGGTCTGA
95 :     GAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
96 :     GGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGGGTGAAGAAGGC
97 :     TTTCGGGTTGTAAAGCCCTTTCAGTGGGGAAGAAAAGCGATGTGTGAATAGCACATCGTG
98 :     TTGACGTTACCTACAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGG
99 :     AGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTTGGTAAGT
100 :     TGGGTGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAATGGCACTTGATACTGCCTGGCTAGAGTA
101 :     TGGTAGAGGGAGGCGGAATTTCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGAAGGAACA
102 :     CCAGTGGCGAAGGCGGCCTCCTGGACCACTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAG
103 :     CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGAGAACTAGACGTTGGGA
104 :     GGGATAGCCTTTCAGTGTTGCAGCTAACGCGTTAAGTTCTCCGCCTGGGGAGTACGGCCG
105 :     CAAGGTTGAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTA
106 :     ATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGCCTTGACATCCCCGGAACTTTGCTGAGAGG
107 :     CGAAGGTGCCTTCGGGAGCCGGGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGT
108 :     GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTCTAGTTGCCAGCGGTTCG
109 :     GCCGGGCACTCTAGAGGGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAG
110 :     TCATCATGGCCCTTATGGCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGTGG
111 :     CCAAGCAGCGATGCGGAGCTAATCTCAGAAAACCGGTCGTAGTCCGGATTGCAGTCTGCA
112 :     ACTCGACTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCAATGCCGCGGTGAATA
113 :     CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTGCACCAGAAGTG
114 :     GGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTTACTACGGTGTGGTCAATGACTGGGGTGAAGTCG
115 :     TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
116 :     >Fran.talar Francisella tularensis subsp. tularensis Schu 4 [gi|56707187 c1379589-1378063]
117 :     AAACTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGTGGCATGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGT
118 :     AACAGGTCTTAGGATGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGGAATCTGCCCATTTGAGGGGG
119 :     ATACCAGTTGGAAACGACTGTTAATACCGCATAATATCTGTGGATTAAAGGTGGCTTTCGGGCTGTCGCA
120 :     GATGGATGAGCCTGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAGGGCCCACCAAGGCTACGATCCATAGCTG
121 :     ATTTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGG
122 :     AATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCAATGCCATGTGTGTGAAGAAGGCCCTAGGGTTGTAAA
123 :     GCACTTTAGTTGGGGAGGAAAGCCTCAAGGTTAATAGCCTTGGGGAGGACGTTACCCAAAGAATAAGCAC
124 :     CGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAA
125 :     AGGGTCTGTAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCAGGGCTCAACCTTGGAACTGCATTTGATAC
126 :     TGGCAAACTAGAGTACGGTAGAGGAATGGGGAATTTCTGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCAGAAG
127 :     GAACACCAATGGCGAAGGCAACATTCTGGACCGATACTGACACTGAGGGACGAAAGCGTGGGGATCAAAC
128 :     AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGAGTACTAGCTGTTGGAGTCGGTGTAAAGGCTC
129 :     TAGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTACTCCGCCTGGGGACTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAAT
130 :     TGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTC
131 :     TTGACATCCTGCGAACTTTCTAGAGATAGATTGGTGCCTTCGGGAACGCAGTGACAGGTGCTGCACGGCT
132 :     GTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGATAGTTACCA
133 :     TCATTAAGTTGGGTACTCTATTGAGACTGCCGCTGACAAGGCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCA
134 :     TCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGGTATTACAGAGGGCTGCGAAGGTGCGAGC
135 :     TGGAGCGAAACTCAAAAAGGTACTCTTAGTCCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGTCGGAAT
136 :     CGCTAGTAATCGCAGGTCAGAATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACAC
137 :     CATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGATAGCTTAACGAATGGGCGTTTACCACGGAGTGATTCATGACT
138 :     GGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
139 :     >Thsp.cruno Thiomicrospira crunogena XCL-2 [fig|317025.3.rna.52]
140 :     ATTAAACTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG
141 :     CAAGTCGGACGGAAACGACAAGAACAATCACTTCGGTGTGCGTTTTTGGGCGTCGAGTGG
142 :     CGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAATCTACCCTTTAGTTGGGGACAACATATGGAAACGT
143 :     ATGCTAATACCGAATATGCTCTACGGAGTAAAGGTGCCCTCTCCTTGGAAGGTATCGCTA
144 :     AAGGATGAGCCCGCGTTAGATTAGCTAGTTGGTAAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGACGAT
145 :     CTATAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCT
146 :     ACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGAGGGAAACCTTGATGCAGCCATGCCGC
147 :     GTGTGTGAAGAAGGCCCGAGGGTTGTAAAGCACTTTCAATTGTGAGGAAGATTAAGTAGC
148 :     TAATACCTGCTTAGTTTGACGTTAACTTTAGAAGAAGCACCGGCTAACTCTGTGCCAGCA
149 :     GCCGCGGTAATACAGAGGGTGCAAGCGTTATTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTA
150 :     GGCGGACTGTTAAGTCGGTTGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTAGGAACTGCATCCGATAC
151 :     TGGCAATCTAGAGTTTAAGAGAGGGAAGTGGAATTCCAGGTGTAGCAGTGAAATGCGTAG
152 :     ATATCTGGAGGAACATCAGTGGCGAAGGCGACTTCCTGGCTTAAAACTGACGCTGAGGTG
153 :     CGAAAGCTTGGGTAGCGAACGGGATTAGATACCCCGGTAGTCCAAGCCGTAAACGATGTC
154 :     AACTAGCTGTTGGCCTTATTAAAAAGGTTAGTAGCGTAGCTAACGCGATAAGTTGACCGC
155 :     CTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGG
156 :     TGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCATCCCTTGACATCCTGC
157 :     GAACTTTCTAGAGATAGATTGGTGCCTTCGGGAACGCAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGT
158 :     CGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCATT
159 :     AGTTGCTAACATTCAGTTGAGAACTCTAATGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGC
160 :     GGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGGGATGGGCTACACACGTGCTACAATGGG
161 :     GGGTACAAAGAGCAGCCAACTGGCGACAGTGCGCGAATCTCATAAAACCTCTCGTAGTCC
162 :     GGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAA
163 :     TGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGG
164 :     TTGCAAAAGAAGTGGGTAGTCTAACCTTCGGGAGGGCGCTCACCACTTTGTGATTCATGA
165 :     CTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCCTAGCGGAAGCTGGGGCTGGATCACCTCCTTTA
166 :     >Nies.menin Neisseria meningitidis MC58 [gi|15675948 60971-62514]
167 :     TGAACATAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCA
168 :     AGTCGGACGGCAGCACAGAGAAGCTTGCTTCTCGGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTA
169 :     ACATATCGGAACGTACCGAGTAGTGGGGGATAACTGATCGAAAGATCAGCTAATACCGCA
170 :     TACGTCTTGAGAGAGAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTGCGCTATTCGAGCGGCCGATAT
171 :     CTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGACGATCAGTAGCGGGTCTGAG
172 :     AGGATGATCCGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG
173 :     GGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTCTGAAGAAGGCC
174 :     TTCGGGTTGTAAAGGACTTTTGTCAGGGAAGAAAAGGCTGTTGCTAATATCAGCGGCTGA
175 :     TGACGGTACCTGAAGAATAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTA
176 :     GGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGGGCGCAGACGGTTACTTAAGCA
177 :     GGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCCGGGAACTGCGTTCTGAACTGGGTGACTCGAGTGT
178 :     GTCAGAGGGAGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAATAC
179 :     CGATGGCGAAGGCAGCCTCCTGGGACAACACTGACGTTCATGCCCGAAAGCGTGGGTAGC
180 :     AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAATTAGCTGTTGGGCA
181 :     ACCTGATTGCTTGGTAGCGTAGCTAACGCGTGAAATTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGC
182 :     AAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAA
183 :     TTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATGTACGGAATCCTCCGGAGACGG
184 :     AGGAGTGCCTTCGGGAGCCGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTG
185 :     AGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAGTTGCCATCATTCAGT
186 :     TGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC
187 :     CTCATGGCCCTTATGACCAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGTACAGAGGGTAGCC
188 :     AAGCCGCGAGGCGGAGCCAATCTCACAAAACCGATCGTAGTCCGGATTGCACTCTGCAAC
189 :     TCGAGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGT
190 :     TCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGGGATACCAGAAGTAGGT
191 :     AGGATAACCACAAGGAGTCCGCTTACCACGGTATGCTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAA
192 :     CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
193 :     >Rals.solan Ralstonia solanacearum GMI1000 [gi|17544719 1532698-1534234]
194 :     GAACTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTTACACATGCAAGTCGAACGGC
195 :     AGCGGGGGTAGCTTGCTACCTGCCGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTGCCCTGTAG
196 :     TGGGGGATAACTAGTCGAAAGACTAGCTAATACCGCATACGACCTGAGGGTGAAAGTGGGGGACCGCAAG
197 :     GCCTCATGCTATAGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCCACCAAGGCGACGA
198 :     TCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
199 :     AGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTC
200 :     GGGTTGTAAAGCACTTTTGTCCGGAAAGAAATCGCACTGGTTAATACCTGGTGTGGATGACGGTACCGGA
201 :     AGAATAAGGACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTCCAAGCGTTAATCGGAATT
202 :     ACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTGTGCAAGACCGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAATT
203 :     GCATTGGTGACTGCACGGCTAGAGTGTGTCAGAGGGAGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTA
204 :     GAGATGTGGAGGAATACCGATGGCGAAGGCAGCCTCCTGGGATAACACTGACGCTCATGCACGAAAGCGT
205 :     GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTTGGGGATTC
206 :     ATTTCCTTAGTAACGTAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCA
207 :     AAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTA
208 :     CCTACCCTTGACATGCCACTAACGAAGCAGAGATGCATTAGGTGCTCGAAAGAGAAAGTGGACACAGGTG
209 :     CTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCT
210 :     CTAGTTGCTACGAAAGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCA
211 :     AGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTGCATACAGAGGGTTGCCAAGCCG
212 :     CGAGGTGGAGCTAATCCCAGAAAATGCATCGTAGTCCGGATCGTAGTCTGCAACTCGACTACGTGAAGCT
213 :     GGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGT
214 :     CACACCATGGGAGTGGGCTTTACCAGAAGTAGTTAGCCTAACCGCAAGGAGGGCGATTACCACGGTAGGG
215 :     TTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTA
216 :     >Agro.tumef Agrobacterium tumefaciens str. C58 [fig|176299.3.rna.63]
217 :     TCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCA
218 :     AGTCGAACGCCCCGCAAGGGGAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAATCTACCCAT
219 :     CTCTGCGGAATAGCTCTGGGAAACTGGAATTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGA
220 :     TTTATCGGGGATGGATGAGCCCGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCA
221 :     AGGCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGC
222 :     CCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCA
223 :     GCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCACCGATGAAGATA
224 :     ATGACGGTAGTCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGA
225 :     AGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATATTTAAGT
226 :     CAGGGGTGAAATCCCGCAGCTCAACTGCGGAACTGCCTTTGATACTGGGTATCTTGAGTA
227 :     TGGAAGAGGTAAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACA
228 :     CCAGTGGCGAAGGCGGCTTACTGGTCCATTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAG
229 :     CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGTTAGCCGTCGGGC
230 :     AGTATACTGTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGC
231 :     AAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA
232 :     TTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCTCTTGACATTCGGGGTATGGGCATTGGAGAC
233 :     GATGTCCTTCAGTTAGGCTGGCCCCAGAACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGT
234 :     CGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGCCCTTAGTTGCCAGCATT
235 :     TAGTTGGGCACTCTAAGGGGACTGCCGGTGATAAGCCGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTC
236 :     AAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTGGTGACAGTGGG
237 :     CAGCGAGACAGCGATGTCGAGCTAATCTCCAAAAGCCATCTCAGTTCGGATTGCACTCTG
238 :     CAACTCGAGTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATGCTGCGGTGAAT
239 :     ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAAGG
240 :     TAGTGCGCTAACCGCAAGGAGGCAGCTAACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTC
241 :     GTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
242 :     >Rhod.rubru Rhodospirillum rubrum [fig|1085.1.rna.053]
243 :     GATCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG
244 :     CAAGTCGAACGCATCCTTCGGGATGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTAC
245 :     CTTGGAGTGCGGAATAATCTTTGGAAACGAGGACTAATACCGCATACGCCCTTAGGGGGA
246 :     AAGATTTATCGCTCCAAGATCGGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGGCGGGGTAATGGCCC
247 :     ACCAAGGCGACGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGGCCAGCCACACTGGGACTGAGACA
248 :     CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGCAACCCTGA
249 :     CGCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCGGGTGTGAA
250 :     GATGATGACGGTAACACCAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
251 :     ACGAAGGGGGCAAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGCGCGTAGGCGGTCTGAT
252 :     TAGTCAGAGGTGAAATCCCAGAGCTCAACTTTGGAACTGCCTTTGATACTGTTAGACTAG
253 :     AATCCGTGAGAGGGTGGTGGAATTCCCAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTGGGAGG
254 :     AACACCAGTGGCGAAGGCGGCCACCTGGCGCGGTATTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGG
255 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGATGTC
256 :     GGGGTACATGTACCTCGGTGTCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGG
257 :     CCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGT
258 :     TTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCCGTGACACTTCCAGAG
259 :     ATGGAAGGTTCCCTTCGGGGACACGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGT
260 :     CGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCATCTTCAGTTGCCAGCAAG
261 :     TAACGTTGGGCACTCTGAAGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGT
262 :     CAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCCTACAATGG
263 :     GCAGCGACCTCGCGAGGGGAAGCTAATCTCCAAAAGGCGTCTCAGTTCGGATTGCACTCT
264 :     GCAACTCGGGTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAA
265 :     TACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCCGAAG
266 :     ACGGTACGCTAACCGCAAGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGT
267 :     CGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCA
268 :     >Sili.pomer Silicibacter pomeroyi DSS-3 [fig|246200.3.rna.62]
269 :     TTAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCA
270 :     AGTCGAGCGCGCCCTTCGGGGTGAGCGGCGGACGGGTTAGTAACGCGTGGGAACGTACCC
271 :     TTTGGTAGGGAATAGCCACTGGAAACGGTGAGTAATACCCTATGAGCCCTTCGGGGGAAA
272 :     GATTTATCGCCAAAGGATCGGCCCGCGTTAGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTAC
273 :     CAAGCCTACGATCTATAGCTGGTTTTAGAGGATGATCAGCAACACTGGGACTGAGACACG
274 :     GCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATC
275 :     CAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTAGGGTCGTAAAGCTCTTTCGCCTGTGAAGA
276 :     TAATGACGGTAGCAGGTAAAGAAACCCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATAC
277 :     GGAGGGGGTTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGACCAGAAA
278 :     GTTGGGGGTGAAATCCCGGGGCTCAACCCCGGAACTGCCTCCAAAACTCCTGGTCTTGAG
279 :     TTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAA
280 :     CACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGTGTGGGG
281 :     AGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACACCGTAAACGATGAATGCCAGTCGTCGG
282 :     GTAGCATGCTGCTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGCC
283 :     GCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTT
284 :     AATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATCCTCGGACCGTCCCAGAGAT
285 :     GGGTCTTTCACTTCGGTGACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCG
286 :     TGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACACCCTTAGTTGCCAGCATTCA
287 :     GTTGGGCACTCTAGGGGAACTGCCCGTGATAAGCGGGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAG
288 :     TCCTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTA
289 :     ATCCCAAAAAACTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAA
290 :     TCGCTAGTAATCGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC
291 :     GCCCGTCACACCATGGGAGTTGGGTCTACCCGAAGACGGTGCGCCAACCTTTCGAGGAGG
292 :     CAGCTGGCCACGGTAGGCTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGA
293 :     ACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
294 :     >Magn.MC-1 Magnetococcus sp. MC-1 [fig|156889.1.rna.046]
295 :     TTTTGTGTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGTTGGTGGCATGCTTAACACATG
296 :     CAAGTCGAACGGTAGCAGGCCCTTCGGGGTGCTGACGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGC
297 :     GTGGATGACCTACCCAGATGTGGGGGACAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCGCATAA
298 :     TCCCTAAGGGGGAAAGGCTTAGGCCGCATTTGGAGGGGTCCGCGTTGGATTAGGTAGTTG
299 :     GTGGGGTAAAGGCCTACCAAGCCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCAC
300 :     ACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAA
301 :     TGGGGGAAACCCTGACGCAGCAATGCCACGTGAATGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGT
302 :     TCTTTTAGTAGGGAAGATAGTGACGGTACCTACAGAAAAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCC
303 :     AGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCAAACGTTGTTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCG
304 :     CGTAGGCGGTTATCTAAGCCAGAAGTGAAATCTCGGGGCTCAACCTCGAAACTGCTTTTG
305 :     GAACTGGAAGACTAGAATCCGGTAGAGGATGGTGGAATTCCCCGTGTAGAGGTGAAATTC
306 :     GTAGATATGGGGAGGAACACCGGAGGCGAAGGCGGCCATCTGGGCCGGTATTGACGCTGA
307 :     GGCGCGAAAGTGTGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACACCGTAAACGA
308 :     TGAGTGCTAGTAGTTGCGGGTATCGACCCCTGCGGCTACGAAGTTAACACGATAAGCACT
309 :     CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAA
310 :     GCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGCTTTTGACATC
311 :     CTTGGAACCTTACGGAGACGTAGGGGTGCTTTTCGGAGAACCAAGTGACAGGTGCTGCAT
312 :     GGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCT
313 :     GCCTTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAGAGGAACTGCCGGTGTTAAGCCGGAG
314 :     GAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGGGCAGGGCTACACACGTGCTAC
315 :     AATGGCGGATACAGAGGGCGGCGAAGCAGTGATGTGGAGCGAATCTCTTAAAGTCCGTCT
316 :     CAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGA
317 :     TCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGG
318 :     AGTTGGTTTTACCCGAAGCCGGTGGCCTAACCTTTCGAGGGGGGAGCTGTCTACGGTAAG
319 :     ATCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCAC
320 :     CTCCTTTCTA
321 :     >Gluc.oxyda Gluconobacter oxydans 621H [fig|290633.1.rna.44]
322 :     TGAACCTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCA
323 :     AGTCGCACGAAGGTTTCGGCCTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGGGATCTATCC
324 :     ACGGGTGGGGGACAACTTCGGGAAACTGGAGCTAATACCGCATGATACCTGAGGGTCAAA
325 :     GGCGCAAGTCGCCTGTGGAGGAACCTGCGTTCGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCT
326 :     ACCAAGGCGATGATCGATAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACA
327 :     CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGA
328 :     TCCAGCAATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGATTGTAAAGCACTTTCGACGGGGAC
329 :     GATGATGACGGTACCCGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
330 :     ACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATGACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTGTTA
331 :     CAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCATTTGATACGTGACGACTAG
332 :     AGTTCGAGAGAGGGTTGTGGAATTCCCAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTGGGAAG
333 :     AACACCGGTGGCGAAGGCGGCAACCTGGCTCGATACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGG
334 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGTGTGCTGGATGTT
335 :     GGGAAACTTAGTTTCTCAGTGTCGAAGCTAACGCGCTAAGCACACCGCCTGGGGAGTACG
336 :     GCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGG
337 :     TTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGGGCTTGCATGGGGAGGACCGGTTCAGA
338 :     GATGGACCTTTCTTCGGACCTCCCGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCG
339 :     TGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTTAGTTGCCAGCACTTT
340 :     CAGGTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCA
341 :     AGTCCTCATGGCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGGGA
342 :     AGCTACATGGTGACATGGTGCTGATCTCTAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGTACTCTGC
343 :     AACTCGAGTACATGAAGGTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATA
344 :     CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCGACCTTAAGCC
345 :     GGTGAGCGAACCGCAAGGACGCAGCCGACCACGGACGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCG
346 :     TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCA
347 :     >C.Pela.ubi Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 [gi|71082709 511358-512832]
348 :     TAACTTGAGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAA
349 :     GTAGCAATACTTAGTGGCAGACGGGTGAGTAACATGTGGGTATCTACCCTTTGGCCTGGAATAACACGAG
350 :     GAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGTCTTTACGGAGAAAGCTTTATGCACCATTGGATGAGCCCGCACTT
351 :     GATTAGTTTGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGACTATGATCAATAGCTGATTTGAGAGGATGATCAGC
352 :     CACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCACAATGGAGGA
353 :     AACTCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTTGGGTTGTAAAGCTCTTTCGTCGGGGAAGA
354 :     AAATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGACCT
355 :     AGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCTTAAAGAGTTCGTAGGTGGTTGAAAAAGTTGGTGGTGAAATCCCAGA
356 :     GCTTAACTCTGGAACTGCCATCAAAACTTTTCAGCTAGAGTATGATAGAGGAAAGCAGAATTTCTAGTGT
357 :     AGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGAAAGAATACCAATTGCGAAGGCAGCTTTCTGGATCATTACTGACAC
358 :     TGAGGAACGAAAGCATGGGTAGCGAAGAGGATTAGATACCCTCGTAGTCCATGCCGTAAACGATGTGTGT
359 :     TAGACGTTGGAAATTTATTTTCAGTGTCGCAGGGAAACCGATAAACACACCGCCTGGGGAGTACGACCGC
360 :     AAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTAGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGATA
361 :     CGCGCAGAACCTTACCAACACTTGACATGTTCGTCGCGACTCTAAGAGATTAGAGTTTTCGGTTCGGCCG
362 :     GACGAAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGA
363 :     GCGCAACCCTCACTTTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTGAAAGAACTGCCAGTGATAAGCTGGA
364 :     GGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCATC
365 :     TACAACAGGAAGCAAAACGGCAACGTTAAGCAAATCCCGAAAAGATGCCTCAGTTCGGATTGCACTCTGC
366 :     AACTCGAGTGCATGAAGCTGGAATTACTAGTAATCGTGGATCAGCGTGCCACGGTGAATGCGTTCCCGGG
367 :     TCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTTAAGGCAAGGTTTTAAACCCTTGACC
368 :     ACGGTATAGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATTACCT
369 :     CCTTT
370 :     >Rick.prowa Rickettsia prowazekii str. Madrid E [fig|272947.1.rna.25]
371 :     ATCAAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTATCGGTATGCTTAACACATG
372 :     CAAGTCGAACGGATTAACTAGAGCTCGCTTTAGTTAATTAGTGGCAGACGGGTGAGTAAC
373 :     ACGTGGGAATCTACCCATCAGTACGGAATAACTTTTAGAAATAAAAGCTAATACCGTATA
374 :     TTCTCTACGGAGGAAAGATTTATCGCTGATGGATGGGCCCGCGTCAGATTAGGTAGTTGG
375 :     TGAGGTAATGGCTCACCAAGCCGACGATCTGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACA
376 :     CTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAAT
