[Bio] / FigKernelPackages / Observation.pm Repository:
ViewVC logotype

Diff of /FigKernelPackages/Observation.pm

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1.46, Thu Nov 29 19:33:33 2007 UTC revision 1.48, Tue Dec 4 20:41:34 2007 UTC
# Line 942  Line 942 
942      my $lines = [];      my $lines = [];
943      my $line_data = [];      my $line_data = [];
944      my $line_config = { 'title' => "PDB hit for $fid",      my $line_config = { 'title' => "PDB hit for $fid",
945                            'hover_title' => 'PDB',
946                          'short_title' => "best PDB",                          'short_title' => "best PDB",
947                          'basepair_offset' => '1' };                          'basepair_offset' => '1' };
948    
# Line 1218  Line 1219 
1219      my $short_title = $thing->acc;      my $short_title = $thing->acc;
1220      $short_title =~ s/::/ - /ig;      $short_title =~ s/::/ - /ig;
1221      my $line_config = { 'title' => $name_value,      my $line_config = { 'title' => $name_value,
1222                            'hover_title', => 'Domain',
1223                          'short_title' => $short_title,                          'short_title' => $short_title,
1224                          'basepair_offset' => '1' };                          'basepair_offset' => '1' };
1225    
# Line 1396  Line 1398 
1398    
1399          my $line_config = { 'title' => 'Localization Evidence',          my $line_config = { 'title' => 'Localization Evidence',
1400                              'short_title' => 'CELLO',                              'short_title' => 'CELLO',
1401                                'hover_title' => 'Localization',
1402                              'basepair_offset' => '1' };                              'basepair_offset' => '1' };
1403    
1404          my $description_cello_location = {"title" => 'Best Cello Location',          my $description_cello_location = {"title" => 'Best Cello Location',
# Line 1455  Line 1458 
1458          my $line_data =[];          my $line_data =[];
1459          my $line_config = { 'title' => 'Localization Evidence, Transmembrane and Signal Peptide',          my $line_config = { 'title' => 'Localization Evidence, Transmembrane and Signal Peptide',
1460                              'short_title' => 'TM and SP',                              'short_title' => 'TM and SP',
1461                                'hover_title' => 'Localization',
1462                              'basepair_offset' => '1' };                              'basepair_offset' => '1' };
1463    
1464          foreach my $tm_loc (@phobius_tm_locations){          foreach my $tm_loc (@phobius_tm_locations){
# Line 1508  Line 1512 
1512    
1513          my $line_config = { 'title' => 'Localization Evidence',          my $line_config = { 'title' => 'Localization Evidence',
1514                              'short_title' => 'SignalP',                              'short_title' => 'SignalP',
1515                                'hover_title' => 'Localization',
1516                              'basepair_offset' => '1' };                              'basepair_offset' => '1' };
1517    
1518          my $description_signal_peptide_score = {"title" => 'signal peptide score',          my $description_signal_peptide_score = {"title" => 'signal peptide score',
# Line 1852  Line 1857 
1857      }      }
1858    
1859      my $line_config = { 'title' => $peg,      my $line_config = { 'title' => $peg,
1860                            'hover_title' => 'Domain',
1861                          'short_title' => $peg,                          'short_title' => $peg,
1862                          'basepair_offset' => '1' };                          'basepair_offset' => '1' };
1863    
# Line 2613  Line 2619 
2619          $org = $fig->org_of($id);          $org = $fig->org_of($id);
2620          $function = $fig->function_of($id);          $function = $fig->function_of($id);
2621          if ($mypeg ne $id){          if ($mypeg ne $id){
2622              $function_cell = "<input type=\"radio\" name=\"function\" id=\"$id\" value=\"$function\" onClick=\"clearText('newAnnotation');\">&nbsp;&nbsp;$function";              $function_cell = "<input type='radio' name='function' id='$id' value='$function' onClick=\"clearText('setAnnotation');\">&nbsp;&nbsp;$function";
2623              $id_cell .= &HTML::set_prot_links($cgi,$id);              $id_cell .= "<a href='?page=Annotation&feature=$id'>$id</a>"; # &HTML::set_prot_links($cgi,$id);
2624              if (defined($e_identical{$id})) { $id_cell .= "*";}              if (defined($e_identical{$id})) { $id_cell .= "*";}
2625          }          }
2626          else{          else{
2627              $function_cell = "&nbsp;&nbsp;$function";              $function_cell = "&nbsp;&nbsp;$function";
2628              $id_cell = "<input type=checkbox name=peg id=peg$count value=$id checked=true>";              $id_cell = "<input type='checkbox' name='peg' id='peg$count' value='$id' checked='true'>";
2629              $id_cell .= &HTML::set_prot_links($cgi,$id);              $id_cell .= "<a href='?page=Annotation&feature=$id'>$id</a>"; # &HTML::set_prot_links($cgi,$id);
2630          }          }
2631    
2632          push(@$row_data,$id_cell);          push(@$row_data,$id_cell);

Legend:
Removed from v.1.46  
changed lines
  Added in v.1.48

MCS Webmaster
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3