[Bio] / FigKernelPackages / FigGFF.pm Repository:
ViewVC logotype

Diff of /FigKernelPackages/FigGFF.pm

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1.16, Wed Sep 28 17:02:34 2005 UTC revision 1.17, Thu Sep 29 18:59:01 2005 UTC
# Line 57  Line 57 
57      {      {
58          return "NCBI_NP:$1";          return "NCBI_NP:$1";
59      }      }
60        elsif (/^NM_(\d+.*)/)
61        {
62            return "NCBI_NM:$1";
63        }
64      elsif (/^gi\|(\d+)/)      elsif (/^gi\|(\d+)/)
65      {      {
66          return "NCBI_gi:$1";          return "NCBI_gi:$1";
# Line 92  Line 96 
96    
97      if (lc($type) eq "ncbi_np")      if (lc($type) eq "ncbi_np")
98      {      {
99          return "NP_$ref";          return "$ref";
100        }
101        elsif (lc($type) eq "ncbi_nm")
102        {
103            return "$ref";
104      }      }
105      elsif (lc($type) eq "ncbi_pid")      elsif (lc($type) eq "ncbi_pid")
106      {      {
# Line 102  Line 110 
110      {      {
111          return "gi|$ref";          return "gi|$ref";
112      }      }
113      elsif ($type eq "KEGG")      elsif (lc($type) eq "kegg")
114      {      {
115          $ref =~ s/ /:/;          $ref =~ s/ /:/;
116          return "kegg|$ref";          return "kegg|$ref";
117      }      }
118      elsif ($type eq "UniProt")      elsif (lc($type) eq "uniprot")
119      {      {
120          return "uni|$ref";          return "uni|$ref";
121      }      }
122      elsif ($type eq "Swiss-Prot")      elsif (lc($type) eq "swiss-prot")
123      {      {
124          return "sp|$ref";          return "sp|$ref";
125      }      }

Legend:
Removed from v.1.16  
changed lines
  Added in v.1.17

MCS Webmaster
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.3