377 :     GGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATACCGAGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCT
378 :     CTTTTAGCAAGGAAGATAATGACGTTACTTGCAGAAAAAGCCCCGGCTAACTCCGTGCCA
379 :     GCAGCCGCGGTAAGACGGAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGTGC
380 :     GTAGGCGGTTTAGTAAGTTGGAAGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCTCGGAATTGCTTTCAA
381 :     AACTACTAATCTAGAGTGTAGTAGGGGATGATGGAATTCCTAGTGTAGAGGTGAAATTCT
382 :     TAGATATTAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGTCATCTGGGCTACAACTGACGCTGAT
383 :     GCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGAT
384 :     GAGTGCTAGATATCGGAGGATTCTCTTTCGGTTTCGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGC
385 :     CTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCTCGCACAAGCGG
386 :     TGGAGCATGCGGTTTAATTCGATGTTACGCGAAAAACCTTACCAACCCTTGACATGGTGG
387 :     TTACGGATTGCAGAGATGCTTTCCTTCAGTTCGGCTGGGCCACACACAGGTGTTGCATGG
388 :     CTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTAT
389 :     TCTTATTTGCCAGTGGGTAATGCCGGGAACTATAAGAAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAG
390 :     GAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACGCGTGCTAC
391 :     AATGGTGTTTACAGAGGGAAGCAATACGGTGACGTGGAGCAAATCCCTAAAAGACATCTC
392 :     AGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGAT
393 :     CAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACTGCCCGTCACGCCATGGGA
394 :     GTTGGTTTTACCTGAAGGTGGTGAGCTAACGCAAGAGGCAGCCAACCACGGTAAAATTAG
395 :     CGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACTGCGGCTGGATTACCTCCTT
396 :     A
397 :     >Ehrl.canis Ehrlichia canis str. Jake [fig|269484.4.rna.37]
398 :     GTCAAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAAGCCTAACACATG
399 :     CAAGTCGAACGGACAATTATTTATAGCCTCTGGCTATAGGAAATTGTTAGTGGCAGACGG
400 :     GTGAGTAATGCGTAGGAATCTACCTAGTAGTACGGAATAGCCATTAGAAATGGTGGGTAA
401 :     TACTGTATAATCCCCGAGGGGGAAAGATTTATCGCTATTAGATGAGCCTACGTTAGATTA
402 :     GCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTTACCAAGGCTATGATCTATAGCTGGTCTGAGAGGACGA
403 :     TCAGCCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATA
404 :     TTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCTATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGT
405 :     TGTAAAACTCTTTCAATAGGGAAGATAATGACGGTACCTATAGAAGAAGTCCCGGCAAAC
406 :     TCTGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCAAGCGTTGTTCGGAATTATTGGGCGT
407 :     AAAGGGCACGTAGGTGGACTAGTAAGTTAAAAGTGAAATACCAAAGCTTAACTTTGGAGC
408 :     GGCTTTTAATACTGCTAGACTAGAGGTCGAAAGAGGATAGCGGAATTCCTAGTGTAGAGG
409 :     TGAAATTCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTATCTGGTTCGATACT
410 :     GACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCT
411 :     GTAAACGATGAGTGCTAAATGTGAGGATTTTATCTTTGTATTGTAGCTAACGCGTTAAGC
412 :     ACTCCGCCTGGGGACTACGGTCGCAAGACTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCA
413 :     ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCTACGCGAAAAACCTTACCACTTTTTGA
414 :     CATGAAGGTCGTATCCCTCCTAACAGGGGGAGTCAGTTCGGCTGGACCTTACACAGGTGC
415 :     TGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA
416 :     CCCTCATTCTTAGTTACCAACAGGTAATGCTGGGCACTCTAAGGAAACTGCCAGTGATAA
417 :     ACTGGAGGAAGGTGGGGATGATGTCAAATCAGCACGGCCCTTATAGGGTGGGCTACACAC
418 :     GTGCTACAATGGCAACTACAATAGGTTGCGAGACCGCAAGGTTTAGCTAATCCATAAAAG
419 :     TTGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGAAACTCGAGAGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAAT
420 :     CGTGGATCATCACGCCACGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACTGCCCGTCACGC
421 :     CATGGGAATTGGCTTAACTCGAAGCTGGTGTGCTAACCGCAAGGAAGCAGCCATTTAAGG
422 :     TTGGGTTAGTGACTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCTGTAGGTGAACCTGCGGCTGGA
423 :     TTACCTCCTTTTA
424 :     >Desu.desul Desulfovibrio desulfuricans G20 [fig|207559.3.rna.70]
425 :     TTCTAACTGGAGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG
426 :     CAAGTCGTACGCGAAAGTTCCTTCGGGAATGAGTAAAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCG
427 :     TGGATTATCTACCTGCATCACCGGAATAACGGTTGGAAACGACTGCTAATGCCGGATAGT
428 :     CTTGAAAGGGTAAAGGGGGCCTCTGCTTGCAAGCTTCCGGGTGCTGATGAGTCCGCGTCT
429 :     GATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATCAGTAGCAGGTTTGAGAG
430 :     GATGACCTGCCACACTGGGACTGGAACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGG
431 :     GAATATTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGGAGGATGAAGGCCTT
432 :     CGGGTCGTAAACTCCTGTCAAGAGGGAAGAACCGTATGCGGAATAATACGCCGCATGCCT
433 :     GACGGTACCTCTAGAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAG
434 :     GGTGCAAGCGTTAATCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGCTTGGTAAGTCA
435 :     GGTGTGAAAGCCCCCGGCCCAACCGGGGAATTGCACTTGATACTGCTAGGCTAGAGTTCA
436 :     GGAGAGGGTGGCGGAATTCCAGGTGTAGGAGTGAAATCCGTAGATATCTGGAGGAACACC
437 :     GGTGGCGAAGGCGGCCACCTGGACTGACACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGTAGCA
438 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTCGGGGAC
439 :     TTGATCCTCGGTGCCGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG
440 :     GCTGAAACTCAAAGAAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTC
441 :     GATGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGGCTTGACATCCGGAGAATCCCTCCGAAAAGAGGG
442 :     AGTGCCCTTCGGGGAGCTCCGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGA
443 :     GGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCTTCAGTTGCCATCAGGTGATG
444 :     CTGGGCACTCTGGAGAGACTGCCCCGGTTAACGGGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGT
445 :     CATCATGGCCCTTACGCCTAGGGCTACACACGTACTACAATGGCGCATACAAAGGGTTGC
446 :     GATACCGCGAGGTGGAGCTAATCCCAAAAAGTGCGTCTCAGTCCGGATTGCAGTCTGCAA
447 :     CTCGACTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCCCGTATCATCATGACGGGGTGAATGCG
448 :     TTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGTTGGTTCTGCCCGACGCCGA
449 :     TGAGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGTCGTCTACGGTAGGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCG
450 :     TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTA
451 :     >Desu.psych Desulfotalea psychrophila LSv54 [gi|51243852 806222-807712]
452 :     TCAAACTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
453 :     AAGTCGAACGCGAACGAGTTTTTCGAAACTCTAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGC
454 :     GTAAGTAATCTACCCTGATATCTGGGATAACAATTCGAAAGGATTGCTAATACCGGATAC
455 :     GTTGATTTATCAAGAAAGATGGCCTCTTCATGAAAGCTATTGTATCGGGAGGAGCTTGCG
456 :     TACCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGGCGACGATGGTTAGCGGGTCTGA
457 :     GAGGATGATCCGCCACACTGGAACTGAAACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
458 :     GAGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGGATGATGAAGGC
459 :     CTTCGGGTCGTAAAATCCTGTCAGATGGGAAGAAATGGTAATGAGCTAATACCTCGTTAC
460 :     TTTGACGGTACCATCAAAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACG
461 :     GGGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGCTTTTTAAG
462 :     TCAGATGTGAAAGTCCTCGGCTCAACCGAGGAAGTGCATTTGAAACTGGGGAGCTTGAGT
463 :     ACTGGAGGGGATGGTGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAAT
464 :     ACCGGTGGCGAAGGCGACCATCTGGCCAGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGA
465 :     GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCAACTAGGTGTTGGA
466 :     GTGGTTAATCGCTTCATTGCCGGAGCTAACGCATTAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGT
467 :     CGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTT
468 :     TAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCTCGGAAATCTCTTGGAAA
469 :     CAGGAGAGTGCCTCTTGAGGAATCCGATGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTG
470 :     TCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTCTCTAGTTGCCATCAT
471 :     TAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGTCAAACCGGAGGAAGGTAGGGATGACGTC
472 :     AAGTCCTCATGGCCTTTATGACCAGGGCTACACACGTACTACAATGGCATAGACAAAGGG
473 :     CAGCAACACAGCGATGTGAAGCCAATCCCATAAACTATGTCTCAGTCCGGATTGGAGTCT
474 :     GCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGCATGCTACGGTGAA
475 :     TACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGGTTGTACCAGAAG
476 :     CAGTTGAGCTAACCCTTCGGGGGGGCAGGCTGCCAAGGTATGGCTGGTAACTGGGGTGAA
477 :     GTCGTAACAAGGTAGCCCTAGGGGAACCTGGGGCTGGATCACCTCCTTT
478 :     >Pelo.carbi Pelobacter carbinolicus DSM 2380 [gi|77917618 c2748366-2746944]
479 :     TAACTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAA
480 :     GTCGAACGCGAAAGTTTCCTTCGGGAAGCGAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACACGT
481 :     GGATAATCTGCCCGATGACCTGGGATAACACTTCGAAAGAGGTGCTAATACCGGATAAGC
482 :     CCACAGGCTCTTCGGAGCATGCGGGAAAAGGTGGGGACCTTCGGGCCTACCGTCATCGGA
483 :     TGAGTCCGCGGCCCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATGGGTA
484 :     GCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG
485 :     AGGCAGCAGTGGGGAATTTTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGAG
486 :     TGATGAAGGCTTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTCAGAGGGGAAGAAACTATCGTGGTCGAAT
487 :     AGGCCCCGGTACTGACGGTACCCTCAAAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCG
488 :     CGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGTGTAGGCG
489 :     GTCTGTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCCGGGAAGTGCATTGGATACTGGC
490 :     AGACTTGAGTACGGGAGAGGAAAGTGGAATTCCGAGTGTAGGGGTGAAATCCGTAGATAT
491 :     TCGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGCTTTCTGGACCGATACTGACGCTGAGACGCGAA
492 :     AGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTACT
493 :     AGGTGTCGCGGGTATTGACCCCTGCGGTGCCGAAGCTAACGCATTAAGTACCCCGCCTGG
494 :     GGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA
495 :     GCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCTGGGCTTGACATCCCGATCGT
496 :     ACTTTCTGGAAACAGTTAGGTCAGTACGGCTGGATCGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTC
497 :     GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTA
498 :     GTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGTTAAACCGGAGGAAGGTG
499 :     GGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGTCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCC
500 :     GGTACAAAGGGCAGCGAAACCGCAAGGTTTAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCG
501 :     GATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCAT
502 :     GCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGAT
503 :     TGTACCTGAAATCGGTGGGCTAACCTTCGGGAGGCAGCCGCTTATGGTATGGTCGGTAAC
504 :     TGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT
505 :     >Bact.marin Bacteriovorax marinus SJ [fig|97084.1.rna.14]
506 :     ATTTGCTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGTCGGCATGCCTAACACATG
507 :     CAAGTCGTACGAGAAAGCACCTTCGGGTGTGAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCG
508 :     TAGGTGATCTACCATTTGGCGGGGGATAACCAGGAGAAATTCTGGCTAATACCGCATACG
509 :     TACTGCAATTTTGAAAGTAGCAGTAGAAAGAATGCCTCTCCTTGGAAGCATTTACCAAAT
510 :     GATGAGCCTGCGTAGCATTAGTTTGATGGTGGGGTAATGGCCTACCATGACTACGATGCT
511 :     TAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACG
512 :     GGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAATGCCGAGTG
513 :     AGTGAGGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCAGAAGGGAATAATGGTGTAGGGTCCA
514 :     ATAGGCCTTACATTTGAAGGTACCTTCAAAGGAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGC
515 :     CGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGG
516 :     CGGATTGTTAAGTCAGATGTGAAATCTCGGGGCTCAACCTCGAAACTGCGTCTGAAACTG
517 :     ATAATCTAGAATCTCGGAGGGGGAAGGGGAATTTCGCATGTAGGGGTAAAATCCGTAGAG
518 :     ATGCGAAGGAACACCAGAGGCGAAGGCGCCTTCCTGGACGAGTATTGACGCTGAGGCGCG
519 :     AAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTGCA
520 :     CTAGATATTGGAGGTTTGACCCCTTCAGTGTCGTAGCTAACGCATTAAGTGCACCGCCTG
521 :     GGGAGTACGGTCGCAAGACTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGG
522 :     ATTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCTAGGCTTGAAATCCTGAGAA
523 :     TCTAATGGAAACATTGGAGTGCTCTTCGGAGAATTCAGTGACAGGCGCTGCATGGCTGTC
524 :     GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCTCGCAACGAGCGCAACCCCTATCCTTA
525 :     GTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAGGGAGACTGCCCGGGCTAACCGGGAGGAAGGTG
526 :     GGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGTCTAGGGCTACACACGTAATACAATGGTA
527 :     CATACAAAGGGAAGCGACCTGGCAACAGTGAGCAAATCTCAAAAAGTGTATCTCAGTCCG
528 :     GATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGGAGATCAGCAC
529 :     GCTCCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGGT
530 :     CTTACCTGAAGTCGTGGCCCTAACTGCTTGCAGAGGGGAGCGCCTACGGTCGGACCGATG
531 :     ACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
532 :     TAA
533 :     >Anae.dehal Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C [gi|86156430 1361311-1362870]
534 :     TAATTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGAG
535 :     AAAGCCCGCAAGGGTGAGTAAAGCGGCGCACGGGTGCGTAACACGTGGGTAATCTGCCCTAGAGTCCGGA
536 :     ATAACTCGCCGAAAGGCGTGCTAATGCCGGATGAGACCACGGGAGCTTCGGCTCCTGCGGGAAAAGGTGG
537 :     CCTCTGTACACAAGCTATCGCTCTAGGATGAGCCCGCGGCCCATCAGCTCGTTGGCGGGGTAATGGCCCA
538 :     CCAAGGCAACGACGGGTAGCTGGTCTGAGAGGACGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACT
539 :     CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGTGTG
540 :     ATGAAGGTCTTCGGATCGTAAAGCACTGTCGCGAGGGACGAATAAGGGACGGGCGAACAGTCCGTCACGA
541 :     TGACGGTACCTCGAGAGGAAGCACCGGCTAACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACAGAGGGTGCGAGC
542 :     GTTGTTCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGTGTAGGCGGCCTAGCAAGTCGGATGTGAAAGCCCTCGGCT
543 :     TAACCGAGGAAGTGCGTTCGAAACTACTGGGCTTGAGTACCGGAGAGGGTGGCGGAATTCCCGGTGTAGA
544 :     GGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCCACCTGGACGGATACTGACGCTGA
545 :     GACGCGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGAGCGCTAG
546 :     GTGTTGCGGGTGTTGACCCCTGCAGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGCGCTCCGCCTGGGAAGTACGGCCG
547 :     CAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCA
548 :     ACGCGCAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCTCGGAATCCCTCAGAGATGAGGGGGTGCCCGCAAGGGAA
549 :     CCGAGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG
550 :     CGCAACCCCTGCCGTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAACGGGACTGCCGGCGTCAAGCCGGAG
551 :     GAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCTTTATGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCGGT
552 :     ACAGAGGGTCGCCAAGTCGCGAGACGGAGCTAATCCCAGAAAACCGGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGC
553 :     AACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGG
554 :     CCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTCAGTTGCTCCAGAAGTGGCCGCGCCAACCCGCAAGGG
555 :     AGGCAGGTCCCTAAGGAGTGGCTGGTAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCG
556 :     GCTGGATCACCTCCTTTCTA
557 :     >Woli.succi Wolinella succinogenes DSM 1740 [gi|34556458 136184-137682]
558 :     ATTATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGGT
559 :     AACAGGGTGTAGCTTGCTATACTGCTGACGAGTGGCGCACGGGTGAGTAATGCATAGGTTATGTGCCCCA
560 :     TAGTCTGGAATAGCCACTGGAAACGGTGATTAATACCGGATATTCCCGAGAGGGGAAAGTTTTTCGCTAT
561 :     GGGATCAGCCTATGTCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCTATGACGGGTATCCGGC
562 :     CTGAGAGGGTGATCGGACACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAA
563 :     TATTGCTCAATGGGCGAAAGCCTGAAGCAGCAACGCCGCGTGGAGGATGAAGGTCTTCGGATTGTAAACT
564 :     CCTTTTCTAAGAGAAGATTATGACGGTATCTTAGGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCG
565 :     GTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTACTCGGAATCACTGGGCGTAAAGAGCACGTAGGCGGCCTTGCAAGTC
566 :     AGATGTGAAATCCAACGGCTTAACCGTTGAACTGCATTTGAAACTGCAAGGCTAGAGTATGGGAGAGGTA
567 :     GGTGGAATTCTCGGTGTAGGGGTAAAATCCGTAGAGATCGAGAGGAATACTCATTGCGAAGGCGACCTGC
568 :     TGGAACATTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACG
569 :     CCCTAAACGATGAATGCTAGTTGTTGCCCTGCTTGTCAGGGCAGTAATGCAGTTAACACATTAAGCATTC
570 :     CGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATAGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCA
571 :     TGTGGTTTAATTCGAAGATACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATTGATAGAATCCTATAGAGATAT
572 :     GGGAGTGCCAGTTTACTGGAGCTTGAAAACAGGTGCTGCACGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGT
573 :     TGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTCACTAGTTGCTAACGGTTCGGCCGAGCACTCTAGTGA
574 :     GACTGCCTTCGCAAGGAGGAGGAAGGTGAGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGCCCAGGGCTAC
575 :     ACACGTGCTACAATGGTGTGTACAAAGAGAAGCAATACCGCGAGGTGGAGCAAATCTTTAAAACACATCT
576 :     CAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCGACTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGTAGATCAGCAATGC
577 :     TACGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACTCACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGTATTCGCCTTAAGC
578 :     CGGGACGCTAAACTGGCTACCGTCCACGGCGGATGCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGT
579 :     AGGTGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTT
580 :     >Prop.acnes Propionibacterium acnes [fig|267747.1.rna.10 NC_006085_606156_607682]
581 :     TCATTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAA
582 :     GTCGAACGGAAAGGCCCTGCTTTTGTGGGGTGCTCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACG
583 :     TGAGTAACCTGCCCTTGACTTTGGGATAACTTCAGGAAACTGGGGCTAATACCGGATAGG
584 :     AGCTCCTGCTGCATGGTGGGGGTTGGAAAGTTTCGGCGGTTGGGGATGGACTCGCGGCTT
585 :     ATCAGCTTGTTGGTGGGGTAGTGGCTTACCAAGGCTTTGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGG
586 :     GTGACCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGG
587 :     AATATTGCACAATGGGCGGAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGCGGGATGACGGCCTTC
588 :     GGGTTGTAAACCGCTTTCGCCTGTGACGAAGCGTGAGTGACGGTAATGGGTAAAGAAGCA
589 :     CCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTGATACGTAGGGTGCGAGCGTTGTCCGGATTT
590 :     ATTGGGCGTAAAGGGCTCGTAGGTGGTTGATCGCGTCGGAAGTGTAATCTTGGGGCTTAA
591 :     CCCTGAGCGTGCTTTCGATACGGGTTGACTTGAGGAAGGTAGGGGAGAATGGAATTCCTG
592 :     GTGGAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGTTCTCTGG
593 :     GCCTTTCCTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGCTTAGATACCCTGGTA
594 :     GTCCACGCTGTAAACGGTGGGTACTAGGTGTGGGGTCCATTCCACGGGTTCCGTGCCGTA
595 :     GCTAACGCTTTAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAAT
596 :     TGACGGGGCCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGTAGAACC
597 :     TTACCTGGGTTTGACATGGATCGGGAGTGCTCAGAGATGGGTGTGCCTCTTTTGGGGTCG
598 :     GTTCACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
599 :     CAACGAGCGCAACCCTTGTTCACTGTTGCCAGCACGTTATGGTGGGGACTCAGTGGAGAC
600 :     CGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCC
601 :     AGGGCTTCACGCATGCTACAATGGCTGGTACAGAGAGTGGCGAGCCTGTGAGGGTGAGCG
602 :     AATCTCGGAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCTCATGAAGTCGG
603 :     AGTCGCTAGTAATCGCAGATCAGCAACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGGCTTGTACAC
604 :     ACCGCCCGTCAAGTCATGAAAGTTGGTAACACCCGAAGCCGGTGGCCTAACCGTTGTGGG
605 :     GGAGCCGTCGAAGGTGGGACTGGTGATTAGGACTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGG
606 :     AAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
607 :     >Mycb.tuber Mycobacterium tuberculosis CDC1551 [gi|50953765 1471388-1472923]
608 :     TTTGTTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
609 :     AAGTCGAACGGAAAGGTCTCTTCGGAGATACTCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTG
610 :     GGTGATCTGCCCTGCACTTCGGGATAAGCCTGGGAAACTGGGTCTAATACCGGATAGGAC
611 :     CACGGGATGCATGTCTTGTGGTGGAAAGCGCTTTAGCGGTGTGGGATGAGCCCGCGGCCT
612 :     ATCAGCTTGTTGGTGGGGTGACGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGG
613 :     GTGTCCGGCCACACTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGG
614 :     AATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGGGGGATGACGGCCTTC
615 :     GGGTTGTAAACCTCTTTCACCATCGACGAAGGTCCGGGTTCTCTCGGATTGACGGTAGGT
616 :     GGAGAAGAAGCACCGGCCAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCG
617 :     TTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGTGGTTTGTCGCGTTGTTCGTGAAAT
618 :     CTCACGGCTTAACTGTGAGCGTGCGGGCGATACGGGCAGACTAGAGTACTGCAGGGGAGA
619 :     CTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAG
620 :     GCGGGTCTCTGGGCAGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTA
621 :     GATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGGTGGGTACTAGGTGTGGGTTTCCTTCCTTGGG
622 :     ATCCGTGCCGTAGCTAACGCATTAAGTACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAA
623 :     ACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGATTAATTCGATGCA
624 :     ACGCGAAGAACCTTACCTGGGTTTGACATGCACAGGACGCGTCTAGAGATAGGCGTTCCC
625 :     TTGTGGCCTGTGTGCAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGT
626 :     TAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTCATGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGGACTC
627 :     GTGAGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCC
628 :     CTTATGTCCAGGGCTTCACACATGCTACAATGGCCGGTACAAAGGGCTGCGATGCCGCGA
629 :     GGTTAAGCGAATCCTTAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATCGGGGTCTGCAACTCGACCCCG
630 :     TGAAGTCGGAGTCGCTAGTAATCGCAGATCAGCAACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGC
631 :     CTTGTACACACCGCCCGTCACGTCATGAAAGTCGGTAACACCCGAAGCCAGTGGCCTAAC
632 :     CCTCGGGAGGGAGCTGTCGAAGGTGGGATCGGCGATTGGGACGAAGTCGTAACAAGGTAG
633 :     CCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
634 :     >Stre.coeli Streptomyces coelicolor A3(2) [fig|100226.1.rna.3]
635 :     CATTCACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
636 :     AAGTCGAACGATGAACCACTTCGGTGGGGATTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGG
637 :     CAATCTGCCCTTCACTCTGGGACAAGCCCTGGAAACGGGGTCTAATACCGGATACTGACC
638 :     CTCGCAGGCATCTGCGAGGGTCGAAAGCTCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATC
639 :     AGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGCG
640 :     ACCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAAT
641 :     ATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATGACGGCCTTCGGG
642 :     TTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAGAAGCGCCG
643 :     GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATT
644 :     GGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGCTTGTCACGTCGGTTGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCC
645 :     CGGGTCTGCAGTCGATACGGGCAGGCTAGAGTTCGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGGTG
646 :     TAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGATCTCTGGGCC
647 :     GATACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC
648 :     CACGCCGTAAACGGTGGGCACTAGGTGTGGGCAACATTCCACGTTGTCCGTGCCGCAGCT
649 :     AACGCATTAAGTGCCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGA
650 :     CGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTA
651 :     CCAAGGCTTGACATACACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGCCCCCCTTGTGGTCGGTGTAC
652 :     AGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGA
653 :     GCGCAACCCTTGTCCCGTGTTGCCAGCAAGCCCTTCGGGGTGTTGGGGACTCACGGGAGA
654 :     CCGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTC
655 :     TTGGGCTGCACACGTGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGATACCGCAAGGTGGAGC
656 :     GAATCTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCG
657 :     GAGTCGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACA
658 :     CACCGCCCGTCACGTCACGAAAGTCGGTAACACCCGAAGCCGGTGGCCCAACCCCTTGTG
659 :     GGAGGGAGCTGTCGAAGGTGGGACTGGCGATTGGGACGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA
660 :     CCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
661 :     >Bifi.longu Bifidobacterium longum NCC2705 [fig|206672.1.rna.53]
662 :     TTTTTGTGGAGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGC
663 :     AAGTCGAACGGGATCCATCAGGCTTTGCTTGGTGGTGAGAGTGGCGAACGGGTGAGTAAT
664 :     GCGTGACCGACCTGCCCCATACACCGGAATAGCTCCTGGAAACGGGTGGTAATGCCGGAT
665 :     GCTCCAGTTGATCGCATGGTCTTCTGGGAAAGCTTTCGCGGTATGGGATGGGGTCGCGTC
666 :     CTATCAGCTTGACGGCGGGGTAACGGCCCACCGTGGCTTCGACGGGTAGCCGGCCTGAGA
667 :     GGGCGACCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGG
668 :     GGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATGGAGGCCT
669 :     TCGGGTTGTAAACCTCTTTTATCGGGGAGCAAGCGAGAGTGAGTTTACCCGTTGAATAAG
670 :     CACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTATCCGGAA
671 :     TTATTGGGCGTAAAGGGCTCGTAGGCGGTTCGTCGCGTCCGGTGTGAAAGTCCATCGCTT
672 :     AACGGTGGATCCGCGCCGGGTACGGGCGGGCTTGAGTGCGGTAGGGGAGACTGGAATTCC
673 :     CGGTGTAACGGTGGAATGTGTAGATATCGGGAAGAACACCAATGGCGAAGGCAGGTCTCT
674 :     GGGCCGTTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGG
675 :     TAGTCCACGCCGTAAACGGTGGATGCTGGATGTGGGGCCCGTTCCACGGGTTCCGTGTCG
676 :     GAGCTAACGCGTTAAGCATCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGAA
677 :     ATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAA
678 :     CCTTACCTGGGCTTGACATGTTCCCGACGGTCGTAGAGATACGGCTTCCCTTCGGGGCGG
679 :     GTTCACAGGTGGTGCATGGTCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
680 :     CAACGAGCGCAACCCTCGCCCCGTGTTGCCAGCGGATTATGCCGGGAACTCACGGGGGAC
681 :     CGCCGGGGTTAACTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAGATCATCATGCCCCTTACGTCC
682 :     AGGGCTTCACGCATGCTACAATGGCCGGTACAACGGGATGCGACGCGGCGACGCGGAGCG
683 :     GATCCCTGAAAACCGGTCTCAGTTCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGGCGG
684 :     AGTCGCTAGTAATCGCGAATCAGCAACGTCGCGGTGAATGCGTTCCCGGGCCTTGTACAC
685 :     ACCGCCCGTCAAGTCATGAAAGTGGGCAGCACCCGAAGCCGGTGGCCTAACCCCTTGTGG
686 :     GATGGAGCCGTCTAAGGTGAGGCTCGTGATTGGGACTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAC
687 :     CGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
688 :     >Rubr.xylan Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 [fig|266117.1.rna.047]
689 :     TTTAGTTCGGAGAGTTTGATCTTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTTAGGCATG
690 :     CAAGTCGAACGCGAAAGCCCCTTCGGGGGTGAGTAGAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACG
691 :     TGGGTAACCTGCCCCTCGCAGGGGGATAACCGGGGGAAACCCCGGCTAATACCCCGTACG
692 :     CTTGCCGGGGCGCATGCTCCGGCAAGGAAAGGTAGCTTCGGCCATCCGGCGAGGGAGGGG
693 :     CCCGCGGCCCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATGGGTAGCTG
694 :     GCCTGAGAGGGTGGTCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
695 :     AGCAGCCAGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGGCGAT
696 :     GAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCCCTGTTGTCGGGGACGAAGGGCGAAGGGTTAATAGCCC
697 :     CTAGCCTGACGGTACCCGACGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA
698 :     TACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATCATTGGGCGTAAAGAGCGTGTAGGCGGCCCGG
699 :     TAAGTCTGCTGTGAAAACCCGGGGCTCAACCCCGGGCGTGCAGTGGAAACTGCCGGGCTA
700 :     GAGGGCGGCAGAGGCGAGTGGAATTCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCGGGAG
701 :     GAACACCAGTAGCGAAGGCGGCTCGCTGGGCCGTTCCTGACGCTGAGACGCGAAAGCTAG
702 :     GGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGGCACTAGGTGT
703 :     GGGGGGAGTCGAATCCCTCCGTGCCGCAGCCAACGCGTTAAGTGCCCCGCCTGGGGAGTA
704 :     CGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAAGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGT
705 :     TCTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATGCTGGTGGTAGGCGC
706 :     CGGAAACGGTGGCCGACCCTTCGGGGAGCCAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCT
707 :     CGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCCTGTGTTGCCA
708 :     GCATTGAGTTGGGGACTCACAGGGGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGA
709 :     CGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGCCCAGGGCTAGAAACGTGCTACAATGGCCGGTACAA
710 :     TGGGCTGCGATGCCGCGAGGCGGAGCGAATCCCATCAAAGCCGGTCTAAGTTCGGATTGG
711 :     AGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGGCGGAGTTGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCG
712 :     GTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTCGGCAATACC
713 :     CGAAGCAGGCGCAGCTAACCCCTCTTCGGAGGGGAGGCGGCTTGCGAAGGTAGGGCCGGC
714 :     GACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCTGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
715 :     TCTA
716 :     >Chla.trach Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX [gi|15604717 854124-855677]
717 :     TTTTCTGAGAATTTGATCTTGGTTCAGATTGAACGCTGGCGGCGTGGATGAGGCATGCAAGTCGAACGGA
718 :     GCAATTGTTTCGACGATTGTTTAGTGGCGGAAGGGTTAGTAATGCATAGATAATTTGTCCTTAACTTGGG
719 :     AATAACGGTTGGAAACGGCCGCTAATACCGAATGTGGCGATATTTGGGCATCCGAGTAACGTTAAAGAAG
720 :     GGGATCTTAGGACCTTTCGGTTAAGGGAGAGTCTATGTGATATCAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTAC
721 :     CAAGGCTATGACGTCTAGGCGGATTGAGAGATTGGCCGCCAACACTGGGACTGAGACACTGCCCAGACTC
722 :     CTACGGGAGGCTGCAGTCGAGAATCTTTCGCAATGGACGGAAGTCTGACGAAGCGACGCCGCGTGTGTGA
723 :     TGAAGGCTCTAGGGTTGTAAAGCACTTTCGCTTGGGAATAAGAGAAGACGGTTAATACCCGCTGGATTTG
724 :     AGCGTACCAGGTAAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCTGCGGTAATACGGAGGGTGCTAGCGT
725 :     TAATCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGCGTGTAGGCGGAAAGGTAAGTTAGTTGTCAAAGATCGGGGCTCA
726 :     ACCCCGAGTCGGCATCTAATACTATTTTTCTAGAGGATAGATGGAGAAAAGGGAATTTCACGTGTAGCGG
727 :     TGAAATGCGTAGATATGTGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGCTTTTCTAATTTATACCTGACGCTAAGG
728 :     CGCGAAAGCAAGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCTTGCCGTAAACGATGCATACTTGAT
729 :     GTGGATGGTCTCAACCCCATCCGTGTCGGAGCTAACGCGTTAAGTATGCCGCCTGAGGAGTACACTCGCA
730 :     AGGGTGAAACTCAAAAGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAAC
731 :     GCGAAGGACCTTACCTGGGTTTGACATGTATATGACCGCGGCAGAAATGTCGTTTTCCGCAAGGACATAT
732 :     ACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA
733 :     CCCTTATCGTTAGTTGCCAGCACTTAGGGTGGGAACTCTAACGAGACTGCCTGGGTTAACCAGGAGGAAG
734 :     GCGAGGATGACGTCAAGTCAGCATGGCCCTTATGCCCAGGGCGACACACGTGCTACAATGGCCAGTACAG
735 :     AAGGTGGCAAGATCGCGAGATGGAGCAAATCCTCAAAGCTGGCCCCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTC
736 :     GACTACATGAAGTCGGAATTGCTAGTAATGGCGTGTCAGCCATAACGCCGTGAATACGTTCCCGGGCCTT
737 :     GTACACACCGCCCGTCACATCATGGGAGTTGGTTTTACCTTAAGTCGTTGACTCAACCCGCAAGGGAGAG
738 :     AGGCGCCCAAGGTGAGGCTGATGACTAGGATGAAGTCGTAACAAGGTAGCCCTACCGGAAGGTGGGGCTG
739 :     GATCACCTCCTTT
740 :     >Para.UWE25 Parachlamydia sp. UWE25 [fig|264201.1.rna.39]
741 :     TTTTTCTGTGAGAATTTGATCTTGGTTCAGATTGAATGCTGACAGCGTGGATGAGGCATG
742 :     CAAGTCGAACGAAACCTTCGGGTTTAGTGGCGGAAGGGTTAGTAAGACATGGATAACTTG
743 :     CCTTTAACTCTGGGATAACGGTTGGAAACGACCGCTAATACCGGATAGGGTGAAAAGAAG
744 :     ACATCTTTTTTTTATTAAAGTGGGGGATCGCAAGACCTCGCGGTTAAAGAGAGGTCCATG
745 :     GGATATCAGCTAGTTGGTGTGGTAAAGGCGCACCAAGGCTAAGACGTCTAGGCGGATTGA
746 :     GAGATTGACCGCCAACACTGGGACTGAGAACTGCCCAGACTCCTACGGGAGGCTGCAGTC
747 :     GAGAATCATTCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGATGCGACGCTGTGTGAGTGAAGAAGGCC
748 :     TTAGGGTCGTAAAGCTCTTTCGCCTGGGAACAAGATGAGCTGGCTAACATCCAGTGATTT
749 :     TGAGCGTACCAGGTAAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCTGCGGTAATACGGA
750 :     GGGTGCAAGCATTAATCGGATTTATTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGGGGTGTCAGTC
751 :     AGATGTGAAATCCCGAGGCTCAACCTCGGAACAGCATTTGAAACTACATCTCTAGAGGGT
752 :     AGGCGGAGAAAACGGAATTCCACAAGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATGTGGAAGAACAC
753 :     CGGTGGCGAAGGCGGTTTTCTAGCTTATACCTGACGCTAAAGCGCGAAAGCAAGGGGATC
754 :     AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCTTGCCGTAAACTATGTATACTTGGTGTAACTGG
755 :     ACTCAACCCTAGTTGTGCCGTAGCTAACGCGTTAAGTATACCGCCTGGGGAGTACAGTCG
756 :     CAAGGCTGAAACTCAAAAGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCAGTGGAGCATGTGGTTTA
757 :     ATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCCAGACTTGACATGTAGTAGACCGGTCTAGAAAT
758 :     AGGCCTTTCCTTCGGGACTGCTACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTG
759 :     AGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCATTAGTTGCCAACATTTAAG
760 :     GTGGGAACTCTAATGAGACTGCCTGGGTTAACCAGGAGGAAGGTGAGGATGACGTCAAGT
761 :     CCGCATGGCCCTTATGTCTGGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAAGGCAGC
762 :     GAAGCCGCGAGGTGAAGCAAATCCCGAAAGCCGGCCCCAGTTCAGATTGTAGTCTGCAAC
763 :     TCGACTACATGAAGACGGAATTGCTAGTAATGGCGAGTCAGCAACATCGCCGTGAATACG
764 :     TTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACATCATGGGAGTTGGTTTTACCCGAATCCGC
765 :     TGGCTTAACCGCAAGGGAAGAGGCGTGTAAGGTGAGGCCGATGACTGGGATGAAGTCGTA
766 :     ACAAGGTAGCCCTACCGGAAGGTGGGGCTGGATCACCTCCTTTA
767 :     >Ther.marit Thermotoga maritima MSB8 [fig|243274.1.rna.2]
768 :     TATATGGAGGGTTTGATCCTGGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAA
769 :     GTCGAGCGGGGGAAACTCCCTTCGGGGAGGAGTACCCAGCGGCGGACGGGTGAGTAACAC
770 :     GTGGGTAACCTGCCCTCCGGAGGGGGATAACCAGGGGAAACCCTGGTTAATACCCCATAC
771 :     GCTCCATCAACGCAAGTTGGTGGAGGAAAGGGGCGTTTGCCCCGCCGGAGGAGGGGCCCG
772 :     CGGCCCATCAGGTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGACGACGGGTAGCCGGCCT
773 :     GAGAGGGTGGTCGGCCACAGGGGCACTGAGACACGGGCCCCACTCTACGGGAGGCAGCAG
774 :     TGGGGAATCTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCGACGCCGCGTGCGGGACGAAGC
775 :     CTTCGGGGTGTAAACCGCTGTGGCGGGGGAAGAATAAGGTAGGGAGGAAATGCCCTACCG
776 :     ATGACGGTACCCCGCTAGAAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGT
777 :     AGGGGGCAAGCGTTACCCGGATTTACTGGGCGTAAAGGGGGCGTAGGCGGCCTGGTGTGT
778 :     CGGATGTGAAATCCCACGGCTCAACCGTGGGGCTGCATCCGAAACTACCAGGCTTGGGGG
779 :     CGGTAGAGGGAGACGGAACTGCCGGTGTAGGGGTGAAATCCGTAGATATCGGCAGGAACG
780 :     CCGGTGGGGAAGCCGGTCTCCTGGGCCGACCCCGACGCTGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAG
781 :     CAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACGATGCCCACTAGGTGTGGGGG
782 :     GGTAATCCCTCCGTGCTGAAGCTAACGCGTTAAGTGGGCCGCCTGGGGAGTACGCCCGCA
783 :     AGGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCGTGTGGTTTAAT
784 :     TGGATGCTAAGCCAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATGCCGGTGGTACCTCCCCGAAAGG
785 :     GGTAGGGACCCAGTCCTTCGGGACTGGGAGCCGGCACAGGTGGTGCACGGCCGTCGTCAG
786 :     CTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGCCCCTAGTTGC
787 :     CAGCGGTTCGGCCGGGCACTCTAGGGGGACTGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGA
788 :     TGACGTCAGGTACTCGTGCCCCTTATGCCCTGGGCGACACACGCGCTACAATGGGCGGTA
789 :     CAATGGGTTGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAATCCCCAAAGCCGCCCTCAGTTCGGATCG
790 :     CAGGCTGCAACCCGCCTGCGTGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCCATGCCG
791 :     CGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACGCCACCCGAGTCGGGGGCT
792 :     CCCGAAGACACCTACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGTGTCGAGGGAGAACCTGGCGAG
793 :     GGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCT
794 :     >Fuso.nucle Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 [fig|190304.1]
795 :     GATTGAACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG
796 :     CAAGTCTACTTGAATTTGGGTTTTTTAACTTCGATTTGGGTGGCGGACGGGTGAGTAACG
797 :     CGTAAAGAATTTGCCTCACAGCTAGGGACAACATTTGGAAACGAATGCTAATACCTGATA
798 :     TTATGATTATAGGGCATCCTAGAATTATGAAAGCTATATGCGCTGTGAGAGAGCTTTGCG
799 :     TCCCATTAGCTAGTTGGAGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGATGATGGGTAGCCGGCCTGA
800 :     GAGGGTGAACGGCCACAAGGGGACTGAGACACGGCCCTTACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
801 :     GGGGAATATTGGACAATGGACCGAGAGTCTGATCCAGCAATTCTGTGTGCACGATGACGT
802 :     TTTTCGGAATGTAAAGTGCTTTCAGTTGGGAAGAAAAAAATGACGGTACCAACAGAAGAA
803 :     GTGACGGCTAAATACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGTCACGAGCGTTATCCGGA
804 :     TTTATTGGGCGTAAAGCGCGTCTAGGTGGTTATGTAAGTCTGATGTGAAAATGCAGGGCT
805 :     CAACTCTGTATTGCGTTGGAAACTGTGTAACTAGAGTACTGGAGAGGTAAGCGGAACTAC
806 :     AAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTTGTAGGAATGCCGATGGGGAAGCCAGCTTACT
807 :     GGACAGATACTGACGCTGAAGCGCGAAAGCGTGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGG
808 :     TAGTCCACGCCGTAAACGATGATTACTAGGTGTTGGGGGTCGAACCTCAGCGCCCAAGCA
809 :     AACGCGATAAGTAATCCGCCTGGGGAGTACGTACGCAAGTATGAAACTCAAAGGAATTGA
810 :     CGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAGGAACCTTA
811 :     CCAGCGTTTGACATCTTAGGAATGAGACAGAGATGTTTCAGTGTCCCTTCGGGGAAACCT
812 :     AAAGACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG
813 :     CAACGAGCGCAACCCCTTTCGTATGTTACCATCATTAAGTTGGGGACTCATGCGATACTG
814 :     CCTACGATGAGTAGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATACGCTG
815 :     GGCTACACACGTGCTACAATGGGTAGAACAGAGAGTTGCAAAGCCGTGAGGTGGAGCTAA
816 :     TCTCAGAAAACTATTCTTAGTTCGGATTGTACTCTGCAACTCGAGTACATGAAGTTGGAA
817 :     TCGCTAGTAATCGCGAATCAGCAATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACAC
818 :     CGCCCGTCACACCACGAGAGTTGGTTGCACCTGAAGTAGCAGGCCTAACCGTAAGGAGGG
819 :     ATGTTCCGAGGGTGTGATTAGCGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTATCCGTACGGGAA
820 :     CGTGCGGATGGATCACCTCCTTTCTA
821 :     >Aqui.aeoli Aquifex aeolicus VF5 [gi|15282445 c572785-571199]
822 :     TTTCCCTGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGCGCGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGC
823 :     AAGTCGTGCGCAGGGTCGGCCCCTTTTGGGGCCGGCCGCTGAGCGGCAAACGGGTGAGTA
824 :     ACACGTGGGTAACCTACCCCCAGGAGGGGGATAACCCCGGGAAACCGGGGCTAATACCCC
825 :     ATAATGCCACCCGCCACTAAGGCGCGGTGGCCAAAGGGGGCCTCTGGCCTTCGGCCACGC
826 :     TCCCGCCTGGGGATGGGCCCGCGGCCCATCAGGTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAG
827 :     CCTATGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGCCGGCCACAGCGGGACTGAGACACGGCCC
828 :     GCACCCCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATCGTGGGCAATGGGCGAAAGCCTGACCCCGC
829 :     GACGCCGCGTGGGGGATGAAGCCCTGCGGGGTGTAAACCCCTGTCGGGGGGGACGATGCG
830 :     GACACGGGTTAATAGCCCGTGTCCGTGACGGTACCCCCAGAGGAAGGGACGGCTAACTAC
831 :     GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTCCCAAGCGTTGCGCGAAGTCACTGGGCGTAAA
832 :     GCGTCCGCAGCCGGTCGGGTAAGCGGGATGTCAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGACCGGC
833 :     ATCCCGAACTGCCCGACTTGAGGCACGCCCGGGCAGGCGGAATTCCCGGGGTAGCGGTGA
834 :     AATGCGTAGATCTCGGGAGGAACACCGAAGGGGAAGCCAGCCTGCTGGGGCTGTCCTGAC
835 :     GGTCAGGGACGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCCGGCCGTA
836 :     AACCATGGGCGCTAGGGCTTGTCCCTCTGGGGCAGGCTCGCAGCTAACGCGTTAAGCGCC
837 :     CCGCCTGGGGAGTACGGGCGCAAGCCTGAAACTCAAAGGAATTGGCGGGGGCCCGCACAA
838 :     CCGGTGGAGCGTCTGGTTCAATTCGATGCTAACCGAAGAACCTTACCCGGGCTTGACATG
839 :     CCGGGGAGACTCCGCGAAAGCGGAGTTGTGGAAGTCCCTAGGACTTTCCCCCGGCACAGG
840 :     TGGTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCG
841 :     CAACCCCTGCCCCCAGTTGCTACCCCGTTTGGGGAGCACTCTGGGGGGACCGCCGGCGAT
842 :     AAGCCGGAGGAAGGGGGGGATGACGTCAGGTCAGTATGCCCTTTATGCCCGGGGCCACAC
843 :     AGGCGCTACAGTGGCCGGGACAATGGGATGCGACCCCGTAAGGGGGAGCTAATCCCTAAA
844 :     CCCGGTCATGGTGCGGATTGGGGGCTGAAACTCGCCCCCATGAAGCCGGAATCGGTAGTA
845 :     ACGGGGTATCAGCGATGTCCCCGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGCACACACCGCCCGTCA
846 :     CGCCACGGAAGTCGGTCCGGCCGGAAGTCCCCGAGCTAACCGGCTCCTTCGGGAGCCGGA
847 :     GGCAGGGGCCGATGGCCGGGCCGGCGACTGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGG
848 :     GAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTA
849 :     >Porp.gingi Porphyromonas gingivalis W83 [gi|34539880 119556-121030]
850 :     ACAGTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATGCAA
851 :     GTCGAGGGGCAGCATGATCTTAGCTTGCTAAGGTTGATGGCGACCGGCGCACGGGTGCGT
852 :     AACGCGTATGCAACTTGCCTTACAGAGGGGGATAACCCGTTGAAAGACGGACTAAAACCG
853 :     CATACACTTGTATTATTGCATGATATTACAAGGAAATATTTATAGCTGTAAGATAGGCAT
854 :     GCGTCCCATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGGGTAGGGGAAC
855 :     TGAGAGGTTTATCCCCCACACTGGTACTGAGACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGC
856 :     AGTGAGGAATATTGGTCAATGGGCGAGAGCCTGAACCAGCCAAGTCGCGTGAAGGAAGAC
857 :     AGTCCTAAGGATTGTAAACTTCTTTTATACGGGAATAACGGGCGATACGAGTATTGCATT
858 :     GAATGTACCGTAAGAATAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAG
859 :     GATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGTTGTTCGGTAAGTCA
860 :     GCGGTGAAACCTGAGCGCTCAACGTTCAGCCTGCCGTTGAAACTGCCGGGCTTGAGTTCA
861 :     GTGGCGGCAGGCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACGAGGAACTCC
862 :     GATTGCGAAGGCAGCTTGCCATACTGCGACTGACACTGAAGCACGAAGGCGTGGGTATCA
863 :     AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCAGTAAACGATGATTACTAGGAGTTTGCGAT
864 :     ATACCGTCAAGCTTCCACAGCGAAAGCGTTAAGTAATCCACCTGGGGAGTACGCCGGCAA
865 :     CGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGAGGAACATGTGGTTTAATT
866 :     CGATGATACGCGAGGAACCTTACCCGGGATTGAAATGTAGATGACGGATGGTGAAAACCG
867 :     TCTTCCCTTCGGGGCTTCTATGTAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGG
868 :     TGTCGGCTTAAGTGCCATAACGAGCGCAACCCACATCGGTAGTTACTAACAGTTTTCGCT
869 :     GAGGACTCTACCGAGACTGCCGTCGTAAGGCGTGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAATCA
870 :     GCACGGCCCTTACATCCGGGGCGACACACGTGTTACAATGGGAGGGACAAAGGGCAGCTA
871 :     CCGGGCGACCGGATGCGAATCTCTAAACCCTTCCCCAGTTCGGATCGGAGTCTGCAACTC
872 :     GACTCCGTGAAGCTGGATTCGCTAGTAATCGCGCATCAGCCATGGCGCGGTGAATACGTT
873 :     CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGGAGTCGGGGGTACCTGAAGGGCGTA
874 :     ACCGCAAGGGGCGCACTAGGGTAATACCGGTGACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCC
875 :     GTACCGGAAGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTT
876 :     >Bact.frag Bacteroides fragilis YCH46 [gi|53711291 c3145859-3144323]
877 :     TTTACAATGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG
878 :     CAAGTCGAGGGGCATCAGGAAGAAAGCTTGCTTTCTTTGCTGGCGACCGGCGCACGGGTG
879 :     AGTAACACGTATCCAACCTGCCCTTTACTCGGGGATAGCCTTTCGAAAGAAAGATTAATA
880 :     CCCGATGGCATAATGATTCCGCATGGTTTCATTATTAAAGGATTCCGGTAAAGGATGGGG
881 :     ATGCGTTCCATTAGGTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGCCTTCGATGGATAGGGGT
882 :     TCTGAGAGGAAGGTCCCCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAAACTCCTACGGGAGGCA
883 :     GCAGTGAGGAATATTGGTCAATGGGCGCTAGCCTGAACCAGCCAAGTAGCGTGAAGGATG
884 :     AAGGCTCTATGGGTCGTAAACTTCTTTTATATAAGAATAAAGTGCAGTATGTATACTGTT
885 :     TTGTATGTATTATATGAATAAGGATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGG
886 :     AGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGAGCGTAGGTGGACTGGTAAGT
887 :     CAGTTGTGAAAGTTTGCGGCTCAACCGTAAAATTGCAGTTGATACTGTCAGTCTTGAGTA
888 :     CAGTAGAGGTGGGCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCTTAGATATCACGAAGAACT
889 :     CCGATTGCGAAGGCAGCTCACTGGACTGCAACTGACACTGATGCTCGAAAGTGTGGGTAT
890 :     CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACACAGTAAACGATGAATACTCGCTGTTTGCG
891 :     ATATACAGTAAGCGGCCAAGCGAAAGCATTAAGTATTCCACCTGGGGAGTACGCCGGCAA
892 :     CGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGAGGAACATGTGGTTTAATT
893 :     CGATGATACGCGAGGAACCTTACCCGGGCTTAAATTGCAGTGGAATGATGTGGAAACATG
894 :     TCAGTGAGCAATCACCGCTGTGAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGG
895 :     TGTCGGCTTAAGTGCCATAACGAGCGCAACCCTTATCTTCAGTTACTAACAGGTTATGCT
896 :     GAGGACTCTGGAGAGACTGCCGTCGTAAGATGTGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCA
897 :     GCACGGCCCTTACGTCCGGGGCTACACACGTGTTACAATGGGGGGTACAGAAGGCAGCTA
898 :     GCGGGTGACCGTATGCTAATCCCAAAAGCCTCTCTCAGTTCGGATCGAAGTCTGCAACCC
899 :     GACTTCGTGAAGCTGGATTCGCTAGTAATCGCGCATCAGCCACGGCGCGGTGAATACGTT
900 :     CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGGAGCCGGGGGTACCTGAAGTACGTA
901 :     ACCGCAAGGATCGTCCTAGGGTAAAACTGGTGACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCC
902 :     GTACCGGAAGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTTCT
903 :     >Cyto.hutch Cytophaga hutchinsonii [fig|985.1]
904 :     TTTACAATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAATACATG
905 :     CAAGTCGAGGGGCAGCGGGGTAGCAATACTGCCGGCGACCGGCGCACGGGTGCGTAACAC
906 :     GTATGCAACCTACCTTAAACTGGGAGATAGCCCGGGGAAACTCGGATTAATACCCCATAA
907 :     CACATTTGTGTCTCATGACATGATTGTTAAAGATTTATCGGTTTAAGATGGGCATGCGTT
908 :     CGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCTACGATCGATAGGGGGTCTGAGA
909 :     GGATGATCCCCCACACTGGTACTGAGATACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAG
910 :     GGAATATTGGTCAATGGAGGCAACTCTGAACCAGCCATGCCGCGTGTAGGAAGAAGGCGT
911 :     TCTGCGTTGTAAACTACTTTTGATTGGGAACAAATGACTCTTGCGAGAGTAGCTGAGTGT
912 :     ACCAATAGAATAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCA
913 :     AGCGTTGTCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCTTAATAAGTCAGTGGTG
914 :     AAAGCCGATCGCTTAACGATCGAACTGCCATTGATACTGCTAGGCTTGAGTATAGATGAG
915 :     GTAGGCGGAATTGACAGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATTGTCAAGAACACCAATTGC
916 :     GAAGGCAGCTTACTAAGTTATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGTGCGGGGATCAAACAGG
917 :     ATTAGATACCCTGGTAGTCCGCACCGTAAACGATGATCACTCGCTGTGTGCGATAAACAG
918 :     TACGCGGCCAAGCGAAAGCGATAAGTGATCCACCTGGGGAGTACGCCCGCAAGGGTGAAA
919 :     CTCAAAGGAATTGACGGGGGTCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATA
920 :     CGCGAGGAACCTTACCTAGGCTAGAATGTGAAGGAATGTATCAGAAATGGTGCAGTCAGC
921 :     AATGACCTGAAACAAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTT
922 :     AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATCTTTAGTTGCCAGCGAGTTATGTCGGGGACTCT
923 :     AGAGAGACTGCCTGTGTAAACAGAGAGGAAGGAGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCC
924 :     TTACGCCTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGAGTGTTGCAAGCTAGTGAT
925 :     AGCAAGCCAATCACAAAAAGTGCGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCAT
926 :     GAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGTATCAGCAATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGACC
927 :     TTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGAAAGTCTGGTGGACCTGAAGGCCGTAACCGCAAG
928 :     GAGCGGCTCAGGGTAAAACAGGTAATTAGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGA
929 :     AGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTTC
930 :     >Croc.atlan Croceibacter atlanticus HTCC2559 [fig|216432.3.rna.32]
931 :     ACTACGATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG
932 :     CAAGTCGAACGGCAGCGGGAAGGAGCTTGCTCCTTTGCCGGCGAGTGGCGCACGGGTGCG
933 :     TAACGCGTATACAACCTACCTTATACAGGGGTATAGCCCAGGGAAACTTGGATTAACACC
934 :     CCATAGTAATATGTTTTGGCATCATTACATATTTAAAACTACGGTGGTATAAGATGGGTA
935 :     TGCGTCCCATTAGCTTGTTGGTGTGGTAACGGCACACCAAGGCAACGATGGGTAGGGGCC
936 :     CTGAGAGGGGGATCCCCCACACTGGTACTGAGACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAG
937 :     CAGTGAGGAATATTGGACAATGGGCGGGAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGCAGGAAGA
938 :     CTGCCCTATGGGTTGTAAACTGCTTTTATACGGGAAGAAACCCACCTACGTGTAGGTGGC
939 :     TGACGGTACCGTAAGAATAAGGACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGA
940 :     GGGTCCGAGCGTTATCCGGAATCATTGGGTTTAAAGGGTCCGCAGGCGGCCAGATAAGTC
941 :     AGTGGTGAAATTCCGTGGCTCAACCACGGAACTGCCATTGATACTGTTTGGCTTGAATCA
942 :     GTTCGAGGATGCCGGAATGTGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACACAGAACAC
943 :     CAATTGCGAAGGCAGGTGTCCAGAACTGTATTGACGCTGATGGACGAAAGCGTGGGTAGC
944 :     GAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGTCACTAGCTGTCCGGAC
945 :     TTAGGTCTGGGTGGCCAAGCGAAAGTGATAAGTGACCCACCTGGGGAGTACGTTCGCAAG
946 :     AATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC
947 :     GATGATACGCGAGGAACCTTACCAGGGCTTAAATGCATTATGACAGGGGTGGAGACACCC
948 :     TTTTCTTCGGACATTTTGCAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGT
949 :     CAGGTTAAGTCCTATAACGAGCGCAACCCCTGTTGTTAGTTGCCAGCGAGTAATGTCGGG
950 :     AACTCTAGCAAGACTGCCGGTGCAAACCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCA
951 :     CGGCCCTTACGCCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCAGGTACAGCAAGCAGCCACTG
952 :     GGCGACCAGGAGCGAATCTGTAAAGCCTGTCACAGTTCGGATCGGAGTCTGCAACTCGAC
953 :     TCCGTGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCATATCAGCCATGATGCGGTGAATACGTTCCC
954 :     GGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGCTGGGAGTGCCTGAAGTCCGTCGCC
955 :     GTAAGGAGCGGCCTAGGGTAAGACCGGTAACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA
956 :     CCGGAAGGTGCGGCTGGAACACCTCCTTTCTG
957 :     >Chlo.tepid Chlorobium tepidum TLS [fig|194439.1.rna.54]
958 :     CTTACAACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
959 :     CAAGTCAAAGTTTGAGTAACTTCGGTTACAAAGACTTGGCGCAAGGGTGAGTAAGGCATA
960 :     GGTAATCTGCCTTTTGGTCTGGGATAACCCCGAGAAATCGGGAACAATACCAGATGATGC
961 :     AGCGGAATCGCATGGTTATGTTGTTAAAGATTTATCGCCAAAAGATGAGCCTATGTTCCA
962 :     TCAGGTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGCCTACGACGGATAGCTGGTCTGAGAGGA
963 :     TGATCAGCCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGA
964 :     ATATTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGGATGATGAAGTTCTTCG
965 :     GAATGTAAAATCCTTTTGCAGGAGACGAAGAGGTCGGCTTGCCGGCTGTGACGGTACCCT
966 :     GCGAATAAGCCACGGCTAACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGTGATACAGGGGTGGCAAGCGT
967 :     TGTCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGTGCGCAGGCGGATCGATAAGTCGGGGGTTAAATC
968 :     CATGTGCTTAACACATGCACGGCTTCCGATACTGTTGATCTAGAGTCTCGAAGAGGAAGG
969 :     TGGAATTTCCGGTGTAACGGTGGAATGTGTAGATATCGGAAAGAACACCAGTGGCGAAGG
970 :     CAGCCTTCTGGTCGAGTACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAG
971 :     ATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGATGTTGGTCATAGTGATCAGTG
972 :     TCGCAGCTAACGCGTTAAGTATTCCACCTGGGAAGTACGCCCGCAAGGGTGAAACTCAAA
973 :     GGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGATCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAA
974 :     GAACCTTACCTAGGCTTGATATTACAGCTAAACCTCCTGAAAGGGAGGGTCCTTCGGGGA
975 :     GCTGTAACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC
976 :     CGCAACGAGCGCAACCCCTACAATTAGTTACCATCAGGTTAAGCTGGGGACTCTAATTGA
977 :     ACTGCCTACGCAAGTAGAGAGGAGGGAGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGC
978 :     CTAGGGCCACACACGTGATACAATGGCGACTACAGAGGGCAAAGCCGCAAGGCAGAGGGA
979 :     ATCCCAAAAAAGTCGTCTCAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTTGGA
980 :     ATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATGTGTTCCCGGGCCTTGTACACAC
981 :     CGCCCGTCAAGTCATGGAAGTCAGGAGTACCCAAAGACGCTCGCGCGTTTAAGGTAAGAC
982 :     TGGTAACTGGGACTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCT
983 :     CCTTT
984 :     >Sali.ruber Salinibacter ruber DSM 13855 [gi|83814055 c3330049-3328508]
985 :     TACTACGGAGAGTTTGATCCTAGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCA
986 :     AGTCGCACGAGAACGTTCTGGCTTTGCCAGGACAAGTACAGTGGCGGACGGGTGCGTATC
987 :     GCGTAGATAACCTGCCCTCAGGCGCGGGACAATCACGGGAAACCGTGGCTAATACCGCAC
988 :     GTCGTCTGGATCCCGCATGGGGACCAGATGAAAGCCTTCGGGCGCCTTTGGATGGGTCTG
989 :     CGTTGGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATCCATAGCTGGTCT
990 :     GAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCA
991 :     GTGGGGAATCTTGCACAATGGGGTCACCCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGGAGGAAGACA
992 :     CCCCTATGGGGCGTAAACTCCTTTTCTGAATGAAGAAACCCCTGTAGCTTCAGGGCGCGA
993 :     CGGTAGTTCAGGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGG
994 :     TGCAAGCGTTGTCCGGAATCACTGGGTGTAAAGGGTGTGCAGGCGGGGCAGCAAGTCGGA
995 :     TGTGAAACCCCATGGCTTAACCATGGAGGTGCATTCGAAACTGTTGCTCTTGAGTCCCGG
996 :     AGAGGCTGTCGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCACGAGGAACACCAG
997 :     AGGCGAAAGCGGACAGCTGGACGGGTACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA
998 :     CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCTCGCCGTTGCCTCGTT
999 :     AGGGGGCAGTGGCTAAGCTAACGCGTTAAGCATTCCACCTGGGGAGTACGATCGCAAGGT
1000 :     TGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGCTCAATTCGA
1001 :     TGCAACGCGAAGAACCTTACCTAGGCTCGAACGCTAAAGGACCGCTCCTGAAAGGGAGCT
1002 :     TCCCCTTTGGGGCCTTTAGCGAGGTACTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG
1003 :     TTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGTAACCCCTGTTGCTAGTTACCAGCGGATAATGCCGG
1004 :     GGACTCTAGCGAAACTGCCTGCGCAAGCAGTGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATC
1005 :     ATGGTCCTTACGCCTAGGGCTGCACACGTGCTACAATGGCCGGTACAACGAGCAGCCACC
1006 :     TCGCGAGAGGGAGCGAATCTCTGAAAACCGGTCCCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCG
1007 :     ACTCCATGAAGCAGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCAATGCCGCGGTGAATCCGTTC
1008 :     CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGCTGAGAGCACCCGAAGTCCGTGA
1009 :     CCCAACCTTTTGGGAGGGAGCGGCCGAAGGTGAGCTCAGTGACTGGGGCTAAGTCGTAAC
1010 :     AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTAAA
1011 :     >Dein.radio Deinococcus radiodurans R1 [gi|15805042 84836-86337]
1012 :     TTTATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGCGTGCTTAAGACATGCAA
1013 :     GTCGAACGCGGTCTTCGGACCGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACACGTAACTGACCTACCC
1014 :     AGAAGTCACGAATAACTGGCCGAAAGGTCCGCTAATACGTGATGTGGTGATGCACCGTGG
1015 :     TGCATCACTAAAGATTTATCGCTTCTGGATGGGGTTGCGTTCCATCAGCTGGTTGGTGGG
1016 :     GTAAAGGCCTACCAAGGCGACGACGGATAGCCGGCCTGAGAGGGTGGCCGGCCACAGGGG
1017 :     CACTGAGACACGGGTCCCACTCCTACGGGAGGCAGCAGTTAGGAATCTTCCACAATGGGC
1018 :     GCAAGCCTGATGGAGCGACGCCGCGTGAGGGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAACCTCTGA
1019 :     ATCTGGGACGAAAGAGCCTTAGGGCAGATGACGGTACCAGAGTAATAGCACCGGCTAACT
1020 :     CCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTACCCGGAATCACTGGGCGTA
1021 :     AAGGGCGTGTAGGCGGAAATTTAAGTCTGGTTTTAAAGACCGGGGCTCAACCTCGGGGAT
1022 :     GGACTGGATACTGGATTTCTTGACCTCTGGAGAGGTAACTGGAATTCCTGGTGTAGCGGT
1023 :     GGAATGCGTAGATACCAGGAGGAACACCAATGGCGAAGGCAAGTTACTGGACAGAAGGTG
1024 :     ACGCTGAGGCGCGAAAGTGTGGGGAGCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCACACCC
1025 :     TAAACGATGTACGTTGGCTAAGCGCAGGATGCTGTGCTTGGCGAAGCTAACGCGATAAAC
1026 :     GTACCGCCTGGGAAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA
1027 :     CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGAC
1028 :     ATGCTAGGAACTTTGCAGAGATGCAGAGGTGCCCTTCGGGGAACCTAGACACAGGTGCTG
1029 :     CATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
1030 :     CTTGCCTTTAGTTGTCAGCATTCAGTTGGACACTCTAGAGGGACTGCCTATGAAAGTAGG
1031 :     AGGAAGGCGGGGATGACGTCTAGTCAGCATGGTCCTTACGTCCTGGGCGACACACGTGCT
1032 :     ACAATGGGTAGGACAACGCGCAGCAAACCCGCGAGGGTAAGCGAATCGCTAAAACCTATC
1033 :     CCCAGTTCAGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCG
1034 :     GGTCAGCATACCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATG
1035 :     GGAGTAGATTGCAGTTGAAACCGCCGGGAGCTTAACGGCAGGCGTCTAGACTGTGGTTTA
1036 :     TGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACTGTACCGGAAGGTGCGGTTGGATCACCTCCT
1037 :     TT
1038 :     >Ther.ther Thermus thermophilus HB8 [gi|55771382 131300-132821]
1039 :     TTTGTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAAGACATGCA
1040 :     AGTCGTGCGGGCCGCGGGGTTTTACTCCGTGGTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTG
1041 :     GGTGACCTACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACTCGGGCTAATCCCCCATGTGGA
1042 :     CCCGCCCCTTGGGGTGTGTCCAAAGGGCTTTGCCCGCTTCCGGATGGGCCCGCGTCCCAT
1043 :     CAGCTAGTTGGTGGGGTAATGGCCCACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGTCTGAGAGGAT
1044 :     GGCCGGCCACAGGGGCACTGAGACACGGGCCCCACTCCTACGGGAGGCAGCAGTTAGGAA
1045 :     TCTTCCGCAATGGGCGCAAGCCTGACGGAGCGACGCCGCTTGGAGGAAGAAGCCCTTCGG
1046 :     GGTGTAAACTCCTGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACTGACGGTACCGGGGTA
1047 :     ATAGCGCCGGCCAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGCGCGAGCGTTACCC
1048 :     GGATTCACTGGGCGTAAAGGGCGTGTAGGCGGCCTGGGGCGTCCCATGTGAAAGACCACG
1049 :     GCTCAACCGTGGGGGAGCGTGGGATACGCTCAGGCTAGACGGTGGGAGAGGGTGGTGGAA
1050 :     TTCCCGGAGTAGCGGTGAAATGCGCAGATACCGGGAGGAACGCCGATGGCGAAGGCAGCC
1051 :     ACCTGGTCCACCCGTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACCGGATTAGATACC
1052 :     CGGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGCGCGCTAGGTCTCTGGGTCTCCTGGGGGCCGAAGC
1053 :     TAACGCGTTAAGCGCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTG
1054 :     ACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTT
1055 :     ACCAGGCCTTGACATGCTAGGGAACCCGGGTGAAAGCCTGGGGTGCCCCGCGAGGGGAGC
1056 :     CCTAGCACAGGTGCTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCC
1057 :     CGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGTTAGTTGCCAGCGGTTCGGCCGGGCACTCTAACGGGA
1058 :     CTGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGTCTGGTCAGCATGGCCCTTACGGCC
1059 :     TGGGCGACACACGTGCTACAATGCCCACTACAAAGCGATGCCACCCGGCAACGGGGAGCT
1060 :     AATCGCAAAAAGGTGGGCCCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACCCGACCCCATGAAGCCGG
1061 :     AATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAC
1062 :     ACCGCCCGTCACGCCATGGGAGCGGGCTCTACCCGAAGTCGCCGGGAGCCTACGGGCAGG
1063 :     CGCCGAGGGTAGGGCCCGTGACTGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCTGTACCGGAAGGT
1064 :     GCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1065 :     >Synec.6803 Synechocystis sp. PCC 6803 [fig|1148.1]
1066 :     ACAATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCCTAACACATGCAA
1067 :     GTCGAACGGAGTTCTTCGGAACTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGAGAACCTACC
1068 :     TTCAGAATGGGGACAACAGTTGGAAACGACTGCTAATACCCAATGTGCCGAAAGGTGAAA
1069 :     GATTTATCGTCTGAAGATGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGATGGTGGGGTAAGAGCCTAC
1070 :     CATGGCAACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGAGCAGCCACACTGGGACTGAGACACG
1071 :     GCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACG
1072 :     GAGCAATACCGCGTGAGGGAGGAAGGTCCTTGGATTGTAAACCTCTTTTATCAGGGAAGA
1073 :     AGTTCTGACGGTACCTGATGAATAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
1074 :     ACGGAGGATGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGTCCGTAGGTGGTTATGC
1075 :     AAGTCTGCCGTTAAAGAATGGAGCTTAACTCCATAGGAGCGGTGGAAACTGCAAGACTAG
1076 :     AGTACAGTAGGGGTAGCAGGAATTCCCAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTGGGAAG
1077 :     AACATCGGTGGCGAAAGCGTGCTACTGGGCTGAAACTGACACTGAGGGACGAAAGCTAGG
1078 :     GTAGCGAAAGGGATTAGATACCCCTGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTG
1079 :     GCTTGTATCGACCCGAGCCGTGCCGAAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTAC
1080 :     GCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTG
1081 :     GTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATCCCTGGAATCCTGCGG
1082 :     AAACGTGGGAGTGCCTTAGGGAGCCAGGAGACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGT
1083 :     GTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTTTTTAGTTGCCATCA
1084 :     TTAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGT
1085 :     CAAGTCATCATGCCCCTTACGCCTTGGGCTACACACGTACTACAATGGTCGGGACAACGG
1086 :     GCAGCGAGCTCGCGAGAGTAAGCGAATCCCATCAAACCCGGCCTCAGTTCAGATTGCAGG
1087 :     CTGCAACTCGCCTGCATGAAGGAGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGAATACTGCGGTG
1088 :     AATTCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGCTGGTCACGCCCGA
1089 :     AGTCGTTACTCTAACCTTAGGGAGGAGGGCGCCGAAGGCAGGGCTAGTGACTGGGGTGAA
1090 :     GTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGTGGCTGGATCACCTCCTTTA
1091 :     >Marc.polym_c Marchantia polymorpha chloroplast [fig|3197.1.rna.44]
1092 :     TCTCATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCA
1093 :     AGTCGTACGGGAAGGATCCTAGTGGTGTTTCCAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAG
1094 :     AACCTGCCCTTGGGAGGGGGACAACAGCTGGAAACGGTTGCTAATACCCCATAGGCTGAG
1095 :     GAGCAAAAGGAGGAATCCGCCTAAGGAGGGGCTTGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGT
1096 :     AATAGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGA
1097 :     CTGAGACACGGCCCAGACTCTTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGA
1098 :     AACGTGACGGAGCAATGCCGCGTGGAGGTAGAAGGCTCACGGGTCGTAAACTCCTTTTCT
1099 :     CAGAGAAGATGCAATGACGGTATCTGAGGAATAAGCATCGGCTAACTCTGTGCCAGCAGC
1100 :     CGCGGTAAGACAGAGGATGCAAGCGTTATCCGGAATGATTGGGCGTAAAGCGTCTGTAGG
1101 :     TGGCTTTTTAAGTCCGCCGTCAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGACAGGCGGTGGAAACTA
1102 :     CCAAGCTGGAGTACGGTAGGGGCAGAGGGAATTTCCGGTGGAGCGGTGAAATGCGTAGAG
1103 :     ATCGGAAAGAACACCAATGGCGAAAGCACTCTTCTGGGCCGACACTGACACTGAGAGACG
1104 :     AAAGCTAGGGGAGCAAATGGGATTAGATACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATA
1105 :     CTAAGCGCTGTGCTATCGACCCGTGCAGTGCTGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTG
1106 :     GGGAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGG
1107 :     AGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATGCCGTGAA
1108 :     TCTTTTTGAAAGAAAAGAGTGCCTTCGGGAACGCGGACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGT
1109 :     CAGCTCGTGCCGTAAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCTTGTTTAGT
1110 :     TGCCATCATTAAGTTTGGAACCCTAAACAGACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGAG
1111 :     GATGACGTCAAGTCAGCATGCCCCTTACGCCCTGGGCGACACACGTGCTACAATGGCCGG
1112 :     GACAAAGGGTCGCGACCTCGCGAGAGAAAGCTAACCTCAAAAACCCGGCCTCAGTTCGGA
1113 :     TTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCCATA
1114 :     CGGCGGTGAATCCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACTATGGGAGCTGGCC
1115 :     ATGCCCGAAGTCGTTACTCTAACCGTAAGGAGGGGGGTGCCGAACAGGGGCTAGTGACTG
1116 :     GAGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACTGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCC
1117 :     >Toxo.gondi_p Toxoplasma gondii plastid [fig|5811.1.rna.36]
1118 :     AAATTATTACGAGTTTGATCCTGGCTCCGGAAGAACGCAAGAGATGTGCTTAACACATGC
1119 :     TAATTGAATGGTATTAATATATCATAGTGTAATAGTGAGTAATGTATGAGAATTTATTTT
1120 :     TAGAATATAATAAAAATTTAATAATTTATAATAAACGCAATAGTGTTTTAAAAGATAATT
1121 :     ATTGTCTAAAAAAAAGCTCATATCTAATTAGCTAGTTGGTGAAGTAATAGTTTTACCAAG
1122 :     GCGAAGATTAGTAGCTGCCTTGAGAGGGGAAACAGCCACATAGAGATTGAAATACAGCTC
1123 :     TAACTCCTAAGGGGGGCAGCAGTGGGGAATTTTCTGCCAATAAGCGCAAGCTTGACAGAG
1124 :     CGTCATCACATGAAGGAGGAAGGCCTATAAAGGTTGTAAACTTCTTTTGCTTAAAAAAAT
1125 :     AATACTGACGTTTAAGTTTAAAAAGTATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTCATA
1126 :     CGGGGGATACAAGCGTTTTCCAAAATTACTGGGCGTAAAGTGTATGTAGGTGGATTGGTA
1127 :     TGTTCTTCCTTAAATACTATTTGATAAATTTAGAAAAAGGAAGAAAACTATTAATCTTGA
1128 :     GTTCGATAAGGGTAAGAGGAATTTTTTGAGGAGTAGTGAAATGCGAAGATACAAAAAAGA
1129 :     AGATCAACAGCGAAAGCATCTTACTGGGTCGATACTGACACTGAGATACGAAAGTTAAGG
1130 :     TAGCAAATGGGATTAGATACCCCAGTAGTCTTAACTGTAAACAATGGATACTCGGTACTG
1131 :     GAGACATTAAATATATAAATTCAGTACCCTAGCTAACGCGTTAAGTATTCCGCCTGAGTA
1132 :     GTACGCTCGCAAGGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCTCGTACAAGCGGTGGAGCA
1133 :     CGTAATTTAATTCGATGTAACGCGATAAACCTTACCAGAACTAGACTAAATTTATTTTAA
1134 :     ATTATTAATATTAATTAATAAAAAATTTACAGGAGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGT
1135 :     CGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCTACGAGCGCTACCCTTATTTAAAGTTTTTTATATC
1136 :     TTTAAAAACAGACTATATAAATTTTTGTACTAAATTAGTAGGAAGGAGAGGAAAACGTCA
1137 :     AGTCTTTATGCCCTTTATGTTCTGGGCTACATACGTGCTACAATAGATGGTACAATAATT
1138 :     TTTAAAAATAAATACAATATCAATTTATTTTTAATTTATTTGTGAAAATAAATGTAATAA
1139 :     TTGAAAACCATTTTTAGTTCGGAACATAAACTGCAATTTGTTTATGTAAAGTTGGAATCG
1140 :     CTAGTAATCGCCGGTCAGCATTACGGCGGTGAATAAGTCTTCGAGCCTTGTACACACCGC
1141 :     CCGTCACGCCACGGAAATTGATTATTTTTTAAAACTTTTGATAAAAGGATAAATAATAAT
1142 :     AAATAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCTGTACTGGAAGGTGCTGCTGGATAA
1143 :     >Cyan.calda_c Cyanidium caldarium cyanelle [fig|2771.1.rna.10]
1144 :     ATATTATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC
1145 :     AAGTCGTACGAAAACTTTAATGTTTTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGAATTTG
1146 :     CCCTTAGGAAGAGAATAACGATTGGAAACGATCGCTAATACTCTATATCTCTAAGTTTTA
1147 :     ATTTAGATGAAAAAGATTAGATTTGTACATTGTGTAGATTTAATCTGCCTAAGGAGAAGC
1148 :     TCGCGGCTGATTAGCTAGTTGGTAAGGTAAATGCTTACCAAGGCTATGATCAGTAGCTGG
1149 :     TCTAAGAGGACGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCA
1150 :     GCAGTGGGGAATTTTCTGCAATGGGCGCAAGCCTGACAGAGCAATACCGCGTGAAGGAAG
1151 :     AAGGCCTTAGGGTTGTAAACTTCTTTTGTTAGGGAAGAAATTTTGACGGTACCTAAAGAA
1152 :     TAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGGGATGCAAGCGTTATCC
1153 :     GGAATTATTGGGCGTAAAGCGTTTGTAGGTGGTTTAGCAAGTCTGTTGTTAAATCTTGAG
1154 :     GCTTAACTTCAAACAAGCAAGAGAAACTGCTAGACTAGAGTGTGGTGGAGGCAGAGGGAA
1155 :     TTTCCAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTGGAAAGAACACCAGAAGCGAAAGCGCTT
1156 :     TGCTATACCAAAACTGACACTGAGAAACGAAAGCTAGGGGAGCAAATGGGATTAGATACC
1157 :     CCAGTAGTCCTAGCTGTAAACTATGGATACTAGATGTTGCGTAAAAGATTATGCAGTGTC
1158 :     ATAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGAAGTACGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGG
1159 :     AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGA
1160 :     ACCTTACCAAAGCTTGACATGTTGCGAATTTCTTTAATCAAGAAAGTACCTTTTGGAACG
1161 :     CAAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCC
1162 :     GCAACGAGCGCAACCCTTGTTTTTAGTTGCCACCATTAAGTTGGGAACTTTAAAAAGACT
1163 :     GCCAGTGACAAGCTGGAGGAAGGTGAGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGCTTT
1164 :     GGGCTACACACGTGCTACAATGACTAAGACAACGAGTCGCAAAGTTGTGAAACCTAGCTA
1165 :     ATCTCTTAAACTTAGTCTCAGTTCAGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGACGGA
1166 :     ATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCCACACGGCGGTGAATTTGTTCCCGGGCCTTGTACACA
1167 :     CCGCCCGTCACACCATGGAAGCTGATTGTGCCCGAAGTCGTTTTTTCTCCATAACAATGG
1168 :     TAGTAAGCGCCTAAGGCAAAATTAGTGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACT
1169 :     GGAAGGTGCGGCTGGATTACCTCC
1170 :     >Cyan.merol_c Cyanidioschyzon merolae chloroplast [fig|45157.1.rna.34]
1171 :     CAAAAGAAGCGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC
1172 :     AAGTCGAACGCGCGTAAGTGGCGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGAATCTGCCCCT
1173 :     AGGAGTTGGATAAGGCTTGGAAACGAGCGCTAAACCAACATATAAGGAAAGGAGAGATCG
1174 :     CCTAGGGAAGAGCTCGCGGCTGATTAGCTAGTTGGTAGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGAT
1175 :     GATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT
1176 :     CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCTGCAATGGGCGAAAGCCTGACAGAGCAATAC
1177 :     CGCGTGAGGGATGAAGGCCTTAGGGTTGTCAACCTCTTTTGATGGGGAAGAATAGATGAC
1178 :     GGTACCCATAGAAAAAGCATCGGCAAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGGGGGAT
1179 :     GCAAGCGTTATCCGGAATCACTGGGCGTAAAGCGTCTGTAGGTGGTGATGCAAGTCACTG
1180 :     GTGCAAAACTCTGGCTCAACCGGAGGAAAGCCAGTGAAACTGCATGACTAGAGTGTGGGA
1181 :     GAGGTAGAAGGAATTCCCTGAGTAGCGGTGAAATGCGTAGATACAGGGAAGAACACCGGA
1182 :     GGCGAAAGCGTTCTACTGGAACACAACTGACACTGAGAGACGAAAGCTAGGGGAGCGAAT
1183 :     GGGATTAGATACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGACGTTGGCCTAAGC
1184 :     CAGTGTCGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGAAGTACGCTCGCAAGAGTGAAAC
1185 :     TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAAC
1186 :     GCGAAGAACCTTACCAGTACTTGACATGTGGTGAAGTGACCTTAATGGGTCACAAGGACG
1187 :     GCAACGTCCACACCAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
1188 :     GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCTTTAGTTAAAGTATCTAGAGAGACTGC
1189 :     CGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGAGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTACTGG
1190 :     GCGACACACGTGCTACAATGGCGCAGACAAACAGTGAATCTGAGAAACTGCGCCCAAGTT
1191 :     CAGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGC
1192 :     CATACGGCGGTGAATCCGTACCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGCT
1193 :     GGCCATGCCCGAAGTGATGTTACCATCCCCACGGCAGGGCTAGTGACTGGGGTGAAGTCG
1194 :     TAACAAGGTAGCCGTACTGGAAGGTGCGGCTGGATTACCTCC
1195 :     >Eugl.graci_c Euglena gracilis chloroplast [fig|3039.1.rna.49]
1196 :     TGGAAATGACGAGTTTGATCCTTGCTCAGGGTGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC
1197 :     AAGTTGAACGAAATTACTAGCAATAGTAATTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAATATGTAAG
1198 :     AATCTGCGCTTGGGTGAGGAATAACAGATGGAAACGTTTGCTAATGCCTCATAATTTACT
1199 :     AGATCTATGTGAGTAGCTAGTTAAAGAGAATTTCGCCTAGGCATGAGCTTGCATCTGATT
1200 :     AGCTTGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGATTTGAGAGGATG
1201 :     ATCAGCCACACTGGGATTGAGAACGGAACAGACTTTTACGGAAGGCAGCAGTGAGGAATT
1202 :     TTCCGCAATGGGCGCAAGCCTGACGGAGCAATACCGCGTGAAGGAAGAAGGCCTTTGGGT
1203 :     TGTAAACTTCTTTTCTCAAAGAAGAAGAAATGACGGTATTTGAGGAATAAGCATCGGCTA
1204 :     ATTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGAGATGCGAGCGTTATCCGGAATTATTGGGC
1205 :     GTAAAGAGTTTGTAGGCGGTCAAGTGTGTTTAATGTTAAAAGTCAAAGCTTAACTTTGGA
1206 :     AGGGCATTAAAAACTGCTAGACTTGAGTATGGTAGGGGTGAAGGGAATTTCCAGTGTAGC
1207 :     GGTGAAATGCGTAGAGATTGGAAAGAACACCAATGGCGAAGGCACTTTTCTAGGCCAATA
1208 :     CTGACGCTGAGAAACGAAAGCTGAGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCTTGG
1209 :     CCGTAAACTATGGATACTAAGTGGTGCTGAAAGTGCACTGCTGTAGTTAACACGTTAAGT
1210 :     ATCCCGCCTGGGGAGTACGCTTGCACAAGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA
1211 :     CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACACGAAGAACCTTACCAGGATTTGAC
1212 :     AGGATCTAGGAGGAAGTTTGAAAGAACGCAGTACCTTCGGGTATCTAGACACAGGTGGTG
1213 :     CATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACCCTTTTTTTT
1214 :     AATTAACGCTTGTCATTTAGAAATACTGCTGGTTATTACCAGAGGAAGGTGAGGACGACG
1215 :     TCAAGTCATCATGCCCCTTATATCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTAAGACAATA
1216 :     AGTTGCAATTTTGTGAAAATGAGCTAATCTTAAAACTTAGCCTAAGTTCGGATTGTAGGC
1217 :     TGAAACTCGCCTACATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCTATACGGCGGTG
1218 :     AATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGAAGTTGGCTGTGCCCGA
1219 :     AGTTATTATCTTGCCTGAAAAGAGGGAAATACCTAAGGCCTGGCTGGTGACTGGGGTGAA
1220 :     GTCGTAACAAGGTAGCCGTACTGGAAGGTGTGGCTGGAACAATT
1221 :     >Borr.burg Borrelia burgdorferi B31 [gi|15594346 c446118-444581]
1222 :     AAATAACGAAGAGTTTGATCCTGGCTTAGAACTAACGCTGGCAGTGCGTCTTAAGCATGC
1223 :     AAGTCAAACGGGATGTAGCAATACATTCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGATGAT
1224 :     CTACCTATGAGATGGGGATAACTATTAGAAATAGTAGCTAATACCGAATAAGGTCAGTTA
1225 :     ATTTGTTAATTGATGAAAGGAAGCCTTTAAAGCTTCGCTTGTAGATGAGTCTGCGTCTTA
1226 :     TTAGCTAGTTGGTAGGGTAAATGCCTACCAAGGCAATGATAAGTAACCGGCCTGAGAGGG
1227 :     TGAACGGTCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGCTAAGA
1228 :     ATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCGACACTGCGTGAATGAAGAAGGTCGAAA
1229 :     GATTGTAAAATTCTTTTATAAATGAGGAATAAGCTTTGTAGGAAATGACAAAGTGATGAC
1230 :     GTTAATTTATGAATAAGCCCCGGCTAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAAGGG
1231 :     GCGAGCGTTGTTCGGGATTATTGGGCGTAAAGGGTGAGTAGGCGGATATATAAGTCTATG
1232 :     CATAAAATACCACAGCTCAACTGTGGACCTATGTTGGAAACTATATGTCTAGAGTCTGAT
1233 :     AGAGGAAGTTAGAATTTCTGGTGTAAGGGTGGAATCTGTTGATATCAGAAAGAATACCGG
1234 :     AGGCGAAGGCGAACTTCTGGGTCAAGACTGACGCTGAGTCACGAAAGCGTAGGGAGCAAA
1235 :     CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCTACGCTGTAAACGATGCACACTTGGTGTTAACTAAAA
1236 :     GTTAGTACCGAAGCTAACGTGTTAAGTGTGCCGCCTGGGGAGTATGCTCGCAAGAGTGAA
1237 :     ACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGAT
1238 :     ACGCGAGGAACCTTACCAGGGCTTGACATATATAGGATATAGTTAGAGATAATTATTCCC
1239 :     CGTTTGGGGTCTATATACAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCTGTGAGGTGTTG
1240 :     GGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTATCTGTTACCAGCATGTAATGGTGGGGA
1241 :     CTCAGATAAGACTGCCGGTGATAAGTCGGAGGAAGGTGAGGATGACGTCAAATCATCATG
1242 :     GCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCTGTACAAAGCGAAGCGAAACAG
1243 :     TGATGTGAAGCAAAACGCATAAAGCAGGTCTCAGTCCGGATTGAAGTCTGAAACTCGACT
1244 :     TCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTATATCAGAATGATACGGTGAATACGTTCTCGG
1245 :     GCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACCCGAGTTGAGGATACCCGAAGCTATTATTCTA
1246 :     ACCCGTAAGGGAGGAAGGTATTTAAGGTATGTTTAGTGAGGGGGGTGAAGTCGTAACAAG
1247 :     GTAGCCGTACTGGAAAGTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
1248 :     >Trep.dent Treponema denticola ATCC 35405 [gi|42516522 610184-611729]
1249 :     ATGATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGCGTCTTAAGCATGCAAGTCGAACGGT
1250 :     AAGGGAGAGCTTGCTCTCCCCTAGAGTGGCGGACTGGTGAGTAACGCGTGGGTGACCTGCCCTGAAGATG
1251 :     GGGATAGCTAGTAGAAATATTAGATAATACCGAATGTGCTCATTTACATAAAGGTAAATGAGGAAAGGAG
1252 :     CTACGGCTCCGCTTCAGGATGGGCCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCCCACCAAGGCAA
1253 :     CGATGGGTATCCGGCCTGAGAGGGTGAACGGACACATTGGGACTGAGATACGGCCCAAACTCCTACGGGA
1254 :     GGCAGCAGCTAAGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCGACGCCGTGTGAATGAAGAAGGCC
1255 :     GAAAGGTTGTAAAATTCTTTTGCAGATGAAGAATAAGAAGAAGAGGGAATGCTTCTTTGATGACGGTAGT
1256 :     CATGCGAATAAGCCCCGGCTAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAACACGTAAGGGGCGAGCGTTGTTCGG
1257 :     AATTATTGGGCGTAAAGGGTATGTAGGCGGTTAGGTAAGCCTGGTGTGAAATCTACGAGCTCAACTCGTA
1258 :     AACTGCATTGGGTACTGCTTGACTTGAATCACGGAGGGGAAACCGGAATTCCAAGTGTAGGGGTGGAATC
1259 :     TGTAGATATTTGGAAGAACACCGGTGGCGAAGGCGGGTTTCTGGCCGATGATTGACGCTGATATACGAAG
1260 :     GTGCGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCGCACAGTAAACGATGTACACTAGGTGTCGGGG
1261 :     CAAGAGCTTCGGTGCCGACGCAAACGCATTAAGTGTACCGCCTGGGAAGTATGCCCGCAAGGGTGAAACT
1262 :     CAAAGGAATTGACGGGGGCCCACACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAGAAACCT
1263 :     TACCTGGGTTTGACATCAAGAGCAATGACATAGAGATATGGCAGCGTAGCAATACGGCTCTTGACAGGTG
1264 :     CTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTACTG
1265 :     CCAGTTACTAACAGGTAAAGCTGAGGACTCTGGCGGAACTGCCGATGACAAATCGGAGGAAGGTGGGGAT
1266 :     GACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGCTACAAATCGAAGC
1267 :     GACACCGCGAGGTCAAGCAAAACGCAAAAAAGCAATCGTAGTCCGGATTGAAGTCTGAAACTCGACTTCA
1268 :     TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGCACATCAGCACGGTGCGGTGAATACGTTCCTGGGCCTTGTACACAC
1269 :     CGCCCGTCACACCATCCGAGTCGAGGGTACCCGAAGTCGCTAGTCTAACCCGTAAGGGAGGACGGTGCCG
1270 :     AAGGTACGTTTGGTAAGGAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCT
1271 :     CCTTTC
1272 :     >Lept.inter Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 [fig|267671.1.rna.20]
1273 :     AACACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACTAACGCTGGCGGCGCGTCTTAAACATGCAA
1274 :     GTCAAGCGGAGTAGCAATACTCAGCGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGGTAATCTTCCT
1275 :     CTGAGTCTGGGATAACTTTCCGAAAGGGAAGCTAATACTGGATGGTCCCGAGAGATCATA
1276 :     AGATTTTTCGGGTAAAGATTTATTGCTCGGAGATGAGCCCGCGTCCGATTAGCTAGTTGG
1277 :     TGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGTTCGGCCACA
1278 :     ATGGAACTGAGACACGGTCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTTAAGAATCTTGCTCAAT
1279 :     GGGGGGAACCCTGAAGCAGCGACGCCGCGTGAACGATGAAGGTCTTCGGATTGTAAAGTT
1280 :     CAGTAAGCAGGGAAAAATAAGCAGCAATGTGATGATGGTACCTGCCTAAAGCACCGGCTA
1281 :     ACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATCATTGGGC
1282 :     GTAAAGGGTGCGTAGGCGGACATGTAAGTCAGGTGTGAAAACTGCGGGCTCAACTCGCAG
1283 :     CCTGCACTTGAAACTATGTGTCTGGAGTTTGGGAGAGGCAAGTGGAATTCCAGGTGTAGC
1284 :     GGTGAAATGCGTAGATATCTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTGCTGGCCTAAAA
1285 :     CTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGTAGTGAACGGGATTAGATACCCCGGTAATCCACG
1286 :     CCCTAAACGTTGTCTACCAGTTGTTGGGGGTTTTAACCCTCAGTAACGAACCTAACGGAT
1287 :     TAAGTAGACCGCCTGGGGACTATGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGT
1288 :     CCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAAAAACCTCACCTAGGC
1289 :     TTGACATGGAGTGGAATCATGTAGAGATACATGAGCCTTCGGGCCGCTTCACAGGTGCTG
1290 :     CATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
1291 :     CTCACCTTATGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCGTAAGGAACTGCCGGTGACAAACCG
1292 :     GAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCCTCATGGCCTTTATGTCTAGGGCAACACACGTGC
1293 :     TACAATGGCCGGTACAAAGGGTAGCCAACTCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAAAAATCCGG
1294 :     TCCCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGC
1295 :     GGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGACCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAC
1296 :     CTGAGTGGGGAGCACCCGAAGTGGTCTTTGCCAACCGCAAGGAAGCAGACTACTAAGGTG
1297 :     AAACTCGTGAAGGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATC
1298 :     ACCTCCTTT
1299 :     >Amin.colom Aminobacterium colombiense [TTCGGCTTAGA,gi|4079807]
1300 :     TTCGGCTTAGA
1301 :     GTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCTTGTTTAACACATGCAAGTTGTACGGG
1302 :     ACGGATATTGAAGCGACTTTTCGGAGTGGTGGATATATTTGTTTAGTAGCGGACGGGTGA
1303 :     GTAATGCATGAGAACCTGCCCTTCAGAGGGGGACAACAGTTGGAAACGGTTGCTAATACC
1304 :     CCATATGCCGAGAGGTGAAAGGAGCGATCCGCTGAAGGAGTGGCTCATGTCCTATCAGCT
1305 :     AGTTGGTGAGGTAAGTGCTCACCAAGGCGATGACGGGTACCCGGCCTGAAAGGGCGACCG
1306 :     GCCACACTGGAACTGAGATACGGTCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTG
1307 :     GGCAATGGGCGGAACCTGACCCACCGACGCCGCGTGAGGGAAGAAGGCCTTTGGNTCGTA
1308 :     AACCTCTGTTGTATGGGAAGAAGGAAGTGACGGTACCATACGAGGAAGTCCCGGCTAACT
1309 :     ACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGACGAGCGTTGTCCGGAATTATCGGGCGTA
1310 :     AAGGGCGCGCAGGCGGATATTTAAGTCAGCTGTTAAAGTCATGGGCTCAACTCATGGATG
1311 :     CGGTTGAAACTGGGTATTTAGAGTGCTGGAGAGGTAGGCGGAATTCCCGGTGTAGCGGTG
1312 :     AAATGCGTAGATATCGGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTACTGGCCAGCAACTGA
1313 :     CGCTGAGGCGCGAAAGCCAGGGGAGCGAACGGGATTAGATACCCCGGTAGTCCTGGCCGT
1314 :     AAACGATGAATGCTAGGTGTGGGTGTCGAGAGGCATCCGTGCCGGAGTTAACGCGATAAG
1315 :     CATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGC
1316 :     ACAAGCGGTGGAGCACGTGGTTTAATTCGATGCAAACCGAAGAACCTTACCTAGGTTTGA
1317 :     CATGTACGTGGTACGGATCTGAAAGGAGAAGGACCTAGCCTTCGGGCAAGGAGCGTACAC
1318 :     AGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGA
1319 :     GCGCAACCCCTGCATCCAGTTACCATCGAGTGAAGTCGGGGACTCTGGATGGACTGCCAA
1320 :     CGACAAGCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTATGCCTAGGGCG
1321 :     ACACACGTGCTACAATGGCCGATACAGCGGGAAGCTAGCCTGCGAAGGTATGTGGATCCC
1322 :     ACAAAGTCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGTGTGCAACTCGACTGCATGAAGGAGGAATCGC
1323 :     TAGTAATCGCGGATCAGCCAAGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCC
1324 :     CGTACACCACCCGAGTTGGGTGCACCCGAAGCCGGAGGCTTAACCTTTCGAGGAAGGATC
1325 :     CGTCTAAGGTGTGTCTGGTGAGGGGGGTGAANTCGTAACAAGGTAGCCGTACCGGAAGGT
1326 :     GCGGCTGGATCACCTCCNT
1327 :     >Anae.mobil Anaerobaculum mobile [gi|14494874, trimmed]
1328 :     TTCGGCTTAGAGTTGGATCCTGGCTCAGGACG
1329 :     AACGCTGGCGGCGCGCTTAACACATGCAAGTCGTGCGGTGTCGAAGGCAAGTCTTACGACAAGCCTTCGA
1330 :     CACAGCGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGTAGCTGTCCTAAGGAGGGGGATAACGCCTGGAAACGGGT
1331 :     GCTAATACCCCATATGCCTCGCAAGAGGTGAAAGTGTACTTGTTACAGCCTTAGGGTGTGCTCGCGGCCT
1332 :     ATCAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCTAAGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGTACGGCC
1333 :     ACACTGGAATTGAGATACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGGGCAATGGGCGAA
1334 :     AGCCTGACCCAGCGACGCCGCGTTGGGGATGAAGCCCTTCGGGGCGTAAACCCATGTTGTAGGGGACGAA
1335 :     GAAAGTGACGGTACCCTACGAGAAAGCCCTGGCCAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAAACGTAGGGGG
1336 :     CGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCACGCAGGCGGTACGCCAAGTCGGGGGTGTAAAGTTA
1337 :     CGGCTCAACCGTGACCTTGCAATCGATACTGGCGTACTGGAGTGCGGGAGAGGGAAGTGGAATTCCCGGT
1338 :     GTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACGCCAGTGGCGAAGGCGGCTTCCTGGCCCGCGACTGAC
1339 :     GCTCATGTGCGAAAGCCAGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCCGTAAACGATGGGT
1340 :     GCTAGGTGTAGGCGCGTCAAGCGTCTGTGCCGCAGTTAACGCGATAAGCACCTCGCCTGGGGAGTACGGT
1341 :     CGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCACGTGGTTTAATTCGATG
1342 :     CAAACCGAAGAACCTTACCTGGGTTTGACATGCAGGTGGTACGAGCCTGAAAGGGCGAGGACCGCATCTT
1343 :     CGGATGCGGAGCCTGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC
1344 :     CGCAACGAGCGCAACCCCTGCGCCTAGTTGCCATCAGTTAGGCTGGGCACTCTAGGCGGACTGCCGGCGA
1345 :     CAAGTCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCTTTAAGCCCAGGGCGACACACGTGCTAC
1346 :     AATGGCCAGCACAGAGGGCTGCAAGTCCGCGAGGACAAGCGAATCCCTTAAAGCTGGTCTCAGTTCGGAT
1347 :     TGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGCCGGTCAGCCATACGGCGGTGAAT
1348 :     ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACCCGAGTTGGGTGCTCCCGAAGCCGCCGGCCCA
1349 :     ACCCCGTAAGGGGAGGGAGGCGTCGAAGGAGTGTCTGATAAGGGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGT
1350 :     ACCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
1351 :     >Ther.tengc Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 [fig|273068.3]
1352 :     GATTAGCTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
1353 :     CAAGTCGAGCGGGCCTGTCAAGGCGTTATGTTTTGGCAGGTTAAGCGGCGGACGGGTGAG
1354 :     TAACGCGTGAGCAACCTACCCTTGAGACAGGGATAACCCTGGGAAACCGGGGCTAATACC
1355 :     TGATATACTCTATTAGGGCATCCTGATGGAGGAAAGGGCGGGAAGCCGCTCAAGGATGGG
1356 :     CTCGCGTCCCATCAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCTACGACGGGTAGCCG
1357 :     GCCTGAGAGGGTGGTCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
1358 :     AGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCGACGCCGCGTGAGCGAA
1359 :     GAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCGATAGTGTGGGAAGAAGGGATGACGGTACCACACGA
1360 :     AAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCG
1361 :     GAGTTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTTAGCAAGTCAGGTGTAAAAGGCCACGG
1362 :     CTCAACCGTGGATATGCATCTGAAACTGCTGAGCTAGAGGGCAGGAGAGGGGAGTGGAAT
1363 :     TCCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAATACCAGTGGCGAAGGCGACTC
1364 :     CCTGGACTGGCCCTGACGCTGAGGCGCGAGAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCC
1365 :     TGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGGGTGCTAGGTGTGGGGAGCGGAAGCTTTCCGTGCCG
1366 :     TAGGAAACCCAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGA
1367 :     ATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAA
1368 :     CCTTACCAGGGCTTGACATGCAGGTAGTAGCGAGCCGAAAGGTGAGCGACCCTTTCTTAT
1369 :     GGGAGGGAGCCTGCACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGG
1370 :     TTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGCCTCTAGTTGCCATCGGGTAAAGCCGGGCACT
1371 :     CTAGAGGGACTGCCGTCGACAAGACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCC
1372 :     CTATATGCCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGAAGCGAAGGAGCG
1373 :     ATCCGGAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGC
1374 :     ATGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATGCGTTCCCGGGC
1375 :     CTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTCTGCAACACCCGAAGCCGGTGGCCCAAC
1376 :     CCGAAGAGGGAGGGAGCCGTCGAAGGTGGGGCAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGG
1377 :     TAGCCGTACGGGAACGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
1378 :     >Ther.xylan Thermoanaerobacterium xylanolyticum [ATRAACATGAGA,gi|349572]
1379 :     ATRAACATGAGA
1380 :     GTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGAT
1381 :     CCGGCACTCAACTAAGCGCTTACAGNTTTNTNAGACAGCNAAGAGAGNAGTAAGCAGTTT
1382 :     NNAGAGAGAAATAAGAGTAAACGCGGAGTTGAGTGCCGGATAGCGGCGGACGGGTGAGTA
1383 :     ACGCGTGGACAATCTACCCTGTAGACTGGGATAACACCCCGAAAGGGGTGCTAATACCGG
1384 :     ATAATGTCAAGTAATGGCATCATTGCTTGAAGAAAGGAGAAATCCGCTATAGGATGAGTC
1385 :     CGCGTCCCATTAGCTAGTTGGCGGGGTAAAAGCCCACCAAGGCGACGATGGGTAGCCGGC
1386 :     CTGAGAGGGTGATCGNCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
1387 :     CAGTGGGGAATATTGTTCAATGGGGGAAACCCTGACACAGCGACNCCGCGTGAGCGAAGA
1388 :     AGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCAATAGTATGGGAAGATAATGACGGTACCATACGAAAGC
1389 :     CCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAAT
1390 :     TACTGGGCGTAAAGAGCACGTAGGCGGCTATAAAAGTCAGATGTGAAAAACCTGGGCTCA
1391 :     ACCGAGGGTATGCATCTGAAACTAAATAGCTTGAGTCAAGGAGAGGAGAGCGGAATTCCT
1392 :     GGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCAGGAAGAATACCAGTGGCGAAAGCGGCTCTCTG
1393 :     GACTTGAACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGT
1394 :     AGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTGGGTTAGTATAATCCGTGCCGGAGTTAA
1395 :     CGCAATAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACG
1396 :     GGGGCCCGCACAAGCAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACC
1397 :     AGGGCTTGACATCCACAGAATCCGGTAGAAATACCGGAGTGCCTCGAAAGAGGAGCTGTG
1398 :     AGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCA
1399 :     ACGAGCGCAACCCCTGTTGGTAGTTACCAGCGTAAAGGCGGGGACTCTACCGAGACTGCC
1400 :     GTGGATAACACGGAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTTTATGCCCTGGG
1401 :     CTACACACGTGCTACAATGGCCTGAACAGAGGGCAGCGAAGGAGCGATCCGGAGCGAATC
1402 :     CCAGAAAACAGGTCCCAGTTCAGATTGCAGGCTGCAACCCGCCTGCATGAAGACGGAGTT
1403 :     GCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGC
1404 :     CCGTCACACCACGAGAGTTTACAACACCCGAAGTCAGTGACCTAACCGCAAGGAAGGAGC
1405 :     TGCCGAAGGTGGGGTAAATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCCCATCGGAAGGT
1406 :     GCGGCTGGATCACCTCCTTTC
1407 :     >Deha.ethen Dehalococcoides ethenogenes 195 [gi|57233530 c929873-928439]
1408 :     TTGAGCTTGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCGTGCCTTATGCATG
1409 :     CAAGTCGAACGGTCTTAAGCAATTAAGATAGTGGCAAACGGGTGAGTAACGCGTAAGTAA
1410 :     CCTACCTCTAAGTGGGGGATAGCTTCGGGAAACTGAAGGTAATACCGCATGTGATGGGCT
1411 :     GACATAAGTCGGTTCATTAAAGCCGCAAGGTGCTTGGTGAGGGGCTTGCGTCCGATTAGC
1412 :     TAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGGCTTCGATCGGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATC
1413 :     AGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGCAAGGAATCTT
1414 :     GGGCAATGGGCGAAAGCCTGACCCAGCAACGCCGCGTGAGGGATGAAGGCTTTCGGGTTG
1415 :     TAAACCTCTTTTCACAGGGAAGAATAATGACGGTACCTGTGGAATAAGCTTCGGCTAACT
1416 :     ACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGAAGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTA
1417 :     AAGTGAGCGTAGGTGGTCTTTCAAGTTGGATGTGAAATTTCCCGGCTTAACCGGGACGTG
1418 :     TCATTCAATACTGTTGGACTAGAGTACAGCAGGAGAAAACGGAATTCCCGGTGTAGTGGT
1419 :     AAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGAGGCGAAGGCGGTTTTCTAGGTTGTCACTG
1420 :     ACACTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGAATTAGATACTCTGGTAGTCCACGCCT
1421 :     TAAACTATGGACACTAGGTATAGGGAGTATCGACCCTCTCTGTGCCGAAGCTAACGCTTT
1422 :     AAGTGTCCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCC
1423 :     CGCACAAGCAGCGGAGCGTGTGGTTTAATTCGATGCTACACGAAGAACCTTACCAAGATT
1424 :     TGACATGCATGAAGTAGTGAACCGAAAGGGAAACGACCTGTTAAGTCAGGAGTTTGCACA
1425 :     GGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTTGGTTAAGTCCTGCAACGAG
1426 :     CGCAACCCTTGTTGCTAGTTAAATTTTCTAGCGAGACTGCCCCGCGAAACGGGGAGGAAG
1427 :     GTGGGGATGACGTCAAGTCAGCATGGCCTTTATATCTTGGGCTACACACACGCTACAATG
1428 :     GACAGAACAATAGGTTGCAACAGTGTGAACTGGAGCTAATCCCCAAAGCTGTCCTCAGTT
1429 :     CGGATTGCAGGCTGAAACCCGCCTGCATGAAGTTGGAGTTGCTAGTAACCGCATATCAGC
1430 :     AAGGTGCGGTGAATACGTTCTCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACGTCATGAAAGCCG
1431 :     GTAACACTTGAAGTCGATGTGCCAACCGCAAGGAGGCAGTCGCCGAGGGTGGGACTGGTA
1432 :     ATTGGGACGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGCGGAAGCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
1433 :     >Baci.subti Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 [fig|224308.1]
1434 :     TTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCA
1435 :     AGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACAC
1436 :     GTGGGTAACCTGCCTGTAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGG
1437 :     TTGTTTGAACCGCATGGTTCAAACATAAAAGGTGGCTTCGGCTACCACTTACAGATGGAC
1438 :     CCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGA
1439 :     CCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCA
1440 :     GCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATG
1441 :     AAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTACCGTTCGAATAGGGC
1442 :     GGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTA
1443 :     ATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTTC
1444 :     TTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACT
1445 :     TGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGA
1446 :     GGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGT
1447 :     GGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTG
1448 :     TTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGT
1449 :     ACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATG
1450 :     TGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCCT
1451 :     AGAGATAGGACGTCCCCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTC
1452 :     GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAG
1453 :     CATTCAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGAC
1454 :     GTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGACAGAACAAA
1455 :     GGGCAGCGAAACCGCGAGGTTAAGCCAATCCCACAAATCTGTTCTCAGTTCGGATCGCAG
1456 :     TCTGCAACTCGACTGCGTGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGT
1457 :     GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCG
1458 :     AAGTCGGTGAGGTAACCTTTTAGGAGCCAGCCGCCGAAGGTGGGACAGATGATTGGGGTG
1459 :     AAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1460 :     >Mycp.hyopn Mycoplasma hyopneumoniae 7448 [fig|262722.3.rna.33]
1461 :     GCAATCATGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATAAACGCTAGCTGTGTGCTTAATACATGC
1462 :     ATGTTGAACGGAATATTTTAGTTCGCTAAAATATTTAGTAGCAAATGGGTGAGTAACACG
1463 :     TACCTAACCTACCTTTTGGACTGGGATAACCATTGGAAACAGTGGCTAATACCGGATATG
1464 :     ATAAAAATTTGCATGAATTTTTATTCAAAGGAGCCTTCAAGCTTCACCAAGAAATGGGGG
1465 :     TGCGCAACATTAGTTAGTTGGTAGGGTAAAAGCCTACCAAGACGATGATGTTTAGCGGGG
1466 :     CCAAGAGGTTGTACCGCCACACTGGGATTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
1467 :     CAGTAAGGAATATTCCACAATAAGCGAAAGCTTGATGGAGCGACACAGCGTGCAGGATGA
1468 :     AGTCTTTCGGGATGTAAACTGCTGTTGTAAGGGAAGAAAAAACTAGATAGGAAATGCTCT
1469 :     AGTCTTGACGGTACCTTATTAGAAAGCGACGGCAAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT
1470 :     ACATAGGTCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGTCCGTAGGTTTTTTGTT
1471 :     AAGTTTAAAGTTAAATGCTAAAGCTCAACTTTAGTCCGCTTTAGATACTGGCAAAATAGA
1472 :     ATTATGAAGAGGTTAGCGGAATTCCTAGTGGAGTGGTGGAATACGTAGATATTAGGAAGA
1473 :     ACACCAATAGGCGAAGGCAGCTAACTGGTCATATATTGACACTAAGGGACGAAAGCGTGG
1474 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATCATTAGTTGGT
1475 :     GGCAAAAGTCACTAACACAGCTAACGCGTTAAATGATCCGCCTGAGTAGTATGCTCGCAA
1476 :     GAGTGAAACTTAAAGGAATTGACGGGAACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATT
1477 :     TGATGTTACGCGTAGAACCTTACCCACTCTTGACATTCTCGCAAAACTATAGAGATATAG
1478 :     CCGAGGCTAACGAGATCACAGATGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
1479 :     AGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCTTTTCTTTAGTTGCTAACATTTAGTTGAGAAC
1480 :     CCTAAAGATACTGCCGGCGCAAGCCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCC
1481 :     TCTTACGAGTGGGGCAACACACGTGCTACAATGGCTACTACAAAGAGCAGCAAAACAGTG
1482 :     ATGTCAAGCTAATCTCAAAAAAGTAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTC
1483 :     ATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCTATACTGCGGTGAATACGTTCTCGGG
1484 :     TTTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTAATGCCCAAAGTCGGTGAGTTAA
1485 :     CTTCGGAGACCATTGCCTAAGGCAGGACCGATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTATC
1486 :     CCTACGAGAACGTGGGGATGGAACACCTCCTTTCT
1487 :     >Myco.capr Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 [gi|83319253 464430-465954]
1488 :     TAAAATGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATAAACGCTGGCGGCATGCCTAATACATGCAAGTCGAACGGG
1489 :     GGTGCTTGCACCTCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTATCTAACCTACCTTATAGCGGGGGATAACTT
1490 :     TTGGAAACGAAAGATAATACCGCATGTAGATCTTATTATCGCATGAGAAAAGATCAAAAGAACCGTTTGG
1491 :     TTCACTATGAGATGGGGATGCGGCGTATTAGCTAGTAGGTGAGATAATAGCCCACCTAGGCGATGATACG
1492 :     TAGCCGAACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCA
1493 :     GTAGGGAATTTTTCACAATGGACGAAAGTCTGATGAAGCAATGCCGCGTGAGTGATGACGGCCTTCGGGT
1494 :     TGTAAAGCTCTGTTGTAAGGGAAGAAAAAATAGAGTAGGAAATGACTTTATCTTGACAGTACCTTACCAG
1495 :     AAAGCCACGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTG
1496 :     GGCGTATAGGGTGCGTAGGCGGTTTTGCAAGTTTGAGGTTAAAGTCCGGAGCTCAACTCCGGTTCGCCTT
1497 :     GAAGACTGTTTTACTAGAATGCAAGAGAGGTAAGCGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATAT
1498 :     ATGGAAGAACACCTGTGGCGAAAGCGGCTTACTGGCTTGTTATTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGA
1499 :     GCAAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTACTAAGTGTTGGGGTAACTCAGC
1500 :     GCTGCAGCTAACGCATTAAGTACTCCGCCTGAGTAGTATGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGGAATTGAC
1501 :     GGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACACGAAGAACCTTACCAGGGCTTGA
1502 :     CATCCAGTGCAAAGCTATAGAGATATAGTAGAGGTTAACATTGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAG
1503 :     TTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAACGCAACCCTTGTCGTTAGTTACTAACATTAAG
1504 :     TTGAGAACTCTAACGAGACTGCTAGTGTAAGCTAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCC
1505 :     TTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCTGGTACAAAGAGTTGCAATCCTGTGAAGGGGAGCTAA
1506 :     TCTCAAAAAACCAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAAGCCGGAATCACTAGTAA
1507 :     TCGCGAATCAGCTATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAG
1508 :     TTGGTAATACCAGAAGTAGGTAGCTTAACCATTTGGAGAGCGCTTCCCAAGGTAGGACTAGCGATTGGGG
1509 :     TGAAGTCGTAACAAGGTATCCGTACGGGAACGTGCGGATGGATCACCTCCTTTCT
1510 :     >Myco.pneum Mycoplasma pneumoniae M129 [gi|13507739 118312-119824]
1511 :     ATTTTTCTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTGGCGGCATGCCTAATACATGC
1512 :     AAGTCGATCGAAAGTAGTAATACTTTAGAGGCGAACGGGTGAGTAACACGTATCCAATCT
1513 :     ACCTTATAATGGGGGATAACTAGTTGAAAGACTAGCTAATACCGCATAAGAACTTTGGTT
1514 :     CGCATGAATCAAAGTTGAAAGGACCTGCAAGGGTTCGTTATTTGATGAGGGTGCGCCATA
1515 :     TCAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCAATGACGTGTAGCTATGCTGAGAAGT
1516 :     AGAATAGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGA
1517 :     ATTTTTCACAATGAGCGAAAGCTTGATGGAGCAATGCCGCGTGAACGATGAAGGTCTTTA
1518 :     AGATTGTAAAGTTCTTTTATTTGGGAAGAATGACTTTAGCAGGTAATGGCTAGAGTTTGA
1519 :     CTGTACCATTTTGAATAAGTGACGACTAACTATGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACATAGG
1520 :     TCGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCAAGCGCAGGCGGATTGAAAAGTCTG
1521 :     GTGTTAAAGGCAGCTGCTTAACAGTTGTATGCATTGGAAACTATTAATCTAGAGTGTGGT
1522 :     AGGGAGTTTTGGAATTTCATGTGGAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGAAGGAACACCAG
1523 :     TGGCGAAGGCGAAAACTTAGGCCATTACTGACGCTTAGGCTTGAAAGTGTGGGGAGCAAA
1524 :     TAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACACCGTAAACGATAGATACTAGCTGTCGGGGCGAT
1525 :     CCCCTCGGTAGTGAAGTTAACACATTAAGTATCTCGCCTGGGTAGTACATTCGCAAGAAT
1526 :     GAAACTCAAACGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTTGCTTAATTCGA
1527 :     CGGTACACGAAAAACCTTACCTAGACTTGACATCCTTGGCAAAGTTATGGAAACATAATG
1528 :     GAGGTTAACCGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG
1529 :     GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCGTTAGTTACATTGTCTAGCGAGACTGCTA
1530 :     ATGCAAATTGGAGGAAGGAAGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTAGGGCT
1531 :     GCAAACGTGCTACAATGGCCAATACAAACAGTCGCCAGCTTGTAAAAGTGAGCAAATCTG
1532 :     TAAAGTTGGTCTCAGTTCGGATTGAGGGCTGCAATTCGTCCTCATGAAGTCGGAATCACT
1533 :     AGTAATCGCGAATCAGCTATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCC
1534 :     GTCAAACTATGAAAGCTGGTAATATTTAAAAACGTGTTGCTAACCATTAGGAAGCGCATG
1535 :     TCAAGGATAGCACCGGTGATTGGAGTTAAGTCGTAACAAGGTACCCCTACGAGAACGTGG
1536 :     GGGTGGATCACCTCCTTT
1537 :     >Mycp.penet Mycoplasma penetrans HF-2 [fig|272633.1.rna.32]
1538 :     GTCAATTTTAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTAGCGGGATGCCTAATACATG
1539 :     CAAGTCGGACGAAGCACTTGTGCTTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTATCTAACATA
1540 :     CCTTTTAGTGGGGGATAACTGGTTGAAAAACTAGCTAATACCGCATAGGACATTACTATC
1541 :     GCATGAGAAAATGTTTAAAGTTGCGTTTGCAACGCTTTAAGATTGAGGTGTGGCATATCA
1542 :     GATAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGTCTATGACGTGTAGCTGTGCTGAGAGGCAAA
1543 :     ACAGCCACAATGGAACTGAGACACGGTCCATACTTCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATT
1544 :     TTTCACAATGGGCGCAAGCCTGATGGAGCAATCCCGCGTGAACGACGAAGGTTTTTTAAA
1545 :     TTGTAAAGTTCTTTTATTGGGGACGAATTGTAAGAAGAGGAAATGCTTTTTATTTGACTG
1546 :     TACCCTTTGAATAAGTATCGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGATGC
1547 :     AAGCGTTATCCGGATTTACTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGATTTACAAGTCTGGTGT
1548 :     TAAATATAGCTGCCCAACAGTTATATGCATTGGAAACTGTAAGTCTAGAGTGCAGTAGAG
1549 :     AGTTTTGGAACTCCATGTGGAGCGGTGGAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGAGGC
1550 :     GAAGGCGAAAACTTAGGCTGTTACTGACGCTTAGGCTCGAAAGTGTGGGGAGCAAATAGG
1551 :     ATTAGATACCCTAGTAGTCCACACCGTAAACGATGGTAATTAAATCTTGGTACGGGATGT
1552 :     ATCAGGATTGCAGTTAACACATTAAATTACCCGCCTGGGTAGTACATTCGCAAGAATGAA
1553 :     ACTCAAACGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTTGCTTAATTCGACGA
1554 :     TACACGTAAAACCTTACCTGGGTTTGACATCCTCTGCAAAGCTATAGAGATATAGTGGAG
1555 :     GTTAACAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTT
1556 :     AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCGTTAGTTACTTCATCTAGCGAGACTGCCAGCG
1557 :     TAAGCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTTTATATCCAGGGCCGCA
1558 :     AACGTGCTACAATGGTCGGTACAAACTGTTGCCAATCAGCAATGAGGAGCTAATCAGAGA
1559 :     AAGCCGATCTCAGTTCGGATCGAGGGCTGCAATTCGTCCTCGTGAAGTTGGAATCACTAG
1560 :     TAATCGCAAATCAGCCATGTTGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCCGT
1561 :     CAAACTATGAGAGCTGGTAATACCTAAAACCGTTAAGCTAACCTCGTGAGGCTTGCGTCT
1562 :     AGGGTAGGACTGGTAATTGGAGTTAAGTCGTAACAAGGTACCCCTACGGGAATGTGGGGG
1563 :     TGGATCACCTCCTTTCTA
1564 :     >Urea.parvu Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970 [fig|273119.1.rna.8]
1565 :     TCAATTTTAAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTGGCGGCATGCCTAATACATG
1566 :     CAAATCGAACGAAGCCTTTTAGGCTTAGTGGTGAACGGGTGAGTAACACGTATCCAATCT
1567 :     ACCCTTAAGTTGGGGATAACTAGTCGAAAGATTAGCTAATACCGAATAATAACATCAATA
1568 :     TCGCATGAGAAGATGTAGAAAGTCGCTCTTTGTGGCGACGCTTTTGGATGAGGGTGCGAC
1569 :     GTATCAGATAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGTCAATGACGCGTAGCTGTACTGAGA
1570 :     GGTAGAACAGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAG
1571 :     GGAATTTTTCACAATGGGCGCAAGCCTTATGAAGCAATGCCGCGTGAACGATGAAGGTCT
1572 :     TATAGATTGTAAAGTTCTTTTATATGGGAAGAAACGCTAAGATAGGAAATGATTTTAGTT
1573 :     TGACTGTACCATTTGAATAAGTATCGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATA
1574 :     GGATGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGCGTAAAACGAGCGCAGGCGGGTTTGTAAGTT
1575 :     TGGTATTAAATCTAGATGCTTAACGTCTAGCTGTATCAAAAACTGTAAACCTAGAGTGTA
1576 :     GTAGGGAGTTGGGGAACTCCATGTGGAGCGGTAAAATGCGTAGATATATGGAAGAACACC
1577 :     GGTGGCGAAGGCGCCAACTTGGACTATCACTGACGCTTAGGCTCGAAAGTGTGGGGAGCA
1578 :     AATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCCACACCGTAAACGATCATCATTAAATGTCGGCCCG
1579 :     AATGGGTCGGTGTTGTAGCTAACGCATTAAATGATGTGCCTGGGTAGTACATTCGCAAGA
1580 :     ATGAAACTCAAACGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTTGCTTAATTT
1581 :     GACAATACACGTAGAACCTTACCTAGGTTTGACATCTATTGCGATGCTATAGAAATATAG
1582 :     TTGAGGTTAACAATATGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT
1583 :     GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTTTCGTTAGTTACTTTTCTAGCGATACTGCT
1584 :     ACCGCAAGGTAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATATCTAGGGC
1585 :     TGCAAACGTGCTACAATGGCTAATACAAACTGCTGCAAAATCGTAAGATGAAGCGAAACA
1586 :     GAAAAAGTTAGTCTCAGTTCGGATAGAGGGCTGCAATTCGTCCTCTTGAAGTTGGAATCA
1587 :     CTAGTAATCGCGAATCAGACATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGTCTTGTACACACCGC
1588 :     CCGTCAAACTATGGGAGCTGGTAATATCTAAAACCGCAAAGCTAACCTTTTGGAGGCATG
1589 :     CGTCTAGGGTAGGATCGGTGACTGGAGTTAAGTCGTAACAAGGTATCCCTACGAGAACGT
1590 :     GGGGATGGATCACCTCCTTT
1591 :     >Onio.yello Onion yellows phytoplasma OY-M [fig|262768.1.rna.9]
1592 :     CATACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATTAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAA
1593 :     GTCGAACGGAAGTTTAAGCAATTAAACTTTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTAAGCA
1594 :     ATCTGCCCCTAAGACGAGGATAACAGTTGGAAACGACTGCTAAGACTGGATAGGAGACAA
1595 :     GAGGGCATCTTCTTGTTTTTAAAAGACCTAGCAATAGGTATGCTTAGGGAGGAGCTTGCG
1596 :     TCACATTAGTTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGACTATGATGTGTAGCCGGGCTGA
1597 :     GAGGTTGAACGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
1598 :     AGGGAATTTTCGGCAATGGAGGAAACTCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAACGATGAAGTA
1599 :     TTTCGGTACGTAAAGTTCTTTTATTAGGGAAGAATAAATGATGGAAAAATCATTCTGACG
1600 :     GTACCTAATGAATAAGCCCCGGCTAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGGGG
1601 :     CAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGTTAAATAAGTTTATGG
1602 :     TCTAAGTGCAATGCTCAACATTGTGATGCTATAAAAACTGTTTAGCTAGAGTAAGATAGA
1603 :     GGCAAGTGGAATTCCATGTGTAGTGGTAAAATGCGTAAATATATGGAGGAACACCAGTAG
1604 :     CGAAGGCGGCTTGCTGGGTCTTTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAG
1605 :     GATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTACTAAACGTTGGGTAAAACCA
1606 :     GTGTTGAAGTTAACACATTAAGTACTCCGCCTGAGTAGTACGTACGCAAGTATGAAACTT
1607 :     AAAGGAATTGACGGGACTCCGCACAAGCGGTGGATCATGTTGTTTAATTCGAAGGTACCC
1608 :     GAAAAACCTCACCAGGTCTTGACATGCTTCTGCAAAGCTGTAGAAACACAGTGGAGGTTA
1609 :     TCAGTTGCACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGT
1610 :     CCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTGTTAGTTACCAGCACGTAATGGTGGGGACTTTAGCA
1611 :     AGACTGCCAGTGATAAATTGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCCTTAT
1612 :     GACCTGGGCTACAAACGTGATACAATGGCTGTTACAAAGGGTAGCTGAAGCGCAAGTTTT
1613 :     TGGCGAATCTCAAAAAAACAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAA
1614 :     GTTGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCTCGGGGTTTGT
1615 :     ACACACCGCCCGTCAAACCACGAAAGTTGGTAATACCCAAAGCCGGTGGCCTAACTTCGC
1616 :     AAGAAGAGGGAACCGTCTAAGGTAGGGTCGATGATTGGGGTTAAGTCGTAACAAGGTATC
1617 :     CCTACCGGAAGGTGGGGATGGATCACCTCCTT
1618 :     >Clos.perfi Clostridium perfringens str. 13 [fig|195102.1.rna.107]
1619 :     TTTTAAATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG
1620 :     CAAGTCGAGCGATGAAGTTTCCTTCGGGAAACGGATTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACAC
1621 :     GTGGGTAACCTGCCTCATAGAGTGGAATAGCCTTCCGAAAGGAAGATTAATACCGCATAA
1622 :     CGTTGAAAGATGGCATCATCATTCAACCAAAGGAGCAATCCGCTATGAGATGGACCCGCG
1623 :     GCGCATTAGCTAGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGA
1624 :     GAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
1625 :     GGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGT
1626 :     TTTCGGATCGTAAAGCTCTGTCTTTGGGGAAGATAATGACGGTACCCAAGGAGGAAGCCA
1627 :     CGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTTATCCGGATTTA
1628 :     CTGGGCGTAAAGGGAGCGTAGGCGGATGATTAAGTGGGATGTGAAATACCCGGGCTCAAC
1629 :     TTGGGTGCTGCATTCCAAACTGGTTATCTAGAGTGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCCTAG
1630 :     TGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTAGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGA
1631 :     CTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAG
1632 :     TCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTGGGGGTTTCAACACCTCCGTGCCGCCGCTA
1633 :     ACGCATTAAGTATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGAC
1634 :     GGGGACCCGCACAAGTAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTAC
1635 :     CTACACTTGACATCCCTTGCATTACTCTTAATCGAGGAAATCCCTTCGGGGACAAGGTGA
1636 :     CAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACG
1637 :     AGCGCAACCCTTGTCGTTAGTTACTACCATTAAGTTGAGGACTCTAGCGAGACTGCCTGG
1638 :     GTTAACCAGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTGTAGGGCTA
1639 :     CACACGTGCTACAATGGCTGGTACAGAGAGATGCAATACCGCGAGGTGGAGCCAAACTTA
1640 :     AAAACCAGTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGCTGGAGTTACTA
1641 :     GTAATCGCGAATCAGAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGT
1642 :     CACACCATGAGAGTTGGCAATACCCGAAGTCCGTGAGCTAACCGCAAGGAGGCAGCGGCC
1643 :     GAAGGTAGGGTCAGCGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGG
1644 :     CTGGATCACCTCCTTTCTA
1645 :     >Clos.diffi Clostridium difficile 630 [fig|1496.1.rna.81]
1646 :     CTTTTATTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
1647 :     CAAGTTGAGCGATTTACTTCGGTAAAGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACC
1648 :     TACCCTGTACACACGGATAACATACCGAAAGGTATGCTAATACGGGATAATATATTTGAG
1649 :     AGGCATCTCTTGAATATCAAAGGTGAGCCAGTACAGGATGGACCCGCGTCTGATTAGCTA
1650 :     GTTGGTAAGGTAATGGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGG
1651 :     CCACATTGGAACTGAGACACGGTCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGC
1652 :     ACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTCGTA
1653 :     AAACTCTGTCCTCAAGGAAGATAATGACGGTACTTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAACTACG
1654 :     TGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCTAGCGTTATCCGGATTTACTGGGCGTAAAG
1655 :     GGTGCGTAGGCGGTCTTTCAAGTCAGGAGTGAAAGGCTACGGCTCAACCGTAGTAAGCTC
1656 :     TTGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAA
1657 :     TGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTTGCGAAGGCGGCTCTCTGGACTGTAACTGACGC
1658 :     TGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAA
1659 :     CGATGAGTACTAGGTGTCGGGGGTTACCCCCTTCGGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTAC
1660 :     TCCGCCTGGGAAGTACGCTCGCAAGAGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACA
1661 :     AGTAGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCTAAGCTTGACAT
1662 :     CCCAATGACATCTCCTTAATCGGAGAGTTCCCTTCGGGGACATTGGTGACAGGTGGTGCA
1663 :     TGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT
1664 :     TGTCTTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCAGGGATAACCTGGA
1665 :     GGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGCTTAGGGCTACACACGTGCTA
1666 :     CAATGGGTAGTACAGAGGGTTGCCAAGCCGTAAGGTGGAGCTAATCCCTTAAAGCTACTC
1667 :     TCAGTTCGGATTGTAGGCTGAAACTCGCCTACATGAAGCTGGAGTTACTAGTAATCGCAG
1668 :     ATCAGAATGCTGCGGTGAATGCGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGG
1669 :     GAGTTGGAGACGCCCGAAGCCGATTATCTAACCTTTTGGAAGAAGTCGTCGAAGGTGGAA
1670 :     TCAATAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACC
1671 :     TCCTTTCTA
1672 :     >Clos.papyr Clostridium papyrosolvens [TTWTTGAGAG,gi|431242]
1673 :     TTWTTGAGAG
1674 :     TTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGNCGAGCGGAGTAGAGTGTNA
1675 :     GCTTTCTTGTGAGTAACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGCAACCTGCCTGTTACAGGGGGAT
1676 :     AACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGCATAACACNNCGAGAAAGCAGTTTTCTTGTTGTCAAAGGAGCA
1677 :     ATCCGGTAANAGATGGGCCCGCGTCCAATTAGCTAGTTGGTGATGTAACGGACCACCAAGGCGACGATTG
1678 :     GTAGCCGAACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGC
1679 :     AGTGGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAAGGATGAAGGTTTTCGGA
1680 :     TTGTAAACTTCTTTAGTCAGGGACGAATAAATGACGGTACCTGAAGAATAAGCCACGGCTAACTACGTGC
1681 :     CAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTAGGCGG
1682 :     GAATGTAAGTCAGATGTGAAATCCCAGAGCTTAACTCTGGAGCTGCATCTGAAACTATGTTTCTTGAGTG
1683 :     CCGGAGAGGAAAGCGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGA
1684 :     AGGCGGCTTTCTGGACGGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCT
1685 :     GGTAGTCCACGCTGTAAACGATGGATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGGAGTTAACA
1686 :     CAATAAGTATCCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACA
1687 :     AGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATAATAGTGAAT
1688 :     ACGGTAGAGATATCGTAGTCCTTCGGGACACTATTACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGT
1689 :     GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTTGCTAGTTGATAACATTAAGATGATCACTC
1690 :     TAGCGAGACTGCCGGTGATAAATCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTGAAATCATCATGCCCCTTATGTCTT
1691 :     GGGCTACACACGTACTACAATGGCTATAACAGAGGGAAGCTAAGCTGCAAAGTGGAGCAAATCCCCAAAA
1692 :     ATAGTCCCAGTTCAGATTGTGGGCTGCAACCCGCCCACATGAAGTCGGAATTGCTAGTAATGGCAGGTCA
1693 :     GCATACTGCCGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTCTGCAACACC
1694 :     CGAAGTCGATAGTCTAACCGCAAGGAGGACGTCGCCGAAGGTGGGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCGTAA
1695 :     CAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1696 :     >Clos.therm Clostridium thermocellum ATCC 27405 [fig|203119.1.rna.057]
1697 :     CTTTTTTTAGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
1698 :     CAAGTCGAGCGGGGATATACGGAAGGTTTACCGGAAGTATATCCTAGCGGCGGACGGGTG
1699 :     AGTAACGCGTGGGTAACCTACCTCATACAGGGGGATAACACAGGGAAACCTGTGCTAATA
1700 :     CCGCATAACATAACGGGGCGGCATCGTCCTGTTATCAAAGGAGAAATCCGGTATGAGATG
1701 :     GGCCCGCGTCCGATTAGCTGGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATCGGTAGC
1702 :     CGAACTGAGAGGTTGGTCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAG
1703 :     GCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCAACGCCGCGTGAAGG
1704 :     AAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAACTTCTTTGATTGGGGACGAAGGAAGTGACGGTACCCAA
1705 :     AGAACAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCGAGCGTT
1706 :     GTCCGGAATTACTGGGTGTAAAGGGCGCGTAGGCGGGGATGCAAGTCAGATGTGAAATTC
1707 :     CGGGGCTTAACCCCGGCGCTGCATCTGAAACTGTATCTCTTGAGTGCTGGAGAGGAAAGC
1708 :     GGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGC
1709 :     GGCTTTCTGGACAGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGA
1710 :     TACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTC
1711 :     TGTGCCGGAGTTAACACAATAAGTATCCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACT
1712 :     CAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACG
1713 :     CGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCCTCTGACAGCTCTAGAGATAGGGCTTCCCTTC
1714 :     GGGGCAGAGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTT
1715 :     AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCGTTAGTTGCCAGCACGTTAAGGTGGGCACTCT
1716 :     AGCGAGACTGCCGGCGACAAGTCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCC
1717 :     TTATGTCCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCTGCTACAAAGGGAAGCGATACCGCGAG
1718 :     GTGGAGCAAATCCCCAAAAGCAGTCCCAGTTCGGATTGCAGGCTGAAACTCGCCTGCATG
1719 :     AAGTCGGAATTGCTAGTAATGGCAGGTCAGCATACTGCCGTGAATACGTTCCCGGGCCTT
1720 :     GTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTCTGCAACACCCGAAGTCAGTAGTCTAACCGT
1721 :     AAGGAGGGCGCTGCCGAAGGTGGGGCAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCG
1722 :     TATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTA
1723 :     >Clos.cellu Clostridium cellulolyticum [TTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGG,gi|431235]
1724 :     TTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCGAGTCGAGCGGAGTT
1725 :     ACCTTTAGCNCTGAGTATTCTTGGANATGATGCTGNCCCGACAGCGTCATCCNNNAACAA
1726 :     CCTTAATGAAATATTTAGTTGGAGTTTTGCATCACGCGTTTTATCAAAGTGTCAACACAT
1727 :     AATAGTAGAAGAGAATGTTCAGTGCTGAAGGTAACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGC
1728 :     GTGGGCAACCTGCCTGTTACAGGGGGATAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGCATAA
1729 :     CACAACGAAGAAGCATTTCNTTGTTGTCAAAGGAGCAATCCGGTGACAGATGGGCCCGCG
1730 :     TCCAATTAGCTAGTTGGTGATGTAACGGATCACCAAGGCGACGATTGGTAGCCGAACTGA
1731 :     GAGGTTGATCGGCCACATTGGGNCTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
1732 :     GGGGAATATTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAAGGATGAAGGT
1733 :     TTTCGGATTGTAAACTTCTTTAGTCAGGGACGAAGAAAATGACGGTACCTGAAGAATAAG
1734 :     CCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAA
1735 :     TTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTAGGCGGGAATGTAAGTCAGATGTGAAATCCCAGGGCTT
1736 :     AACCCTGGAGCTGCATCTGAAACTATGTTTCTTGAGTGCCGGAGAGGAAAGCGGAATTCC
1737 :     TAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTTTCT
1738 :     GGACGGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGG
1739 :     TAGTCCACGCTGTAAACGATGGATACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGG
1740 :     AGTTAACACAATAAGTATCCCACCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAA
1741 :     TTGACGGGGGCCCGCACAAGCAGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAAC
1742 :     CTTACCAAGGCTTGACATATAGCGGAATNCGGCAGAGATGTCGTAGTCCTTCGGGACTGC
1743 :     TATACACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCC
1744 :     GCAACGAGCGCAACCCCTGTTGCTAGTTGATAACATTAAGATGATCACTCTAGCGAGACT
1745 :     GCCGGTGACAAATCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTT
1746 :     GGGCTACACACGTACTACAATGGCTATAACAGAGGGAAGCTAAGCTGCAAAGTGGAGCAA
1747 :     ATCCCCAAAAATAGTCCCAGTTCAGATGGTGGGCTGCAACCCGCCCACATGAAGTCGGAA
1748 :     TTGCTAGTAATGGTAGGTCAGTATACTGTCGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC
1749 :     GCCCGTCACACCATGAGAGTCTGCAACACCCGAAGTCGATAGTCTAACCGCAAGGAGGAC
1750 :     GTCGCCGAAGGTGGGGCCGATGATTGGTGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAG
1751 :     GTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
1752 :     >Clos.polys Clostridium polysaccharolyticum [TTTTTGAGAG,gi|431244]
1753 :     TTTTTGAGAG
1754 :     TTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGANCGAAG
1755 :     CACCTGGATGGATTCCTTCGGGAGGAAGTTCTTGTGACTGAGTGGCGGACGGGTGAGTAA
1756 :     CGCGTGGGCAACCTGCCTCATACAGGGGGATAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCGCA
1757 :     TAACCCGATAGGGCCGCATGGCCCGGTCGGAAAAGAATTATCGGTATGAGATGGACCCGC
1758 :     GTCTGATTAGCTAGTTGGAGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGCCGGCTTG
1759 :     AGAGATTGACCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAG
1760 :     TGGGGAATATTACACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGTGAAGAAGT
1761 :     ATTTCGGTATGTAAAGCTCTATCAGCAGGGAAGAAAATGACGGNACCTGAATAAGAAGCC
1762 :     CCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGTGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTATCCGGATTT
1763 :     ACTGGGTGTAAAGGGAGCGCAGGTGGCGTGGCAAGTCAGAAGTGAAAGCCCGGGGCTCAA
1764 :     CCCCGGGACTGCTTTTGAAACTGTCATGCTGGAGTGCAGGAGAGGCAGGCGGAATTCCTA
1765 :     GTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCCTGCTGG
1766 :     ACTGTAACTGACACTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTA
1767 :     GTCCACGCCGTAAACGATGAATACTAGGTGTCGGGGCCCACAGGGCTTCGGTGCCGCAGC
1768 :     TAACGCAGTAAGTATTCCACCTGGGGAGTACGTTCGCAAGAATGAAACTCAAAGGAATTG
1769 :     ACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTT
1770 :     ACCAAGCCTTGACATCCCAATGACCGTCCGGCAATGCGGACTTTCCTTCGGGACATTGGA
1771 :     GACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAA
1772 :     CGAGCGCAACCCCTATCTTCAGTAGCCAGCGGATNNGCCGGGCACTCTGGAGAGACTGCC
1773 :     AGGGACAACCTGGAGGAAGGCGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGNCTTGGG
1774 :     CTACACACGTGCTACAATGGCAGCTACAAAGTGAAGCTACCCCGTGAGGGCGAGCAAATC
1775 :     ACAAAAAGGCTGTCCCAGTTCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGCTGGAATC
1776 :     GCTAGTAATCGCAAATCAGAATGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGC
1777 :     CCGTCACACCATGGGAGTCGGAAATGCCCGAAGTCAGTGCACCCACCCGAAAGGAGGGAG
1778 :     CTGCCGAAGGTGGAGCCGGTAACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGG
1779 :     TGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1780 :     >Lact.acido Lactobacillus acidophilus NCFM [fig|272621.3.rna.74]
1781 :     AAAAACGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAA
1782 :     GTCGAGCGAGCTGAACCAACAGATTCACTTCGGTGATGACGTTGGGAACGCGAGCGGCGG
1783 :     ATGGGTGAGTAACACGTGGGGAACCTGCCCCATAGTCTGGGATACCACTTGGAAACAGGT
1784 :     GCTAATACCGGATAAGAAAGCAGATCGCATGATCAGCTTATAAAAGGCGGCGTAAGCTGT
1785 :     CGCTATGGGATGGCCCCGCGGTGCATTAGCTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGGCA
1786 :     ATGATGCATAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAA
1787 :     CTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAAC
1788 :     GCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTGGTGAAGAAGGATAG
1789 :     AGGTAGTAACTGGCCTTTATTTGACGGTAATCAACCAGAAAGTCACGGCTAACTACGTGC
1790 :     CAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGA
1791 :     GCGCAGGCGGAAGAATAAGTCTGATGTGAAAGCCCTCGGCTTAACCGAGGAACTGCATCG
1792 :     GAAACTGTTTTTCTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGGAATG
1793 :     CGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGTCTGCAACTGACGCTG
1794 :     AGGCTCGAAAGCATGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACG
1795 :     ATGAGTGCTAAGTGTTGGGAGGTTTCCGCCTCTCAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCAC
1796 :     TCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACA
1797 :     AGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACAT
1798 :     CTAGTGCAATCCGTAGAGATACGGAGTTCCCTTCGGGGACACTAAGACAGGTGGTGCATG
1799 :     GCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTG
1800 :     TCATTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGG
1801 :     AAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACA
1802 :     ATGGACAGTACAACGAGGAGCAAGCCTGCGAAGGCAAGCGAATCTCTTAAAGCTGTTCTC
1803 :     AGTTCGGACTGCAGTCTGCAACTCGACTGCACGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGAT
1804 :     CAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGA
1805 :     GTCTGCAATGCCCAAAGCCGGTGGCCTAACCTTCGGGAAGGAGCCGTCTAAGGCAGGGCA
1806 :     GATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACCTC
1807 :     CTTTCTA
1808 :     >Lact.seqri Lactobacillus saerimneri [CCGAATTCGTCGACAACAGAGT,gi|3599569]
1809 :     CCGAATTCGTCGACAACAGAGT
1810 :     TTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCG
1811 :     CATCGGCCCAACTGATTGAAGATGCTTGCATCCGATTGACGATGGTTTACCGATGAGCGG
1812 :     CGGACGGGTGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACA
1813 :     GATGCTAATACCGCATAGGTCATTTGACCGCATGGTCAAATGATTAAAGATGGCTCTGCT
1814 :     ATCACTTCTGGATGGACCTGCGGCGTATTAGCTAGTTGGTAAGGTAACGGCTTACCAAGG
1815 :     CGATGATACGTAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCA
1816 :     GACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGCAAGTCTGATGGAGCA
1817 :     ACGCCGCGTGAGCGAAGAAGGTCTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGAGAAGAACACG
1818 :     GGTGAGAGTAACTGTTCACCTGTTGACGGTATCTAACCAGCAAGTCACGGCTAACTACGT
1819 :     GCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGG
1820 :     GAACGCAGGCGGTTCTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCTTCGGCTTAACCGAAGATGTGCAT
1821 :     TGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAA
1822 :     TGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGGCTCTCTGGTCTGTAACTGACGC
1823 :     TGAGGTTCGAAAGCGTGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA
1824 :     CGATGAATGCTAGGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCCGCAGCTAACGCACTAAGC
1825 :     ATTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA
1826 :     CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCTACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGAC
1827 :     ATCTTTTGACCACCTAAGAGATTAGGTTTTCCCTTCGGGGACAAAATGACAGGTGGTGCA
1828 :     TGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCT
1829 :     TGTTGTCAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTGGCGAGACTGCCGGTGACAAACCGGA
1830 :     GGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTA
1831 :     CAATGGGCAGTACAACGAGTCGCGAAACCGCGAGGTTTAGCAAATCTCTTAAAGCTGCTC
1832 :     TCAGTTCGGACTGTAGGCTGCAACTCGCCTRCACGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGA
1833 :     ATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGA
1834 :     GAGTTTGTAACACCCAAAGCCGGTGGGGTAACCTTTTGGAGCCAGCCGTCTAAGGTGGGA
1835 :     CAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCACC
1836 :     TCCTTTCT
1837 :     >Oeno.oeni Oenococcus oeni PSU-1 [fig|203123.1.rna.043]
1838 :     TTTTAAATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGTGGCGTGCCTAATACATG
1839 :     CAAGTCGTACGCTAGCCGCTGAATTGATCCTTCGGGTGAAGTGAGGCAATGACTAGAGTG
1840 :     GCGAACTGGTGAGTAACACGTAAGAAACCTGCCCTTTAGTGGGGGATAACATTTGGAAAC
1841 :     AGATGCTAATACCGCGTAACAACAAATCACACATGTGATCTGTTTGAAAGGTCCTTTTGG
1842 :     ATCGCTAGAGGATGGTCTTGCGGCGTATTAGCTTGTTGGTAGGGTAGAAGCCTACCAAGG
1843 :     CAATGATGCGTAGCCGAGTTGAGAGACTGGCCGGCCACATTGGGACTGAGACACTGCCCA
1844 :     AACTCCTACGGGAGGCTGCAGTAGGGAATTTTCCGCAATGCACGAAAGTGTGACGGAGCG
1845 :     ACGCCGCGTGTGTGATGAAGGCTTTCGGGTCGTAAAGCACTGTTGTAAGGGAAGAATAAC
1846 :     TGAATTCAGAGAAAGTTTTCAGCTTGACGGTACCTTACCAGAAAGGGATGGCTAAATACG
1847 :     TGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTATGTCCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAG
1848 :     CGAGCGCAGACGGTTTATTAAGTCTGATGTGAAATCCCGAGGCCCAACCTCGGAACTGCA
1849 :     TTGGAAACTGATTTACTTGAGTGCGATAGAGGCAAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAA
1850 :     ATGCGTAGATATGTGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGGCTTGCTAGATCGTAACTGACG
1851 :     TTGAGGCTCGAAAGTATGGGTAGCAAACGGGATTAGATACCCCGGTAGTCCATACCGTAA
1852 :     ACGATGGGTGCTAGTTGTTAAGAGGTTTCCGCCTCCTAGTGACGTAGCAAACGCATTAAG
1853 :     CACCCCGCCTGAGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTTAAAGGAATTGACGGGGACCCGC
1854 :     ACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGATACGCGAAAAACCTTACCAGGTCTTGA
1855 :     CATACCAATGATCGCTTTTGTAATGAAAGCTTTTCTTCGGAACATTGGATACAGGTGGTG
1856 :     CATGGTCGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC
1857 :     CTTGTTATTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAATGAGACTGCCGGTGATAAACCG
1858 :     GAGGAAGGTGGGGACGACGTCAGATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCAACACACGTGC
1859 :     TACAATGGGAAGTACAACGAGTCGCAAACCGGCGACGGTAAGCTAATCTCTTAAAACTTC
1860 :     TCTCAGTTCGGACTGGAGTCTGCAACTCGACTCCACGAAGGCGGAATCGCTAGTAATCGC
1861 :     GAATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCAAATCAT
1862 :     GGGAGTCGGAAGTACCCAAAGTCGCTTGGCTAACTTTTAGAGGCCGGTGCCTAAGGTAAA
1863 :     ATCGATGACTGGGATTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCTGGATCAC
1864 :     CTCCTTTCTA
1865 :     >Stre.py.MG Streptococcus pyogenes MGAS5005 [fig|293653.3.rna.85]
1866 :     ATTAAAGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAA
1867 :     GTAGAACGCTGAGAACTGGTGCTTGCACCGGTTCAAGGAGTTGCGAACGGGTGAGTAACG
1868 :     CGTAGGTAACCTACCTCATAGCGGGGGATAACTATTGGAAACGATAGCTAATACCGCATA
1869 :     AGAGAGACTAACGCATGTTAGTAATTTAAAAGGGGCAATTGCTCCACTATGAGATGGACC
1870 :     TGCGTTGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATACATAGCCGAC
1871 :     CTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
1872 :     CAGTAGGGAATCTTCGGCAATGGGGGCAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGA
1873 :     AGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGAGAAGAATGATGGTGGGAGTGGAAAATCC
1874 :     ACCAAGTGACGGTAACTAACCAGAAAGGGACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA
1875 :     TACGTAGGTCCCGAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGTTTTT
1876 :     TAAGTCTGAAGTTAAAGGCATTGGCTCAACCAATGTACGCTTTGGAAACTGGAGAACTTG
1877 :     AGTGCAGAAGGGGAGAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAGG
1878 :     AACACCGGTGGCGAAAGCGGCTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCGTGG
1879 :     GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTT
1880 :     AGGCCCTTTCCGGGGCTTAGTGCCGGAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTAC
1881 :     GACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG
1882 :     GTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCCGATGCCCGCTCTA
1883 :     GAGATAGAGTTTTACTTCGGTACATCGGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGT
1884 :     GTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCA
1885 :     TTAAGTTGGGCACTCTAGCGAGACTGCCGGTAATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGT
1886 :     CAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTTGGTACAACGA
1887 :     GTCGCAAGCCGGTGACGGCAAGCTAATCTCTTAAAGCCAATCTCAGTTCGGATTGTAGGC
1888 :     TGCAACTCGCCTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCACGCCGCGGTGA
1889 :     ATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAA
1890 :     GTCGGTGAGGTAACCTATTAGGAGCCAGCCGCCTAAGGTGGGATAGATGATTGGGGTGAA
1891 :     GTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTC
1892 :     >Desu.7475 Desulfotomaculum thermobenzoicum DSM 7475 [gi|2578020]
1893 :     TTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGATTGAGAGGTGAG
1894 :     AGGTGAGAGGTTAGAAGTGAGATTAAGAAGGCTTTGGCAAAGCCAAAGCCAACAATAGATCTCACATCTT
1895 :     GCTTCTCACATCTCACCTCTCAATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACCTGCCCATTAGACC
1896 :     GGGATAACGCCGGGAAACTGGTGCTAATACCGGATACGCTCCACTGGCCGCATGGTCGGGGGAGGAAAGG
1897 :     GGAAACCCGCTAATGGATGGGTCCGCGTCCCATTAGCTAGATGGTGGGGTAACGGCCCACCATGGCGACG
1898 :     ATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGACTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGA
1899 :     CGGAGCGACGCCGCGTGAGCGAAGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTTGTTGGGGACGAAGGAAGTG
1900 :     ACGGTACCCAACGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACGTAGGGGGCGAGCGT
1901 :     TGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGCAGGCGGCTCAAGAAGTCAGGGGTGAAATACCGCAGCTCA
1902 :     ACTGCGGGGGTGCCTTTGAAACCATTGGGCTTGANGGCAGGAGAGGGGAGTGGAATTCCCNGTGTAGCGG
1903 :     TGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGNTCTCTGGCCTGGCCCTGACGCTGAGG
1904 :     CGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTGCTAGGT
1905 :     GTTGGGGGATGTAACCCCCTCAGTGCCGTAGCAAACGCAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCA
1906 :     AGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC
1907 :     GCGAAGAACCTTACCAGGGCTTGACATCCCCTGACAGCCTGTGAAAGCGGGTTTTCTATCTTCGGATAGA
1908 :     CAGGGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG
1909 :     CGCAACCCCTACGGTTAGTTGCCAGCGGGTCAAGCCGGGCACTCTAACCGAACTGCCGTTGACAAAACGG
1910 :     AGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCTTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCG
1911 :     GTACAAAGGGCAGCGAACCCGCGAGGGGGAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCT
1912 :     GCAACTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCG
1913 :     GGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGCCGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCGCAAGG
1914 :     AGGCAGCCGTCGAAGGTGGGGTTGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCG
1915 :     GCTGGATCACCTCCTT
1916 :     >Desu.reduc Desulfotomaculum reducens [gi|134050581:10041-11659]
1917 :     TTTACGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGT
1918 :     CTTCGAGGTTCGACATTCGAGGTTCGAATTTTGAGTTCGAGTAAAGCTTAAGGGTCATTTAAAAGACCCC
1919 :     AAAGAAATGCTTGGATCGAATCACGAATTTCGAACGTCGAACTTCGAAGATAGTGGCGAACGGGTGAGTA
1920 :     ACGCGTGGATAACCTGCCTGATAGACCGGGATAACAGCTGGAAACGGCTGCTAATACCGGATACGCTTGC
1921 :     GGAGTCGCATGGCTCTGCAAGGAAAGCTATTGTGCTATCAGATGGATCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGT
1922 :     GGTGTAACGGACCACCAAGGCGACGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGCGAACGGCCACACTGGGACTGAG
1923 :     ACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCA
1924 :     ACGCCGCGTGAGGGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTGTTTTCAGGGAAGAACAAATGACGGTACC
1925 :     TGAAGAGTAAGCTCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGAGCGAGCGTTGTCCGGA
1926 :     TTTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGTGGTGCATTAAGTTAGAGGTGAAAGTTCGGGGCTCAACCCCGTG
1927 :     ATTGCCTCTGATACTGGTGGACTTGAGTGCAGGAGAGGGGAGCAGAATTCCCAGTGTAGCGGTGAAATGC
1928 :     GTAGATATTGGGAGGAATACCAGTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGACTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAG
1929 :     CGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTTGCGGG
1930 :     TATCGACCCCTGCAGTGCCGCAGTAAACACAATAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAA
1931 :     ACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAA
1932 :     CCTTACCAGGGCTTGACATCCTACGAAACTCATAGAGATATGAGCCTTATCCTTCGGGATAACGTAGAGA
1933 :     CAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCC
1934 :     CTAACATTAGTTGCCAGCATGTAAAGGTGGGAACTCTAATGTGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGT
1935 :     GGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTACTACAATGGCCGGTACAGAC
1936 :     GGAAGCGAAGCCGTGAGGTGGAGCAAACCTGAGAAAGCCGGTCCCAGTTCGGATTGTAGTCTGCAACTCG
1937 :     ACTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGT
1938 :     ACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGTTGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCGCAAGGAGGCAGCC
1939 :     GTCGAAGGTGGGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATC
1940 :     ACCTCCTTT
1941 :     >Hala.chiti Halanaerobacter chitinivorans [CAATCGGAGAGTTTGATCCTGGCCTAGGA,gi|1235890]
1942 :     CAATCGGAGAGTTTGATCCTGGCCTAGGA
1943 :     CGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTTGCGCCAGAAAGCTACCTTCGGGTAGT
1944 :     GAGTAAAGCGGNGAACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAATCTACCTTTAAGTTAAGGATAAC
1945 :     TTCTCGAAAGGAAAGCTAATACTTAATAATAATAAAGATGGCTTTGCTATCGCTTAGAGA
1946 :     TGAGCCCGCGTCCCATTAGCTTGTTGGTAGGGTAAGGGCCTNCCNAAGGCAACAATGGTA
1947 :     GCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGNACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGG
1948 :     AGGCTGCAGTGGGGAATCGGAGCAATGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTCGCAAGCTCTGTC
1949 :     CTTAGGGAAGAACAAACCAGTTGATAATACCAGCTGGGCTTGACGGTACCTTTGGAGGAA
1950 :     GCCTCGGCTAATTACGTGCCAGAAGCCGCGGTAATACGTAAGAGGCTAGCGTTGTCCGGA
1951 :     ATCACTGGGCGTTAAGGGTGCGCAGCGGGTCTAGTAAGTCAAGAGTGAAAATAAGATACC
1952 :     CCGGTAGTCCTAGCTGTAAACGCTGGATACTAGGTGTTGGGGGGTCAACTCCCCTCGGTG
1953 :     CTGCAGTTAACGCGTTAAGTGTCCCGCCTGGGGATTACGNCCGCAAGGTTGAAACTCAAA
1954 :     GGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGCGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAA
1955 :     GAACATTACCAGGGTTTGACATCCTATGACCATCTGTGAAAGCAGAGTTTGGCTCTTTGA
1956 :     GTCACATAGTGACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAAGTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA
1957 :     AGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTTCTTAGTTGCCAGCACGTAATGGTGGGGACTCTA
1958 :     AGAAGACTGCCGCAGAAAAAATGCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCC
1959 :     CTTATACTCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCTAAACAGAGGGAANCAAGACTGCGA
1960 :     ATCCAAGCGAATCTCACAAATTAGATCTCAGTTCGGATTGCAGATTGTAATTCATCTGCA
1961 :     TGAAGCTGGAGTCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATATGTTCTCGGGCC
1962 :     TTGTACACACCGCCCGTCACACCACCCGAGTTGGGGACACCAGAAGTCATTTGCGATAGC
1963 :     AAGTGCCGAAGGTGTGCCTGATAAGGGGAGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAA
1964 :     GGTGCGGCTGGATCACCTCCTTAA
1965 :     >Pelo.therm Pelotomaculum thermopropionicum [gi|146272432:265365-266967]
1966 :     TTGCAGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGT
1967 :     TCGGCACTCAGCCACTAGTGGTCAGTAGTTGCTATGAGTTTTGGCAATAGCTGAGGCAAGGGAGCAGCAA
1968 :     CTGGCCAGTAGGGCTGAGTGCCGGATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACCTGCCTGTCAGA
1969 :     CCGGGATAACACCGGGAAACTGGTGCTAATACCGGATACGTTCACCGGGGCGCATGCTTTGGTGAAGAAA
1970 :     GGGGCAACCCACTGACAGATGGGTCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGCGGTGTAACGGACCACCAAGGCGA
1971 :     CGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGACGGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGA
1972 :     GGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGCGAAGAAGGCC
1973 :     TTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCTTCAGGGACGAAGGAAGTGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAAC
1974 :     TACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAAACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCG
1975 :     TAGGCGGTTCCTTAAGTCAGGGGTGAAAACTGTCGGCTTAACCGGCAGCCTGCCTTTGAAACTGAGGGAC
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1977 :     GTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGCCTGTTTCTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACGGGATTAG
1978 :     ATACCCCGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGGGTGCTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGTA
1979 :     GTTAACACAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGC
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1983 :     AGAGCCGGGCACTCTAAACGAACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCAT
1984 :     GCCCCTTATGTCCTGGGCCACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAGAGGGAGGCGAAGCCGTGAGGCGGA
1985 :     GCAAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGAAATTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCT
1986 :     AGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACG
1987 :     AAAGCTGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCGCGAAAGCGGAGGCAGCCGTCGAAGGTGGGGTTGGT
1988 :     GATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT
1989 :     >Desu.kuznA Desulfotomaculum kuznetsovii (rrnA) [gi|14585793]
1990 :     AGTGATTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGCT
1991 :     CTTGGAGGTTGGAGGTTAGAGGTTAGAAGTTGGATTAAGAAGGAATTCGGCGGAGGCGAATTCCAACAAG
1992 :     GTCCAACATCTAATTTCCAACTTCCAACCTCCAAGGGAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGATAACC
1993 :     TGCCCATTAGACCGGGATAACGCCGGGAAACTGGCGCTAATACCGGATACGCTCCTTGAGCCGCATGGCA
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1997 :     CGAGGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTTCTGGGGGAAGAAGAGGGTGACGGTACCCCAGGAGGAAG
1998 :     CCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCG
1999 :     TAAAGGGCGCGTAGGCGGCTCAAGAAGTCAGGGGTGAAATACCGCAGCTCAACTGCGGGGGTGCCTCTGA
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2014 :     TCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
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2029 :     GTGCCGTAGCAAACGCAATAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTG
2030 :     ACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGGCTT
2031 :     GACATCCCCTGACGGCCGTGGAAACACGGATTTCACGGGAGTAATCTCGTGACAGGGAGACAGGTGGTGC
2032 :     ATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTACGGTTAG
2033 :     TTGCTAACGGGTAAAGCCGAGCACTCTAGCCGGACTGCCGTTGACAAAACGGAGGAAGGTGGGGATGACG
2034 :     TCAAATCATCATGCCCCTTATGTCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCCGGTACAAAGGGCAGCGAAC
2035 :     CCGCGAGGGGGAGCGAATCCCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAA
2036 :     GTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCC
2037 :     CGTCACACCACGAAAGCCGACAACACCCGAAGCCGGTGAGCTAACCTGTTCGGAAGTCAGAGGTCAGAAG
2038 :     TCAGAAGTTGGATTGGGAAAAGGAGGGCGGGTAAAACCTCCGCACCCTTAGCCTGGATCTGACATCCGAC
2039 :     TTCCGACTTCCGAACGGGGGGCAGCCGTCGAAGGTGGGGTTGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA
2040 :     GCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTA
2041 :     >Moor.ther Moorella thermoacetica ATCC 39073 [gi|83588874 147988-149555]
2042 :     TTAATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACAAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGT
2043 :     CTTTAATTGGGGAAATCTTCGGATGGAACCGATTAAAGATAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGTA
2044 :     ATCTACCCTTCAGACTGGGATAACACCGGGAAACTGGTGCTAATACCGGATACGGTCTACGGGAGGCATC
2045 :     TTCTGTAGAAGAAAGGTGGCGCAAGCTACCGCTGAAGGATGAGCCCGCGTCCCATTAGCTAGTTGGTGAG
2046 :     GTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGGTCGGCCACACTGGGACTGAGACA
2047 :     CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCAACG
2048 :     CCGCGTGAGCGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTGTCATCAGGGACGAAGTCTTAAAGGCGAATAG
2049 :     CCTTTAAGGTGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAAAACGTAG
2050 :     GGGGCGAGCGTTGTCCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGTGTAGGCGGCCTGGCAAGTCAGATGTGAAAA
2051 :     ACCCCGGCTTAACCGGGGGCATGCATTTGAAACTGCCGGGCTTGAGGGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCC
2052 :     CGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGCCTGGCCC
2053 :     TGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGAT
2054 :     GGGTACTAGGTGTAGGAGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGCAGTAAACACAATAAGTACCCCGCCTGGGGA
2055 :     GTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA
2056 :     TTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCGGGGTTTGACATCCTGCGAACCTGGTGGAAACACTGGGGTGCCC
2057 :     TTCGGGGAACGCAGAGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC
2058 :     CGCAACGAGCGCAACCCCTACCTTTAGTTGCCAGCGGGTAAAGCCGGGCACTCTAAAGGGACTGCCGGTG
2059 :     ACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATATCCCGGGCTACACACGTGCTA
2060 :     CAATGGCCTGTACAAAGGGGTGCGAAGGAGCGATCCGGAGCGAATCCCAAAAAGCAGGTCTCAGTTCGGA
2061 :     TTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAAT
2062 :     ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAAAGCTGGCAACACCCGAAGCCGGTGACCTA
2063 :     ACCCGCGAGGGAAGGAGCCGTCTAAGGTGGGGCTGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAT
2064 :     CGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT
2065 :     >Desu.hafni Desulfitobacterium hafniense [fig|49338.1.rna.044]
2066 :     AATTTTATGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG
2067 :     CAAGTCGAACGGAGAGCTCAATAAGCTTGCTTAGAGAGTTCTTAGTGGCGGACGGGTGAG
2068 :     TAACGCGTGGATAACCTACCTAGTAGACCGGGACAACCCTTGGAAACGAGGGCTAATACC
2069 :     GGATAAGCTTAATTAGTGGCATCACTGATTAAGGAAAGATGGCCTCTGAAGATGCTATCG
2070 :     TTAGTAGATGGATCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCCTACCAAGGCGAC
2071 :     GATCAGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGAACGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT
2072 :     CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGC
2073 :     CGCGTGTACGACGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTGTCTTCAGGGACGAACGGTAAGT
2074 :     ATGTAAAGAATGTACTTACATGACGGTACCTGAGGAGGAAGCCCCGGCTAACTACGTGCC
2075 :     AGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGGGCAAGCGTTGTCCGGAATCATTGGGCGTAAAGGGCG
2076 :     CGTAGGCGGATACTTAAGTCTGGTGTGAAAACCTAGGGCTCAACCCTGGGACTGCATCGG
2077 :     AAACTGGGTATCTTGAGGACAGGAGAGGAAAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGC
2078 :     GTAGATATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGACTGTAACTGACGCTGA
2079 :     GGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGA
2080 :     TGAGTGCTAGGTGTAGAGGGTATCGACCCCTTCTGTGCCGCAGTTAACACACTAAGCACT
2081 :     CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAA
2082 :     GCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATC
2083 :     CATAGAATCCTGTGGAAACATGGGAGTGCCCTTCGGGGAGCTATGAGACAGGTGGTGCAT
2084 :     GGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCT
2085 :     ATGTTTAGTTGCTAACGCGTAATGGTGAGCACTCTAGACAGACTGCCGGTGACAAACCGG
2086 :     AGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTACACACGTGCT
2087 :     ACAATGGCCAGTACAGACGGAAGCGAAGCCGTGAGGTGAAGCCAATCCGAGAAAGCTGGT
2088 :     CTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCA
2089 :     GGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACG
2090 :     AAAGTCTGCAACACCCGAAGCCGGTGAGGTAACCCGAAAGGGAGCTAGCCGTCGAAGGTG
2091 :     GGGCCGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATC
2092 :     ACCTCCTTTCTA
2093 :     >Rhod.balti Rhodopirellula baltica SH 1 [gi|32470666 c5078478-5076964]
2094 :     ACAAAATTGAAGGGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGTTGGCGGCATGGATTAGGCATG
2095 :     CAAGTCGCACGAGAAGCTGAGTAGCTTGCTACAAAGCGGACAGTGGCGAAAGGGAGAGTA
2096 :     ACGTGTGGTTACGTGCCCTCGAGACCGGGATAGCGTCGGGAAACTGGCAGTAATACCGGA
2097 :     TAATATCTACGGATCAAATGGTGAGATTCCGCTCGAGGATTGGACCGCATACTATTAGCT
2098 :     TGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCTGCGATGGTTACCGGGTGTGAGAGCATGGCCC
2099 :     GGCTCACTGGGACTGAGACACTGCCCAGACACCTACGGGTGGCTGCAGTCGAGAATCTTC
2100 :     GGCAATGGACGAAAGTCTGACCGAGCGATGCCGCGTGCGGGATGAAGGCCCTCGGGTTGT
2101 :     AAACCGCTGTCAGTTGTTAGGAAATGCATGGTGGTTATCCATCATGTTTGACCGATCTTC
2102 :     AGAGGAAGGACGGGCTAAGTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAACACGTACCGTCCAAACGTT
2103 :     ATTCGGTATCACTGGGCTTAAAGCGTTCGTAGGCGGCCTAGAAGGTGAGATGTGAAAGCC
2104 :     CACGGCTCAACCGTGGAATTGCGTTTCAAACCACTAGGCTTGAGGAAGACAGGGGTGATG
2105 :     GGAACTTATGGTGGAGCGGTGAAATGCGTTGATATCATAGGGAACACCGGTGGCGAAAGC
2106 :     GCATCACTGGGTCTTTTCTGACGCTGAGGAACGAAAGCTAGGGTAGCGAACGGGATTAGA
2107 :     TACCCCGGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGAGCACTAGGCTGAGGGAACTTCCACATTCTC
2108 :     TCGGCCGCAGGGAAACCATTAAGTGCTCCGCCTGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACT
2109 :     CAAAGGAATTGACGGGGGCTCACACAAGCGGTGGAGGATGTGGCTTAATTCGAGGCTACG
2110 :     CGAAGAACCTTATCCTAGACTTGACATGCTTGAGAATCCCTATGAAAGTAGAGAGTGCCC
2111 :     TTCGGGGAGCTCTTGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTCG
2112 :     GGTTAAGTCCCTTAACGAGCGAAACCCTTATCTTTAGTTGCCAGCGGGTAATGCCGGGGA
2113 :     CTCTAAAGAGACTGCCGGTGTCAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATG
2114 :     GCCTTTATGTCTAGGGCTGCACACGTCCTACAATGGCACGGACAAACGGACGCAATACCG
2115 :     CGAGGTGGAGCAAATCCTAGAAACCGTGCCTCAGTTCGGATTGCAGGCTGCAACTCGCCT
2116 :     GCATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGTAGGTCAGCATACTACGGTGAATGTGTTCCTGA
2117 :     GCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCACGAAAGTTGGGAGGGCCCGAAGTCACCAAGCTA
2118 :     ACCCGCAAGGGAGGCAGGTGCCGAAGGTCAGCTCGACAATTGGGACTAAGTCGTAACAAG
2119 :     GTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT
2120 :     >Meth.kandl Methanopyrus kandleri AV19 [fig|190192.1.rna.15]
2121 :     ACTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCACCGCTATCGGGGTCCGACTAAGCCATGCAAGTCG
2122 :     AGGGCCGCCCGGCAATGGGGGCGGCCCGGCGGACGGCTCAGTAACACGTGGGTAACCTAC
2123 :     CCTCGGGACGGGGATAACCCCGGCGAAAGTGGGGCTAATCCCCGATAGGCGGGGCGGCCT
2124 :     GGAACGGTCCTCCGCCGAAAGGGCCCGGGCCCATGCCGCCCGGGTCCGCCCGAGGATGGG
2125 :     CCTGCGGCCGATTAGGTAGTTGGCGGGGTAACGGCCCGCCAAGCCGATAATCGGTACGGG
2126 :     CGGTGAGAGCCGGAGCCCGGAGACGGGGACTGAGACAAGGCCCCGGGCCCTACGGGGCGC
2127 :     AGCAGGCGCGAAACCTCCGCAATGCGGGCAACCGCGACGGGGGGACCCCGAGTGCCGTCG
2128 :     GGGCAAAGCCCCGGCGGCTGTACCGGGGTGTAAAAAGCCCCGGGTAGAAAGCGGCGGGCA
2129 :     AGACCGCTGCCAGCCGCCGCGGTAATAGCGGCGCCGCAAGTGGTGGCCGCTTTTATTGGG
2130 :     CCTAAAGGGGCCGTAGCCGGTCCCGTGGGTCCCCGCCGAAAGCCCGCGGCTTAACCGCGG
2131 :     GAGTCGGCGGGGAAACTGCGGGACTTGGGACCGGGAGAGGCCGGAGGTACCCCCGGGGTA
2132 :     GGGGTGAAATCCTGTCATCCCGGGGGGACCGCCAGTGGCGAAGGCGTCCGGCTGGAACGG
2133 :     GTCCGACGGTGAGGGCCGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCC
2134 :     GGCTGTAAACGATGCGGACTAGGTGTTGGGGCGGCCACGAGCCGCCCCAGTGCCGTAGGG
2135 :     AAGCCGTTAAGTCCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGG
2136 :     CGGGGGAGCACCACAACCGGTGGAGCCTGCGGTTTAATTGGATTCAACGCCGGAAACCTT
2137 :     ACCGGGGGCGACAGCAGGATGAAGGCCAGGTTGACGACCTTGCCGGACGAGCTGAGAGGA
2138 :     GGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCCTGTTAAGTCAGGTAACGAGCGA
2139 :     GACCCCCGCCCGCAGTTGCCAGCGGGCCCCGTAAGGGGCGCCGGGCACTCTGCGGGGATC
2140 :     GCCGCCGTTAAGGCGGATGAAAGTGGGGGCGACGGCAGGTCCGTATGCCCCGAAACCCCC
2141 :     GGGCTACACGCGGGCTACAATGGCGGGGACAATGGGATCCGACCCCGAAAGGGGGAGGAA
2142 :     ATCCCCTAAACCCCGTCGTAGTTCGGATTGCGGGCTGCAACTCGCCCGCATGAAGGTGGA
2143 :     ATCGGTAGTAACCGTGCCTCAGAATGGCACGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACAC
2144 :     CGCCCGTCACGCCACCCGAGCCCCCCGGGGGCAAGCCCCCGGTCCGCAAGGGCTGGGGGC
2145 :     GAGCCCCCGGGGGGTGAGGGGGGCGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGG
2146 :     CTGGATCACCTCCA
2147 :     >Meth.janna Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 [fig|243232.1.rna.24]
2148 :     ATTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCACTGCTATCGGGGTCCGACTAAGCCATGCGAGTCA
2149 :     AGGGGCTCCCTTCGGGGAGCACCGGCGCACGGCTCAGTAACACGTGGCTAACCTACCCTC
2150 :     GGGTGGGGGATAACCTCGGGAAACTGAGGCTAATCCCCCATAGGGGAGGAGGTCTGGAAT
2151 :     GATCCCTCCCCGAAAGGCGTAAGCCGCCCGAGGATGGGGCTGCGGCGGATTAGGTAGTTG
2152 :     GTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCTACGATCCGTACGGGCCCTGAGAGGGGGAGCCCGGAG
2153 :     ATGGACACTGAGACACGGGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTCCGCAA
2154 :     TGCGCGAAAGCGCGACGGGGGGACCCCGAGTGCCCACGCCCTGCGTGGGCTTTTCCGGAG
2155 :     TGTAAACAGCTCCGGGAATAAGGGCTGGGCAAGTCCGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACC
2156 :     GGCGGCCCAAGTGGTGGCCACTGTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCGGCCCGGTAAG
2157 :     TCTCTGCTTAAATCCTGCGGCTCAACCGCAGGGCTGGCAGAGATACTGCCGGGCTTGGGA
2158 :     CCGGGAGAGGCCGGGGGTACCCCAGGGGTAGCGGTGAAATGCGTTGATCCCTGGGGGACC
2159 :     ACCTGTGGCGAAGGCGCCCGGCTGGAACGGGTCCGACGGTGAGGGACGAAGGCCAGGGGA
2160 :     GCAAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACTCTGCGGACTAGGTGTCGCG
2161 :     TCGGCTTCGGGCCGACGCGGTGCCGAAGGGAAGCCGTTAAGTCCGCCGCCTGGGGAGTAC
2162 :     GGTCGCAAGACTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACGGGTGGAGCCTGC
2163 :     GGTTTAATTGGATTCAACGCCGGGCATCTTACCAGGGGCGACGGCAGGATGAAGGCCAGG
2164 :     TTGACGACCTTGCCAGACGCGCCGAGAGGTGGTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTACCGTG
2165 :     AGGCGTCCTGTTAAGTCAGGTAACGAGCGAGACCCGTGCCCCATGTTGCTACCTCCTCCT
2166 :     CCGGGAGGAGGGCACTCATGGGGGACCGCCGGCGCTAAGCCGGAGGAAGGTGCGGGCAAC
2167 :     GACAGGTCCGCATGCCCCGAATCCCCTGGGCTACACGCGGGCTACAATGGCCGGGACAAT
2168 :     GGGACGCGACCCCGAAAGGGGGAGCGAATCCCCTAAACCCGGTCGTAGTCCGGATCGAGG
2169 :     GCTGTAACTCGCCCTCGTGAAGCCGGAATCCGTAGTAATCGCGCCTCACCATGGCGCGGT
2170 :     GAATGCGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCACGCCACCCGAGTTGAGCCCAAGTG
2171 :     AGGCCCTGTCCGCAAGGGCAGGGTCGAACTTGGGTTCAGCGAGGGGGGCGAAGTCGTAAC
2172 :     AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTG
2173 :     >Meth.therm Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H [fig|187420.1.rna.37]
2174 :     ATTCCGTTTGATCCTGGCGGAGGCTACTGCTATTGGGGTTCGATTAAGCCATGCAAGTCG
2175 :     AACGAACCTTGTGTTCGTGGCGAACGGCTCAGTAACACGTGGATAACCTGCCCTTGGGAC
2176 :     CGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGATAAACCCGGATAGGTGATGCTGCCTGGAATGGTTC
2177 :     TTCACCGAAACACCTTCGGGTGCCCAAGGATGGGTCTGCGGCCGATTAGGTTGTTGGTAG
2178 :     GGTAACGGCCTACCAAGCCGATCATCGGTACGGGTTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGATGG
2179 :     AACCTGAGACAAGGTTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTCCGCAATGCA
2180 :     CGCAAGTGCGACGGGGGAACCCCAAGTGCCACTCTTAACGGGGTGGCTTTTCAGAAGTGT
2181 :     AAAAAGCTTCTGGAATAAGGGCTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAACACCGGC
2182 :     AGCTCAAGTGGTAGCCGCTTTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCGGTCTGATAAGTCT
2183 :     CTGGTGAAATCCCACAGCTTAACTGTGGGAATTGCTGGAGATACTATCATGACTCGAGGT
2184 :     CGGGAGAGGCTGGAGGTACTCCCAGGGTAGGGGTGAAATCCTGTAATCCTGGGAGGACCA
2185 :     CCTGTGGCGAAGGCGTCCAGCTGGAACGAACCTGACGGTGAGGGACGAAAGCCAGGGGCG
2186 :     CGAACCGGATTAGATACTCGGGTAGTCCTGGCCGTAAACGATGTGGACTTGGTGTTGGGA
2187 :     TGGCTTCGAGCTGCCCCAGTGCCGAAGGGAAGCTGTTAAGTCCACCGCCTGGGAAGTACG
2188 :     GCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCACAACGCGTGGAGCCTGCG
2189 :     GTTTAATTGGATTCAACGCCGGACATCTCACCAGGGGCGACAGCAGTATGATGGCCAGGT
2190 :     TGATGACCTTGCCTGACGAGCTGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTACCGTGA
2191 :     GGCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCACGCCCTTAGTTACCAGCGGAACCCT
2192 :     TATGGGTTGCCGGGCACACTAAGGGGACCGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGAGTGGACG
2193 :     ACGGTAGGTCCGTATGCCCCGAATCCCCTGGGCAACACGCGGGCTACAATGGCCTGGACA
2194 :     ATGGGTTCCGACACCGAAAGGTGGAGGTAATCCCCTAAACCAGGTCGTAGTTCGGATCGA
2195 :     GGGCTGTAACCCGCCCTCGTGAAGCTGGAATGCGTAGTAATCGCGTGTCACTATCGCGCG
2196 :     GTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCACGCCACCCAAAAAGGGCTTGGA
2197 :     TGAGGCCACAACATTCTGTTGTGGTCGAATCTGGGTTCTTTGAGGAGGGCGAAGTCGTAA
2198 :     CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT
2199 :     >Meth.aceti Methanosarcina acetivorans C2A [fig|188937.1.rna.10]
2200 :     ATTCTGGTTGATCCTGCCAGAGGTTACTGCTATCGGTGTTCGCCTAAGCCATGCGAGTCA
2201 :     TATGTTCTTTGTGAACATGGCGTACTGCTCAGTAACACGTGGATAACCTGCCCTTGGGTC
2202 :     CGGCATAACCCCGGGAAACTGGGGATAATACCGGATAACGCACATATGCTGGAATGCTTT
2203 :     CTGCGTAAAACGGATTCGTCTGCCCAAGGATGGGTCTGCGGCCTATCAGGTAGTAGTGGG
2204 :     TGTAACGTACCTACTAGCCGACAACGGGTACGGGTTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGATGG
2205 :     ATTCTGAGACATGAATCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAAACTTTACAATGCG
2206 :     GGAAACCGTGATAAGGGGACACCGAGTGCCAGCATCATATGCTGGCTGTCCGGATGTGTA
2207 :     AAATACATCTGTTAGCAAGGGCCGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAACACCGGC
2208 :     GGCCCGAGTGGTGATCGTGATTATTGGGTCTAAAGGGTCCGTAGCCGGTTTGGTCAGTCC
2209 :     TCCGGGAAATCTGACAGCTCAACTGTTAGGCTTTCGGGGGATACTGCCAGACTTGGAACC
2210 :     GGGAGAGGTAAGAGGTACTACAGGGGTAGGAGTGAAATCTTGTAATCCCTGTGGGACCAC
2211 :     CTGTGGCGAAGGCGTCTTACCAGAACGGGTTCGACGGTGAGGGACGAAAGCTGGGGGCAC
2212 :     GAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCCAGCCGTAAACGATGCTCGCTAGGTGTCAGGCA
2213 :     TGGCGCGACCGTGTCTGGTGCCGCAGGGAAGCCGTGAAGCGAGCCACCTGGGAAGTACGG
2214 :     CCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACAACAACGGGTGGAGCCTGCGG
2215 :     TTTAATTGGACTCAACGCCGGACAACTCACCGGGGACGACAGCAATATGTAGGCCAGGCC
2216 :     GAAGACCTTGCCTGAATCGCTGAGAGGAGGTGCATGGCCGTCGCCAGTTCGTACTGTGAA
2217 :     GCATCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGTGCCCACTGTTACCAGCATGTCCTCC
2218 :     GGGACGATGGGTACTCTGTGGGGACCGCCGGTGTTAAATCGGAGGAAGGTGCGGGCCACG
2219 :     GTAGGTCAGTATGCCCCGAATTTCCCGGGCTACACGCGGGCTACAATGAATGGGACAATG
2220 :     GGTCCCTCCCCTGAAAAGGGCTGGTAATCTCACAAACCCATCCGTAGTTCGGATCGAGGG
2221 :     CTGTAACTCGCCCTCGTGAAGCTGGAATCCGTAGTAATCGCGTTTCAATATAGCGCGGTG
2222 :     AATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAACCACCCGAGTGAGGTATGGGTGA
2223 :     GGGCACGGACTTCGTGCCGTGTTCGAACCTGAATTTTGCAAGGGGGGTTAAGTCGTAACA
2224 :     AGGTAGCCGTAGGGGAATCTGCGGCTGGATCACCTCCTA
2225 :     >Arch.fulgi Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 [fig|224325.1]
2226 :     ATTCTGGTTGATCCTGCCAGAGGCCGCTGCTATCCGGCTGGGACTAAGCCATGCGAGTCA
2227 :     AGGGGCTTGTATCCCTTCGGGGATGCAAGCACCGGCGGACGGCTCAGTAACACGTGGACA
2228 :     ACCTGCCCTCGGGTGGGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCCATAGGGGATGG
2229 :     GTACTGGAATGTCCCATCTCCGAAAGCGCTTAGCGCCCGAGGATGGGTCTGCGGCGGATT
2230 :     AGGTTGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGAAGATCCGTACGGGCCATGAGAGTGGG
2231 :     AGCCCGGAGATGGACCCTGAGACACGGGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAA
2232 :     CCTCCGCAATGCGGGAAACCGCGACGGGGTCAGCCGGAGTGCTCGCGCATCGCGCGGGCT
2233 :     GTCGGGGTGCCTAAAAAGCACCCCACAGCAAGGGCCGGGCAAGGCCGGTGGCAGCCGCCG
2234 :     CGGTAATACCGGCGGCCCGAGTGGCGGCCACTTTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCG
2235 :     GGCTGGTAAGTCCTCCGGGAAATCTGGCGGCTTAACCGTCAGACTGCCGGAGGATACTGC
2236 :     CAGCCTAGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGTATTCCCGGAGTAGGGGTGAAATCCTGTAATC
2237 :     CCGGGAGGACCACCTGTGGCGAAGGCGCCCGGCTGGAACGGGTCCGACGGTGAGGGACGA
2238 :     AGGCCAGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACGATGCGGAC
2239 :     TAGGTGTCACCGAAGCTACGAGCTTCGGTGGTGCCGGAGGGAAGCCGTTAAGTCCGCCGC
2240 :     CTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACGG
2241 :     GTGGAGCCTGCGGTTTAATTGGATTCAACGCCGGGAAGCTTACCGGGGGAGACAGCGGGA
2242 :     TGAAGGTCGGGCTGAAGACCTTACCAGACTAGCTGAGAGGTGGTGCATGGCCGCCGTCAG
2243 :     TTCGTACTGTGAAGCATCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGTTGC
2244 :     CAGCGGTTCCCTTCGGGGAAGCCGGGCACACTGGGGGGACTGCCGGCGCTAAGCCGGAGG
2245 :     AAGGTGCGGGCAACGGCAGGTCCGTATGCCCCGAATCCCCCGGGCTACACGCGGGCTACA
2246 :     ATGGCCGGGACAATGGGTACCGACCCCGAAAGGGGTAGGTAATCCCCTAAACCCGGTCTA
2247 :     ACCTGGGATCGAGGGCTGCAACTCGCCCTCGTGAACCTGGAATCCGTAGTAATCGCGCCT
2248 :     CAAAATGGCGCGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAGCCACCCGA
2249 :     GTGGGCCAGGGGCGAGGGGGTGGCCCTAGGCCACCTTCGAGCCCAGGGTCCGCGAGGGGG
2250 :     GCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAATCTGCGGCTGGATCACCTCCTA
2251 :     >Ther.volca Thermoplasma volcanium GSS1 [fig|273116.1.rna.47]
2252 :     ACTCCGGTCGATCCTGCCGGCGGTCACTGCTATCAGGTTCCGACTAAGCCATGCAAGTCA
2253 :     CGGGGCCGTAAGGCACCGGCGAACAGCTCAGTAACACGTGGATAATTTACCCTCAGGTGG
2254 :     GGTATAACCTCGGGAAACTGAGGCTAATCCCCCATAGTCATTACAAACTGGAACGTTGTA
2255 :     ATGATGAAAGCTCCGGCGCCTGAGGATAAGTCTGCGGCCTATCAGGTAGTAGGTGGTGTA
2256 :     AAGGACCACCTAGCCTAAGACGGGTACGGGCCCTGAAAGGGGGAGCCCGGAGATGGACTC
2257 :     TGAGACAACAGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAAACTGTGCAATGCGCGAA
2258 :     AGCGCGACACGGGGAACCTGAGTGCCTTGACTTTTCGTCAAGGCTTTTCTGATGCCTAAA
2259 :     AAGCATCAGGAATAAGGGCTGGGCAAGACGGGTGCCAGCCGCCGCGGTAACACCCGCAGC
2260 :     TCGAGTGGTGATCACTTTTATTGAGTCTAAAGCGTCCGTAACCGGTCTTATAAATCTTCA
2261 :     GATAAATTCTCCCGCTTAACGGAAGAACTTCTGAAGAGACTGTAAGACTTGGGACCGGGT
2262 :     GAGGTTGAATGTACTTTCAGGGTAGGGGTAAAATCCTGTAATCCTGAAAGGACGACCGGT
2263 :     GGCGAAAGCGTTCAACTAGAACGGATCCGACGGTGAGGGACGAAGGCTAGGGGAGCAAAC
2264 :     CGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTAGCTGTAAACGCTGCCCACTTGGTGTTGCTTCTCCG
2265 :     TTGAGGGGGAGCAGTGCCGTAGCGAAGGTGTTAAGTGGGTCACTTGGGGAGTACGGCCGC
2266 :     AAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCGCAACGGGAGGAGCGTGCGGTTTA
2267 :     ATTGGATTCAACGCCGGAAAACTCACCGGGAGCGACCTTCGGATGAGGGTCAACCTGACG
2268 :     AATTTACCCGATAGAAGGAGAGGTGGTGCATGGCCGTCGTCAGCTCGTACCGTAGGGCGT
2269 :     TCACTTAAGTGTGATAACGAGCAAGACCCCCATCTCTAATTGCTAAGCTTTCTTAGCGGG
2270 :     AAGCTGCACTTTAGAGGGACCGCCAGCGCTAAGCTGGAGGAAGGAGGGGTCGACGGCAGG
2271 :     TCAGTACGCCCCGAATCTCCCGGGCTACACGCGCGCTACAAAGGACGGGACAATGAGTTG
2272 :     CAACCTCGAAAGGGGAAGCTAACCTCGAAACCCGTTCGTAGTCAGGACTGAGGGCTGTAA
2273 :     CTCGCCCTCACGAATGTGGATTCCGTAGTAATCGTAGGTCAACAGCCTACGGTGAATATG
2274 :     CCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAACCATCCGAGCTGGTGTTGGATGAGGGTCT
2275 :     GTCCATTGGATGGATTCGAATCTGATGTCAGTGAGGAGGGTTAAGTCGTAACAAGGTATC
2276 :     CGTAGGGGAACCTGCGGATGGATCACCTCCA
2277 :     >Halo.NRC-1 Halobacterium sp. NRC-1 [fig|64091.1.rna.42]
2278 :     ATTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCATTGCTATCGGAGTCCGATTTAGCCATGCTAGTTG
2279 :     TGCGGGTTTAGACCCGCAGCGGAAAGCTCAGTAACACGTGGCCAAGCTACCCTGTGGACG
2280 :     GGAATACTCTCGGGAAACTGAGGCTAATCCCCGATAACGCTTTGCTCCTGGAAGGGGCAA
2281 :     AGCCGGAAACGCTCCGGCGCCACAGGATGCGGCTGCGGTCGATTAGGTAGACGGTGGGGT
2282 :     AACGGCCCACCGTGCCCATAATCGGTACGGGTTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAAT
2283 :     CTGAGACAAGATTCCGGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTTTACACTGTACGA
2284 :     AAGTGCGATAAGGGGACTCCGAGTGTGAAGGCATAGAGCCTTCACTTTTGTACACCGTAA
2285 :     GGTGGTGCACGAATAAGGACTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAATACCGGCAG
2286 :     TCCGAGTGATGGCCGATCTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCTGGCTGAACAAGTCCGT
2287 :     TGGGAAATCTGTCCGCTTAACGGGCAGGCGTCCAGCGGAAACTGTTCAGCTTGGGACCGG
2288 :     AAGACCTGAGGGGTACGTCTGGGGTAGGAGTGAAATCCTGTAATCCTGGACGGACCGCCG
2289 :     GTGGCGAAAGCGCCTCAGGAGAACGGATCCGACAGTGAGGGACGAAAGCTAGGGTCTCGA
2290 :     ACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTAGCTGTAAACGATGTCCGCTAGGTGTGGCGCAGG
2291 :     CTACGAGCCTGCGCTGTGCCGTAGGGAAGCCGAGAAGCGGACCGCCTGGGAAGTACGTCT
2292 :     GCAAGGATGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACCGGAGGAGCCTGCGGTT
2293 :     TAATTGGACTCAACGCCGGACATCTCACCAGCCCCGACAGTAGTAATGACGGTCAGGTTG
2294 :     ATGACCTTACCCGAGGCTACTGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTACCGTGAG
2295 :     GCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACTCCTAATTGCCAGCAGTACCCTT
2296 :     TGGGTAGCTGGGTACATTAGGTGGACTGCCGCTGCCAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAAC
2297 :     GGTAGGTCAGTATGCCCCGAATGGGCTGGGCAACACGCGGGCTACAATGGTCGAGACAAT
2298 :     GGGAAGCCACTCCGAGAGGAGGCGCTAATCTCCTAAACTCGATCGTAGTTCGGATTGAGG
2299 :     GCTGAAACTCGCCCTCATGAAGCTGGATTCGGTAGTAATCGCGTGTCAGCAGCGCGCGGT
2300 :     GAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCAAATCACCCGAGTGGGGTTCGGATG
2301 :     AGGCCGGCATGCGCTGGTCAAATCTGGGCTCCGCAAGGGGGATTAAGTCGTAACAAGGTA
2302 :     GCCGTAGGGGAATCTGCGGCTGGATCACCTCCTA
2303 :     >Pyro.horik Pyrococcus horikoshii OT3 [fig|70601.1.rna.4]
2304 :     ATTCCGGTTGATCCTGCCGGAGGCCACTGCTATGGGGGTCCGACTAAGCCATGCGAGTCA
2305 :     AGGGGGCGTCCCTTCTGGGACGCCACCGGCGGACGGCTCAGTAACACGTCGGTAACCTAC
2306 :     CCTCGGGAGGGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCCATAGGCCTGGGGTACTG
2307 :     GAAGGTCCCCAGGCCGAAAGGGAGCCGTAAGGCTCCGCCCGAGGATGGGCCGGCGGCCGA
2308 :     TTAGGTAGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGCCGAAGATCGGTACGGGCCGTGAGAGCG
2309 :     GGAGCCCGGAGATGGACACTGAGACACGGGTCCAGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGA
2310 :     AACCTCCGCAATGCGGGAAACCGCGACGGGGGGACCCCCAGTGCCGTGCCTCTGGCACGG
2311 :     CTTTTCCGGAGTGTAAAAAGCTCCGGGAATAAGGGCTGGGCAAGGCCGGTGGCAGCCGCC
2312 :     GCGGTAATACCGGCGGCCCGAGTGGTGGCCACTATTATTGGGCCTAAAGCGGCCGTAGCC
2313 :     GGGCCCGTAAGTCCCTGGCGAAATCCCACGGCTCAACCGTGGGGCTCGCTGGGGATACTG
2314 :     CGGGCCTTGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGTACCCCCGGGGTAGGGGTGAAATCCTATAAT
2315 :     CCCGGGGGGACCGCCAGTGGCGAAGGCGCCCGGCTGGAACGGGTCCGACGGTGAGGGCCG
2316 :     AAGGCCAGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAAGGATGCGGG
2317 :     CTAGGTGTCGGGCGAGCTTCGAGCTCGCCCGGTGCCGTAGGGAAGCCGTTAAGCCCGCCG
2318 :     CCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAAGG
2319 :     GGTGGAGCGTGCGGTTTAATTGGATTCAACGCCGGGAACCTCACCGGGGGCGACGGCAGG
2320 :     ATGAAGGCCAGGCTGAAGGTCTTGCCGGACGCGCCGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCA
2321 :     GCTCGTACCGTGAGGCGTCCACTTAAGTGTGGTAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGTTG
2322 :     CCAGTCCCTCCCGCTCGGGAGGGAGGCACTCTGGGGGGACTGCCGGCGATAAGCCGGAGG
2323 :     AAGGGGCGGGCGACGGTAGGTCAGTATGCCCCGAAACCCCCGGGCTACACGCGCGCTACA
2324 :     ATGGGCGGGACAATGGGTGCCGACCCCGAAAGGGGGAGGTAATCCCCTAAACCCGCCCTC
2325 :     AGTTCGGATCGCGGGCTGCAACTCGCCCGCGTGAAGCTGGAATCCCTAGTACCCGCGCGT
2326 :     CATCATCGCGCGGCGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCACTCCACCCGA
2327 :     GCGGGGCCTAGGTGAGGCCCGATCTCCTTCGGGAGGTCGGGTCGAGCCTAGGCTCCGTGA
2328 :     GGGGGGAGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTACGGCTCGATCACCTCCTA
2329 :     >Sulf.solfa Sulfolobus solfataricus P2 [fig|273057.1.rna.44]
2330 :     AATCCGGTTGATCCTGCCGGACCCGACCGCTATCGGGGTGGGGCTAAGCCATGGGAGTCG
2331 :     TACGCTCCCGGGCAAGGGAGCGTGGCGGACGGCTGAGTAACACGTGGCTAACCTACCCTG
2332 :     AGGAGGGAGATAACCCCGGGAAACTGGGGATAATCTCCCATAGGCGAGGAGTCCTGGAAC
2333 :     GGTTCCTCGCTGAAAGGCTCATGGGCTATTCCCCGCTCATGAGCGCCTCAGGATGGGGCT
2334 :     GCGGCCCATCAGGTAGTTGGGGGGGTAAGGGCCCCCCAAGCCTATAACGGGTAGGGGCCG
2335 :     TGAGAGCGGGAGCCCCCAGTTGGGCACTGAGACAAGGGCCCAGGCCCTACGGGGCGCACC
2336 :     AGGCGCGAAACGTCCCCAATGCGCGGAAGCGTGAGGGCGCCACCCCGAGTGCTCCCGTAA
2337 :     GGGAGCTTTTCCCCGCTCTACAAAGGCGGGGGAATAAGCGGGGGGCAAGTCTGGTGTCAG
2338 :     CCGCCGCGGTAATACCAGCCCCGCGAGTGGTCGGGACTCTTACTGGGCCTAAAGCGCCCG
2339 :     TAGCCGGCCCGACAAGTCACTCCTTAAAGACCCCGGCTCAACCGGGGGAATGGGGGTGAT
2340 :     ACTGTCGGGCTAGGGGGCGGGAGAGGCCAGCGGTACTCCCGGAGTAGGGGCGAAATCCTC
2341 :     AGATCTCGGGAGGACCACCAGTGGCGAAAGCGGCTGGCTAGAACGCGCCCGACGGTGAGG
2342 :     GGCGAAAGCCGGGGCAGCAAAAGGGATTAGATACCCCTGTAGTCCCGGCTGTAAACAATG
2343 :     CAGGCTAGGTGTCACATGGGCTTAGAGCCCATGTGGTGCCGCAGGGAAGCCGTTAAGCCT
2344 :     GCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCAC
2345 :     AAGGGGTGGAACCTGCGGCTCAATTGGAGTCAACGCCTGGAATCTTACTAGGGGAGACCG
2346 :     CAGGATGACGGCCAGGCTAACGACCTTGCCTGACTCGCGGAGAGGAGGTGCATGGCCGTC
2347 :     GCCAGCTCGTGTTGTGAAATGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCCCACCACTA
2348 :     GTTGGTATCCTGGTCTCCGGGCCGGGACCACACTAGTGGGACTGCCGGCGTAAGCCGGAG
2349 :     GAGGGAGGGGGCCACGGCAGGTCAGCATGCCCCGAAACCCCTGGGCCGCACGCGGGTTAC
2350 :     AATGGCAGGGACAGCGGGATTCCGACCCCGAAAGGGGAAGGTAATCCCTTAAACCCTGCC
2351 :     GCAGTTGGGATCGAGGGCTGAAACTCGCCCTCGTGAACGAGGAATCCCTAGTAACCGCAG
2352 :     ATCAACAATCTGCGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACCGCCCGTCGCTCCACCC
2353 :     GAGTAGGAGAGGGGTGAGGCCCCTTGCCTTTGGGTGGGGGGTCGAGCTTCTCTCCTGCAA
2354 :     GGGGGGAGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCA
2355 :     >Aero.perni Aeropyrum pernix K1 (intron removed) [fig|272557.1]
2356 :     GTAACTCCGGTTGATCCTGCCGGACCCGACCGCTATCGGGGTAGGGCTAAGCCATGGGAG
2357 :     TCGAACGCCCCGCCGCTGCGGGGCGTGGCGGACGGCTGAGTAACACGTGGCTAACCTACC
2358 :     CTCGGGACGGGGATAACCCCTCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCGATAGGCGGGGGGTGCC
2359 :     TGGAAGGGTCCTCCGCCGAAAGGGGCCGCGGGGGGTTATCGCCCGCGGTCCGCCCGAGGA
2360 :     TGGGGCTGCGGCCCATCACGGTAGTTGGCGGGGTAATGGCCCGCCAAGCCTACGACGGGT
2361 :     AGGGGCCGTGAGAGCGGGAGCCCCCAGATGGGCACTGAGACAAGGGCCCAGGCCCTACGG
2362 :     GGCGCACCAGGCGCGAAAACTCCGCAATGCGGGCAACCGTGACGGGGCTACCCCGAGTGC
2363 :     CCCCCTTGGGGGGGCTTTTCCCCGCTGTAAGTAGGCGGGGGAATAAGCGGGGGGCAAGAC
2364 :     TGGTGTCAGCCGCCGCGGTAATACCAGCCCCGCGAGCGGTCGGGGTGCTTACTGGGCCTA
2365 :     AAGCGCCCGTAGCCGGCTCGACAAGTCCCCGCCTAAAGCCCCGGGCTCAACCCGGGGAGT
2366 :     GGCGGGGATACTGTCGGGCTAGGGGGCGGGAGAGGCCGAGGGTACTCCCGGGGTAGGGGC
2367 :     GAAATCCATTAATCCCGGGAGGACCACCAGTGGCGAAGGCGCTCGGCTGGAACGCGCCCG
2368 :     ACGGTGAGGGGCGAAAGCCGGGGGAGCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCCGGCTG
2369 :     TAAACGATGCGGGCTAGGTGTTGGGCGGGCGTGCGAGCCCGCCCAGTGCCGCAGGGAAGC
2370 :     CGTTAAGCCCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGG
2371 :     GGAGCACCACAAGGGGTGGAGCCTGCGGCTTAATTGGAGTCAACGCCGGGAACCTCCACC
2372 :     GGGGGCGACAGCAGGATGACGGCCAGGCTGAAGGCCTTGCCCGACGCGCTGAGGGGAGAT
2373 :     GCATGGCCGTCGCCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGAC
2374 :     CCCCGCCCCTAGTTGCCATCCCCGGGGCGACCCGGGGGGCACACTAGGGGGACTGCCGCC
2375 :     GCTAAGGCGGAGGAAGGAGGGGGCAACGGCAGGTCAGCATGCCCCTAAACCCCCGGGCTG
2376 :     CACGCGGGCTACAATGGCGGGGACAGCGGGTGCCGACCCCGAAAGGGGGAGGCAATCCCT
2377 :     CAAACCCCGCCTCAGTTGGGATCGAGGGCTGCAACTCGCCCTCGTGAACGTGGAATCCCT
2378 :     AGTAACCGCGCGTCATCATCGCGCGGTGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACACACTGCCCG
2379 :     TCGCTCCACCCGAGGGGGGAGGGGGTGAGGCCCTCTCCGCCGGGAGGGGGTCGAACCCCC
2380 :     TCCCCCCGAGGGGGGAGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCA
2381 :     CCTCCCG
2382 :     >Pyro.aerop Pyrobaculum aerophilum str. IM2 (intron removed) [fig|178306.1]
2383 :     CCGGTTGATCCTGCCGGACCCGACCGCTATCGGGGTAGGGCTAAGCCATGCGAGTCGCGC
2384 :     GCCCGGGGGCGCCCGGGAGCGGCGCACGGCTCAGTAACACGTGCCTAACCTAACCTCGGG
2385 :     AGGGGGACACCCCCGGGAAACTGGGGTCAATCCCCCATAGGGGAAGGGCGCTGGAAGGCC
2386 :     CCTTCCCCGAAAGGGATGGCGGCCGATCCGCCGCCGTCCGCCCGAGGGTGGGGGCACGGC
2387 :     CCATCAGGTAGTTGGCGGGTTAAAGGCCCGCCAAGCCGAAGACGGGTAGGGGCGGTGAGA
2388 :     GCCGCGAGCCCCGAGATCGGCACTGAGACAAGGGCCGAGGCCCTACGGGGTGCAGCAGGC
2389 :     GCGAATACTCCGGAATGCGGGCAACCGCGACGGGGCTACCCCGAGTGCCGGGCGAAGAGC
2390 :     CCGGCTTTTGCCCGGTCTAAAACGCCGGGCGAATAAGCGGGGGGCAAGTCTGGTGTCAGC
2391 :     CGCCGCGGTAATACCAGCTCCGCGAGTGGTCGGGGTGTTTACTGGGCTTAAAGCGCCCGT
2392 :     AGCCGGCCCGGCAAGTCGCTCCTGAAATCCCCGGGCTCAACCCGGGGGCGGGGGGCGATA
2393 :     CTGCCGGGCTAGGGGGCGGGAGAGGCCGCCGGTACTCCGGGGGTAGGGGCGAAATCCGTT
2394 :     AATCCCCGGAGGACCACCAGTGGCGAAAGCGGGCGGCCAGAACGCGCCCGACGGTGAGGG
2395 :     GCGAAAGCCGGGGGAGCAAAGGGGATTAGATACCCCTGTAGTCCCGGCCGTAAACGATGC
2396 :     GGGCTAGCTGTCGGTCGGGCTTAGGGCCCGGCCGGTGGCGAAGGGAAACCGTTAAGCCCG
2397 :     CCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGGGCACCACA
2398 :     AGGGGTGAAGCTTGCGGCTTAATTGGAGTCAACGCCGGAAACCTCACCCGGGGCGACAGC
2399 :     AGGATGAAGGCCAGGCTAACGACCTTGCCGGACGAGCTGAGAGGAGGTGCATGGCCGTCG
2400 :     TCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTCCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGAGACCCCCGCCCCTAG
2401 :     TTGCTACCCCGTCCTTCGGGACGGGGGGCACACTAGGGGGACTGCCGGCGTAAGCCGGAG
2402 :     GAAGGAGGGGGCCACGGCAGGTCAGTATGCCCCGAAACCCCGGGGCTGCACGCGAGCTGC
2403 :     AATGGCGGGGACAGCGGGATCCGACCCCGAAAGGGGGAGGCAATCCCGTAAACCCCGCCC
2404 :     CAGTAGGGATCGAGGGTTGCAACTCGCCCTCGTGAACGTGGAATCCCTAGTAACCGCGTG
2405 :     TCACCAACGCGCGGTGAATACGTCCCTGCCCCTTGCACACACCGCCCGTCGCACCACCCG
2406 :     AGGGAGCCCTCTGCGAGGCCCCTCGCCGAAGAGGTGGGGGGACGAGCAGGGGGCTCCCAA
2407 :     GGGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCA
2408 :     >Nano.equit Nanoarchaeum equitans Kin4-M [fig|228908.1]
2409 :     ACTCCCGTTGATCCTGCGGGAGGCCACCGCTATCTCCGTCCGGCTAACCCATGGAAGGCG
2410 :     AGGGTCCCCGGGTAAGGGGGCCCGCCGCACGGCTGAGTAACACGTCGGTAACCTACCCTC
2411 :     GGGACGGGGATAACCCCGGGAAACTGGGGCTAATCCCCGATAGGGGATGGGTGCTGGAAG
2412 :     GCCCCATCCCCGAGAGGGGCTAGCGGTACTTCCCCCGCTAGCCCGCCCGAGGATGGGCCG
2413 :     GCGGCCCATCAGGTAGTTGGCGGGGTAATGGCCCGCCAAGCCGAAGACGGGTAGGGGCCG
2414 :     TGAGAGCGGGAGCCCCCAGATCGGCACTGAGACAAGGGCCGAGGCCCTACGGGGCGCACC
2415 :     AGGGGCGAAACCTCCGCAATGCGGGAAACCGTGACGGGGGGACGGAGAGTGCCGGAGGGC
2416 :     GTTATGCTCTCCGGCTTTTGGGGAGTGTAAGTAGCTCCCCGAATAAGCGGTGGGCAAGAG
2417 :     GGGTGGCAGCCGCCGCGGGAACACCCCCACCGCGAGCGGTGGCCGTGATTATTGGGCCTA
2418 :     AAGGGGCCGTAGCCGGGCCGGTGTGGCTCCGGTGAAATCCTCGGGCTCAACCCGAGGGCG
2419 :     CGCCGGAGCTACTACCGGCCTAGGGACCGGGAGGGGCCGACCGTACTCCCGGGGGAGCGG
2420 :     TGAAATGCTGTAATCCCGGGAGGACGACCCGTGGCGAAAGCGGTCGGCCAGAACGGGTCC
2421 :     GACGGTGAGGGCCGAAGGCCGGGGGCTAGAACGGGATTAGAGACCCCGGTATTCCCGGCT
2422 :     GTCAACGCTGCGGGCTACCTGCTGGGCGGGCTACGAGCCCGCCCAGTGGGGTAGGGAAGC
2423 :     CGTTAAGCCCGCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATAGGCGGG
2424 :     GGAGCACACAAGAGGTGGGGTGCGCGGTTTAATTGGATTCGACGCCGGGAACCTCACCGG
2425 :     GGCTGACAGCACAATGATGGTCGGCCTGAAGGGCCTACCGGAGGCGCTGAGAGGAGGTGC
2426 :     ATGGCCGCCGTCAGCCTGTGCCGTGAGGTGCCCTGTTAAGTCAGGAAACAGGCGAGACCC
2427 :     GCGCCCGCAGTTGCGACGGCCGAAAGGCCGGCACACTGCGGGGACTGCCGGGGAAACCCG
2428 :     GAGGAAGGTGCGGGCGACGGCAGGTATGCATGCCCCGAATGCCCCGGGCTACACGCGCGC
2429 :     ATCAATGGGCGGGACAGGGGGCCGCGACCCCGAAAGGGGGAGCAAATCCCCAAACCCGCT
2430 :     CTCAGTCCAGATCGAGGGCTGCAACTCGCCCTCGTGACGGCGGAATCTCTAGTAGTCGGA
2431 :     CGTCACCAGCGTCCGGCGAATACGTCCCTGCTCCTTGCACTCACCGCCCGTCAAGCCACC
2432 :     CGAGCTGGGGCCTAGCGAGGCCGTGGGGGGTTCGCCCCCCACGGTCGAGCTAGGCCCCGG
2433 :     CGAGGGGGGCTAAGTCGACACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT
2434 :     A

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